MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010334	CAT	2	6	27427	27432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621964
502	NC_010334	CA	3	6	27435	27440	50 %	0 %	0 %	50 %	167621964
503	NC_010334	TGC	2	6	27453	27458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621964
504	NC_010334	AAAC	2	8	27466	27473	75 %	0 %	0 %	25 %	167621964
505	NC_010334	CGC	2	6	27539	27544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621964
506	NC_010334	ACC	2	6	27569	27574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621964
507	NC_010334	CATGG	2	10	27590	27599	20 %	20 %	40 %	20 %	167621964
508	NC_010334	GCT	2	6	27626	27631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621964
509	NC_010334	GTT	2	6	27711	27716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621964
510	NC_010334	ACC	2	6	27758	27763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621964
511	NC_010334	AAG	2	6	27771	27776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621964
512	NC_010334	ACGGCC	2	12	27783	27794	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167621964
513	NC_010334	AGT	2	6	27893	27898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621964
514	NC_010334	AAG	2	6	27921	27926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621964
515	NC_010334	GCA	2	6	27969	27974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621964
516	NC_010334	CAG	2	6	28007	28012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621964
517	NC_010334	GCTG	2	8	28070	28077	0 %	25 %	50 %	25 %	167621964
518	NC_010334	AG	3	6	28092	28097	50 %	0 %	50 %	0 %	167621964
519	NC_010334	TTC	2	6	28121	28126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621964
520	NC_010334	ATA	2	6	28130	28135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621964
521	NC_010334	CTT	2	6	28297	28302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621965
522	NC_010334	AAG	2	6	28310	28315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621965
523	NC_010334	CTT	2	6	28368	28373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621965
524	NC_010334	TGG	2	6	28405	28410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621965
525	NC_010334	CGATAT	2	12	28584	28595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167621965
526	NC_010334	T	6	6	28648	28653	0 %	100 %	0 %	0 %	167621965
527	NC_010334	AGCA	2	8	28669	28676	50 %	0 %	25 %	25 %	167621965
528	NC_010334	ATG	2	6	28685	28690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621965
529	NC_010334	TCG	2	6	28700	28705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621965
530	NC_010334	AATA	2	8	28717	28724	75 %	25 %	0 %	0 %	167621965
531	NC_010334	TTC	2	6	28744	28749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621965
532	NC_010334	AGC	2	6	28751	28756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621965
533	NC_010334	CAC	2	6	28776	28781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621965
534	NC_010334	TC	3	6	28804	28809	0 %	50 %	0 %	50 %	167621965
535	NC_010334	GC	3	6	28823	28828	0 %	0 %	50 %	50 %	167621965
536	NC_010334	TCAA	2	8	28841	28848	50 %	25 %	0 %	25 %	167621965
537	NC_010334	ACC	3	9	28900	28908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621965
538	NC_010334	CGCA	2	8	28963	28970	25 %	0 %	25 %	50 %	167621965
539	NC_010334	GAA	2	6	28990	28995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621965
540	NC_010334	TGG	2	6	29019	29024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621965
541	NC_010334	TGC	2	6	29104	29109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621965
542	NC_010334	TCA	2	6	29261	29266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621965
543	NC_010334	ATA	2	6	29267	29272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621965
544	NC_010334	TGG	2	6	29373	29378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621965
545	NC_010334	GGCA	2	8	29406	29413	25 %	0 %	50 %	25 %	167621965
546	NC_010334	TCG	2	6	29426	29431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621965
547	NC_010334	ACC	2	6	29513	29518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621965
548	NC_010334	CCA	2	6	29618	29623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621965
549	NC_010334	TAA	2	6	29685	29690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621966
550	NC_010334	TGT	2	6	29701	29706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621966
551	NC_010334	CCAA	2	8	29726	29733	50 %	0 %	0 %	50 %	167621966
552	NC_010334	ATC	2	6	29735	29740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621966
553	NC_010334	TTG	2	6	29750	29755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621966
554	NC_010334	AAG	2	6	29793	29798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621966
555	NC_010334	GTT	2	6	29930	29935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621966
556	NC_010334	GAC	2	6	29962	29967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621966
557	NC_010334	CCA	2	6	30029	30034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621966
558	NC_010334	GGC	2	6	30047	30052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621966
559	NC_010334	TGC	2	6	30099	30104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
560	NC_010334	AAGT	2	8	30167	30174	50 %	25 %	25 %	0 %	167621966
561	NC_010334	ACC	2	6	30185	30190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621966
562	NC_010334	TCA	2	6	30219	30224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621966
563	NC_010334	GCT	2	6	30323	30328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
