MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS195 chromosome

Total Repeats: 3340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009997	AGCCG	2	10	723	732	20 %	0 %	40 %	40 %	160873127
2	NC_009997	AGTGA	2	10	5220	5229	40 %	20 %	40 %	0 %	160873130
3	NC_009997	ACCCA	2	10	5893	5902	40 %	0 %	0 %	60 %	160873130
4	NC_009997	TGAAT	2	10	11070	11079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009997	ATGGC	2	10	14534	14543	20 %	20 %	40 %	20 %	160873139
6	NC_009997	TGATG	2	10	16061	16070	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009997	CATTC	2	10	19337	19346	20 %	40 %	0 %	40 %	160873141
8	NC_009997	GCATC	2	10	23241	23250	20 %	20 %	20 %	40 %	160873146
9	NC_009997	ACATC	2	10	23625	23634	40 %	20 %	0 %	40 %	160873146
10	NC_009997	AGTTT	2	10	24926	24935	20 %	60 %	20 %	0 %	160873146
11	NC_009997	CTATT	2	10	28889	28898	20 %	60 %	0 %	20 %	160873149
12	NC_009997	CATGG	2	10	31869	31878	20 %	20 %	40 %	20 %	160873153
13	NC_009997	TTGTC	2	10	33996	34005	0 %	60 %	20 %	20 %	160873155
14	NC_009997	GCGCC	2	10	34549	34558	0 %	0 %	40 %	60 %	160873155
15	NC_009997	GCGAG	2	10	35254	35263	20 %	0 %	60 %	20 %	160873156
16	NC_009997	GTGAT	2	10	37325	37334	20 %	40 %	40 %	0 %	160873158
17	NC_009997	CTGGG	2	10	38014	38023	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009997	CGAAA	2	10	38602	38611	60 %	0 %	20 %	20 %	160873159
19	NC_009997	TTCGT	2	10	39274	39283	0 %	60 %	20 %	20 %	160873160
20	NC_009997	GGTCA	2	10	44334	44343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009997	AGTCG	2	10	47846	47855	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009997	AGGCT	2	10	48173	48182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009997	ATCCC	2	10	49825	49834	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009997	TCCGC	2	10	50011	50020	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_009997	CCGTC	2	10	50096	50105	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009997	CTTGC	2	10	51007	51016	0 %	40 %	20 %	40 %	160873169
27	NC_009997	GATTG	2	10	54053	54062	20 %	40 %	40 %	0 %	160873172
28	NC_009997	GATAG	2	10	56704	56713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009997	AAGTT	2	10	56848	56857	40 %	40 %	20 %	0 %	160873175
30	NC_009997	TGTGA	2	10	58021	58030	20 %	40 %	40 %	0 %	160873176
31	NC_009997	AGAAA	2	10	58200	58209	80 %	0 %	20 %	0 %	160873176
32	NC_009997	GGATG	2	10	59937	59946	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009997	CCAGC	2	10	63388	63397	20 %	0 %	20 %	60 %	160873180
34	NC_009997	TGGTG	2	10	64267	64276	0 %	40 %	60 %	0 %	160873181
35	NC_009997	AGCGC	2	10	65604	65613	20 %	0 %	40 %	40 %	160873183
36	NC_009997	TTGCA	2	10	66188	66197	20 %	40 %	20 %	20 %	160873183
37	NC_009997	CTTTA	2	10	67810	67819	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009997	ACCTT	2	10	68734	68743	20 %	40 %	0 %	40 %	160873185
39	NC_009997	GGCGG	2	10	70109	70118	0 %	0 %	80 %	20 %	160873186
40	NC_009997	GGCTG	2	10	76259	76268	0 %	20 %	60 %	20 %	160873192
41	NC_009997	TTGAT	2	10	76524	76533	20 %	60 %	20 %	0 %	160873192
42	NC_009997	GATTT	2	10	76619	76628	20 %	60 %	20 %	0 %	160873192
43	NC_009997	ATGGT	2	10	77824	77833	20 %	40 %	40 %	0 %	160873193
44	NC_009997	GTTTG	2	10	77960	77969	0 %	60 %	40 %	0 %	160873193
45	NC_009997	ACCTG	2	10	81336	81345	20 %	20 %	20 %	40 %	160873194
46	NC_009997	TTAAT	2	10	81471	81480	40 %	60 %	0 %	0 %	160873194
47	NC_009997	AAAGC	2	10	82691	82700	60 %	0 %	20 %	20 %	160873195
48	NC_009997	ATAGC	2	10	82895	82904	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009997	AGCAA	2	10	83062	83071	60 %	0 %	20 %	20 %	160873196
50	NC_009997	ATTTA	2	10	85896	85905	40 %	60 %	0 %	0 %	160873197
51	NC_009997	GTGAG	2	10	86018	86027	20 %	20 %	60 %	0 %	160873197
52	NC_009997	TGAGT	2	10	91820	91829	20 %	40 %	40 %	0 %	160873199
