MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu3

Total Repeats: 1573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009782	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978333
2	NC_009782	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009782	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009782	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156978337
5	NC_009782	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156978337
6	NC_009782	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156978337
7	NC_009782	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978337
8	NC_009782	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156978337
9	NC_009782	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156978339
10	NC_009782	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156978339
11	NC_009782	TAAATC	2	12	17173	17184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009782	GCTTTA	2	12	17451	17462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156978344
13	NC_009782	TTTGAA	2	12	18272	18283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978344
14	NC_009782	TTGGTG	2	12	19116	19127	0 %	50 %	50 %	0 %	156978345
15	NC_009782	TAAAGG	2	12	20319	20330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156978346
16	NC_009782	TTGAAG	2	12	20516	20527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978346
17	NC_009782	TGATTG	2	12	21720	21731	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156978347
18	NC_009782	TGAAAT	2	12	22051	22062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156978347
19	NC_009782	AAGGAA	2	12	22489	22500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978348
20	NC_009782	TGAATT	2	12	25417	25428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978349
21	NC_009782	ATTTCA	2	12	27901	27912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156978351
22	NC_009782	ATCAGC	2	12	31216	31227	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156978354
23	NC_009782	AAAAGA	2	12	33857	33868	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	156978355
24	NC_009782	ACATCT	2	12	35511	35522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156978356
25	NC_009782	GTTTAA	2	12	36654	36665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978358
26	NC_009782	ATTTAT	2	12	37500	37511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978360
27	NC_009782	AAAAAT	2	12	43651	43662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009782	AATGAA	2	12	44887	44898	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156978370
29	NC_009782	ACAACT	2	12	46952	46963	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156978371
30	NC_009782	TTTTCT	2	12	57811	57822	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	156978384
31	NC_009782	AATTAA	2	12	58001	58012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156978384
32	NC_009782	GGCATG	2	12	58632	58643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156978385
33	NC_009782	TAAAAA	2	12	59794	59805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	156978385
34	NC_009782	CATTAA	2	12	60430	60441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156978386
35	NC_009782	ATTTTT	2	12	70080	70091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009782	ATAAGA	2	12	72536	72547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009782	AAATAA	2	12	74201	74212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	156978401
38	NC_009782	TTTAAT	2	12	85268	85279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978410
39	NC_009782	ACAAAT	2	12	87683	87694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	156978412
40	NC_009782	AATTAA	2	12	87774	87785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156978412
41	NC_009782	ATTTAT	2	12	90195	90206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009782	TTAATG	2	12	90719	90730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978414
43	NC_009782	AAGTCA	2	12	91924	91935	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156978416
44	NC_009782	AAAAAG	2	12	92038	92049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	156978416
45	NC_009782	GAAAAA	2	12	92351	92362	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	156978416
46	NC_009782	AATTAT	2	12	94590	94601	50 %	50 %	0 %	0 %	156978418
47	NC_009782	ACCCTT	2	12	96429	96440	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156978419
48	NC_009782	TTTAGC	2	12	98338	98349	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156978422
49	NC_009782	AAATAA	2	12	98389	98400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	156978422
50	NC_009782	GTTAGA	2	12	100512	100523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978423
51	NC_009782	AAAAGA	2	12	100566	100577	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	156978423
52	NC_009782	GCTAAA	2	12	103354	103365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156978425
53	NC_009782	AACAAA	2	12	103775	103786	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009782	TAAAGA	2	12	107502	107513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156978430
55	NC_009782	AACCAC	2	12	111374	111385	50 %	0 %	0 %	50 %	156978432
56	NC_009782	AATATA	2	12	113076	113087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009782	AACCGA	2	12	114685	114696	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156978434
58	NC_009782	ATAGAT	2	12	119585	119596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156978438
59	NC_009782	TATCAT	2	12	120352	120363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156978439
60	NC_009782	TTTATT	2	12	120760	120771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	156978440
61	NC_009782	TATTTG	2	12	120846	120857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156978440
62	NC_009782	TAAATA	2	12	122279	122290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156978440
63	NC_009782	TTTTTC	2	12	123949	123960	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	156978441
64	NC_009782	TTAAAT	2	12	124044	124055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009782	TAACAA	2	12	125401	125412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009782	TAAGCC	2	12	125810	125821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156978443
