MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 68935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010079	ATTA	2	8	202275	202282	50 %	50 %	0 %	0 %	161508442
5002	NC_010079	TAC	2	6	202400	202405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508442
5003	NC_010079	AGC	2	6	202416	202421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508442
5004	NC_010079	TTTAT	2	10	202444	202453	20 %	80 %	0 %	0 %	161508442
5005	NC_010079	AT	3	6	202452	202457	50 %	50 %	0 %	0 %	161508442
5006	NC_010079	TGA	2	6	202494	202499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508442
5007	NC_010079	AT	3	6	202541	202546	50 %	50 %	0 %	0 %	161508442
5008	NC_010079	ATC	2	6	202609	202614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508442
5009	NC_010079	ATG	2	6	202615	202620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508442
5010	NC_010079	AT	3	6	202641	202646	50 %	50 %	0 %	0 %	161508442
5011	NC_010079	GTC	3	9	202744	202752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508442
5012	NC_010079	A	6	6	202801	202806	100 %	0 %	0 %	0 %	161508442
5013	NC_010079	TTG	2	6	202835	202840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508442
5014	NC_010079	TTA	2	6	202876	202881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508442
5015	NC_010079	GTT	2	6	202882	202887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508442
5016	NC_010079	ATT	2	6	202915	202920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508442
5017	NC_010079	AAC	2	6	202940	202945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508442
5018	NC_010079	ATT	2	6	202954	202959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508442
5019	NC_010079	CTAG	2	8	203023	203030	25 %	25 %	25 %	25 %	161508442
5020	NC_010079	TTG	2	6	203117	203122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508442
5021	NC_010079	ATTT	2	8	203164	203171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_010079	ATTT	2	8	203176	203183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_010079	TTA	2	6	203243	203248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_010079	GTT	2	6	203290	203295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_010079	AAC	2	6	203330	203335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_010079	AAC	2	6	203361	203366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_010079	ATGT	2	8	203407	203414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_010079	GAT	2	6	203446	203451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_010079	AT	3	6	203474	203479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_010079	TTAA	2	8	203528	203535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_010079	TCG	2	6	203540	203545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_010079	TATCA	2	10	203548	203557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5033	NC_010079	AGTA	2	8	203570	203577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_010079	TAT	2	6	203583	203588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010079	AAG	2	6	203596	203601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508443
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5037	NC_010079	ATA	2	6	203662	203667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508443
5038	NC_010079	AC	3	6	203679	203684	50 %	0 %	0 %	50 %	161508443
5039	NC_010079	CTA	2	6	203725	203730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508443
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5043	NC_010079	TAC	2	6	203795	203800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508443
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5046	NC_010079	TGC	2	6	203972	203977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508443
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5051	NC_010079	TTA	2	6	204073	204078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508443
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5054	NC_010079	GT	3	6	204298	204303	0 %	50 %	50 %	0 %	161508443
5055	NC_010079	CAA	2	6	204327	204332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508443
5056	NC_010079	ATG	2	6	204334	204339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508443
5057	NC_010079	CGTTAA	2	12	204400	204411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161508443
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5061	NC_010079	TG	3	6	204462	204467	0 %	50 %	50 %	0 %	161508443
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5124	NC_010079	ATT	2	6	207038	207043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508443
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5153	NC_010079	TTG	2	6	208541	208546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508443
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5224	NC_010079	TAA	2	6	211696	211701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_010079	ATCA	2	8	211714	211721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5226	NC_010079	GAT	2	6	211734	211739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_010079	TAAG	2	8	211971	211978	50 %	25 %	25 %	0 %	161508445
5233	NC_010079	T	6	6	211983	211988	0 %	100 %	0 %	0 %	161508445
5234	NC_010079	AAT	2	6	212004	212009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508445
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5238	NC_010079	AAT	2	6	212313	212318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_010079	TTA	2	6	212375	212380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_010079	T	6	6	212382	212387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_010079	TAAA	2	8	212439	212446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_010079	ATC	2	6	212477	212482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5245	NC_010079	ATT	2	6	212552	212557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508446
5246	NC_010079	AT	3	6	212685	212690	50 %	50 %	0 %	0 %	161508446
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5494	NC_010079	TGA	2	6	222616	222621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508454
5495	NC_010079	TAA	2	6	222659	222664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508454
5496	NC_010079	ATG	2	6	222736	222741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508454
5497	NC_010079	CAT	2	6	222749	222754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508454
5498	NC_010079	GAA	2	6	222779	222784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508454
5499	NC_010079	CCG	2	6	222858	222863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161508454
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