MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 102272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010102	TGTT	2	8	513993	514000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_010102	CGT	2	6	514001	514006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_010102	CGG	2	6	514238	514243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612840
11004	NC_010102	CG	3	6	514244	514249	0 %	0 %	50 %	50 %	161612840
11005	NC_010102	CAC	2	6	514281	514286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612840
11006	NC_010102	TGC	2	6	514300	514305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11007	NC_010102	CAT	2	6	514355	514360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612840
11008	NC_010102	CAT	2	6	514578	514583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612840
11009	NC_010102	CGA	2	6	514586	514591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11010	NC_010102	GTG	2	6	514602	514607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612840
11011	NC_010102	TGA	2	6	514643	514648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612840
11012	NC_010102	TCG	2	6	514703	514708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11013	NC_010102	TG	3	6	514737	514742	0 %	50 %	50 %	0 %	161612840
11014	NC_010102	GTG	3	9	514740	514748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612840
11015	NC_010102	GAC	2	6	514749	514754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11016	NC_010102	CAA	2	6	514799	514804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612840
11017	NC_010102	GAT	2	6	514871	514876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612840
11018	NC_010102	CGA	2	6	514883	514888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11019	NC_010102	CGGTG	2	10	514913	514922	0 %	20 %	60 %	20 %	161612840
11020	NC_010102	GCG	2	6	514999	515004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612840
11021	NC_010102	GAT	2	6	515030	515035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612840
11022	NC_010102	CGGTG	2	10	515051	515060	0 %	20 %	60 %	20 %	161612840
11023	NC_010102	CTG	2	6	515094	515099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11024	NC_010102	ACC	2	6	515107	515112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612840
11025	NC_010102	GCG	2	6	515310	515315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612840
11026	NC_010102	A	6	6	515316	515321	100 %	0 %	0 %	0 %	161612840
11027	NC_010102	GTG	2	6	515355	515360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612840
11028	NC_010102	CAG	2	6	515392	515397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11029	NC_010102	CCA	2	6	515405	515410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612840
11030	NC_010102	CGG	2	6	515425	515430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612840
11031	NC_010102	GCA	2	6	515542	515547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11032	NC_010102	CAA	2	6	515558	515563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612840
11033	NC_010102	CAG	2	6	515595	515600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612840
11034	NC_010102	GGCAG	2	10	515626	515635	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11035	NC_010102	TAT	2	6	515648	515653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_010102	TTCCTG	2	12	515732	515743	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161612841
11037	NC_010102	AAT	2	6	515768	515773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612841
11038	NC_010102	CGC	2	6	515795	515800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612841
11039	NC_010102	GCAG	2	8	515841	515848	25 %	0 %	50 %	25 %	161612841
11040	NC_010102	GTT	2	6	515956	515961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612841
11041	NC_010102	CAGC	2	8	516007	516014	25 %	0 %	25 %	50 %	161612841
11042	NC_010102	ATT	2	6	516050	516055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612842
11043	NC_010102	CACG	2	8	516101	516108	25 %	0 %	25 %	50 %	161612842
11044	NC_010102	GA	3	6	516111	516116	50 %	0 %	50 %	0 %	161612842
11045	NC_010102	AGC	2	6	516166	516171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612842
11046	NC_010102	AT	3	6	516244	516249	50 %	50 %	0 %	0 %	161612842
11047	NC_010102	CTT	2	6	516326	516331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612842
11048	NC_010102	TTC	2	6	516384	516389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612842
11049	NC_010102	ACT	2	6	516493	516498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_010102	ATG	2	6	516598	516603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_010102	GCATG	2	10	516664	516673	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11052	NC_010102	CCA	2	6	516705	516710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11053	NC_010102	GCATG	2	10	516782	516791	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11054	NC_010102	CCA	2	6	516823	516828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_010102	GTTT	2	8	516909	516916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_010102	GCT	2	6	516920	516925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_010102	TTA	2	6	516976	516981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_010102	TA	3	6	516993	516998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_010102	ATG	2	6	516999	517004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_010102	A	6	6	517042	517047	100 %	0 %	0 %	0 %	161612843
11061	NC_010102	CTGGC	2	10	517148	517157	0 %	20 %	40 %	40 %	161612843
11062	NC_010102	GCC	2	6	517197	517202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612843
11063	NC_010102	ATG	2	6	517229	517234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612843
11064	NC_010102	AATG	2	8	517241	517248	50 %	25 %	25 %	0 %	161612843
11065	NC_010102	TGC	2	6	517281	517286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612843
11066	NC_010102	TGC	2	6	517308	517313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612843
11067	NC_010102	GC	4	8	517344	517351	0 %	0 %	50 %	50 %	161612843
11068	NC_010102	CCAA	2	8	517368	517375	50 %	0 %	0 %	50 %	161612843
11069	NC_010102	CTT	2	6	517483	517488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612843
11070	NC_010102	GGCACC	2	12	517490	517501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161612843
11071	NC_010102	TAT	2	6	517568	517573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612843
11072	NC_010102	GAT	2	6	517582	517587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612843
