MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS185 chromosome

Total Repeats: 92092

< Previous12...173174175176177178179180181182183184185Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
92001	NC_009665	GAT	2	6	5224723	5224728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92002	NC_009665	TA	3	6	5224754	5224759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92003	NC_009665	TCT	2	6	5224762	5224767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92004	NC_009665	TAT	2	6	5224768	5224773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92005	NC_009665	TA	3	6	5224819	5224824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92006	NC_009665	ATTA	2	8	5224829	5224836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92007	NC_009665	TGATC	2	10	5224854	5224863	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92008	NC_009665	ATA	2	6	5224968	5224973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92009	NC_009665	TCT	2	6	5225109	5225114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153002873
92010	NC_009665	AATT	2	8	5225189	5225196	50 %	50 %	0 %	0 %	153002873
92011	NC_009665	CA	3	6	5225380	5225385	50 %	0 %	0 %	50 %	153002873
92012	NC_009665	CAT	2	6	5225438	5225443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153002873
92013	NC_009665	TCG	2	6	5225445	5225450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153002873
92014	NC_009665	TGT	2	6	5225474	5225479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153002873
92015	NC_009665	TCA	2	6	5225593	5225598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92016	NC_009665	GAG	2	6	5225665	5225670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92017	NC_009665	AT	3	6	5225680	5225685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92018	NC_009665	TTG	2	6	5225721	5225726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92019	NC_009665	CAA	2	6	5225731	5225736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92020	NC_009665	CAG	2	6	5225881	5225886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153002874
92021	NC_009665	GAC	3	9	5225964	5225972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153002874
92022	NC_009665	TTC	2	6	5226037	5226042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153002874
92023	NC_009665	TTC	2	6	5226091	5226096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153002874
92024	NC_009665	TCA	2	6	5226099	5226104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153002874
92025	NC_009665	TTA	2	6	5226131	5226136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153002874
92026	NC_009665	CGG	3	9	5226207	5226215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153002874
92027	NC_009665	CCA	2	6	5226228	5226233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153002874
92028	NC_009665	AAT	2	6	5226331	5226336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153002874
92029	NC_009665	GAC	2	6	5226465	5226470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153002874
92030	NC_009665	AAT	2	6	5226499	5226504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153002874
92031	NC_009665	CTTG	2	8	5226510	5226517	0 %	50 %	25 %	25 %	153002874
92032	NC_009665	GAT	2	6	5226547	5226552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153002874
92033	NC_009665	CTT	2	6	5226597	5226602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153002874
92034	NC_009665	CCA	2	6	5226657	5226662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153002874
92035	NC_009665	GC	3	6	5226705	5226710	0 %	0 %	50 %	50 %	153002874
92036	NC_009665	TGG	2	6	5226729	5226734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153002874
92037	NC_009665	ACC	2	6	5226832	5226837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153002874
92038	NC_009665	GCC	2	6	5226880	5226885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153002874
92039	NC_009665	A	6	6	5226937	5226942	100 %	0 %	0 %	0 %	153002874
92040	NC_009665	AAT	2	6	5226993	5226998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153002874
92041	NC_009665	ATG	2	6	5227073	5227078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153002874
92042	NC_009665	CGC	2	6	5227083	5227088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153002874
92043	NC_009665	CCA	2	6	5227143	5227148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92044	NC_009665	CTA	2	6	5227158	5227163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92045	NC_009665	GGC	2	6	5227181	5227186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92046	NC_009665	GCC	2	6	5227194	5227199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92047	NC_009665	ATT	2	6	5227220	5227225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92048	NC_009665	T	6	6	5227274	5227279	0 %	100 %	0 %	0 %	153002875
92049	NC_009665	ATAA	2	8	5227292	5227299	75 %	25 %	0 %	0 %	153002875
92050	NC_009665	TCT	2	6	5227300	5227305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153002875
92051	NC_009665	CAGTA	2	10	5227338	5227347	40 %	20 %	20 %	20 %	153002875
92052	NC_009665	GAA	2	6	5227370	5227375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153002875
92053	NC_009665	CAT	2	6	5227403	5227408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153002875
92054	NC_009665	TCT	2	6	5227450	5227455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153002875
92055	NC_009665	GTA	2	6	5227496	5227501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153002875
92056	NC_009665	ATA	2	6	5227611	5227616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153002875
92057	NC_009665	TCTT	2	8	5227647	5227654	0 %	75 %	0 %	25 %	153002875
92058	NC_009665	CAT	2	6	5227664	5227669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153002875
92059	NC_009665	TCA	2	6	5227692	5227697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153002875
92060	NC_009665	AGTC	2	8	5227714	5227721	25 %	25 %	25 %	25 %	153002875
92061	NC_009665	AAT	2	6	5227814	5227819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153002875
92062	NC_009665	CGA	2	6	5227837	5227842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153002875
92063	NC_009665	ACC	2	6	5227885	5227890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153002875
92064	NC_009665	CCGCG	2	10	5228017	5228026	0 %	0 %	40 %	60 %	153002875
92065	NC_009665	CCGC	2	8	5228046	5228053	0 %	0 %	25 %	75 %	153002875
92066	NC_009665	TGT	2	6	5228118	5228123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153002875
92067	NC_009665	TCA	2	6	5228178	5228183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153002875
92068	NC_009665	CAC	3	9	5228224	5228232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153002875
92069	NC_009665	GGTA	2	8	5228233	5228240	25 %	25 %	50 %	0 %	153002875
92070	NC_009665	TGC	2	6	5228251	5228256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153002875
92071	NC_009665	GTTT	2	8	5228274	5228281	0 %	75 %	25 %	0 %	153002875
92072	NC_009665	GTT	2	6	5228324	5228329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153002875
92073	NC_009665	TA	3	6	5228540	5228545	50 %	50 %	0 %	0 %	153002875
92074	NC_009665	GCA	2	6	5228619	5228624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153002875
92075	NC_009665	CTG	2	6	5228707	5228712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153002875
92076	NC_009665	TG	3	6	5228749	5228754	0 %	50 %	50 %	0 %	153002875
92077	NC_009665	AGT	2	6	5228850	5228855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153002875
92078	NC_009665	AT	3	6	5228866	5228871	50 %	50 %	0 %	0 %	153002875
92079	NC_009665	TATT	2	8	5228892	5228899	25 %	75 %	0 %	0 %	153002876
92080	NC_009665	G	6	6	5228916	5228921	0 %	0 %	100 %	0 %	153002876
92081	NC_009665	CCG	2	6	5228934	5228939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153002876
92082	NC_009665	CAA	2	6	5228982	5228987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153002876
92083	NC_009665	GCG	2	6	5229124	5229129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153002876
92084	NC_009665	TTG	2	6	5229161	5229166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153002877
92085	NC_009665	TTTCCA	2	12	5229177	5229188	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	153002877
92086	NC_009665	CAA	2	6	5229210	5229215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153002877
92087	NC_009665	TGT	2	6	5229338	5229343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153002877
92088	NC_009665	CAG	2	6	5229375	5229380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153002877
92089	NC_009665	TTA	2	6	5229481	5229486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153002878
92090	NC_009665	ACG	3	9	5229514	5229522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153002878
92091	NC_009665	GCC	2	6	5229538	5229543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153002878
92092	NC_009665	ATG	2	6	5229620	5229625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153002878

< Previous12...173174175176177178179180181182183184185Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.