MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS185 chromosome

Total Repeats: 62634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009665	CAA	2	6	38	43	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009665	ATA	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009665	TAG	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009665	TAA	2	6	206	211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009665	TGA	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009665	GAT	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009665	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998556
8	NC_009665	CAG	2	6	439	444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998556
9	NC_009665	GTC	2	6	620	625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998556
10	NC_009665	ACG	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998556
11	NC_009665	GCG	2	6	823	828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998556
12	NC_009665	GGT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998556
13	NC_009665	ATT	2	6	867	872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998556
14	NC_009665	TTG	2	6	907	912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998556
15	NC_009665	AAT	2	6	940	945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998556
16	NC_009665	GAA	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998556
17	NC_009665	TAC	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998556
18	NC_009665	GAT	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998556
19	NC_009665	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998556
20	NC_009665	TTC	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998556
21	NC_009665	ATT	2	6	1156	1161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998556
22	NC_009665	CCA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998556
23	NC_009665	CTT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998556
24	NC_009665	TAC	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998556
25	NC_009665	TGT	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998556
26	NC_009665	TGG	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998556
27	NC_009665	CAC	2	6	1668	1673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998556
28	NC_009665	AGA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998556
29	NC_009665	TCT	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998556
30	NC_009665	CCT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998557
31	NC_009665	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998557
32	NC_009665	TAC	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998557
33	NC_009665	GCT	2	6	2011	2016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998557
34	NC_009665	AAC	2	6	2061	2066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998557
35	NC_009665	ATA	2	6	2070	2075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998557
36	NC_009665	TGC	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998557
37	NC_009665	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998557
38	NC_009665	TTA	2	6	2245	2250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998557
39	NC_009665	CTA	2	6	2463	2468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998557
40	NC_009665	GTG	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998557
41	NC_009665	GAA	2	6	2687	2692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998557
42	NC_009665	ATC	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998557
43	NC_009665	ACA	2	6	2718	2723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998557
44	NC_009665	CAA	2	6	2773	2778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998557
45	NC_009665	GAT	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998557
46	NC_009665	GAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998557
47	NC_009665	CGG	2	6	2951	2956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009665	GCA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009665	TAA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998558
50	NC_009665	GTG	2	6	3360	3365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998558
51	NC_009665	CCG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998558
52	NC_009665	CGC	2	6	3554	3559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998558
53	NC_009665	ACT	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998558
54	NC_009665	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998558
55	NC_009665	ACA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998558
56	NC_009665	GAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998558
57	NC_009665	CTG	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998558
58	NC_009665	ATA	2	6	4186	4191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998559
59	NC_009665	TTC	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998559
60	NC_009665	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
61	NC_009665	CAT	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998559
62	NC_009665	AGT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998559
63	NC_009665	GAA	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998559
64	NC_009665	GCA	2	6	4461	4466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
65	NC_009665	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998559
66	NC_009665	CGA	2	6	4505	4510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
67	NC_009665	TGG	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998559
68	NC_009665	TCG	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
69	NC_009665	TGA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998559
70	NC_009665	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998559
71	NC_009665	TAA	2	6	4883	4888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998559
72	NC_009665	CAA	2	6	4898	4903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998559
73	NC_009665	CAA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998559
74	NC_009665	TGG	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998559
75	NC_009665	CGA	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
76	NC_009665	CTG	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
77	NC_009665	GCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998559
78	NC_009665	CGT	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
79	NC_009665	GGT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998559
80	NC_009665	CTG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
81	NC_009665	TGT	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998559
82	NC_009665	AAG	2	6	5587	5592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998559
83	NC_009665	CGA	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
84	NC_009665	CAT	4	12	5669	5680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998559
85	NC_009665	CTT	3	9	5729	5737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998559
86	NC_009665	CCA	2	6	5787	5792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998559
87	NC_009665	TTG	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998559
88	NC_009665	AGC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
89	NC_009665	ACC	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998559
90	NC_009665	TGG	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998559
91	NC_009665	AGC	2	6	6117	6122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
92	NC_009665	CTG	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
93	NC_009665	CTT	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998559
94	NC_009665	GAA	2	6	6297	6302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998559
95	NC_009665	GGC	2	6	6303	6308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998559
96	NC_009665	TGA	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998559
97	NC_009665	GTT	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998559
98	NC_009665	TCT	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998560
99	NC_009665	CAA	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998560
100	NC_009665	TGC	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998560
101	NC_009665	ACA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998560
102	NC_009665	CAT	2	6	6862	6867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998560
103	NC_009665	GCA	2	6	7257	7262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998560
104	NC_009665	AGT	2	6	7326	7331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998560
105	NC_009665	CTA	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009665	CTT	2	6	7442	7447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009665	AGT	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998561
108	NC_009665	TCG	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998561
109	NC_009665	AAT	2	6	7599	7604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998561
110	NC_009665	CTG	2	6	7624	7629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998561
111	NC_009665	CTT	2	6	7903	7908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998561
112	NC_009665	AGC	2	6	7995	8000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998561
113	NC_009665	TCA	2	6	8006	8011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998561
114	NC_009665	CGC	2	6	8027	8032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998561
115	NC_009665	ATA	2	6	8249	8254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998561
116	NC_009665	TTA	2	6	8366	8371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998561
117	NC_009665	ATC	2	6	8377	8382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998561
118	NC_009665	CGT	2	6	8391	8396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009665	TGC	2	6	8480	8485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009665	GCA	2	6	8540	8545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009665	TAT	2	6	8654	8659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009665	ATT	2	6	8687	8692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009665	TAA	2	6	8732	8737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998562
124	NC_009665	TGT	2	6	8893	8898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998562
125	NC_009665	TAA	2	6	8933	8938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998562
126	NC_009665	ACA	2	6	9179	9184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998562
127	NC_009665	CAC	2	6	9227	9232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998562
128	NC_009665	TCG	2	6	9275	9280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998562
129	NC_009665	CGA	2	6	9341	9346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998562
130	NC_009665	ATG	2	6	9382	9387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998562
131	NC_009665	AGC	2	6	9448	9453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998562
132	NC_009665	TGA	2	6	9478	9483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998562
133	NC_009665	CGA	2	6	9484	9489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998562
134	NC_009665	CGC	2	6	9599	9604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998562
135	NC_009665	TGC	2	6	9643	9648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998562
136	NC_009665	GCA	2	6	9692	9697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998562
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143	NC_009665	AGT	2	6	10039	10044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998563
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