MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010334	TGC	3	9	304539	304547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622195
5502	NC_010334	CAA	2	6	304630	304635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622195
5503	NC_010334	CAAG	2	8	304641	304648	50 %	0 %	25 %	25 %	167622195
5504	NC_010334	TACTGC	2	12	304708	304719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167622195
5505	NC_010334	GTG	2	6	304827	304832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622195
5506	NC_010334	CTT	2	6	304900	304905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_010334	ATAA	2	8	304951	304958	75 %	25 %	0 %	0 %	167622196
5508	NC_010334	CAA	2	6	304976	304981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622196
5509	NC_010334	TAA	2	6	305112	305117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622196
5510	NC_010334	A	6	6	305119	305124	100 %	0 %	0 %	0 %	167622196
5511	NC_010334	TGCGC	2	10	305250	305259	0 %	20 %	40 %	40 %	167622196
5512	NC_010334	T	7	7	305263	305269	0 %	100 %	0 %	0 %	167622196
5513	NC_010334	AATGT	2	10	305288	305297	40 %	40 %	20 %	0 %	167622196
5514	NC_010334	GTCCA	2	10	305344	305353	20 %	20 %	20 %	40 %	167622196
5515	NC_010334	GTT	2	6	305380	305385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622196
5516	NC_010334	AGGCC	2	10	305391	305400	20 %	0 %	40 %	40 %	167622196
5517	NC_010334	ATT	2	6	305439	305444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622196
5518	NC_010334	GCC	2	6	305451	305456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622196
5519	NC_010334	A	6	6	305499	305504	100 %	0 %	0 %	0 %	167622196
5520	NC_010334	GGC	2	6	305505	305510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622196
5521	NC_010334	AGA	2	6	305528	305533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622196
5522	NC_010334	AAT	2	6	305637	305642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622196
5523	NC_010334	ACC	2	6	305679	305684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622196
5524	NC_010334	AAT	2	6	305751	305756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622196
5525	NC_010334	ATA	2	6	305781	305786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622196
5526	NC_010334	GCT	2	6	305817	305822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_010334	AGC	2	6	305834	305839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_010334	TGT	2	6	305990	305995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622197
5529	NC_010334	AG	3	6	306006	306011	50 %	0 %	50 %	0 %	167622197
5530	NC_010334	A	6	6	306051	306056	100 %	0 %	0 %	0 %	167622197
5531	NC_010334	GCA	2	6	306076	306081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622197
5532	NC_010334	CTG	2	6	306096	306101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622197
5533	NC_010334	TTA	2	6	306124	306129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622197
5534	NC_010334	GCT	2	6	306136	306141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622197
5535	NC_010334	CAA	2	6	306176	306181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622197
5536	NC_010334	CAA	2	6	306206	306211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622197
5537	NC_010334	AAAC	2	8	306299	306306	75 %	0 %	0 %	25 %	167622197
5538	NC_010334	ACG	2	6	306337	306342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622197
5539	NC_010334	AC	3	6	306350	306355	50 %	0 %	0 %	50 %	167622197
5540	NC_010334	CAAAGC	2	12	306425	306436	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167622197
5541	NC_010334	AAT	2	6	306456	306461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622197
5542	NC_010334	GCG	2	6	306466	306471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622197
5543	NC_010334	GGT	2	6	306530	306535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622198
5544	NC_010334	TGGCT	2	10	306596	306605	0 %	40 %	40 %	20 %	167622198
5545	NC_010334	CAC	2	6	306616	306621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622198
5546	NC_010334	AAG	2	6	306762	306767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622198
5547	NC_010334	AAT	2	6	306868	306873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622198
5548	NC_010334	GGC	2	6	306875	306880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622198
5549	NC_010334	CCA	2	6	306931	306936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622198
5550	NC_010334	GAT	2	6	307016	307021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622198
5551	NC_010334	GTA	2	6	307170	307175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622198
5552	NC_010334	GAT	2	6	307289	307294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622198
5553	NC_010334	ATG	2	6	307314	307319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622198
5554	NC_010334	CGC	3	9	307372	307380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622198
5555	NC_010334	GCA	2	6	307383	307388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622198
5556	NC_010334	CAG	2	6	307466	307471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622198
5557	NC_010334	GCC	2	6	307682	307687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622198
5558	NC_010334	TGAGC	2	10	307703	307712	20 %	20 %	40 %	20 %	167622198
5559	NC_010334	ATC	2	6	307788	307793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622198
5560	NC_010334	AAG	2	6	307884	307889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622198
5561	NC_010334	CCAC	2	8	307953	307960	25 %	0 %	0 %	75 %	167622198
5562	NC_010334	A	6	6	307961	307966	100 %	0 %	0 %	0 %	167622198
