MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_010334	CTTA	2	8	276888	276895	25 %	50 %	0 %	25 %	167622171
5003	NC_010334	GATT	2	8	276940	276947	25 %	50 %	25 %	0 %	167622171
5004	NC_010334	CTT	2	6	277144	277149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622171
5005	NC_010334	GTA	2	6	277165	277170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622171
5006	NC_010334	TCT	2	6	277194	277199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622171
5007	NC_010334	GGT	2	6	277253	277258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622171
5008	NC_010334	TGC	2	6	277287	277292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622171
5009	NC_010334	CAG	2	6	277293	277298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622171
5010	NC_010334	ACT	2	6	277373	277378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622171
5011	NC_010334	TGC	2	6	277438	277443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622171
5012	NC_010334	TGC	2	6	277471	277476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622171
5013	NC_010334	T	7	7	277491	277497	0 %	100 %	0 %	0 %	167622171
5014	NC_010334	TGAG	2	8	277500	277507	25 %	25 %	50 %	0 %	167622171
5015	NC_010334	TTA	2	6	277566	277571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622172
5016	NC_010334	ACT	2	6	277597	277602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622172
5017	NC_010334	CTG	2	6	277727	277732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622172
5018	NC_010334	CTGG	2	8	277763	277770	0 %	25 %	50 %	25 %	167622172
5019	NC_010334	GCTG	2	8	277906	277913	0 %	25 %	50 %	25 %	167622172
5020	NC_010334	AG	3	6	277918	277923	50 %	0 %	50 %	0 %	167622172
5021	NC_010334	CACTT	2	10	278119	278128	20 %	40 %	0 %	40 %	167622172
5022	NC_010334	CTG	2	6	278153	278158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622172
5023	NC_010334	TGA	2	6	278161	278166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622172
5024	NC_010334	TGA	3	9	278174	278182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622172
5025	NC_010334	GTC	2	6	278187	278192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622172
5026	NC_010334	CTG	2	6	278285	278290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622172
5027	NC_010334	AC	3	6	278328	278333	50 %	0 %	0 %	50 %	167622172
5028	NC_010334	CAT	2	6	278360	278365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622172
5029	NC_010334	TTA	2	6	278422	278427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622172
5030	NC_010334	T	6	6	278487	278492	0 %	100 %	0 %	0 %	167622172
5031	NC_010334	GA	3	6	278540	278545	50 %	0 %	50 %	0 %	167622172
5032	NC_010334	GTTT	2	8	278683	278690	0 %	75 %	25 %	0 %	167622172
5033	NC_010334	AAT	2	6	278766	278771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622172
5034	NC_010334	GGTT	2	8	278778	278785	0 %	50 %	50 %	0 %	167622172
5035	NC_010334	TGA	2	6	278816	278821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622172
5036	NC_010334	ATCT	2	8	278843	278850	25 %	50 %	0 %	25 %	167622172
5037	NC_010334	TTCATA	2	12	278877	278888	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167622172
5038	NC_010334	T	7	7	278960	278966	0 %	100 %	0 %	0 %	167622172
5039	NC_010334	ACTTCA	2	12	278986	278997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622172
5040	NC_010334	GGT	2	6	279002	279007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622172
5041	NC_010334	AGT	2	6	279054	279059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622172
5042	NC_010334	ATCAAT	2	12	279072	279083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167622172
5043	NC_010334	ATCA	2	8	279144	279151	50 %	25 %	0 %	25 %	167622172
5044	NC_010334	GCA	2	6	279247	279252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622172
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5049	NC_010334	T	6	6	279389	279394	0 %	100 %	0 %	0 %	167622173
5050	NC_010334	ATT	2	6	279440	279445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622173
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5053	NC_010334	CCA	2	6	279615	279620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622173
5054	NC_010334	TCA	2	6	279633	279638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622173
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5056	NC_010334	ATTT	2	8	279818	279825	25 %	75 %	0 %	0 %	167622173
5057	NC_010334	ATTT	2	8	279836	279843	25 %	75 %	0 %	0 %	167622173
5058	NC_010334	TAT	2	6	279862	279867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622173
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5060	NC_010334	ATT	3	9	279944	279952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622173
5061	NC_010334	T	6	6	279951	279956	0 %	100 %	0 %	0 %	167622173
5062	NC_010334	AGT	2	6	279967	279972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622173
5063	NC_010334	TGC	2	6	280022	280027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622173
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5066	NC_010334	AGG	2	6	280149	280154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_010334	A	9	9	280160	280168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_010334	TAT	2	6	280183	280188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_010334	A	6	6	280217	280222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010334	T	8	8	280226	280233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_010334	A	7	7	280249	280255	100 %	0 %	0 %	0 %	167622174
5072	NC_010334	AAG	2	6	280349	280354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622174
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5081	NC_010334	TGCAG	2	10	280786	280795	20 %	20 %	40 %	20 %	167622174
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5115	NC_010334	T	7	7	282366	282372	0 %	100 %	0 %	0 %	167622176
