MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010079	AAAT	2	8	159032	159039	75 %	25 %	0 %	0 %	161508406
4002	NC_010079	AT	3	6	159057	159062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_010079	TAAA	2	8	159081	159088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_010079	TA	3	6	159094	159099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_010079	GAG	2	6	159104	159109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_010079	AGTA	2	8	159111	159118	50 %	25 %	25 %	0 %	161508407
4007	NC_010079	AT	3	6	159132	159137	50 %	50 %	0 %	0 %	161508407
4008	NC_010079	ATC	2	6	159187	159192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508407
4009	NC_010079	TG	3	6	159226	159231	0 %	50 %	50 %	0 %	161508407
4010	NC_010079	GCA	2	6	159253	159258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508407
4011	NC_010079	AGA	2	6	159348	159353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508407
4012	NC_010079	TCA	2	6	159389	159394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508407
4013	NC_010079	TGA	2	6	159423	159428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508407
4014	NC_010079	ACA	2	6	159432	159437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508407
4015	NC_010079	CA	3	6	159472	159477	50 %	0 %	0 %	50 %	161508407
4016	NC_010079	ATT	2	6	159487	159492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508407
4017	NC_010079	TTG	2	6	159502	159507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508407
4018	NC_010079	AGA	2	6	159606	159611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508407
4019	NC_010079	CGTA	2	8	159669	159676	25 %	25 %	25 %	25 %	161508407
4020	NC_010079	AGA	2	6	159681	159686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508407
4021	NC_010079	CAGATT	2	12	159764	159775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161508407
4022	NC_010079	AT	4	8	159780	159787	50 %	50 %	0 %	0 %	161508407
4023	NC_010079	AGT	2	6	159990	159995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508408
4024	NC_010079	AAC	2	6	160007	160012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508408
4025	NC_010079	ATACT	2	10	160020	160029	40 %	40 %	0 %	20 %	161508408
4026	NC_010079	CAA	2	6	160147	160152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508408
4027	NC_010079	GAA	2	6	160156	160161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508408
4028	NC_010079	GTT	2	6	160177	160182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508408
4029	NC_010079	TGC	2	6	160290	160295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508408
4030	NC_010079	AGA	2	6	160317	160322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508408
4031	NC_010079	TAT	2	6	160386	160391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508408
4032	NC_010079	GGT	2	6	160498	160503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508408
4033	NC_010079	ATG	2	6	160505	160510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508408
4034	NC_010079	ATG	2	6	160541	160546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508408
4035	NC_010079	TGA	2	6	160604	160609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508408
4036	NC_010079	AAGA	2	8	160618	160625	75 %	0 %	25 %	0 %	161508408
4037	NC_010079	CTT	2	6	160641	160646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508408
4038	NC_010079	TAG	2	6	160652	160657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508408
4039	NC_010079	TCG	2	6	160680	160685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508408
4040	NC_010079	GAT	2	6	160723	160728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508408
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4042	NC_010079	ATT	2	6	160774	160779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508408
4043	NC_010079	CAG	2	6	160781	160786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508408
4044	NC_010079	GA	3	6	160827	160832	50 %	0 %	50 %	0 %	161508408
4045	NC_010079	AT	3	6	160833	160838	50 %	50 %	0 %	0 %	161508408
4046	NC_010079	GGT	2	6	160870	160875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508408
4047	NC_010079	TAC	2	6	160893	160898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508408
4048	NC_010079	CAG	2	6	161010	161015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_010079	CTG	2	6	161046	161051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_010079	TAT	2	6	161056	161061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_010079	CTT	2	6	161087	161092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_010079	TAATA	2	10	161186	161195	60 %	40 %	0 %	0 %	161508409
4053	NC_010079	GTG	2	6	161236	161241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508409
4054	NC_010079	ACC	2	6	161249	161254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161508409
4055	NC_010079	AGGC	2	8	161326	161333	25 %	0 %	50 %	25 %	161508409
4056	NC_010079	CAC	2	6	161380	161385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161508409
4057	NC_010079	AAAT	2	8	161566	161573	75 %	25 %	0 %	0 %	161508409
4058	NC_010079	ATT	2	6	161609	161614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508409
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4062	NC_010079	AAT	2	6	161751	161756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508409
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4066	NC_010079	TG	3	6	161897	161902	0 %	50 %	50 %	0 %	161508409
