MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 2522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010079	CAAAT	2	10	1472	1481	60 %	20 %	0 %	20 %	161508267
2	NC_010079	AATTT	2	10	2520	2529	40 %	60 %	0 %	0 %	161508268
3	NC_010079	CAATT	2	10	2586	2595	40 %	40 %	0 %	20 %	161508268
4	NC_010079	AAATT	2	10	2964	2973	60 %	40 %	0 %	0 %	161508268
5	NC_010079	CAAAT	2	10	5251	5260	60 %	20 %	0 %	20 %	161508271
6	NC_010079	TGAAT	2	10	6761	6770	40 %	40 %	20 %	0 %	161508271
7	NC_010079	TGAAC	2	10	7002	7011	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010079	TTCAA	2	10	7748	7757	40 %	40 %	0 %	20 %	161508272
9	NC_010079	GGTGT	2	10	10150	10159	0 %	40 %	60 %	0 %	161508273
10	NC_010079	ATCGC	2	10	10212	10221	20 %	20 %	20 %	40 %	161508273
11	NC_010079	CGTTG	2	10	11755	11764	0 %	40 %	40 %	20 %	161508274
12	NC_010079	AGGAA	2	10	14369	14378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010079	GTAGG	2	10	14429	14438	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010079	TTATT	2	10	15469	15478	20 %	80 %	0 %	0 %	161508277
15	NC_010079	GCAAG	2	10	16643	16652	40 %	0 %	40 %	20 %	161508278
16	NC_010079	TTTGA	2	10	16802	16811	20 %	60 %	20 %	0 %	161508278
17	NC_010079	AGTTA	2	10	22115	22124	40 %	40 %	20 %	0 %	161508282
18	NC_010079	ATGTA	2	10	23673	23682	40 %	40 %	20 %	0 %	161508283
19	NC_010079	TCGAT	2	10	23837	23846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010079	ATATT	2	10	24375	24384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010079	ACCAA	2	10	26284	26293	60 %	0 %	0 %	40 %	161508285
22	NC_010079	ATCAA	2	10	26996	27005	60 %	20 %	0 %	20 %	161508285
23	NC_010079	GAAAC	2	10	27617	27626	60 %	0 %	20 %	20 %	161508286
24	NC_010079	GAAGT	2	10	27767	27776	40 %	20 %	40 %	0 %	161508286
25	NC_010079	ATTAT	2	10	29410	29419	40 %	60 %	0 %	0 %	161508287
26	NC_010079	AAGGT	2	10	32503	32512	40 %	20 %	40 %	0 %	161508289
27	NC_010079	CATTA	2	10	33930	33939	40 %	40 %	0 %	20 %	161508290
28	NC_010079	TTTCA	2	10	34333	34342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010079	AAATG	2	10	35574	35583	60 %	20 %	20 %	0 %	161508291
30	NC_010079	ATTTT	2	10	35655	35664	20 %	80 %	0 %	0 %	161508291
31	NC_010079	TAAAA	2	10	35786	35795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010079	ATGAG	2	10	37660	37669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010079	TGAAT	2	10	38007	38016	40 %	40 %	20 %	0 %	161508294
34	NC_010079	TTGGT	2	10	38049	38058	0 %	60 %	40 %	0 %	161508294
35	NC_010079	AATAT	2	10	38117	38126	60 %	40 %	0 %	0 %	161508294
36	NC_010079	TTCGT	2	10	38328	38337	0 %	60 %	20 %	20 %	161508294
37	NC_010079	CAAAA	2	10	38688	38697	80 %	0 %	0 %	20 %	161508295
38	NC_010079	AAATT	2	10	40787	40796	60 %	40 %	0 %	0 %	161508296
39	NC_010079	TTGAA	2	10	42816	42825	40 %	40 %	20 %	0 %	161508299
40	NC_010079	TTGAA	2	10	43162	43171	40 %	40 %	20 %	0 %	161508299
41	NC_010079	TTTGT	2	10	44066	44075	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010079	TTTGA	2	10	47416	47425	20 %	60 %	20 %	0 %	161508304
43	NC_010079	GTTTT	2	10	47499	47508	0 %	80 %	20 %	0 %	161508304
44	NC_010079	GTTTG	2	10	48129	48138	0 %	60 %	40 %	0 %	161508305
45	NC_010079	TTGCT	2	10	48457	48466	0 %	60 %	20 %	20 %	161508305
46	NC_010079	TATTT	2	10	51951	51960	20 %	80 %	0 %	0 %	161508308
