MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010079	ATT	2	6	60676	60681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508316
1502	NC_010079	AAGT	2	8	60692	60699	50 %	25 %	25 %	0 %	161508316
1503	NC_010079	A	6	6	60747	60752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010079	TAA	2	6	60771	60776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010079	AT	3	6	60781	60786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010079	T	7	7	60797	60803	0 %	100 %	0 %	0 %	161508317
1507	NC_010079	AT	3	6	60837	60842	50 %	50 %	0 %	0 %	161508317
1508	NC_010079	ATA	2	6	60867	60872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508317
1509	NC_010079	TAA	2	6	60874	60879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508317
1510	NC_010079	TAA	2	6	60899	60904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508317
1511	NC_010079	TGA	2	6	60906	60911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508317
1512	NC_010079	CTT	2	6	60931	60936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508317
1513	NC_010079	A	6	6	60940	60945	100 %	0 %	0 %	0 %	161508317
1514	NC_010079	A	7	7	60965	60971	100 %	0 %	0 %	0 %	161508317
1515	NC_010079	ATA	2	6	60984	60989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508317
1516	NC_010079	AATG	2	8	60995	61002	50 %	25 %	25 %	0 %	161508317
1517	NC_010079	T	6	6	61004	61009	0 %	100 %	0 %	0 %	161508317
1518	NC_010079	TCA	2	6	61029	61034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508317
1519	NC_010079	T	6	6	61154	61159	0 %	100 %	0 %	0 %	161508317
1520	NC_010079	CTT	2	6	61163	61168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_010079	TAT	2	6	61182	61187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010079	ACA	2	6	61211	61216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_010079	TGT	2	6	61250	61255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010079	AAGA	2	8	61274	61281	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010079	TAT	2	6	61294	61299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010079	ATAACT	2	12	61427	61438	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161508318
1527	NC_010079	ATA	3	9	61478	61486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508318
1528	NC_010079	TAA	2	6	61502	61507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508318
1529	NC_010079	ACTAT	2	10	61510	61519	40 %	40 %	0 %	20 %	161508318
1530	NC_010079	ATT	2	6	61604	61609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_010079	A	7	7	61615	61621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010079	TAA	2	6	61665	61670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010079	GCT	2	6	61687	61692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_010079	TTG	2	6	61731	61736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508319
1535	NC_010079	ATT	3	9	61743	61751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508319
1536	NC_010079	TTA	2	6	61800	61805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508319
1537	NC_010079	ATT	2	6	61811	61816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508319
1538	NC_010079	TTC	2	6	61916	61921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508319
1539	NC_010079	ATA	2	6	61931	61936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508319
1540	NC_010079	GATTT	2	10	61997	62006	20 %	60 %	20 %	0 %	161508319
1541	NC_010079	ATC	2	6	62039	62044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508319
1542	NC_010079	ACA	2	6	62098	62103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508319
1543	NC_010079	GTT	2	6	62136	62141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508319
1544	NC_010079	TAA	2	6	62180	62185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508319
1545	NC_010079	GTC	2	6	62220	62225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508319
1546	NC_010079	ATG	2	6	62252	62257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508319
1547	NC_010079	CT	3	6	62269	62274	0 %	50 %	0 %	50 %	161508319
1548	NC_010079	CT	3	6	62278	62283	0 %	50 %	0 %	50 %	161508319
1549	NC_010079	TGT	2	6	62364	62369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508319
1550	NC_010079	CCA	2	6	62405	62410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161508319
1551	NC_010079	TTG	2	6	62461	62466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508319
1552	NC_010079	CTG	2	6	62473	62478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508319
1553	NC_010079	TTTCA	2	10	62480	62489	20 %	60 %	0 %	20 %	161508319
1554	NC_010079	AAG	2	6	62518	62523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508319
1555	NC_010079	A	8	8	62536	62543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010079	TA	3	6	62590	62595	50 %	50 %	0 %	0 %	161508320
1557	NC_010079	TAAAAT	2	12	62618	62629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508320
1558	NC_010079	T	6	6	62637	62642	0 %	100 %	0 %	0 %	161508320
1559	NC_010079	A	7	7	62676	62682	100 %	0 %	0 %	0 %	161508320
1560	NC_010079	ATT	2	6	62687	62692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508320
1561	NC_010079	AAC	2	6	62695	62700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508320
