MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 5098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010079	AC	3	6	261	266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010079	TG	3	6	334	339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010079	GT	3	6	471	476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010079	AG	3	6	880	885	50 %	0 %	50 %	0 %	161508267
5	NC_010079	TA	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	161508267
6	NC_010079	AG	3	6	1741	1746	50 %	0 %	50 %	0 %	161508267
7	NC_010079	TA	3	6	1934	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010079	AC	3	6	2034	2039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010079	TA	3	6	2143	2148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010079	TA	4	8	2151	2158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010079	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	161508268
12	NC_010079	AT	3	6	3669	3674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010079	AT	3	6	4256	4261	50 %	50 %	0 %	0 %	161508270
14	NC_010079	AG	4	8	5180	5187	50 %	0 %	50 %	0 %	161508271
15	NC_010079	TA	3	6	5501	5506	50 %	50 %	0 %	0 %	161508271
16	NC_010079	AG	3	6	5658	5663	50 %	0 %	50 %	0 %	161508271
17	NC_010079	AG	3	6	7494	7499	50 %	0 %	50 %	0 %	161508272
18	NC_010079	AG	4	8	8339	8346	50 %	0 %	50 %	0 %	161508272
19	NC_010079	AT	3	6	10648	10653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010079	AT	3	6	10916	10921	50 %	50 %	0 %	0 %	161508274
21	NC_010079	CT	3	6	11333	11338	0 %	50 %	0 %	50 %	161508274
22	NC_010079	TA	3	6	11541	11546	50 %	50 %	0 %	0 %	161508274
23	NC_010079	AT	3	6	12532	12537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010079	AG	3	6	12551	12556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010079	AT	4	8	12585	12592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010079	TA	3	6	13489	13494	50 %	50 %	0 %	0 %	161508275
27	NC_010079	TA	3	6	14126	14131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010079	TA	3	6	14714	14719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010079	TA	3	6	14892	14897	50 %	50 %	0 %	0 %	161508276
30	NC_010079	AT	3	6	15210	15215	50 %	50 %	0 %	0 %	161508276
31	NC_010079	AT	3	6	16339	16344	50 %	50 %	0 %	0 %	161508278
32	NC_010079	AT	4	8	17104	17111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010079	CA	3	6	17251	17256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010079	GT	3	6	18092	18097	0 %	50 %	50 %	0 %	161508279
35	NC_010079	AT	3	6	18985	18990	50 %	50 %	0 %	0 %	161508280
36	NC_010079	GT	3	6	19411	19416	0 %	50 %	50 %	0 %	161508280
37	NC_010079	AG	3	6	19527	19532	50 %	0 %	50 %	0 %	161508280
38	NC_010079	AT	4	8	19710	19717	50 %	50 %	0 %	0 %	161508280
39	NC_010079	AC	3	6	20737	20742	50 %	0 %	0 %	50 %	161508281
40	NC_010079	TC	3	6	21817	21822	0 %	50 %	0 %	50 %	161508282
41	NC_010079	AT	3	6	22259	22264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010079	CG	3	6	22554	22559	0 %	0 %	50 %	50 %	161508283
43	NC_010079	AG	3	6	23332	23337	50 %	0 %	50 %	0 %	161508283
44	NC_010079	TA	3	6	23754	23759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010079	AT	3	6	24393	24398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010079	AT	3	6	24748	24753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010079	TA	3	6	24799	24804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010079	AT	3	6	25602	25607	50 %	50 %	0 %	0 %	161508284
49	NC_010079	TA	3	6	26111	26116	50 %	50 %	0 %	0 %	161508285
50	NC_010079	AT	3	6	27553	27558	50 %	50 %	0 %	0 %	161508286
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53	NC_010079	AT	3	6	30784	30789	50 %	50 %	0 %	0 %	161508288
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61	NC_010079	AT	3	6	36458	36463	50 %	50 %	0 %	0 %	161508292
62	NC_010079	CA	3	6	36683	36688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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67	NC_010079	AT	3	6	38754	38759	50 %	50 %	0 %	0 %	161508295
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69	NC_010079	AT	3	6	41071	41076	50 %	50 %	0 %	0 %	161508296
70	NC_010079	TA	3	6	41146	41151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010079	TA	3	6	41311	41316	50 %	50 %	0 %	0 %	161508297
72	NC_010079	AT	3	6	41829	41834	50 %	50 %	0 %	0 %	161508297
73	NC_010079	TA	4	8	41930	41937	50 %	50 %	0 %	0 %	161508297
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90	NC_010079	TA	3	6	51335	51340	50 %	50 %	0 %	0 %	161508308
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102	NC_010079	CG	3	6	52977	52982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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108	NC_010079	TA	3	6	54809	54814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010079	TA	3	6	54936	54941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_010079	AT	3	6	56144	56149	50 %	50 %	0 %	0 %	161508310
112	NC_010079	TA	3	6	56420	56425	50 %	50 %	0 %	0 %	161508311
113	NC_010079	TG	3	6	56877	56882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_010079	AG	3	6	57313	57318	50 %	0 %	50 %	0 %	161508312
116	NC_010079	TA	4	8	58225	58232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010079	TA	3	6	58329	58334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010079	AT	3	6	58803	58808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010079	AT	3	6	58939	58944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010079	AT	3	6	58964	58969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010079	TA	3	6	59083	59088	50 %	50 %	0 %	0 %	161508314
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125	NC_010079	CT	3	6	62278	62283	0 %	50 %	0 %	50 %	161508319
126	NC_010079	TA	3	6	62590	62595	50 %	50 %	0 %	0 %	161508320
127	NC_010079	AT	3	6	63025	63030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_010079	TA	3	6	63158	63163	50 %	50 %	0 %	0 %	161508321
130	NC_010079	TA	3	6	63566	63571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010079	TA	3	6	63721	63726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010079	AT	3	6	63840	63845	50 %	50 %	0 %	0 %	161508322
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145	NC_010079	AT	3	6	71240	71245	50 %	50 %	0 %	0 %	161508332
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