MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 45023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009785	TAA	2	6	21976	21981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150750
502	NC_009785	ACA	2	6	22067	22072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150750
503	NC_009785	TAA	2	6	22084	22089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150750
504	NC_009785	CTT	2	6	22113	22118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150750
505	NC_009785	TC	3	6	22249	22254	0 %	50 %	0 %	50 %	157150750
506	NC_009785	GCT	2	6	22316	22321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150750
507	NC_009785	TAG	2	6	22427	22432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009785	TTTG	2	8	22449	22456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009785	AGCAC	2	10	22515	22524	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
510	NC_009785	GTT	2	6	22592	22597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150902
511	NC_009785	TCA	2	6	22619	22624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150902
512	NC_009785	ATG	2	6	22656	22661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150902
513	NC_009785	GAC	2	6	22688	22693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150902
514	NC_009785	AGA	2	6	22723	22728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150902
515	NC_009785	TAC	2	6	22772	22777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150902
516	NC_009785	CTT	2	6	22822	22827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150902
517	NC_009785	CCTT	2	8	22896	22903	0 %	50 %	0 %	50 %	157150902
518	NC_009785	AG	3	6	22962	22967	50 %	0 %	50 %	0 %	157150902
519	NC_009785	TGC	2	6	22989	22994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150902
520	NC_009785	AAT	2	6	23006	23011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150902
521	NC_009785	ACTT	2	8	23021	23028	25 %	50 %	0 %	25 %	157150902
522	NC_009785	AAC	2	6	23049	23054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150902
523	NC_009785	A	6	6	23141	23146	100 %	0 %	0 %	0 %	157150902
524	NC_009785	CCAGC	2	10	23210	23219	20 %	0 %	20 %	60 %	157150902
525	NC_009785	ATG	2	6	23228	23233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150902
526	NC_009785	TAT	2	6	23276	23281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150902
527	NC_009785	GGT	2	6	23297	23302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157150902
528	NC_009785	TGG	2	6	23311	23316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157150902
529	NC_009785	AGA	2	6	23464	23469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150902
530	NC_009785	GC	3	6	23575	23580	0 %	0 %	50 %	50 %	157150902
531	NC_009785	TAAA	2	8	23694	23701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009785	T	7	7	23718	23724	0 %	100 %	0 %	0 %	157150287
533	NC_009785	TAG	2	6	23788	23793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150287
534	NC_009785	GAT	2	6	23796	23801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150287
535	NC_009785	A	6	6	23806	23811	100 %	0 %	0 %	0 %	157150287
536	NC_009785	TTTC	2	8	23917	23924	0 %	75 %	0 %	25 %	157150287
537	NC_009785	TGG	2	6	23933	23938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157150287
538	NC_009785	AGC	2	6	24007	24012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150287
539	NC_009785	CTA	2	6	24156	24161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150287
540	NC_009785	TCA	2	6	24166	24171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150287
541	NC_009785	AAG	2	6	24185	24190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150287
542	NC_009785	CTT	2	6	24209	24214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150287
543	NC_009785	TGA	2	6	24226	24231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150287
544	NC_009785	ATG	2	6	24246	24251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150287
545	NC_009785	GAT	2	6	24281	24286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150287
546	NC_009785	GATTT	2	10	24337	24346	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009785	ATG	2	6	24371	24376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009785	T	6	6	24402	24407	0 %	100 %	0 %	0 %	157150700
549	NC_009785	T	6	6	24433	24438	0 %	100 %	0 %	0 %	157150700
550	NC_009785	A	10	10	24443	24452	100 %	0 %	0 %	0 %	157150700
551	NC_009785	CA	3	6	24471	24476	50 %	0 %	0 %	50 %	157150700
552	NC_009785	GCTG	2	8	24538	24545	0 %	25 %	50 %	25 %	157149984
553	NC_009785	TTG	2	6	24645	24650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149984
554	NC_009785	GA	3	6	24675	24680	50 %	0 %	50 %	0 %	157149984
555	NC_009785	AGA	2	6	24862	24867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
556	NC_009785	GGTAA	2	10	24869	24878	40 %	20 %	40 %	0 %	157149984
557	NC_009785	TCA	2	6	24898	24903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149984
558	NC_009785	TGC	2	6	24910	24915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149984
559	NC_009785	ATT	3	9	24959	24967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149984
560	NC_009785	AGC	2	6	25006	25011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149984
561	NC_009785	CTC	2	6	25074	25079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149984