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5117	NC_010334	TTG	2	6	282400	282405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_010334	TTGT	2	8	282467	282474	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010334	AT	3	6	282547	282552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010334	TGG	2	6	282562	282567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_010334	TTA	2	6	282600	282605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_010334	A	6	6	282663	282668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_010334	TGT	2	6	282709	282714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_010334	GTT	2	6	282726	282731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_010334	TTG	2	6	282753	282758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_010334	T	7	7	282762	282768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_010334	T	6	6	282773	282778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_010334	TTA	2	6	282840	282845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5130	NC_010334	T	6	6	282946	282951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_010334	TTG	2	6	282954	282959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_010334	TGA	2	6	282975	282980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5237	NC_010334	ATC	2	6	289052	289057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5243	NC_010334	A	6	6	289725	289730	100 %	0 %	0 %	0 %	167622182
5244	NC_010334	AAT	2	6	289813	289818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622182
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5247	NC_010334	TCG	2	6	290179	290184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5248	NC_010334	AGC	2	6	290239	290244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5249	NC_010334	ATT	2	6	290246	290251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622183
5250	NC_010334	AGA	2	6	290275	290280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622183
5251	NC_010334	GCT	2	6	290396	290401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5252	NC_010334	AT	3	6	290407	290412	50 %	50 %	0 %	0 %	167622183
5253	NC_010334	A	6	6	290508	290513	100 %	0 %	0 %	0 %	167622183
5254	NC_010334	AGAA	2	8	290571	290578	75 %	0 %	25 %	0 %	167622183
5255	NC_010334	TGC	2	6	290652	290657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5256	NC_010334	AAGC	2	8	290717	290724	50 %	0 %	25 %	25 %	167622183
5257	NC_010334	ATT	2	6	290744	290749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622183
5258	NC_010334	GCG	2	6	290810	290815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622183
5259	NC_010334	AAG	2	6	290886	290891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622183
5260	NC_010334	GGC	2	6	290932	290937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622183
5261	NC_010334	TGG	2	6	291024	291029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622183
5262	NC_010334	GTTGA	2	10	291116	291125	20 %	40 %	40 %	0 %	167622183
5263	NC_010334	AGCT	2	8	291165	291172	25 %	25 %	25 %	25 %	167622183
5264	NC_010334	CGCGG	2	10	291305	291314	0 %	0 %	60 %	40 %	167622183
5265	NC_010334	CGC	2	6	291326	291331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622183
5266	NC_010334	GAGTCA	2	12	291406	291417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167622183
5267	NC_010334	TG	3	6	291452	291457	0 %	50 %	50 %	0 %	167622183
5268	NC_010334	TAAA	2	8	291519	291526	75 %	25 %	0 %	0 %	167622183
5269	NC_010334	AAC	2	6	291575	291580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622183
5270	NC_010334	CG	3	6	291601	291606	0 %	0 %	50 %	50 %	167622183
5271	NC_010334	AGCA	2	8	291627	291634	50 %	0 %	25 %	25 %	167622183
5272	NC_010334	ACG	2	6	291654	291659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5273	NC_010334	TGC	2	6	291721	291726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5274	NC_010334	TGG	2	6	291753	291758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622183
5275	NC_010334	CTAC	2	8	291818	291825	25 %	25 %	0 %	50 %	167622183
5276	NC_010334	GTG	2	6	291873	291878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622183
5277	NC_010334	AGA	2	6	291910	291915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622183
5278	NC_010334	GTG	2	6	291953	291958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622183
5279	NC_010334	TTG	2	6	291984	291989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622183
5280	NC_010334	TCA	2	6	292000	292005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622183
5281	NC_010334	CGA	2	6	292048	292053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5282	NC_010334	GGT	2	6	292063	292068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622183
5283	NC_010334	TGA	2	6	292147	292152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622183
5284	NC_010334	ACA	2	6	292194	292199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622183
5285	NC_010334	AAGC	2	8	292200	292207	50 %	0 %	25 %	25 %	167622183
5286	NC_010334	AGA	2	6	292257	292262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622183
5287	NC_010334	AGC	2	6	292275	292280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5288	NC_010334	TGC	2	6	292288	292293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622183
5289	NC_010334	GAA	2	6	292330	292335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622183
5290	NC_010334	A	7	7	292357	292363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5291	NC_010334	T	7	7	292384	292390	0 %	100 %	0 %	0 %	167622184
5292	NC_010334	GTTCG	2	10	292424	292433	0 %	40 %	40 %	20 %	167622184
5293	NC_010334	TTGG	3	12	292503	292514	0 %	50 %	50 %	0 %	167622184
5294	NC_010334	AGC	2	6	292588	292593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622184
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5296	NC_010334	TGC	2	6	292648	292653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622184
5297	NC_010334	TGC	2	6	292666	292671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622184
5298	NC_010334	TTG	2	6	292674	292679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622184
5299	NC_010334	AGCTT	2	10	292693	292702	20 %	40 %	20 %	20 %	167622184
5300	NC_010334	TGC	2	6	292732	292737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622184