53	NC_009997	CTTCA	2	10	92975	92984	20 %	40 %	0 %	40 %	160873200
54	NC_009997	TGCGC	2	10	96384	96393	0 %	20 %	40 %	40 %	160873204
55	NC_009997	CTGTG	2	10	99634	99643	0 %	40 %	40 %	20 %	160873206
56	NC_009997	GCCGA	2	10	100683	100692	20 %	0 %	40 %	40 %	160873207
57	NC_009997	TAAAT	2	10	102064	102073	60 %	40 %	0 %	0 %	160873207
58	NC_009997	CTGTC	2	10	103456	103465	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009997	GTTCT	2	10	109233	109242	0 %	60 %	20 %	20 %	160873217
60	NC_009997	AGTGC	2	10	109835	109844	20 %	20 %	40 %	20 %	160873218
61	NC_009997	TGGGT	2	10	111458	111467	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009997	CTTTT	2	10	113963	113972	0 %	80 %	0 %	20 %	160873222
63	NC_009997	AATTT	2	10	114570	114579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009997	GTTGT	2	10	114871	114880	0 %	60 %	40 %	0 %	160873223
65	NC_009997	CTAAG	2	10	116163	116172	40 %	20 %	20 %	20 %	160873223
66	NC_009997	ATCCA	2	10	116684	116693	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009997	TTATT	2	10	118528	118537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009997	GCCAA	2	10	119676	119685	40 %	0 %	20 %	40 %	160873226
69	NC_009997	GCCGC	2	10	121061	121070	0 %	0 %	40 %	60 %	160873228
70	NC_009997	GTGAA	2	10	126504	126513	40 %	20 %	40 %	0 %	160873231
71	NC_009997	AAGCC	2	10	126798	126807	40 %	0 %	20 %	40 %	160873231
72	NC_009997	TGGTG	2	10	128250	128259	0 %	40 %	60 %	0 %	160873232
73	NC_009997	GATGT	2	10	129084	129093	20 %	40 %	40 %	0 %	160873233
74	NC_009997	TTACT	2	10	133185	133194	20 %	60 %	0 %	20 %	160873236
75	NC_009997	ATGAC	2	10	134956	134965	40 %	20 %	20 %	20 %	160873238
76	NC_009997	TTGCT	2	10	136615	136624	0 %	60 %	20 %	20 %	160873240
77	NC_009997	GCTTC	2	10	136675	136684	0 %	40 %	20 %	40 %	160873240
78	NC_009997	GCAAC	2	10	136964	136973	40 %	0 %	20 %	40 %	160873240
79	NC_009997	AGTGA	2	10	137898	137907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009997	AGGTT	2	10	139062	139071	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009997	GCGAA	2	10	139709	139718	40 %	0 %	40 %	20 %	160873242
82	NC_009997	TGGAT	2	10	141199	141208	20 %	40 %	40 %	0 %	160873244
83	NC_009997	CGAGC	2	10	142593	142602	20 %	0 %	40 %	40 %	160873246
84	NC_009997	CCGCA	2	10	145113	145122	20 %	0 %	20 %	60 %	160873249
85	NC_009997	AGCGC	2	10	148579	148588	20 %	0 %	40 %	40 %	160873253
86	NC_009997	CTGTG	2	10	148651	148660	0 %	40 %	40 %	20 %	160873253
87	NC_009997	CTGAG	2	10	148863	148872	20 %	20 %	40 %	20 %	160873253
88	NC_009997	TTCAA	2	10	149606	149615	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009997	ACAGC	2	10	152974	152983	40 %	0 %	20 %	40 %	160873255
90	NC_009997	CGCGA	2	10	154108	154117	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009997	CATCG	2	10	156936	156945	20 %	20 %	20 %	40 %	160873261
92	NC_009997	CGGCG	2	10	160642	160651	0 %	0 %	60 %	40 %	160873264
93	NC_009997	CGTGG	2	10	161030	161039	0 %	20 %	60 %	20 %	160873264
94	NC_009997	CTGCA	2	10	162929	162938	20 %	20 %	20 %	40 %	160873264
95	NC_009997	CACTC	2	10	163089	163098	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_009997	ATCTA	2	10	163222	163231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009997	TGTGA	2	10	163324	163333	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009997	TCACT	2	10	164279	164288	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009997	GTTGT	2	10	165532	165541	0 %	60 %	40 %	0 %	160873266
100	NC_009997	TGAAG	2	10	167785	167794	40 %	20 %	40 %	0 %	160873268
101	NC_009997	TTGAA	2	10	168790	168799	40 %	40 %	20 %	0 %	160873269
102	NC_009997	TGAGC	2	10	170810	170819	20 %	20 %	40 %	20 %	160873271
103	NC_009997	ATTGG	2	10	174996	175005	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009997	GTGCG	2	10	175212	175221	0 %	20 %	60 %	20 %	160873274
