MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome

Total Repeats: 63589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009901	TAT	2	6	23	28	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009901	TCA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009901	TCT	2	6	204	209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009901	CAA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959831
5	NC_009901	ATC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959831
6	NC_009901	GTC	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959831
7	NC_009901	GTT	2	6	481	486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959831
8	NC_009901	CAG	3	9	494	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959831
9	NC_009901	CTT	2	6	542	547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959831
10	NC_009901	GTA	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959831
11	NC_009901	GCT	2	6	661	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959831
12	NC_009901	TGG	2	6	687	692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959831
13	NC_009901	TGG	2	6	717	722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959831
14	NC_009901	ATT	2	6	769	774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959831
15	NC_009901	AGT	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959831
16	NC_009901	CTA	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959831
17	NC_009901	TTC	2	6	919	924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959831
18	NC_009901	CAA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959831
19	NC_009901	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959831
20	NC_009901	TTC	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959831
21	NC_009901	TTA	2	6	973	978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959831
22	NC_009901	ATC	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959831
23	NC_009901	CCA	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959831
24	NC_009901	ATA	2	6	1334	1339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959831
25	NC_009901	AGA	2	6	1343	1348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959831
26	NC_009901	TAC	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959831
27	NC_009901	CGT	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959831
28	NC_009901	TGG	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959831
29	NC_009901	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959831
30	NC_009901	AGA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959831
31	NC_009901	TCT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959831
32	NC_009901	GTG	2	6	1680	1685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959832
33	NC_009901	AGC	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959832
34	NC_009901	TGT	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959832
35	NC_009901	CTG	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959832
36	NC_009901	TTA	2	6	2083	2088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959832
37	NC_009901	TGC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959832
38	NC_009901	CAG	2	6	2313	2318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959832
39	NC_009901	TTG	2	6	2334	2339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959832
40	NC_009901	TCG	2	6	2359	2364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959832
41	NC_009901	GTT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959832
42	NC_009901	GTG	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959832
43	NC_009901	TAA	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959832
44	NC_009901	GAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959832
45	NC_009901	AAT	2	6	2612	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959832
46	NC_009901	GAT	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959832
47	NC_009901	GTT	2	6	2830	2835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009901	TCA	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009901	GAT	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959833
50	NC_009901	TGA	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959833
51	NC_009901	CGT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959833
52	NC_009901	CTG	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959833
53	NC_009901	TGC	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959833
54	NC_009901	AGC	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959833
55	NC_009901	ACA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959833
56	NC_009901	TGG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959833
57	NC_009901	GCA	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959833
58	NC_009901	TAG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959833
59	NC_009901	CGC	2	6	3876	3881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157959833
60	NC_009901	CGA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959834
61	NC_009901	ATA	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959834
62	NC_009901	TTC	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
63	NC_009901	GAT	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
64	NC_009901	AGT	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
65	NC_009901	ACG	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959834
66	NC_009901	ATT	2	6	4128	4133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959834
67	NC_009901	CTG	3	9	4216	4224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
68	NC_009901	TTA	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959834
69	NC_009901	TGG	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
70	NC_009901	GAT	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
71	NC_009901	GGT	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
72	NC_009901	CGT	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
73	NC_009901	TTG	2	6	4561	4566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959834
74	NC_009901	TGA	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
75	NC_009901	TTC	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
76	NC_009901	ACT	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959834
77	NC_009901	AAG	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959834
78	NC_009901	TCT	2	6	4747	4752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
79	NC_009901	CAA	2	6	4760	4765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959834
80	NC_009901	TGG	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
81	NC_009901	GTG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
82	NC_009901	TAA	2	6	4856	4861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959834
83	NC_009901	CTG	2	6	4873	4878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
84	NC_009901	TGA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
85	NC_009901	CTG	2	6	4990	4995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
86	NC_009901	TTG	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959834
87	NC_009901	TCG	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
88	NC_009901	GGT	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
89	NC_009901	TGG	2	6	5234	5239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
90	NC_009901	TTC	2	6	5278	5283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
91	NC_009901	AAG	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959834
92	NC_009901	CTT	3	9	5486	5494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
93	NC_009901	ACC	2	6	5543	5548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959834
94	NC_009901	GAT	2	6	5592	5597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
95	NC_009901	AGC	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959834
96	NC_009901	TGA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
97	NC_009901	CTT	2	6	5990	5995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
98	NC_009901	TAG	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
99	NC_009901	TGG	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
100	NC_009901	GTG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
101	NC_009901	TCG	2	6	6227	6232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
102	NC_009901	GTT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959834
103	NC_009901	CGT	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
104	NC_009901	TAA	2	6	6387	6392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009901	TTG	2	6	6575	6580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959835
106	NC_009901	GCT	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959835
107	NC_009901	TTA	2	6	6649	6654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959835
108	NC_009901	GCA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959835
109	NC_009901	AAC	2	6	6794	6799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959835
110	NC_009901	GAC	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959835
111	NC_009901	ATG	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959835
112	NC_009901	GTT	2	6	7125	7130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959835
113	NC_009901	TGA	2	6	7229	7234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959835
114	NC_009901	TGG	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959835
115	NC_009901	GTT	2	6	7357	7362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959835
116	NC_009901	TAA	2	6	7518	7523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009901	GCA	2	6	7604	7609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959836
118	NC_009901	TAG	2	6	7636	7641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959836
119	NC_009901	GTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959836
120	NC_009901	TCA	3	9	7667	7675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959836
121	NC_009901	GAA	2	6	7696	7701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959836
122	NC_009901	CTT	2	6	7743	7748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959836
123	NC_009901	CAA	2	6	7830	7835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959836
124	NC_009901	TCG	2	6	7844	7849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959836
125	NC_009901	AGC	2	6	7852	7857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959836
126	NC_009901	TTA	2	6	7901	7906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959836
127	NC_009901	GCA	3	9	7907	7915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959836
128	NC_009901	CGA	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959836
129	NC_009901	CAA	2	6	8148	8153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959836
130	NC_009901	GTT	2	6	8167	8172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959836
131	NC_009901	TGC	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959836
132	NC_009901	GCA	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959836
133	NC_009901	TCA	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959836
134	NC_009901	ATA	2	6	8475	8480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959836
135	NC_009901	CGC	2	6	8491	8496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157959836
136	NC_009901	TTC	2	6	8497	8502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959836
137	NC_009901	GCT	2	6	8580	8585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959836
138	NC_009901	GAA	3	9	8650	8658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959836
139	NC_009901	AAT	2	6	8704	8709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959836
140	NC_009901	CTG	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959836
141	NC_009901	TAC	2	6	8872	8877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959836
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143	NC_009901	TCT	2	6	8918	8923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959836
144	NC_009901	CCA	2	6	8936	8941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959836
145	NC_009901	GCT	2	6	8948	8953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959836
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149	NC_009901	TAG	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959836
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155	NC_009901	TCA	2	6	9892	9897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959837
156	NC_009901	CTT	2	6	10037	10042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959837
157	NC_009901	ACC	2	6	10107	10112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959837
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159	NC_009901	TAC	2	6	10308	10313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959837
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161	NC_009901	GCG	2	6	10374	10379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157959837
162	NC_009901	ACT	2	6	10398	10403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959837
163	NC_009901	TGC	2	6	10498	10503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959837
164	NC_009901	CGT	2	6	10550	10555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009901	TCG	2	6	10559	10564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_009901	CAG	2	6	10809	10814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959838
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180	NC_009901	ATA	2	6	11981	11986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_009901	CAC	2	6	12207	12212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959840
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242	NC_009901	TTA	2	6	18995	19000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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