MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_010079	GCA	2	6	42079	42084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508297
1003	NC_010079	TTG	2	6	42179	42184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508297
1004	NC_010079	TGTA	2	8	42192	42199	25 %	50 %	25 %	0 %	161508297
1005	NC_010079	AAG	2	6	42228	42233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508298
1006	NC_010079	GCTAAA	2	12	42326	42337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161508298
1007	NC_010079	CCA	2	6	42380	42385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161508298
1008	NC_010079	A	6	6	42393	42398	100 %	0 %	0 %	0 %	161508298
1009	NC_010079	AGCA	2	8	42420	42427	50 %	0 %	25 %	25 %	161508298
1010	NC_010079	A	7	7	42450	42456	100 %	0 %	0 %	0 %	161508298
1011	NC_010079	A	6	6	42499	42504	100 %	0 %	0 %	0 %	161508299
1012	NC_010079	ATA	2	6	42521	42526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508299
1013	NC_010079	T	6	6	42538	42543	0 %	100 %	0 %	0 %	161508299
1014	NC_010079	T	6	6	42549	42554	0 %	100 %	0 %	0 %	161508299
1015	NC_010079	ATT	2	6	42556	42561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508299
1016	NC_010079	CTA	2	6	42576	42581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508299
1017	NC_010079	GACA	2	8	42646	42653	50 %	0 %	25 %	25 %	161508299
1018	NC_010079	T	6	6	42728	42733	0 %	100 %	0 %	0 %	161508299
1019	NC_010079	TTC	2	6	42791	42796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508299
1020	NC_010079	ATT	2	6	42797	42802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508299
1021	NC_010079	T	7	7	42801	42807	0 %	100 %	0 %	0 %	161508299
1022	NC_010079	GTTT	2	8	42808	42815	0 %	75 %	25 %	0 %	161508299
1023	NC_010079	TTGAA	2	10	42816	42825	40 %	40 %	20 %	0 %	161508299
1024	NC_010079	ATC	2	6	42862	42867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508299
1025	NC_010079	TAT	2	6	42945	42950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508299
1026	NC_010079	T	6	6	43021	43026	0 %	100 %	0 %	0 %	161508299
1027	NC_010079	AT	3	6	43133	43138	50 %	50 %	0 %	0 %	161508299
1028	NC_010079	TTGAA	2	10	43162	43171	40 %	40 %	20 %	0 %	161508299
1029	NC_010079	ATC	2	6	43184	43189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508299
1030	NC_010079	TTG	2	6	43245	43250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508299
1031	NC_010079	TCT	2	6	43298	43303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508299
1032	NC_010079	CAT	2	6	43323	43328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508299
1033	NC_010079	AAT	2	6	43401	43406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508299
1034	NC_010079	T	6	6	43426	43431	0 %	100 %	0 %	0 %	161508299
1035	NC_010079	TTG	2	6	43484	43489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508299
1036	NC_010079	TCT	2	6	43547	43552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508299
1037	NC_010079	TCT	2	6	43574	43579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508299
1038	NC_010079	TCAT	2	8	43637	43644	25 %	50 %	0 %	25 %	161508299
1039	NC_010079	ATC	2	6	43738	43743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508299
1040	NC_010079	AC	3	6	43760	43765	50 %	0 %	0 %	50 %	161508299
1041	NC_010079	AATA	2	8	43780	43787	75 %	25 %	0 %	0 %	161508299
1042	NC_010079	TAA	2	6	43795	43800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508299
1043	NC_010079	AAG	2	6	43845	43850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508299
1044	NC_010079	CAT	2	6	43873	43878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508299
1045	NC_010079	T	6	6	43899	43904	0 %	100 %	0 %	0 %	161508299
1046	NC_010079	TG	3	6	43931	43936	0 %	50 %	50 %	0 %	161508299
1047	NC_010079	CAT	2	6	43960	43965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508299
1048	NC_010079	CAC	2	6	43986	43991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_010079	TCG	2	6	44006	44011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010079	CAA	2	6	44034	44039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_010079	TTTGT	2	10	44066	44075	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010079	TGA	2	6	44172	44177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508300
1053	NC_010079	T	6	6	44180	44185	0 %	100 %	0 %	0 %	161508300
1054	NC_010079	CTTT	2	8	44187	44194	0 %	75 %	0 %	25 %	161508300
1055	NC_010079	AAC	2	6	44239	44244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508300
1056	NC_010079	TCA	2	6	44304	44309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508300
1057	NC_010079	ATA	2	6	44463	44468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508300
