MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19502

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009999	TC	3	6	881	886	0 %	50 %	0 %	50 %	160873003
2	NC_009999	GC	3	6	1194	1199	0 %	0 %	50 %	50 %	160873003
3	NC_009999	AG	3	6	2848	2853	50 %	0 %	50 %	0 %	160873003
4	NC_009999	AG	3	6	3992	3997	50 %	0 %	50 %	0 %	160873003
5	NC_009999	TA	3	6	4938	4943	50 %	50 %	0 %	0 %	160873004
6	NC_009999	GA	3	6	5334	5339	50 %	0 %	50 %	0 %	160873005
7	NC_009999	TG	3	6	6841	6846	0 %	50 %	50 %	0 %	160873008
8	NC_009999	TG	3	6	7395	7400	0 %	50 %	50 %	0 %	160873008
9	NC_009999	AT	3	6	7750	7755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009999	GT	3	6	7915	7920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009999	TG	3	6	8014	8019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009999	GC	4	8	8417	8424	0 %	0 %	50 %	50 %	160873009
13	NC_009999	GA	3	6	9104	9109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009999	GC	3	6	9498	9503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009999	CG	3	6	10052	10057	0 %	0 %	50 %	50 %	160873010
16	NC_009999	CG	3	6	10521	10526	0 %	0 %	50 %	50 %	160873010
17	NC_009999	TG	3	6	11537	11542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009999	GT	3	6	11548	11553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009999	GC	3	6	13374	13379	0 %	0 %	50 %	50 %	160873014
20	NC_009999	AC	3	6	13464	13469	50 %	0 %	0 %	50 %	160873014
21	NC_009999	AG	3	6	14427	14432	50 %	0 %	50 %	0 %	160873015
22	NC_009999	CA	3	6	15003	15008	50 %	0 %	0 %	50 %	160873016
23	NC_009999	CG	3	6	15102	15107	0 %	0 %	50 %	50 %	160873016
24	NC_009999	CA	3	6	15285	15290	50 %	0 %	0 %	50 %	160873017
25	NC_009999	GC	3	6	16467	16472	0 %	0 %	50 %	50 %	160873019
26	NC_009999	AC	3	6	16558	16563	50 %	0 %	0 %	50 %	160873019
27	NC_009999	GT	3	6	16762	16767	0 %	50 %	50 %	0 %	160873020
28	NC_009999	TA	3	6	17648	17653	50 %	50 %	0 %	0 %	160873021
29	NC_009999	GT	3	6	18306	18311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009999	AC	3	6	18674	18679	50 %	0 %	0 %	50 %	160873023
31	NC_009999	TA	3	6	18829	18834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009999	CG	4	8	19688	19695	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
33	NC_009999	CG	3	6	20267	20272	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
34	NC_009999	TG	3	6	20411	20416	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
35	NC_009999	GC	5	10	21285	21294	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
36	NC_009999	GT	3	6	21479	21484	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
37	NC_009999	TG	3	6	21525	21530	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
38	NC_009999	GC	3	6	21841	21846	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
39	NC_009999	AT	3	6	22216	22221	50 %	50 %	0 %	0 %	160873024
40	NC_009999	GT	3	6	22875	22880	0 %	50 %	50 %	0 %	160873024
41	NC_009999	CT	3	6	23526	23531	0 %	50 %	0 %	50 %	160873024
42	NC_009999	CG	3	6	23665	23670	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
43	NC_009999	GC	4	8	24199	24206	0 %	0 %	50 %	50 %	160873024
44	NC_009999	CG	3	6	24824	24829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009999	GC	3	6	26373	26378	0 %	0 %	50 %	50 %	160873025
46	NC_009999	CA	3	6	26809	26814	50 %	0 %	0 %	50 %	160873025
47	NC_009999	TG	3	6	27312	27317	0 %	50 %	50 %	0 %	160873026
48	NC_009999	TG	3	6	27369	27374	0 %	50 %	50 %	0 %	160873026
49	NC_009999	GT	3	6	27671	27676	0 %	50 %	50 %	0 %	160873026
50	NC_009999	CG	3	6	27707	27712	0 %	0 %	50 %	50 %	160873026
51	NC_009999	TA	3	6	27718	27723	50 %	50 %	0 %	0 %	160873026
52	NC_009999	CT	3	6	28595	28600	0 %	50 %	0 %	50 %	160873028
53	NC_009999	CT	3	6	28635	28640	0 %	50 %	0 %	50 %	160873028
54	NC_009999	GC	3	6	29909	29914	0 %	0 %	50 %	50 %	160873028
55	NC_009999	CG	3	6	30316	30321	0 %	0 %	50 %	50 %	160873028
56	NC_009999	CG	3	6	31887	31892	0 %	0 %	50 %	50 %	160873029
57	NC_009999	TG	3	6	32129	32134	0 %	50 %	50 %	0 %	160873029
