MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010079	TTGTT	2	10	222961	222970	0 %	80 %	20 %	0 %	161508454
5502	NC_010079	CGA	2	6	222985	222990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508454
5503	NC_010079	TGC	2	6	222992	222997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508454
5504	NC_010079	GCT	2	6	223002	223007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508454
5505	NC_010079	ACC	2	6	223079	223084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161508454
5506	NC_010079	CCA	2	6	223119	223124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161508454
5507	NC_010079	AGT	2	6	223141	223146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508454
5508	NC_010079	TAA	2	6	223184	223189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508454
5509	NC_010079	GCT	2	6	223197	223202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508454
5510	NC_010079	TTC	2	6	223263	223268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161508454
5511	NC_010079	TATT	2	8	223294	223301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_010079	A	7	7	223316	223322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_010079	CTTA	2	8	223382	223389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_010079	TAAT	2	8	223408	223415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_010079	AAG	2	6	223420	223425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_010079	AGT	2	6	223436	223441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_010079	TTTG	2	8	223498	223505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_010079	ATT	2	6	223548	223553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_010079	ATT	3	9	223587	223595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_010079	ATA	2	6	223601	223606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_010079	TAA	2	6	223643	223648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_010079	CAG	2	6	223651	223656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_010079	AGC	2	6	223658	223663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_010079	TAT	2	6	223664	223669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_010079	AAAG	2	8	223679	223686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_010079	TAA	2	6	223704	223709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_010079	ATT	2	6	223735	223740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_010079	CAACT	2	10	223811	223820	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5529	NC_010079	TAA	2	6	223830	223835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_010079	AGG	2	6	223847	223852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_010079	AGA	3	9	223963	223971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508455
5532	NC_010079	ATT	2	6	223989	223994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508455
5533	NC_010079	ACT	2	6	224002	224007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508455
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5535	NC_010079	ATG	2	6	224097	224102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508455
5536	NC_010079	TAT	2	6	224194	224199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508455
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5538	NC_010079	TAT	2	6	224270	224275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508455
5539	NC_010079	AT	3	6	224357	224362	50 %	50 %	0 %	0 %	161508455
5540	NC_010079	CAA	2	6	224412	224417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508455
5541	NC_010079	ATT	2	6	224458	224463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508455
5542	NC_010079	ATTG	2	8	224503	224510	25 %	50 %	25 %	0 %	161508455
5543	NC_010079	AGGC	2	8	224516	224523	25 %	0 %	50 %	25 %	161508455
5544	NC_010079	AAC	2	6	224526	224531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508455
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5549	NC_010079	TGT	2	6	224815	224820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508455
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5553	NC_010079	AAG	2	6	224906	224911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508455
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5557	NC_010079	A	7	7	225064	225070	100 %	0 %	0 %	0 %	161508456
5558	NC_010079	GATT	2	8	225098	225105	25 %	50 %	25 %	0 %	161508456
5559	NC_010079	GT	3	6	225156	225161	0 %	50 %	50 %	0 %	161508456
5560	NC_010079	TAT	2	6	225198	225203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508456
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5599	NC_010079	TCA	2	6	226808	226813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508457
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5601	NC_010079	CAACA	2	10	226940	226949	60 %	0 %	0 %	40 %	161508457
5602	NC_010079	TGG	3	9	227060	227068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508457
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5609	NC_010079	GACA	2	8	227251	227258	50 %	0 %	25 %	25 %	161508457
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5613	NC_010079	AAAAT	2	10	227568	227577	80 %	20 %	0 %	0 %	161508458
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