47	NC_010079	TATGT	2	10	55267	55276	20 %	60 %	20 %	0 %	161508310
48	NC_010079	GATTT	2	10	56588	56597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010079	AAAGA	2	10	57229	57238	80 %	0 %	20 %	0 %	161508312
50	NC_010079	TATAA	2	10	57897	57906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010079	ATGTA	2	10	58654	58663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010079	AAAAT	2	10	59446	59455	80 %	20 %	0 %	0 %	161508314
53	NC_010079	ACTAT	2	10	61510	61519	40 %	40 %	0 %	20 %	161508318
54	NC_010079	GATTT	2	10	61997	62006	20 %	60 %	20 %	0 %	161508319
55	NC_010079	TTTCA	2	10	62480	62489	20 %	60 %	0 %	20 %	161508319
56	NC_010079	AGCAA	2	10	64739	64748	60 %	0 %	20 %	20 %	161508323
57	NC_010079	CTTTA	2	10	65659	65668	20 %	60 %	0 %	20 %	161508325
58	NC_010079	AAAAC	2	10	67994	68003	80 %	0 %	0 %	20 %	161508329
59	NC_010079	AAATC	2	10	68403	68412	60 %	20 %	0 %	20 %	161508329
60	NC_010079	TTTTC	2	10	69041	69050	0 %	80 %	0 %	20 %	161508330
61	NC_010079	TAATC	2	10	71724	71733	40 %	40 %	0 %	20 %	161508333
62	NC_010079	CTTAT	2	10	74483	74492	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010079	TAAGA	2	10	74977	74986	60 %	20 %	20 %	0 %	161508335
64	NC_010079	AAATG	2	10	78129	78138	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010079	TAAGC	2	10	79019	79028	40 %	20 %	20 %	20 %	161508338
66	NC_010079	AATGA	2	10	79645	79654	60 %	20 %	20 %	0 %	161508339
67	NC_010079	GTAAA	2	10	80860	80869	60 %	20 %	20 %	0 %	161508340
68	NC_010079	TATGA	2	10	81318	81327	40 %	40 %	20 %	0 %	161508340
69	NC_010079	TGATT	2	10	81563	81572	20 %	60 %	20 %	0 %	161508340
70	NC_010079	AAAGT	2	10	88209	88218	60 %	20 %	20 %	0 %	161508346
71	NC_010079	TAGTA	2	10	90926	90935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010079	TTTTA	2	10	91142	91151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010079	TACTA	2	10	92104	92113	40 %	40 %	0 %	20 %	161508349
74	NC_010079	ATCAA	2	10	94857	94866	60 %	20 %	0 %	20 %	161508352
75	NC_010079	TAATA	2	10	96689	96698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010079	GTGTT	2	10	96772	96781	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010079	ATTTT	2	10	99298	99307	20 %	80 %	0 %	0 %	161508357
78	NC_010079	TATGG	2	10	101310	101319	20 %	40 %	40 %	0 %	161508359
79	NC_010079	TAACT	2	10	101615	101624	40 %	40 %	0 %	20 %	161508359
80	NC_010079	ATTGC	2	10	102887	102896	20 %	40 %	20 %	20 %	161508360
81	NC_010079	AGAAA	2	10	103807	103816	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010079	TAAAG	2	10	103848	103857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010079	ATTCA	2	10	104120	104129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010079	TATAT	2	10	104381	104390	40 %	60 %	0 %	0 %	161508362
85	NC_010079	CTAAA	2	10	106021	106030	60 %	20 %	0 %	20 %	161508363
86	NC_010079	CAAAA	2	10	106052	106061	80 %	0 %	0 %	20 %	161508363
87	NC_010079	TTACC	2	10	109168	109177	20 %	40 %	0 %	40 %	161508365
88	NC_010079	GATAT	2	10	110743	110752	40 %	40 %	20 %	0 %	161508366
89	NC_010079	TACTA	2	10	111279	111288	40 %	40 %	0 %	20 %	161508367
90	NC_010079	TTTAC	2	10	111688	111697	20 %	60 %	0 %	20 %	161508367
91	NC_010079	ATTGC	2	10	114171	114180	20 %	40 %	20 %	20 %	161508370