4067	NC_010079	GAC	3	9	161971	161979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508410
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4082	NC_010079	CAT	2	6	162817	162822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508411
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4086	NC_010079	ATC	2	6	162938	162943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508411
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4093	NC_010079	TAA	2	6	163364	163369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508411
4094	NC_010079	CTTT	2	8	163514	163521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_010079	AT	3	6	163654	163659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_010079	ATT	2	6	163717	163722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508412
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4101	NC_010079	GT	3	6	163948	163953	0 %	50 %	50 %	0 %	161508412
4102	NC_010079	TGGT	2	8	163967	163974	0 %	50 %	50 %	0 %	161508412
4103	NC_010079	T	6	6	163976	163981	0 %	100 %	0 %	0 %	161508412
4104	NC_010079	GCA	2	6	164013	164018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508412
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4106	NC_010079	T	6	6	164112	164117	0 %	100 %	0 %	0 %	161508412
4107	NC_010079	CAG	2	6	164143	164148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508412
4108	NC_010079	T	6	6	164216	164221	0 %	100 %	0 %	0 %	161508412
4109	NC_010079	TCT	2	6	164274	164279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508412
4110	NC_010079	TAA	3	9	164303	164311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508412
4111	NC_010079	GCT	2	6	164316	164321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508412
4112	NC_010079	TGG	2	6	164351	164356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508412
4113	NC_010079	T	6	6	164375	164380	0 %	100 %	0 %	0 %	161508412
4114	NC_010079	CAA	2	6	164395	164400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508412
4115	NC_010079	TTGTA	2	10	164401	164410	20 %	60 %	20 %	0 %	161508412
4116	NC_010079	TCC	2	6	164546	164551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161508412
4117	NC_010079	TGC	3	9	164615	164623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508412
4118	NC_010079	TAA	2	6	164784	164789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_010079	CTTT	2	8	164790	164797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_010079	ATTT	2	8	164877	164884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_010079	A	7	7	164906	164912	100 %	0 %	0 %	0 %	161508413
4122	NC_010079	TA	3	6	164913	164918	50 %	50 %	0 %	0 %	161508413
4123	NC_010079	TTG	2	6	164940	164945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508413
4124	NC_010079	TAT	2	6	165024	165029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508413
4125	NC_010079	TGC	2	6	165058	165063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508413
4126	NC_010079	GCA	2	6	165233	165238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508413
4127	NC_010079	TGT	2	6	165268	165273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508413
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4131	NC_010079	TGCAA	2	10	165406	165415	40 %	20 %	20 %	20 %	161508413
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4145	NC_010079	GAT	2	6	166094	166099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508413
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4151	NC_010079	AT	3	6	166448	166453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_010079	AAGA	2	8	166463	166470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_010079	GAGT	2	8	166486	166493	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_010079	GTGA	2	8	166522	166529	25 %	25 %	50 %	0 %	161508414
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4157	NC_010079	AT	4	8	166850	166857	50 %	50 %	0 %	0 %	161508414
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4162	NC_010079	AGATAT	2	12	167163	167174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161508414
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4192	NC_010079	ATT	2	6	168205	168210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4193	NC_010079	TGA	2	6	168218	168223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4196	NC_010079	TA	3	6	168310	168315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4236	NC_010079	T	6	6	169887	169892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_010079	GGGGC	2	10	169957	169966	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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4239	NC_010079	AAAT	2	8	170029	170036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4243	NC_010079	GAG	2	6	170151	170156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4246	NC_010079	AT	3	6	170254	170259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_010079	A	7	7	170268	170274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_010079	GAAA	2	8	170305	170312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_010079	GTTA	2	8	170361	170368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_010079	ACC	2	6	170373	170378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4251	NC_010079	ATC	2	6	170391	170396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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