1562	NC_010079	TAC	2	6	62713	62718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508320
1563	NC_010079	A	6	6	62719	62724	100 %	0 %	0 %	0 %	161508320
1564	NC_010079	TAT	2	6	62750	62755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010079	AAAT	2	8	62775	62782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010079	TTG	2	6	62823	62828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010079	GATA	2	8	62851	62858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010079	TAA	2	6	62864	62869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010079	TTA	2	6	62884	62889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010079	GTT	2	6	62896	62901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010079	TCA	2	6	62908	62913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_010079	TTA	2	6	62987	62992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010079	ACCT	2	8	63011	63018	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_010079	AT	3	6	63025	63030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_010079	TAC	2	6	63044	63049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508321
1576	NC_010079	AT	3	6	63053	63058	50 %	50 %	0 %	0 %	161508321
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1578	NC_010079	TA	3	6	63158	63163	50 %	50 %	0 %	0 %	161508321
1579	NC_010079	T	6	6	63172	63177	0 %	100 %	0 %	0 %	161508321
1580	NC_010079	ATAG	2	8	63195	63202	50 %	25 %	25 %	0 %	161508321
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1582	NC_010079	GATG	2	8	63318	63325	25 %	25 %	50 %	0 %	161508321
1583	NC_010079	TAAT	2	8	63326	63333	50 %	50 %	0 %	0 %	161508321
1584	NC_010079	CTA	2	6	63336	63341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508321
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1586	NC_010079	CAA	2	6	63375	63380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508321
1587	NC_010079	TAA	2	6	63403	63408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508321
1588	NC_010079	AAAT	2	8	63418	63425	75 %	25 %	0 %	0 %	161508321
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1591	NC_010079	TA	3	6	63566	63571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010079	TATAAA	2	12	63579	63590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_010079	ATT	2	6	63604	63609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010079	TTA	2	6	63662	63667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010079	TTA	2	6	63686	63691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_010079	TA	3	6	63721	63726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010079	GATA	2	8	63738	63745	50 %	25 %	25 %	0 %	161508322
1598	NC_010079	TAA	2	6	63751	63756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508322
1599	NC_010079	TAAG	2	8	63775	63782	50 %	25 %	25 %	0 %	161508322
1600	NC_010079	CGT	2	6	63793	63798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508322
1601	NC_010079	AT	3	6	63840	63845	50 %	50 %	0 %	0 %	161508322
1602	NC_010079	T	6	6	63845	63850	0 %	100 %	0 %	0 %	161508322
1603	NC_010079	ATA	2	6	63908	63913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010079	TAT	2	6	63930	63935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010079	AAT	2	6	63940	63945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010079	AAT	2	6	63949	63954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010079	T	6	6	63960	63965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_010079	ATA	3	9	63970	63978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_010079	TA	3	6	64016	64021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010079	AGC	2	6	64052	64057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_010079	ATTA	2	8	64154	64161	50 %	50 %	0 %	0 %	161508323
1612	NC_010079	TAAT	2	8	64201	64208	50 %	50 %	0 %	0 %	161508323
1613	NC_010079	AGACCT	2	12	64215	64226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161508323
1614	NC_010079	AAG	2	6	64357	64362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508323
1615	NC_010079	AGGG	2	8	64420	64427	25 %	0 %	75 %	0 %	161508323
1616	NC_010079	ATG	2	6	64441	64446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508323
1617	NC_010079	ATC	2	6	64459	64464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508323
1618	NC_010079	TGT	2	6	64496	64501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508323
1619	NC_010079	A	7	7	64530	64536	100 %	0 %	0 %	0 %	161508323
1620	NC_010079	TAT	2	6	64571	64576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508323
1621	NC_010079	GTA	2	6	64621	64626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508323
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1624	NC_010079	TAT	2	6	64667	64672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508323
1625	NC_010079	ATT	2	6	64701	64706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508323
1626	NC_010079	AGCAA	2	10	64739	64748	60 %	0 %	20 %	20 %	161508323
1627	NC_010079	AT	3	6	64808	64813	50 %	50 %	0 %	0 %	161508323
1628	NC_010079	G	6	6	64893	64898	0 %	0 %	100 %	0 %	161508323
1629	NC_010079	AAC	2	6	64907	64912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508323
1630	NC_010079	TTTC	2	8	64939	64946	0 %	75 %	0 %	25 %	161508323
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