562	NC_009785	ATG	2	6	25107	25112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
563	NC_009785	TGA	2	6	25132	25137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
564	NC_009785	TGA	2	6	25168	25173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
565	NC_009785	CCA	2	6	25351	25356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149984
566	NC_009785	AGA	2	6	25387	25392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
567	NC_009785	AGA	2	6	25426	25431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
568	NC_009785	ATG	2	6	25481	25486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
569	NC_009785	GCTAT	2	10	25494	25503	20 %	40 %	20 %	20 %	157149984
570	NC_009785	CAG	2	6	25575	25580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149984
571	NC_009785	GAA	2	6	25607	25612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
572	NC_009785	ATT	2	6	25628	25633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149984
573	NC_009785	TGAT	2	8	25713	25720	25 %	50 %	25 %	0 %	157149984
574	NC_009785	GAT	2	6	25850	25855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
575	NC_009785	AATGA	2	10	25898	25907	60 %	20 %	20 %	0 %	157149984
576	NC_009785	AAAC	2	8	25944	25951	75 %	0 %	0 %	25 %	157149984
577	NC_009785	AGA	2	6	25960	25965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
578	NC_009785	AGTTC	2	10	26044	26053	20 %	40 %	20 %	20 %	157149984
579	NC_009785	TGA	2	6	26077	26082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
580	NC_009785	GAT	2	6	26204	26209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
581	NC_009785	AATC	2	8	26251	26258	50 %	25 %	0 %	25 %	157149984
582	NC_009785	CAG	2	6	26301	26306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149984
583	NC_009785	GGAA	2	8	26332	26339	50 %	0 %	50 %	0 %	157149984
584	NC_009785	GTA	2	6	26346	26351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
585	NC_009785	AAAAC	2	10	26368	26377	80 %	0 %	0 %	20 %	157149984
586	NC_009785	A	6	6	26388	26393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009785	ACA	2	6	26415	26420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_009785	ATA	2	6	26438	26443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009785	A	7	7	26477	26483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009785	ATT	2	6	26493	26498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009785	T	9	9	26560	26568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009785	ACA	2	6	26578	26583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_009785	GAT	2	6	26599	26604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009785	CAAT	2	8	26606	26613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_009785	T	6	6	26684	26689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009785	TGA	2	6	26726	26731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150426
597	NC_009785	A	6	6	26731	26736	100 %	0 %	0 %	0 %	157150426
598	NC_009785	TGCT	2	8	26834	26841	0 %	50 %	25 %	25 %	157150426
599	NC_009785	CTT	2	6	26844	26849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150426
600	NC_009785	CAA	2	6	26884	26889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150426
601	NC_009785	T	6	6	26893	26898	0 %	100 %	0 %	0 %	157150426
602	NC_009785	CAG	2	6	26903	26908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150426
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605	NC_009785	ACA	2	6	27052	27057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150426
606	NC_009785	CAG	2	6	27088	27093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150426
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608	NC_009785	T	6	6	27190	27195	0 %	100 %	0 %	0 %	157150426
609	NC_009785	ATG	2	6	27212	27217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150426
610	NC_009785	TAT	2	6	27255	27260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150426
611	NC_009785	ATG	2	6	27275	27280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150426
612	NC_009785	AGA	2	6	27285	27290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150426
613	NC_009785	TGT	2	6	27291	27296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150426
614	NC_009785	TCAG	2	8	27311	27318	25 %	25 %	25 %	25 %	157150426
615	NC_009785	TTG	2	6	27329	27334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150426
616	NC_009785	TCG	2	6	27378	27383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150426
617	NC_009785	ATGGAG	2	12	27527	27538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157150426
618	NC_009785	GGA	2	6	27595	27600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157150426
619	NC_009785	TCT	2	6	27644	27649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150426
620	NC_009785	CTG	3	9	27662	27670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150426
621	NC_009785	CACGTA	2	12	27683	27694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157150426
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624	NC_009785	TGT	2	6	27840	27845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150426
625	NC_009785	GA	3	6	27877	27882	50 %	0 %	50 %	0 %	157150426
626	NC_009785	AAG	3	9	27899	27907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150426
627	NC_009785	AGCTT	2	10	27989	27998	20 %	40 %	20 %	20 %	157150426
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