1058	NC_010079	TGCA	2	8	44502	44509	25 %	25 %	25 %	25 %	161508300
1059	NC_010079	CTTT	2	8	44511	44518	0 %	75 %	0 %	25 %	161508300
1060	NC_010079	TCA	2	6	44555	44560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508300
1061	NC_010079	TG	3	6	44578	44583	0 %	50 %	50 %	0 %	161508300
1062	NC_010079	TCA	2	6	44604	44609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508300
1063	NC_010079	TTC	2	6	44628	44633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508301
1064	NC_010079	ATA	2	6	44649	44654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508301
1065	NC_010079	T	7	7	44713	44719	0 %	100 %	0 %	0 %	161508301
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1068	NC_010079	TCT	2	6	44794	44799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508301
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1078	NC_010079	GATA	2	8	45166	45173	50 %	25 %	25 %	0 %	161508303
1079	NC_010079	TCA	2	6	45189	45194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508303
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1083	NC_010079	TCC	2	6	45279	45284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161508303
1084	NC_010079	TTA	2	6	45309	45314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508303
1085	NC_010079	TA	3	6	45335	45340	50 %	50 %	0 %	0 %	161508303
1086	NC_010079	ATT	2	6	45371	45376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_010079	CAT	2	6	45414	45419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010079	ATA	2	6	45424	45429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010079	TA	3	6	45428	45433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_010079	TTA	2	6	45447	45452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_010079	ATT	2	6	45559	45564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010079	TGA	2	6	45574	45579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010079	TA	4	8	45602	45609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010079	TTAT	3	12	45610	45621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010079	TTC	2	6	45667	45672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_010079	A	6	6	45702	45707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010079	A	6	6	45759	45764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010079	ATT	2	6	45864	45869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010079	TCG	2	6	45950	45955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508304
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1103	NC_010079	TAT	2	6	45963	45968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508304
1104	NC_010079	GTT	2	6	45975	45980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508304
1105	NC_010079	TTA	2	6	45992	45997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508304
1106	NC_010079	T	6	6	46021	46026	0 %	100 %	0 %	0 %	161508304
1107	NC_010079	T	6	6	46039	46044	0 %	100 %	0 %	0 %	161508304
1108	NC_010079	ATCA	2	8	46057	46064	50 %	25 %	0 %	25 %	161508304
1109	NC_010079	GATA	2	8	46067	46074	50 %	25 %	25 %	0 %	161508304
1110	NC_010079	TGT	2	6	46124	46129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508304
1111	NC_010079	TTG	2	6	46177	46182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508304
1112	NC_010079	GTTG	2	8	46191	46198	0 %	50 %	50 %	0 %	161508304
1113	NC_010079	TTAT	2	8	46298	46305	25 %	75 %	0 %	0 %	161508304
1114	NC_010079	TCA	2	6	46319	46324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508304
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1116	NC_010079	TGA	2	6	46352	46357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508304
1117	NC_010079	TTGA	2	8	46384	46391	25 %	50 %	25 %	0 %	161508304
1118	NC_010079	GT	3	6	46393	46398	0 %	50 %	50 %	0 %	161508304
1119	NC_010079	TAC	2	6	46399	46404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508304
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1121	NC_010079	TAC	2	6	46524	46529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508304
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1123	NC_010079	AAT	2	6	46621	46626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508304
1124	NC_010079	TGAC	2	8	46670	46677	25 %	25 %	25 %	25 %	161508304
1125	NC_010079	TAA	2	6	46719	46724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508304
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1127	NC_010079	ATGT	2	8	46844	46851	25 %	50 %	25 %	0 %	161508304
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1129	NC_010079	ATA	2	6	47050	47055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508304
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