58	NC_009999	GA	3	6	33371	33376	50 %	0 %	50 %	0 %	160873031
59	NC_009999	GC	3	6	33643	33648	0 %	0 %	50 %	50 %	160873031
60	NC_009999	GC	3	6	34115	34120	0 %	0 %	50 %	50 %	160873031
61	NC_009999	GC	3	6	34378	34383	0 %	0 %	50 %	50 %	160873032
62	NC_009999	GC	3	6	34403	34408	0 %	0 %	50 %	50 %	160873032
63	NC_009999	AC	3	6	34451	34456	50 %	0 %	0 %	50 %	160873032
64	NC_009999	TG	3	6	36532	36537	0 %	50 %	50 %	0 %	160873033
65	NC_009999	CG	3	6	37471	37476	0 %	0 %	50 %	50 %	160873034
66	NC_009999	CG	3	6	37913	37918	0 %	0 %	50 %	50 %	160873035
67	NC_009999	GT	3	6	37975	37980	0 %	50 %	50 %	0 %	160873035
68	NC_009999	CG	3	6	38129	38134	0 %	0 %	50 %	50 %	160873035
69	NC_009999	CG	3	6	38755	38760	0 %	0 %	50 %	50 %	160873036
70	NC_009999	GC	3	6	39001	39006	0 %	0 %	50 %	50 %	160873037
71	NC_009999	CA	3	6	39366	39371	50 %	0 %	0 %	50 %	160873037
72	NC_009999	GT	3	6	40718	40723	0 %	50 %	50 %	0 %	160873037
73	NC_009999	AC	3	6	41702	41707	50 %	0 %	0 %	50 %	160873038
74	NC_009999	CG	3	6	44001	44006	0 %	0 %	50 %	50 %	160873040
75	NC_009999	GC	3	6	44202	44207	0 %	0 %	50 %	50 %	160873040
76	NC_009999	CG	3	6	44340	44345	0 %	0 %	50 %	50 %	160873041
77	NC_009999	TA	3	6	44508	44513	50 %	50 %	0 %	0 %	160873041
78	NC_009999	GT	3	6	45099	45104	0 %	50 %	50 %	0 %	160873042
79	NC_009999	AC	3	6	45260	45265	50 %	0 %	0 %	50 %	160873043
80	NC_009999	AG	3	6	45760	45765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009999	TG	3	6	45892	45897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009999	GT	3	6	46998	47003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009999	GT	3	6	47465	47470	0 %	50 %	50 %	0 %	160873046
84	NC_009999	TC	3	6	47851	47856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009999	GT	3	6	48524	48529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009999	CT	3	6	50585	50590	0 %	50 %	0 %	50 %	160873050
87	NC_009999	GT	3	6	50731	50736	0 %	50 %	50 %	0 %	160873050
88	NC_009999	CT	3	6	52222	52227	0 %	50 %	0 %	50 %	160873051
89	NC_009999	TA	4	8	52643	52650	50 %	50 %	0 %	0 %	160873051
90	NC_009999	AT	3	6	52849	52854	50 %	50 %	0 %	0 %	160873052
91	NC_009999	AT	3	6	53040	53045	50 %	50 %	0 %	0 %	160873052
92	NC_009999	AT	3	6	53120	53125	50 %	50 %	0 %	0 %	160873052
93	NC_009999	TA	3	6	53577	53582	50 %	50 %	0 %	0 %	160873052
94	NC_009999	AT	3	6	54279	54284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009999	TA	4	8	54370	54377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009999	TA	3	6	54492	54497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009999	TC	4	8	55133	55140	0 %	50 %	0 %	50 %	160873053
98	NC_009999	TG	3	6	55230	55235	0 %	50 %	50 %	0 %	160873053
99	NC_009999	AT	3	6	55423	55428	50 %	50 %	0 %	0 %	160873053
100	NC_009999	TG	3	6	56690	56695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009999	CG	3	6	58387	58392	0 %	0 %	50 %	50 %	160873058
102	NC_009999	GA	3	6	59796	59801	50 %	0 %	50 %	0 %	160873059
103	NC_009999	AT	3	6	60412	60417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009999	AT	3	6	60464	60469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009999	AT	3	6	60790	60795	50 %	50 %	0 %	0 %	160873060
106	NC_009999	AG	3	6	61370	61375	50 %	0 %	50 %	0 %	160873061
107	NC_009999	TC	3	6	62467	62472	0 %	50 %	0 %	50 %	160873063
108	NC_009999	TG	3	6	63317	63322	0 %	50 %	50 %	0 %	160873065
109	NC_009999	AT	5	10	65009	65018	50 %	50 %	0 %	0 %	160873066
110	NC_009999	TA	3	6	65700	65705	50 %	50 %	0 %	0 %	160873066
111	NC_009999	CT	3	6	66700	66705	0 %	50 %	0 %	50 %	160873067
112	NC_009999	CA	3	6	67161	67166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009999	TC	3	6	68056	68061	0 %	50 %	0 %	50 %	160873070
114	NC_009999	AG	3	6	71284	71289	50 %	0 %	50 %	0 %	160873072
115	NC_009999	TA	3	6	71301	71306	50 %	50 %	0 %	0 %	160873072
116	NC_009999	CT	3	6	72971	72976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009999	CT	3	6	73843	73848	0 %	50 %	0 %	50 %	160873074
118	NC_009999	AT	3	6	74747	74752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.