5563	NC_010334	AAC	2	6	308022	308027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622198
5564	NC_010334	ATG	3	9	308054	308062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622198
5565	NC_010334	TCA	2	6	308064	308069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622198
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5569	NC_010334	TGT	2	6	308220	308225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622199
5570	NC_010334	GCACT	2	10	308233	308242	20 %	20 %	20 %	40 %	167622199
5571	NC_010334	AGC	2	6	308294	308299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622199
5572	NC_010334	ATG	2	6	308332	308337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622199
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5575	NC_010334	TGA	2	6	308370	308375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622199
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5577	NC_010334	CGATAT	2	12	308746	308757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167622199
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5580	NC_010334	GCC	2	6	308916	308921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622199
5581	NC_010334	TTG	3	9	308948	308956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622199
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5589	NC_010334	TAC	2	6	309443	309448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622199
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5591	NC_010334	GGT	2	6	309514	309519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622199
5592	NC_010334	ATG	2	6	309537	309542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622199
5593	NC_010334	GCA	2	6	309566	309571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622199
5594	NC_010334	CA	3	6	309689	309694	50 %	0 %	0 %	50 %	167622199
5595	NC_010334	ACA	2	6	309697	309702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622199
5596	NC_010334	GACAA	2	10	309730	309739	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5597	NC_010334	AGA	2	6	309740	309745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_010334	CA	3	6	309748	309753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_010334	A	6	6	309789	309794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_010334	AT	3	6	309922	309927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_010334	GTT	2	6	310016	310021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_010334	GTT	2	6	310034	310039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_010334	TTA	2	6	310045	310050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_010334	ACTT	2	8	310051	310058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_010334	A	6	6	310115	310120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_010334	AAT	2	6	310156	310161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_010334	GGC	2	6	310211	310216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622200
5608	NC_010334	ACT	2	6	310265	310270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622200
5609	NC_010334	TTA	2	6	310278	310283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622200
5610	NC_010334	AAT	3	9	310304	310312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622200
5611	NC_010334	GCT	2	6	310317	310322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622200
5612	NC_010334	TTG	2	6	310556	310561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622200
5613	NC_010334	GTG	2	6	310629	310634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622200
5614	NC_010334	TTG	2	6	310841	310846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622201
5615	NC_010334	TCT	2	6	310851	310856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622201
5616	NC_010334	CAT	2	6	310875	310880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622201
5617	NC_010334	ACT	2	6	310895	310900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622201
5618	NC_010334	CTG	2	6	310918	310923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622201
5619	NC_010334	TTC	2	6	310967	310972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622201
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5622	NC_010334	CTG	2	6	311004	311009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622201
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5988	NC_010334	CAA	2	6	330369	330374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622216
5989	NC_010334	GCT	2	6	330455	330460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622216
5990	NC_010334	TGCAG	2	10	330482	330491	20 %	20 %	40 %	20 %	167622216
5991	NC_010334	TAT	2	6	330599	330604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622216
5992	NC_010334	TA	3	6	330618	330623	50 %	50 %	0 %	0 %	167622216
5993	NC_010334	TGG	2	6	330811	330816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622216
5994	NC_010334	GAT	2	6	330822	330827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622216
5995	NC_010334	AAT	2	6	330858	330863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622216
5996	NC_010334	ACTG	2	8	330887	330894	25 %	25 %	25 %	25 %	167622216
5997	NC_010334	CTA	2	6	331022	331027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622216
5998	NC_010334	ATCTA	2	10	331038	331047	40 %	40 %	0 %	20 %	167622216
5999	NC_010334	TAATC	2	10	331092	331101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6000	NC_010334	TCA	2	6	331177	331182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622217

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