11073	NC_010102	TTTG	2	8	517926	517933	0 %	75 %	25 %	0 %	161612843
11074	NC_010102	TGCG	2	8	518028	518035	0 %	25 %	50 %	25 %	161612843
11075	NC_010102	GT	3	6	518072	518077	0 %	50 %	50 %	0 %	161612843
11076	NC_010102	GCT	3	9	518173	518181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612843
11077	NC_010102	ATT	2	6	518218	518223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612843
11078	NC_010102	AT	3	6	518263	518268	50 %	50 %	0 %	0 %	161612843
11079	NC_010102	TAA	2	6	518281	518286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612843
11080	NC_010102	GCTG	2	8	518394	518401	0 %	25 %	50 %	25 %	161612843
11081	NC_010102	GAC	2	6	518470	518475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612843
11082	NC_010102	TGC	2	6	518484	518489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612843
11083	NC_010102	GCGCG	2	10	518518	518527	0 %	0 %	60 %	40 %	161612843
11084	NC_010102	CGA	2	6	518602	518607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612843
11085	NC_010102	ATG	2	6	518615	518620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612843
11086	NC_010102	GCT	2	6	518767	518772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612843
11087	NC_010102	TCA	2	6	518838	518843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612843
11088	NC_010102	GAA	2	6	518855	518860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612843
11089	NC_010102	TC	3	6	518868	518873	0 %	50 %	0 %	50 %	161612843
11090	NC_010102	ATCA	2	8	518897	518904	50 %	25 %	0 %	25 %	161612843
11091	NC_010102	TGA	2	6	518935	518940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612843
11092	NC_010102	CAT	2	6	518992	518997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612843
11093	NC_010102	GTT	2	6	519009	519014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612843
11094	NC_010102	GAT	2	6	519049	519054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612843
11095	NC_010102	AGCGAA	2	12	519076	519087	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161612843
11096	NC_010102	CGT	2	6	519097	519102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612843
11097	NC_010102	TTG	2	6	519111	519116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612843
11098	NC_010102	GCC	2	6	519183	519188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612843
11099	NC_010102	A	7	7	519216	519222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_010102	AAT	2	6	519387	519392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612844
11101	NC_010102	GA	3	6	519455	519460	50 %	0 %	50 %	0 %	161612844
11102	NC_010102	CAT	2	6	519486	519491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612844
11103	NC_010102	AGA	2	6	519587	519592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612844
11104	NC_010102	AACC	2	8	519631	519638	50 %	0 %	0 %	50 %	161612844
11105	NC_010102	CGC	2	6	519699	519704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612844
11106	NC_010102	GAA	2	6	519756	519761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612844
11107	NC_010102	TTC	2	6	519798	519803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612844
11108	NC_010102	CGC	2	6	519951	519956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612844
11109	NC_010102	ACA	2	6	520088	520093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612844
11110	NC_010102	GAA	2	6	520139	520144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612844
11111	NC_010102	GAA	3	9	520191	520199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612844
11112	NC_010102	GAA	2	6	520323	520328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612844
11113	NC_010102	T	7	7	520382	520388	0 %	100 %	0 %	0 %	161612844
11114	NC_010102	GCT	2	6	520395	520400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612844
11115	NC_010102	CAG	2	6	520404	520409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612844
11116	NC_010102	CAA	2	6	520421	520426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612844
11117	NC_010102	AC	4	8	520538	520545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11118	NC_010102	TAA	2	6	520548	520553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_010102	TACTG	2	10	520598	520607	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11120	NC_010102	ATGAAA	2	12	520611	520622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_010102	GTC	2	6	520676	520681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_010102	TGAC	2	8	520807	520814	25 %	25 %	25 %	25 %	161612845
11123	NC_010102	AGC	2	6	520830	520835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612845
11124	NC_010102	GCG	2	6	520842	520847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612845
11125	NC_010102	GTG	2	6	520968	520973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612846
11126	NC_010102	ATC	2	6	521112	521117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612846
11127	NC_010102	TTA	2	6	521187	521192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612846
11128	NC_010102	CGG	2	6	521276	521281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612846
11129	NC_010102	CGC	3	9	521297	521305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612846
11130	NC_010102	TC	3	6	521326	521331	0 %	50 %	0 %	50 %	161612846
11131	NC_010102	GCC	2	6	521403	521408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612846
11132	NC_010102	CGA	2	6	521422	521427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612846
11133	NC_010102	GCA	2	6	521465	521470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612846
11134	NC_010102	CGG	2	6	521477	521482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612846
11135	NC_010102	CAA	2	6	521490	521495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612846
11136	NC_010102	ATG	2	6	521562	521567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612846
11137	NC_010102	CCG	2	6	521572	521577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612846
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11140	NC_010102	TCC	2	6	521706	521711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612846
11141	NC_010102	GGT	2	6	521738	521743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612846
11142	NC_010102	TGC	2	6	521800	521805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612846
11143	NC_010102	TGA	2	6	521854	521859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612846
11144	NC_010102	TGC	2	6	521866	521871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612846