564	NC_010334	TC	3	6	30400	30405	0 %	50 %	0 %	50 %	167621966
565	NC_010334	CTG	2	6	30416	30421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
566	NC_010334	GTT	2	6	30422	30427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621966
567	NC_010334	TGC	2	6	30491	30496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
568	NC_010334	ACC	2	6	30600	30605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621966
569	NC_010334	GAC	2	6	30631	30636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621966
570	NC_010334	CAAC	2	8	30699	30706	50 %	0 %	0 %	50 %	167621966
571	NC_010334	AGT	2	6	30711	30716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621966
572	NC_010334	GCT	2	6	30730	30735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
573	NC_010334	TTGT	2	8	30770	30777	0 %	75 %	25 %	0 %	167621966
574	NC_010334	AAG	2	6	30821	30826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621966
575	NC_010334	TGA	3	9	31066	31074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621967
576	NC_010334	GCAG	2	8	31338	31345	25 %	0 %	50 %	25 %	167621967
577	NC_010334	GC	3	6	31539	31544	0 %	0 %	50 %	50 %	167621967
578	NC_010334	GCG	2	6	31554	31559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621967
579	NC_010334	ACA	2	6	31653	31658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167621967
580	NC_010334	TCA	2	6	31704	31709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621967
581	NC_010334	CAG	2	6	31795	31800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621967
582	NC_010334	TA	3	6	31816	31821	50 %	50 %	0 %	0 %	167621967
583	NC_010334	GCA	2	6	31869	31874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621967
584	NC_010334	GTG	2	6	31985	31990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621968
585	NC_010334	CAA	2	6	32000	32005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167621968
586	NC_010334	CAAA	2	8	32051	32058	75 %	0 %	0 %	25 %	167621968
587	NC_010334	CTT	2	6	32165	32170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621968
588	NC_010334	CAC	2	6	32183	32188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621968
589	NC_010334	CAA	2	6	32195	32200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167621968
590	NC_010334	TGA	2	6	32210	32215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621968
591	NC_010334	CAT	2	6	32234	32239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621968
592	NC_010334	TGG	2	6	32266	32271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621968
593	NC_010334	TCG	2	6	32332	32337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621968
594	NC_010334	AGC	2	6	32352	32357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621968
595	NC_010334	TAA	2	6	32421	32426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621968
596	NC_010334	AGTT	2	8	32468	32475	25 %	50 %	25 %	0 %	167621968
597	NC_010334	TA	4	8	32539	32546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010334	TAA	2	6	32550	32555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010334	TGA	2	6	32579	32584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621969
600	NC_010334	GTTG	2	8	32614	32621	0 %	50 %	50 %	0 %	167621969
601	NC_010334	TC	3	6	32882	32887	0 %	50 %	0 %	50 %	167621969
602	NC_010334	CT	3	6	32917	32922	0 %	50 %	0 %	50 %	167621969
603	NC_010334	ATT	2	6	33034	33039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167621969
604	NC_010334	TAC	2	6	33233	33238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621969
605	NC_010334	AT	3	6	33503	33508	50 %	50 %	0 %	0 %	167621969
606	NC_010334	CAT	2	6	33591	33596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621969
607	NC_010334	TAG	2	6	33657	33662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621969
608	NC_010334	GTTA	2	8	33676	33683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010334	ATG	2	6	33709	33714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010334	GTT	2	6	33766	33771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010334	TAA	2	6	33812	33817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010334	TAC	2	6	33890	33895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621970
613	NC_010334	GCG	2	6	33931	33936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621970
614	NC_010334	GCA	2	6	33945	33950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621970
615	NC_010334	AGC	2	6	33951	33956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621970
616	NC_010334	CAT	2	6	33964	33969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621970
617	NC_010334	GT	3	6	33973	33978	0 %	50 %	50 %	0 %	167621970
618	NC_010334	CT	3	6	33989	33994	0 %	50 %	0 %	50 %	167621970
619	NC_010334	TCC	2	6	33996	34001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621970
620	NC_010334	TCC	2	6	34023	34028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621970
621	NC_010334	TGT	2	6	34083	34088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621970
622	NC_010334	TGG	2	6	34110	34115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621970
623	NC_010334	A	6	6	34117	34122	100 %	0 %	0 %	0 %	167621970
624	NC_010334	TGC	2	6	34200	34205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621970
625	NC_010334	TATTGA	2	12	34218	34229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167621970
626	NC_010334	CGAAA	2	10	34373	34382	60 %	0 %	20 %	20 %	167621970
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628	NC_010334	AAGC	2	8	34424	34431	50 %	0 %	25 %	25 %	167621970
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