67	NC_009782	ATCGCA	2	12	127025	127036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156978444
68	NC_009782	TTTGAA	2	12	128056	128067	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978445
69	NC_009782	CAATGG	2	12	137014	137025	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156978451
70	NC_009782	TGAAGA	2	12	137848	137859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156978452
71	NC_009782	TTTCAT	2	12	138529	138540	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156978453
72	NC_009782	TGTATA	2	12	142748	142759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978458
73	NC_009782	TCGAAA	2	12	144249	144260	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156978460
74	NC_009782	CTATTG	2	12	146835	146846	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156978462
75	NC_009782	CATATG	2	12	148038	148049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156978463
76	NC_009782	AATGTA	2	12	148939	148950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009782	CTGTAA	2	12	150760	150771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009782	GGTATG	2	12	151081	151092	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156978466
79	NC_009782	CAGATT	2	12	153679	153690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156978468
80	NC_009782	AGATAT	2	12	161057	161068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156978475
81	NC_009782	GTTTTT	2	12	161966	161977	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009782	ATGCCT	2	12	162196	162207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156978476
83	NC_009782	TGAAAG	2	12	162836	162847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156978476
84	NC_009782	GATATG	2	12	170336	170347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978482
85	NC_009782	ATTTGA	2	12	174242	174253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978485
86	NC_009782	GATTTT	2	12	178753	178764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156978490
87	NC_009782	ACAAAG	2	12	183273	183284	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	156978494
88	NC_009782	TGTAAT	2	12	184297	184308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978495
89	NC_009782	AAAGAT	2	12	185286	185297	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156978497
90	NC_009782	ATTAAT	2	12	187192	187203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009782	CAATAT	2	12	187758	187769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156978498
92	NC_009782	TCCCAC	2	12	188509	188520	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009782	TTGGTA	2	12	191843	191854	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156978504
94	NC_009782	GCGATT	2	12	191863	191874	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156978504
95	NC_009782	AAATTT	2	12	191961	191972	50 %	50 %	0 %	0 %	156978504
96	NC_009782	ACCTGC	2	12	194864	194875	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156978507
97	NC_009782	AAGATA	2	12	195010	195021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156978507
98	NC_009782	CGTTAA	2	12	197944	197955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156978509
99	NC_009782	CTATTA	2	12	199795	199806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156978509
100	NC_009782	TATGAT	2	12	201329	201340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978509
101	NC_009782	TTGAAA	2	12	201781	201792	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156978509
102	NC_009782	AACATT	2	12	204221	204232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156978509
103	NC_009782	AGCAAC	2	12	207710	207721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156978513
104	NC_009782	TGTTTG	2	12	207758	207769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156978513
105	NC_009782	CACCTT	2	12	209762	209773	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156978515
106	NC_009782	ACCTTT	2	12	210267	210278	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156978515
107	NC_009782	TTTATA	2	12	210363	210374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009782	ATTAAT	2	12	210386	210397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009782	GTAAAT	2	12	214006	214017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156978518
110	NC_009782	ATTTTA	2	12	215600	215611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978519
111	NC_009782	TATCTT	2	12	220214	220225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156978522
112	NC_009782	ATTTGG	2	12	221227	221238	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156978523
113	NC_009782	GAGTTT	2	12	224570	224581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156978525
114	NC_009782	TATACA	2	12	228571	228582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156978529
115	NC_009782	TTATTT	2	12	230603	230614	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	156978531
116	NC_009782	ATTTAT	2	12	231182	231193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978531
117	NC_009782	TTTTTA	2	12	231213	231224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009782	CCCTGA	2	12	233940	233951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156978535
119	NC_009782	TCCTGA	2	12	234759	234770	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156978535
120	NC_009782	TCAATT	2	12	236910	236921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156978537
121	NC_009782	AATATG	2	12	238210	238221	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156978538
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239	NC_009782	TTGATA	2	12	521621	521632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156978801
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241	NC_009782	AAAATA	2	12	523150	523161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_009782	GTTGGT	2	12	524504	524515	0 %	50 %	50 %	0 %	156978802
243	NC_009782	GCTATT	2	12	524576	524587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156978802
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