11145	NC_010102	GCGCTG	2	12	521886	521897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161612846
11146	NC_010102	ACGCT	2	10	521923	521932	20 %	20 %	20 %	40 %	161612846
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11148	NC_010102	GTC	2	6	521994	521999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612846
11149	NC_010102	CAG	2	6	522097	522102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11150	NC_010102	TGA	2	6	522112	522117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612847
11151	NC_010102	GAT	2	6	522143	522148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612847
11152	NC_010102	GAT	2	6	522212	522217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612847
11153	NC_010102	CCA	2	6	522234	522239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612847
11154	NC_010102	ACC	2	6	522294	522299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612847
11155	NC_010102	AGT	2	6	522305	522310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612847
11156	NC_010102	ATC	2	6	522318	522323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612847
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11158	NC_010102	TC	3	6	522439	522444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11159	NC_010102	T	6	6	522541	522546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11160	NC_010102	CCG	2	6	522589	522594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612848
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11164	NC_010102	CGG	2	6	522775	522780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612848
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11180	NC_010102	GCA	2	6	523399	523404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612848
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11184	NC_010102	AATA	2	8	523568	523575	75 %	25 %	0 %	0 %	161612849
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11192	NC_010102	GCA	2	6	524046	524051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612850
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11194	NC_010102	CGCA	2	8	524199	524206	25 %	0 %	25 %	50 %	161612850
11195	NC_010102	CAT	2	6	524217	524222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612850
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11223	NC_010102	ACG	2	6	525501	525506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612851
11224	NC_010102	GCC	2	6	525510	525515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612851
11225	NC_010102	AGCC	2	8	525528	525535	25 %	0 %	25 %	50 %	161612851
11226	NC_010102	CG	3	6	525538	525543	0 %	0 %	50 %	50 %	161612851
11227	NC_010102	CGC	2	6	525587	525592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612851
11228	NC_010102	GCGCC	2	10	525631	525640	0 %	0 %	40 %	60 %	161612851
11229	NC_010102	CGC	2	6	525667	525672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612851
11230	NC_010102	CGC	3	9	525683	525691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612851
11231	NC_010102	GCG	2	6	525702	525707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612851
11232	NC_010102	GAC	2	6	525713	525718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612851
11233	NC_010102	AAT	2	6	525730	525735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612851
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11235	NC_010102	CAA	2	6	525881	525886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612851
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11238	NC_010102	CCA	2	6	525970	525975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612851
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11240	NC_010102	CGC	2	6	526049	526054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612851
11241	NC_010102	GCC	2	6	526056	526061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612851
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11243	NC_010102	GC	3	6	526159	526164	0 %	0 %	50 %	50 %	161612851
11244	NC_010102	GCC	3	9	526236	526244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612851
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11258	NC_010102	TAG	2	6	526853	526858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612852
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11278	NC_010102	TGG	2	6	527809	527814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11282	NC_010102	ATT	2	6	527973	527978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11356	NC_010102	AGG	2	6	531715	531720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11357	NC_010102	TAT	2	6	531721	531726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11364	NC_010102	ACTC	2	8	532097	532104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11365	NC_010102	ATT	2	6	532129	532134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11366	NC_010102	ATAG	2	8	532158	532165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11484	NC_010102	GGC	2	6	537999	538004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612864
11485	NC_010102	TAC	2	6	538030	538035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612864
11486	NC_010102	GAT	2	6	538084	538089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612864
11487	NC_010102	GCCT	2	8	538123	538130	0 %	25 %	25 %	50 %	161612864
11488	NC_010102	ATC	2	6	538139	538144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612864
11489	NC_010102	AAT	2	6	538179	538184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612864
11490	NC_010102	TGC	2	6	538250	538255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612864
11491	NC_010102	CTT	2	6	538285	538290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612864
11492	NC_010102	GAGCC	2	10	538294	538303	20 %	0 %	40 %	40 %	161612864
11493	NC_010102	ATT	2	6	538339	538344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612864
11494	NC_010102	TCA	2	6	538362	538367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612864
11495	NC_010102	A	6	6	538411	538416	100 %	0 %	0 %	0 %	161612864
11496	NC_010102	A	6	6	538432	538437	100 %	0 %	0 %	0 %	161612864
11497	NC_010102	ACA	3	9	538497	538505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11498	NC_010102	TTA	2	6	538578	538583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11499	NC_010102	TAA	2	6	538652	538657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11500	NC_010102	CGA	2	6	538671	538676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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