MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 45023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_009785	AAC	2	6	265601	265606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150336
5503	NC_009785	CTT	2	6	265636	265641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150336
5504	NC_009785	TCG	2	6	265662	265667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150336
5505	NC_009785	AGT	2	6	265711	265716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150336
5506	NC_009785	GAT	2	6	265751	265756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150336
5507	NC_009785	TG	3	6	265793	265798	0 %	50 %	50 %	0 %	157150336
5508	NC_009785	ACG	2	6	265811	265816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150336
5509	NC_009785	TGT	2	6	265856	265861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150336
5510	NC_009785	GTT	2	6	265923	265928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150336
5511	NC_009785	ACC	2	6	265943	265948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157150336
5512	NC_009785	TCG	2	6	265977	265982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150336
5513	NC_009785	AAT	2	6	266105	266110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150336
5514	NC_009785	AG	3	6	266124	266129	50 %	0 %	50 %	0 %	157150336
5515	NC_009785	AAG	2	6	266148	266153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150336
5516	NC_009785	TTTC	2	8	266212	266219	0 %	75 %	0 %	25 %	157150336
5517	NC_009785	ACA	2	6	266274	266279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150336
5518	NC_009785	AAC	2	6	266285	266290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150336
5519	NC_009785	TTTC	2	8	266308	266315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5520	NC_009785	CTTTT	2	10	266401	266410	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5521	NC_009785	ATA	2	6	266411	266416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_009785	TA	3	6	266445	266450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_009785	GA	3	6	266458	266463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_009785	TTAA	2	8	266558	266565	50 %	50 %	0 %	0 %	157149712
5525	NC_009785	ATC	2	6	266582	266587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149712
5526	NC_009785	T	6	6	266606	266611	0 %	100 %	0 %	0 %	157149712
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5530	NC_009785	CGT	2	6	266698	266703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149712
5531	NC_009785	TTGA	2	8	266867	266874	25 %	50 %	25 %	0 %	157149712
5532	NC_009785	CGA	2	6	266887	266892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149712
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5535	NC_009785	TTGA	2	8	267212	267219	25 %	50 %	25 %	0 %	157149712
5536	NC_009785	GAG	2	6	267347	267352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149712
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5539	NC_009785	GCT	2	6	267574	267579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149712
5540	NC_009785	ATAAAG	2	12	267604	267615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157149712
5541	NC_009785	T	6	6	267635	267640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_009785	T	6	6	267720	267725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_009785	A	6	6	267727	267732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_009785	TAAAA	2	10	267772	267781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_009785	A	6	6	267778	267783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_009785	AAAG	2	8	267803	267810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_009785	GAA	2	6	267821	267826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151206
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5549	NC_009785	A	6	6	267838	267843	100 %	0 %	0 %	0 %	157151206
5550	NC_009785	GCA	3	9	267911	267919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151206
5551	NC_009785	TAT	2	6	268064	268069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151206
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5553	NC_009785	ATT	2	6	268240	268245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_009785	TTTTA	2	10	268261	268270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_009785	T	6	6	268316	268321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_009785	AACAA	2	10	268324	268333	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5557	NC_009785	ATC	2	6	268377	268382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_009785	AACA	3	12	268467	268478	75 %	0 %	0 %	25 %	157151047
5559	NC_009785	CTTT	2	8	268510	268517	0 %	75 %	0 %	25 %	157151047
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5564	NC_009785	TGG	2	6	268852	268857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157151047
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5566	NC_009785	TAT	2	6	269008	269013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151480
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5580	NC_009785	GTCA	2	8	269468	269475	25 %	25 %	25 %	25 %	157151480
5581	NC_009785	GGC	2	6	269587	269592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157151480
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5583	NC_009785	GA	3	6	269749	269754	50 %	0 %	50 %	0 %	157150121
5584	NC_009785	A	6	6	269754	269759	100 %	0 %	0 %	0 %	157150121
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5595	NC_009785	CTG	3	9	270194	270202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150121
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5597	NC_009785	ATG	2	6	270281	270286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150121
5598	NC_009785	ATG	2	6	270312	270317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150121
5599	NC_009785	A	7	7	270354	270360	100 %	0 %	0 %	0 %	157150121
5600	NC_009785	TTTA	2	8	270401	270408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_009785	GAT	2	6	270587	270592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5603	NC_009785	GCTC	2	8	270715	270722	0 %	25 %	25 %	50 %	157150613
5604	NC_009785	GT	3	6	270775	270780	0 %	50 %	50 %	0 %	157150613
5605	NC_009785	T	6	6	270796	270801	0 %	100 %	0 %	0 %	157150613
5606	NC_009785	AATA	2	8	270813	270820	75 %	25 %	0 %	0 %	157150613
5607	NC_009785	GAT	2	6	270905	270910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150613
5608	NC_009785	GATTTG	2	12	270957	270968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	157150613
5609	NC_009785	GATA	2	8	271030	271037	50 %	25 %	25 %	0 %	157150613
5610	NC_009785	AGAA	2	8	271054	271061	75 %	0 %	25 %	0 %	157150613
5611	NC_009785	GAA	3	9	271074	271082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150613
5612	NC_009785	AGAA	2	8	271084	271091	75 %	0 %	25 %	0 %	157150613
5613	NC_009785	TCT	2	6	271126	271131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150613
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5621	NC_009785	AGGGT	2	10	271466	271475	20 %	20 %	60 %	0 %	157150613
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5998	NC_009785	AAG	2	6	290979	290984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150709
5999	NC_009785	ATG	2	6	291223	291228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150709
6000	NC_009785	GAAGG	2	10	291258	291267	40 %	0 %	60 %	0 %	157150709

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