MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	TGAAA	2	10	1164	1173	60 %	20 %	20 %	0 %	152998485
2	NC_009661	GAATC	2	10	1359	1368	40 %	20 %	20 %	20 %	152998485
3	NC_009661	CTTTA	2	10	2051	2060	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009661	ACCGT	2	10	4908	4917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009661	AATTG	2	10	5610	5619	40 %	40 %	20 %	0 %	152998490
6	NC_009661	AAAGA	2	10	6367	6376	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009661	GTGAC	2	10	8107	8116	20 %	20 %	40 %	20 %	152998492
8	NC_009661	AAAGC	2	10	10867	10876	60 %	0 %	20 %	20 %	152998494
9	NC_009661	AAGCA	2	10	11051	11060	60 %	0 %	20 %	20 %	152998494
10	NC_009661	TCGAC	2	10	13120	13129	20 %	20 %	20 %	40 %	152998498
11	NC_009661	GTGAT	2	10	13806	13815	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009661	GGTCT	2	10	15226	15235	0 %	40 %	40 %	20 %	152998500
13	NC_009661	ACGTC	2	10	15623	15632	20 %	20 %	20 %	40 %	152998500
14	NC_009661	CCACA	2	10	15634	15643	40 %	0 %	0 %	60 %	152998500
15	NC_009661	CTTCA	2	10	15870	15879	20 %	40 %	0 %	40 %	152998500
16	NC_009661	TTTTC	2	10	15910	15919	0 %	80 %	0 %	20 %	152998500
17	NC_009661	GTCAC	2	10	16726	16735	20 %	20 %	20 %	40 %	152998501
18	NC_009661	TGGTC	2	10	20657	20666	0 %	40 %	40 %	20 %	152998503
19	NC_009661	AAAAG	2	10	21490	21499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009661	AGTGA	2	10	21532	21541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009661	GCGTT	2	10	21858	21867	0 %	40 %	40 %	20 %	152998504
22	NC_009661	CTTGG	2	10	22378	22387	0 %	40 %	40 %	20 %	152998504
23	NC_009661	ATAAA	2	10	22590	22599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009661	ATCAT	2	10	22653	22662	40 %	40 %	0 %	20 %	152998505
25	NC_009661	ATGCT	2	10	26211	26220	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009661	CACGT	2	10	26784	26793	20 %	20 %	20 %	40 %	152998509
27	NC_009661	ATGCA	2	10	27553	27562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009661	GTGAC	2	10	28502	28511	20 %	20 %	40 %	20 %	152998510
29	NC_009661	TCGCT	2	10	31982	31991	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009661	CCAAA	2	10	32079	32088	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009661	CTTGT	2	10	34045	34054	0 %	60 %	20 %	20 %	152998514
32	NC_009661	GCCAA	2	10	35105	35114	40 %	0 %	20 %	40 %	152998516
33	NC_009661	TCGCT	2	10	35884	35893	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009661	TTCGC	2	10	36122	36131	0 %	40 %	20 %	40 %	152998518
35	NC_009661	GATAT	2	10	36840	36849	40 %	40 %	20 %	0 %	152998518
36	NC_009661	TCGCT	2	10	38977	38986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009661	TTCGC	2	10	39215	39224	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009661	CAAAA	2	10	39421	39430	80 %	0 %	0 %	20 %	152998523
39	NC_009661	GAGAA	2	10	41288	41297	60 %	0 %	40 %	0 %	152998525
40	NC_009661	TTTAT	2	10	41713	41722	20 %	80 %	0 %	0 %	152998526
41	NC_009661	CTGTT	2	10	43924	43933	0 %	60 %	20 %	20 %	152998526
42	NC_009661	GCTGT	2	10	45147	45156	0 %	40 %	40 %	20 %	152998526
43	NC_009661	TTTGT	2	10	45731	45740	0 %	80 %	20 %	0 %	152998526
44	NC_009661	GCTCT	2	10	47409	47418	0 %	40 %	20 %	40 %	152998526
45	NC_009661	TTCTT	2	10	47491	47500	0 %	80 %	0 %	20 %	152998526
46	NC_009661	GCCGC	2	10	47518	47527	0 %	0 %	40 %	60 %	152998526
47	NC_009661	TGCGC	2	10	48019	48028	0 %	20 %	40 %	40 %	152998527
48	NC_009661	TGGTT	2	10	49027	49036	0 %	60 %	40 %	0 %	152998527
49	NC_009661	CACAC	2	10	49177	49186	40 %	0 %	0 %	60 %	152998527
50	NC_009661	TAGCA	2	10	49788	49797	40 %	20 %	20 %	20 %	152998527
51	NC_009661	TTTTG	2	10	52399	52408	0 %	80 %	20 %	0 %	152998529
52	NC_009661	GCCTT	2	10	54383	54392	0 %	40 %	20 %	40 %	152998530
53	NC_009661	TGGTT	2	10	56985	56994	0 %	60 %	40 %	0 %	152998533
54	NC_009661	TTTGC	2	10	59261	59270	0 %	60 %	20 %	20 %	152998535
55	NC_009661	AAATG	2	10	60351	60360	60 %	20 %	20 %	0 %	152998536
56	NC_009661	TGCCA	2	10	62465	62474	20 %	20 %	20 %	40 %	152998539
57	NC_009661	CTTCT	2	10	63145	63154	0 %	60 %	0 %	40 %	152998539
58	NC_009661	ATGCA	2	10	63411	63420	40 %	20 %	20 %	20 %	152998539
59	NC_009661	ATGGC	2	10	66772	66781	20 %	20 %	40 %	20 %	152998542
60	NC_009661	GACGA	2	10	67177	67186	40 %	0 %	40 %	20 %	152998543
61	NC_009661	TGTTT	2	10	67233	67242	0 %	80 %	20 %	0 %	152998543
62	NC_009661	GTAAG	2	10	68932	68941	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009661	ATAGT	2	10	69225	69234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009661	CATTA	2	10	69745	69754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009661	ACGAA	2	10	69971	69980	60 %	0 %	20 %	20 %	152998546
66	NC_009661	GTACA	2	10	74071	74080	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009661	AAGGT	2	10	76758	76767	40 %	20 %	40 %	0 %	152998551
68	NC_009661	CGATG	2	10	81200	81209	20 %	20 %	40 %	20 %	152998553
69	NC_009661	GCAGA	2	10	81297	81306	40 %	0 %	40 %	20 %	152998553

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.