105	NC_009997	ACAGC	2	10	175290	175299	40 %	0 %	20 %	40 %	160873274
106	NC_009997	ATTTG	2	10	178505	178514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009997	ATTTT	2	10	178545	178554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009997	GCCGA	2	10	187928	187937	20 %	0 %	40 %	40 %	160873285
109	NC_009997	TGCGC	2	10	192864	192873	0 %	20 %	40 %	40 %	160873291
110	NC_009997	GCTTG	2	10	193962	193971	0 %	40 %	40 %	20 %	160873292
111	NC_009997	AACAA	2	10	195148	195157	80 %	0 %	0 %	20 %	160873292
112	NC_009997	AACTG	2	10	196120	196129	40 %	20 %	20 %	20 %	160873293
113	NC_009997	CTATG	2	10	196973	196982	20 %	40 %	20 %	20 %	160873294
114	NC_009997	TTTGT	2	10	197070	197079	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009997	ATTTA	2	10	201853	201862	40 %	60 %	0 %	0 %	160873296
116	NC_009997	ACCAA	2	10	202274	202283	60 %	0 %	0 %	40 %	160873296
117	NC_009997	ACCAA	2	10	202550	202559	60 %	0 %	0 %	40 %	160873296
118	NC_009997	ACCAA	2	10	203102	203111	60 %	0 %	0 %	40 %	160873296
119	NC_009997	ACCAA	2	10	204482	204491	60 %	0 %	0 %	40 %	160873296
120	NC_009997	CTTAT	2	10	209200	209209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009997	TTGTC	2	10	210452	210461	0 %	60 %	20 %	20 %	160873298
122	NC_009997	AGTCA	2	10	212149	212158	40 %	20 %	20 %	20 %	160873301
123	NC_009997	CGGTC	2	10	212403	212412	0 %	20 %	40 %	40 %	160873301
124	NC_009997	TTGCA	2	10	214385	214394	20 %	40 %	20 %	20 %	160873302
125	NC_009997	GCAGG	2	10	216845	216854	20 %	0 %	60 %	20 %	160873304
126	NC_009997	ATATT	2	10	218587	218596	40 %	60 %	0 %	0 %	160873306
127	NC_009997	ATCGC	2	10	219114	219123	20 %	20 %	20 %	40 %	160873306
128	NC_009997	CAATG	2	10	219769	219778	40 %	20 %	20 %	20 %	160873307
129	NC_009997	TAAAC	2	10	223370	223379	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009997	AGTCG	2	10	225002	225011	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009997	AGGCT	2	10	225329	225338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009997	ATCCC	2	10	226976	226985	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_009997	GCATG	2	10	227561	227570	20 %	20 %	40 %	20 %	160873309
134	NC_009997	TGAAT	2	10	230195	230204	40 %	40 %	20 %	0 %	160873311
135	NC_009997	CGTAC	2	10	231314	231323	20 %	20 %	20 %	40 %	160873312
136	NC_009997	AGCAA	2	10	240155	240164	60 %	0 %	20 %	20 %	160873320
137	NC_009997	CTGAT	2	10	240206	240215	20 %	40 %	20 %	20 %	160873320
138	NC_009997	TCTGT	2	10	240291	240300	0 %	60 %	20 %	20 %	160873320
139	NC_009997	GAAAA	2	10	245133	245142	80 %	0 %	20 %	0 %	160873322
140	NC_009997	GTTCT	2	10	245616	245625	0 %	60 %	20 %	20 %	160873323
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151	NC_009997	AAGGT	2	10	271333	271342	40 %	20 %	40 %	0 %	160873361
152	NC_009997	TTGAT	2	10	272297	272306	20 %	60 %	20 %	0 %	160873363
153	NC_009997	AGTCG	2	10	276353	276362	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_009997	ATCCC	2	10	278331	278340	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
156	NC_009997	TCCGC	2	10	278517	278526	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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158	NC_009997	TAATT	2	10	279785	279794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009997	TTGAT	2	10	282291	282300	20 %	60 %	20 %	0 %	160873368
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176	NC_009997	TGGCT	2	10	312373	312382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_009997	TATTG	2	10	456014	456023	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009997	GATAG	2	10	457842	457851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009997	TCGCG	2	10	459658	459667	0 %	20 %	40 %	40 %	160873528
266	NC_009997	ATCCA	2	10	459809	459818	40 %	20 %	0 %	40 %	160873528
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