MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010079	AAG	2	6	20364	20369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508281
502	NC_010079	CTT	2	6	20392	20397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508281
503	NC_010079	A	6	6	20459	20464	100 %	0 %	0 %	0 %	161508281
504	NC_010079	CAA	2	6	20483	20488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508281
505	NC_010079	TTGAAG	2	12	20532	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508281
506	NC_010079	GGT	2	6	20564	20569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508281
507	NC_010079	AGTA	2	8	20584	20591	50 %	25 %	25 %	0 %	161508281
508	NC_010079	ATTC	2	8	20669	20676	25 %	50 %	0 %	25 %	161508281
509	NC_010079	AAG	2	6	20712	20717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508281
510	NC_010079	AC	3	6	20737	20742	50 %	0 %	0 %	50 %	161508281
511	NC_010079	GTCT	2	8	20840	20847	0 %	50 %	25 %	25 %	161508282
512	NC_010079	ATT	2	6	20856	20861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508282
513	NC_010079	TAC	2	6	20882	20887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508282
514	NC_010079	ATG	2	6	20949	20954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
515	NC_010079	ATA	2	6	20968	20973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508282
516	NC_010079	TGT	2	6	20984	20989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508282
517	NC_010079	TGAA	2	8	21025	21032	50 %	25 %	25 %	0 %	161508282
518	NC_010079	ACG	2	6	21078	21083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508282
519	NC_010079	TAT	2	6	21096	21101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508282
520	NC_010079	GCAT	2	8	21119	21126	25 %	25 %	25 %	25 %	161508282
521	NC_010079	GATT	2	8	21136	21143	25 %	50 %	25 %	0 %	161508282
522	NC_010079	ATG	2	6	21166	21171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
523	NC_010079	ATG	2	6	21178	21183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
524	NC_010079	ATC	2	6	21236	21241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508282
525	NC_010079	CAG	2	6	21376	21381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508282
526	NC_010079	GGTA	2	8	21626	21633	25 %	25 %	50 %	0 %	161508282
527	NC_010079	TGA	2	6	21659	21664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
528	NC_010079	GTC	2	6	21703	21708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508282
529	NC_010079	TGATTG	2	12	21736	21747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	161508282
530	NC_010079	ACT	2	6	21748	21753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508282
531	NC_010079	ACA	2	6	21797	21802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508282
532	NC_010079	TC	3	6	21817	21822	0 %	50 %	0 %	50 %	161508282
533	NC_010079	GTG	2	6	21886	21891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508282
534	NC_010079	AAC	2	6	21895	21900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508282
535	NC_010079	ATG	2	6	21918	21923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
536	NC_010079	TGA	2	6	21986	21991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
537	NC_010079	GGC	2	6	22005	22010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161508282
538	NC_010079	GAT	2	6	22017	22022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
539	NC_010079	GAT	2	6	22026	22031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
540	NC_010079	GGT	2	6	22032	22037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508282
541	NC_010079	ATG	2	6	22054	22059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
542	NC_010079	TGAAAT	2	12	22067	22078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161508282
543	NC_010079	AGTTA	2	10	22115	22124	40 %	40 %	20 %	0 %	161508282
544	NC_010079	ATA	2	6	22141	22146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508282
545	NC_010079	ATG	2	6	22179	22184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508282
546	NC_010079	A	6	6	22186	22191	100 %	0 %	0 %	0 %	161508282
547	NC_010079	AAT	2	6	22204	22209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010079	GAT	2	6	22216	22221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010079	AT	3	6	22259	22264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010079	TCA	2	6	22468	22473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508283
551	NC_010079	GTA	2	6	22477	22482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508283
552	NC_010079	AAGGAA	2	12	22505	22516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508283
553	NC_010079	CG	3	6	22554	22559	0 %	0 %	50 %	50 %	161508283
554	NC_010079	GGT	2	6	22567	22572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508283
555	NC_010079	AAT	2	6	22573	22578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508283
556	NC_010079	GTT	2	6	22681	22686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508283
557	NC_010079	GAA	2	6	22810	22815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508283
558	NC_010079	GTG	2	6	22823	22828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508283
559	NC_010079	A	6	6	22849	22854	100 %	0 %	0 %	0 %	161508283
560	NC_010079	ATT	2	6	22938	22943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508283
561	NC_010079	CAT	2	6	23003	23008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508283
562	NC_010079	TGA	2	6	23010	23015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508283
563	NC_010079	GAA	2	6	23023	23028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508283
564	NC_010079	TAT	2	6	23029	23034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508283
565	NC_010079	GCA	2	6	23035	23040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508283
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567	NC_010079	CAT	2	6	23323	23328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508283
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572	NC_010079	TCG	2	6	23415	23420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508283
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575	NC_010079	ATGTA	2	10	23673	23682	40 %	40 %	20 %	0 %	161508283
576	NC_010079	TCT	2	6	23693	23698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508283
577	NC_010079	AACA	2	8	23717	23724	75 %	0 %	0 %	25 %	161508283
578	NC_010079	TA	3	6	23754	23759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010079	AGG	2	6	23808	23813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010079	TGCT	2	8	23823	23830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_010079	TCGAT	2	10	23837	23846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
582	NC_010079	A	6	6	23856	23861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010079	AGA	2	6	23898	23903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010079	GAT	2	6	23907	23912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010079	AAG	2	6	23947	23952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010079	ATT	2	6	24039	24044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010079	TTC	2	6	24090	24095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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589	NC_010079	A	6	6	24119	24124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010079	ATCT	2	8	24157	24164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_010079	CGG	2	6	24215	24220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_010079	T	6	6	24253	24258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010079	GCCT	2	8	24285	24292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_010079	T	7	7	24361	24367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010079	ATATT	2	10	24375	24384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010079	AT	3	6	24393	24398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010079	TTA	2	6	24510	24515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010079	TTC	2	6	24547	24552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_010079	CCA	2	6	24564	24569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_010079	TCC	2	6	24571	24576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_010079	AAT	2	6	24608	24613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010079	ATTT	2	8	24617	24624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010079	TAT	2	6	24669	24674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010079	TCA	2	6	24688	24693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_010079	CCG	2	6	24719	24724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_010079	TAA	2	6	24733	24738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_010079	AT	3	6	24748	24753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010079	TA	3	6	24799	24804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010079	T	6	6	24873	24878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010079	A	6	6	24903	24908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010079	ATA	2	6	24916	24921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010079	GTT	2	6	24964	24969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508284
614	NC_010079	TGA	3	9	24975	24983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508284
615	NC_010079	A	7	7	25017	25023	100 %	0 %	0 %	0 %	161508284
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617	NC_010079	GAA	3	9	25081	25089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508284
618	NC_010079	A	6	6	25159	25164	100 %	0 %	0 %	0 %	161508284
619	NC_010079	AAT	3	9	25176	25184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508284
620	NC_010079	CGT	2	6	25303	25308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508284
621	NC_010079	A	6	6	25399	25404	100 %	0 %	0 %	0 %	161508284
622	NC_010079	TGAATT	2	12	25434	25445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161508284
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628	NC_010079	AT	3	6	25602	25607	50 %	50 %	0 %	0 %	161508284
629	NC_010079	TCC	2	6	25634	25639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161508284
630	NC_010079	AAC	2	6	25640	25645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508284
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