MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 97847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009831	GAA	2	6	197941	197946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373314
3502	NC_009831	GTT	2	6	197980	197985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_009831	GAT	2	6	197986	197991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_009831	T	8	8	198029	198036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_009831	A	6	6	198090	198095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_009831	TA	3	6	198106	198111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_009831	TATT	2	8	198137	198144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_009831	TTA	2	6	198176	198181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_009831	AG	3	6	198214	198219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_009831	GA	3	6	198221	198226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_009831	TTTG	2	8	198358	198365	0 %	75 %	25 %	0 %	157373315
3512	NC_009831	TCGA	2	8	198418	198425	25 %	25 %	25 %	25 %	157373315
3513	NC_009831	TGG	2	6	198437	198442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373315
3514	NC_009831	GTTG	2	8	198493	198500	0 %	50 %	50 %	0 %	157373315
3515	NC_009831	CT	3	6	198566	198571	0 %	50 %	0 %	50 %	157373315
3516	NC_009831	TATC	2	8	198686	198693	25 %	50 %	0 %	25 %	157373315
3517	NC_009831	TTG	2	6	198753	198758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373315
3518	NC_009831	GAC	2	6	198764	198769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3519	NC_009831	CTG	2	6	198801	198806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3520	NC_009831	GCT	2	6	198851	198856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3521	NC_009831	CGA	2	6	198935	198940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3522	NC_009831	CT	3	6	198953	198958	0 %	50 %	0 %	50 %	157373315
3523	NC_009831	CTC	2	6	198968	198973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157373315
3524	NC_009831	CT	3	6	198977	198982	0 %	50 %	0 %	50 %	157373315
3525	NC_009831	TTC	2	6	198984	198989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373315
3526	NC_009831	GCA	2	6	199036	199041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3527	NC_009831	AG	3	6	199086	199091	50 %	0 %	50 %	0 %	157373315
3528	NC_009831	TGC	2	6	199094	199099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3529	NC_009831	CT	3	6	199125	199130	0 %	50 %	0 %	50 %	157373315
3530	NC_009831	TTA	2	6	199171	199176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373315
3531	NC_009831	TGA	2	6	199244	199249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373315
3532	NC_009831	GGGCT	2	10	199262	199271	0 %	20 %	60 %	20 %	157373315
3533	NC_009831	CGTTC	2	10	199299	199308	0 %	40 %	20 %	40 %	157373315
3534	NC_009831	T	6	6	199388	199393	0 %	100 %	0 %	0 %	157373315
3535	NC_009831	AGC	2	6	199414	199419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3536	NC_009831	TGG	2	6	199445	199450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373315
3537	NC_009831	ATA	2	6	199465	199470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373315
3538	NC_009831	TTC	2	6	199479	199484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373315
3539	NC_009831	G	6	6	199552	199557	0 %	0 %	100 %	0 %	157373315
3540	NC_009831	TGA	2	6	199573	199578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373315
3541	NC_009831	CAAG	2	8	199610	199617	50 %	0 %	25 %	25 %	157373315
3542	NC_009831	AAT	2	6	199719	199724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373315
3543	NC_009831	ACT	2	6	199783	199788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373315
3544	NC_009831	CAG	2	6	199826	199831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3545	NC_009831	GTGG	2	8	199833	199840	0 %	25 %	75 %	0 %	157373315
3546	NC_009831	AAT	2	6	199880	199885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373315
3547	NC_009831	AG	3	6	199918	199923	50 %	0 %	50 %	0 %	157373315
3548	NC_009831	AGAT	2	8	199933	199940	50 %	25 %	25 %	0 %	157373315
3549	NC_009831	CACC	2	8	199945	199952	25 %	0 %	0 %	75 %	157373315
3550	NC_009831	CT	3	6	199956	199961	0 %	50 %	0 %	50 %	157373315
3551	NC_009831	ATG	2	6	199962	199967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373315
3552	NC_009831	GAC	2	6	200019	200024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373315
3553	NC_009831	GAT	2	6	200079	200084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373315
3554	NC_009831	GTA	2	6	200088	200093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373315
3555	NC_009831	TGGTT	2	10	200267	200276	0 %	60 %	40 %	0 %	157373315
3556	NC_009831	TCA	2	6	200339	200344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373316
3557	NC_009831	CT	3	6	200430	200435	0 %	50 %	0 %	50 %	157373316
3558	NC_009831	TGCT	2	8	200467	200474	0 %	50 %	25 %	25 %	157373316
3559	NC_009831	CGT	2	6	200492	200497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373316
3560	NC_009831	CAG	2	6	200518	200523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373316
3561	NC_009831	GCG	2	6	200543	200548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373316
3562	NC_009831	TTG	2	6	200563	200568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373316
3563	NC_009831	TGT	2	6	200585	200590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373316
3564	NC_009831	CT	3	6	200616	200621	0 %	50 %	0 %	50 %	157373316