5301	NC_010334	TTC	2	6	292752	292757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622184
5302	NC_010334	TGG	2	6	292766	292771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622184
5303	NC_010334	TTG	2	6	292773	292778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622184
5304	NC_010334	CGG	2	6	292779	292784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622184
5305	NC_010334	AAT	2	6	292785	292790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622184
5306	NC_010334	GCT	2	6	292799	292804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622184
5307	NC_010334	GC	3	6	292815	292820	0 %	0 %	50 %	50 %	167622184
5308	NC_010334	GCA	2	6	292831	292836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622184
5309	NC_010334	CAC	2	6	292872	292877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622184
5310	NC_010334	ATA	2	6	292882	292887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622184
5311	NC_010334	CTTAT	2	10	292989	292998	20 %	60 %	0 %	20 %	167622185
5312	NC_010334	TGA	2	6	293034	293039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622185
5313	NC_010334	AGC	2	6	293070	293075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622185
5314	NC_010334	AAG	2	6	293325	293330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622185
5315	NC_010334	TGGC	2	8	293364	293371	0 %	25 %	50 %	25 %	167622185
5316	NC_010334	GCT	2	6	293470	293475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622185
5317	NC_010334	TGC	2	6	293480	293485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622185
5318	NC_010334	C	7	7	293501	293507	0 %	0 %	0 %	100 %	167622185
5319	NC_010334	ACC	2	6	293512	293517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622185
5320	NC_010334	ATA	2	6	293550	293555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622185
5321	NC_010334	C	6	6	293680	293685	0 %	0 %	0 %	100 %	167622185
5322	NC_010334	GAC	2	6	293699	293704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622185
5323	NC_010334	TG	3	6	293950	293955	0 %	50 %	50 %	0 %	167622186
5324	NC_010334	GCA	2	6	294000	294005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622186
5325	NC_010334	TTGGG	2	10	294100	294109	0 %	40 %	60 %	0 %	167622186
5326	NC_010334	TGAT	2	8	294138	294145	25 %	50 %	25 %	0 %	167622186
5327	NC_010334	CTG	2	6	294329	294334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622186
5328	NC_010334	AC	3	6	294348	294353	50 %	0 %	0 %	50 %	167622186
5329	NC_010334	GCG	2	6	294382	294387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622186
5330	NC_010334	TTGA	2	8	294446	294453	25 %	50 %	25 %	0 %	167622186
5331	NC_010334	AAC	2	6	294463	294468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622186
5332	NC_010334	TGA	2	6	294481	294486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622186
5333	NC_010334	GTG	2	6	294529	294534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622186
5334	NC_010334	GAT	2	6	294719	294724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622187
5335	NC_010334	GCT	2	6	294746	294751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622187
5336	NC_010334	T	6	6	294965	294970	0 %	100 %	0 %	0 %	167622187
5337	NC_010334	GC	3	6	295066	295071	0 %	0 %	50 %	50 %	167622187
5338	NC_010334	CGC	2	6	295090	295095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622187
5339	NC_010334	ATT	2	6	295205	295210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622187
5340	NC_010334	GGT	2	6	295223	295228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622187
5341	NC_010334	TAAT	2	8	295303	295310	50 %	50 %	0 %	0 %	167622187
5342	NC_010334	TGA	2	6	295324	295329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622187
5343	NC_010334	TCA	2	6	295440	295445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622187
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5345	NC_010334	CT	3	6	295500	295505	0 %	50 %	0 %	50 %	167622187
5346	NC_010334	GGC	2	6	295535	295540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622187
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5348	NC_010334	CAAT	2	8	295605	295612	50 %	25 %	0 %	25 %	167622187
5349	NC_010334	TAT	2	6	295627	295632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622187
5350	NC_010334	ATC	2	6	295781	295786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622187
5351	NC_010334	AGT	2	6	295800	295805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622187
5352	NC_010334	GAT	2	6	295806	295811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622187
5353	NC_010334	ACC	2	6	295862	295867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622187
5354	NC_010334	AGC	2	6	295917	295922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622187
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5356	NC_010334	AAT	2	6	295965	295970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622187
5357	NC_010334	TTC	2	6	295992	295997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622187
5358	NC_010334	TGC	2	6	296148	296153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622187
5359	NC_010334	GTAG	2	8	296210	296217	25 %	25 %	50 %	0 %	167622187
5360	NC_010334	AGA	2	6	296230	296235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622187
5361	NC_010334	ATC	2	6	296237	296242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622187
5362	NC_010334	T	6	6	296270	296275	0 %	100 %	0 %	0 %	167622187
5363	NC_010334	GGGT	2	8	296346	296353	0 %	25 %	75 %	0 %	167622187
5364	NC_010334	A	6	6	296376	296381	100 %	0 %	0 %	0 %	167622187
5365	NC_010334	CTTG	2	8	296539	296546	0 %	50 %	25 %	25 %	167622187
5366	NC_010334	TAC	2	6	296651	296656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622187
5367	NC_010334	GAC	2	6	296675	296680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622187
5368	NC_010334	TGG	2	6	296695	296700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622187
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5370	NC_010334	CTG	2	6	296813	296818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622187
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