92	NC_010079	CATGG	2	10	115575	115584	20 %	20 %	40 %	20 %	161508370
93	NC_010079	TGAAA	2	10	116243	116252	60 %	20 %	20 %	0 %	161508371
94	NC_010079	TCAAT	2	10	116615	116624	40 %	40 %	0 %	20 %	161508371
95	NC_010079	GTATT	2	10	117104	117113	20 %	60 %	20 %	0 %	161508372
96	NC_010079	AGATA	2	10	122975	122984	60 %	20 %	20 %	0 %	161508375
97	NC_010079	TAAAA	2	10	123535	123544	80 %	20 %	0 %	0 %	161508375
98	NC_010079	AAAGA	2	10	125168	125177	80 %	0 %	20 %	0 %	161508376
99	NC_010079	GTAAT	2	10	125387	125396	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010079	CAATT	2	10	125819	125828	40 %	40 %	0 %	20 %	161508377
101	NC_010079	ATGTT	2	10	126653	126662	20 %	60 %	20 %	0 %	161508378
102	NC_010079	TTGCG	2	10	127224	127233	0 %	40 %	40 %	20 %	161508378
103	NC_010079	AGTTA	2	10	128712	128721	40 %	40 %	20 %	0 %	161508379
104	NC_010079	AGATG	2	10	132085	132094	40 %	20 %	40 %	0 %	161508381
105	NC_010079	GGTGA	2	10	132681	132690	20 %	20 %	60 %	0 %	161508382
106	NC_010079	GAAAA	2	10	136118	136127	80 %	0 %	20 %	0 %	161508385
107	NC_010079	TTATT	2	10	136285	136294	20 %	80 %	0 %	0 %	161508385
108	NC_010079	AATCA	2	10	139307	139316	60 %	20 %	0 %	20 %	161508387
109	NC_010079	GCACG	2	10	139711	139720	20 %	0 %	40 %	40 %	161508388
110	NC_010079	ATTTT	2	10	140005	140014	20 %	80 %	0 %	0 %	161508388
111	NC_010079	ATCAA	2	10	140032	140041	60 %	20 %	0 %	20 %	161508388
112	NC_010079	ATCAC	2	10	141265	141274	40 %	20 %	0 %	40 %	161508389
113	NC_010079	AACGA	2	10	141942	141951	60 %	0 %	20 %	20 %	161508389
114	NC_010079	ACACA	2	10	143998	144007	60 %	0 %	0 %	40 %	161508391
115	NC_010079	GACAA	2	10	145149	145158	60 %	0 %	20 %	20 %	161508392
116	NC_010079	ATTAC	2	10	147790	147799	40 %	40 %	0 %	20 %	161508395
117	NC_010079	ATTTT	2	10	148094	148103	20 %	80 %	0 %	0 %	161508396
118	NC_010079	TATCT	2	10	148450	148459	20 %	60 %	0 %	20 %	161508397
119	NC_010079	ATACG	2	10	150883	150892	40 %	20 %	20 %	20 %	161508399
120	NC_010079	TTATA	2	10	151541	151550	40 %	60 %	0 %	0 %	161508400
121	NC_010079	TTTTA	2	10	152339	152348	20 %	80 %	0 %	0 %	161508400
122	NC_010079	GTATT	2	10	152852	152861	20 %	60 %	20 %	0 %	161508401
123	NC_010079	AATAA	2	10	153445	153454	80 %	20 %	0 %	0 %	161508401
124	NC_010079	TACGC	2	10	153712	153721	20 %	20 %	20 %	40 %	161508401
125	NC_010079	GACAA	2	10	155054	155063	60 %	0 %	20 %	20 %	161508403
126	NC_010079	TCCCT	2	10	156520	156529	0 %	40 %	0 %	60 %	161508404
127	NC_010079	GCTTT	2	10	158754	158763	0 %	60 %	20 %	20 %	161508406
128	NC_010079	TAATT	2	10	158839	158848	40 %	60 %	0 %	0 %	161508406
129	NC_010079	ATACT	2	10	160020	160029	40 %	40 %	0 %	20 %	161508408
130	NC_010079	TAATA	2	10	161186	161195	60 %	40 %	0 %	0 %	161508409
131	NC_010079	ATTTT	2	10	162177	162186	20 %	80 %	0 %	0 %	161508410
132	NC_010079	TTGTA	2	10	164401	164410	20 %	60 %	20 %	0 %	161508412
133	NC_010079	TGCAA	2	10	165406	165415	40 %	20 %	20 %	20 %	161508413
134	NC_010079	ATATG	2	10	167424	167433	40 %	40 %	20 %	0 %	161508414
135	NC_010079	AATAT	2	10	168292	168301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010079	ATTTT	2	10	169681	169690	20 %	80 %	0 %	0 %	161508415
137	NC_010079	GATTT	2	10	169735	169744	20 %	60 %	20 %	0 %	161508415
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