3565	NC_009831	CGG	2	6	200652	200657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373316
3566	NC_009831	CTG	2	6	200734	200739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373316
3567	NC_009831	CGTG	2	8	200746	200753	0 %	25 %	50 %	25 %	157373316
3568	NC_009831	CCTTTA	2	12	200826	200837	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_009831	GAA	2	6	200883	200888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373317
3570	NC_009831	TGA	2	6	200931	200936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373317
3571	NC_009831	GTC	2	6	201149	201154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373317
3572	NC_009831	CT	3	6	201181	201186	0 %	50 %	0 %	50 %	157373317
3573	NC_009831	ATC	2	6	201199	201204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373317
3574	NC_009831	AAG	2	6	201239	201244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373317
3575	NC_009831	GCT	2	6	201276	201281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373317
3576	NC_009831	CTC	2	6	201325	201330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157373317
3577	NC_009831	GAG	2	6	201353	201358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373317
3578	NC_009831	ATC	2	6	201506	201511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373317
3579	NC_009831	AGA	2	6	201565	201570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373317
3580	NC_009831	C	6	6	201600	201605	0 %	0 %	0 %	100 %	157373317
3581	NC_009831	T	6	6	201702	201707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_009831	AGA	2	6	201773	201778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373318
3583	NC_009831	CTG	2	6	201812	201817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373318
3584	NC_009831	GCT	2	6	201818	201823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373318
3585	NC_009831	ATT	2	6	202001	202006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373318
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3588	NC_009831	GAT	2	6	202391	202396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373318
3589	NC_009831	GAC	2	6	202411	202416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373318
3590	NC_009831	GGTT	2	8	202510	202517	0 %	50 %	50 %	0 %	157373318
3591	NC_009831	T	6	6	202564	202569	0 %	100 %	0 %	0 %	157373319
3592	NC_009831	GAG	2	6	202643	202648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373319
3593	NC_009831	TTC	2	6	202682	202687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373319
3594	NC_009831	GCC	2	6	202728	202733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373319
3595	NC_009831	TTC	2	6	202776	202781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373319
3596	NC_009831	TAGG	2	8	202786	202793	25 %	25 %	50 %	0 %	157373319
3597	NC_009831	GCC	2	6	202856	202861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373319
3598	NC_009831	TC	3	6	202885	202890	0 %	50 %	0 %	50 %	157373319
3599	NC_009831	GCT	2	6	202924	202929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373319
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3602	NC_009831	GC	3	6	202990	202995	0 %	0 %	50 %	50 %	157373319
3603	NC_009831	AAT	2	6	203006	203011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373319
3604	NC_009831	GCC	2	6	203015	203020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373319
3605	NC_009831	GAG	2	6	203067	203072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373319
3606	NC_009831	C	6	6	203079	203084	0 %	0 %	0 %	100 %	157373319
3607	NC_009831	AAT	2	6	203090	203095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373319
3608	NC_009831	TAAGG	2	10	203111	203120	40 %	20 %	40 %	0 %	157373319
3609	NC_009831	CTG	2	6	203295	203300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373319
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3611	NC_009831	CAA	2	6	203489	203494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373319
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3613	NC_009831	CGGT	2	8	203572	203579	0 %	25 %	50 %	25 %	157373319
3614	NC_009831	T	6	6	203588	203593	0 %	100 %	0 %	0 %	157373319
3615	NC_009831	ATA	2	6	203596	203601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373319
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3619	NC_009831	T	6	6	203731	203736	0 %	100 %	0 %	0 %	157373319
3620	NC_009831	AATA	2	8	203753	203760	75 %	25 %	0 %	0 %	157373319
3621	NC_009831	TGCCT	2	10	203783	203792	0 %	40 %	20 %	40 %	157373319
3622	NC_009831	ATA	2	6	203813	203818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373319
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3624	NC_009831	AGC	2	6	203961	203966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373319
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3993	NC_009831	GCA	2	6	225066	225071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373339
3994	NC_009831	GAC	2	6	225131	225136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373339
3995	NC_009831	TGA	2	6	225225	225230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373339
3996	NC_009831	TTC	2	6	225278	225283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373339
3997	NC_009831	TGC	2	6	225339	225344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373339
3998	NC_009831	T	6	6	225509	225514	0 %	100 %	0 %	0 %	157373339
3999	NC_009831	CACC	2	8	225530	225537	25 %	0 %	0 %	75 %	157373339
4000	NC_009831	TCG	2	6	225552	225557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373339

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