MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 1516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	AT	3	6	10	15	50 %	50 %	0 %	0 %	152998484
2	NC_009661	CTA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998484
3	NC_009661	A	7	7	23	29	100 %	0 %	0 %	0 %	152998484
4	NC_009661	GA	3	6	59	64	50 %	0 %	50 %	0 %	152998484
5	NC_009661	T	6	6	73	78	0 %	100 %	0 %	0 %	152998484
6	NC_009661	AT	3	6	115	120	50 %	50 %	0 %	0 %	152998484
7	NC_009661	AAG	2	6	135	140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998484
8	NC_009661	TTA	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998484
9	NC_009661	AGA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998484
10	NC_009661	A	6	6	275	280	100 %	0 %	0 %	0 %	152998484
11	NC_009661	TGT	2	6	337	342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998484
12	NC_009661	TG	3	6	457	462	0 %	50 %	50 %	0 %	152998485
13	NC_009661	ACAGGA	2	12	538	549	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152998485
14	NC_009661	GTG	2	6	569	574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998485
15	NC_009661	ATT	2	6	597	602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998485
16	NC_009661	GCAGAT	2	12	607	618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152998485
17	NC_009661	TTAT	2	8	669	676	25 %	75 %	0 %	0 %	152998485
18	NC_009661	TGC	2	6	687	692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998485
19	NC_009661	AAC	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998485
20	NC_009661	AAAC	2	8	756	763	75 %	0 %	0 %	25 %	152998485
21	NC_009661	CCT	2	6	805	810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998485
22	NC_009661	GTT	2	6	915	920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998485
23	NC_009661	AAC	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998485
24	NC_009661	AAAC	2	8	1034	1041	75 %	0 %	0 %	25 %	152998485
25	NC_009661	TCC	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998485
26	NC_009661	AAGA	2	8	1098	1105	75 %	0 %	25 %	0 %	152998485
27	NC_009661	ACA	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998485
28	NC_009661	TGAAA	2	10	1164	1173	60 %	20 %	20 %	0 %	152998485
29	NC_009661	GAT	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998485
30	NC_009661	GAA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998485
31	NC_009661	CCT	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998485
32	NC_009661	TGC	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998485
33	NC_009661	GGTT	2	8	1346	1353	0 %	50 %	50 %	0 %	152998485
34	NC_009661	GAATC	2	10	1359	1368	40 %	20 %	20 %	20 %	152998485
35	NC_009661	CCAA	2	8	1389	1396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009661	GTT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009661	CCAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009661	GAT	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009661	TAA	2	6	1464	1469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009661	T	6	6	1537	1542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009661	TTG	2	6	1550	1555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009661	T	7	7	1557	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009661	AGA	2	6	1573	1578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009661	CTAA	2	8	1653	1660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009661	TAC	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009661	GCTT	2	8	1757	1764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009661	TTG	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009661	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009661	AGTT	2	8	1910	1917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009661	ACTG	2	8	1950	1957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009661	ATCAAT	2	12	1971	1982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009661	CTTTA	2	10	2051	2060	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009661	TTA	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009661	A	6	6	2150	2155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009661	ATT	2	6	2207	2212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009661	GAA	3	9	2355	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998486
57	NC_009661	AG	4	8	2366	2373	50 %	0 %	50 %	0 %	152998486
58	NC_009661	CCA	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998486
59	NC_009661	GGT	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998486
60	NC_009661	TAC	2	6	2474	2479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998486
61	NC_009661	TA	4	8	2498	2505	50 %	50 %	0 %	0 %	152998486
62	NC_009661	TGA	2	6	2506	2511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998486
63	NC_009661	GAAT	2	8	2555	2562	50 %	25 %	25 %	0 %	152998486
64	NC_009661	A	6	6	2574	2579	100 %	0 %	0 %	0 %	152998486
65	NC_009661	AT	3	6	2604	2609	50 %	50 %	0 %	0 %	152998486
66	NC_009661	GA	3	6	2613	2618	50 %	0 %	50 %	0 %	152998486
67	NC_009661	TGC	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998486
68	NC_009661	TGC	2	6	2675	2680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998486
69	NC_009661	A	7	7	2690	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	152998486
70	NC_009661	ATA	2	6	2701	2706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998486
71	NC_009661	TACT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	0 %	25 %	152998486
72	NC_009661	ATT	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998486
73	NC_009661	TTA	2	6	2785	2790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998486
74	NC_009661	ATG	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998486
75	NC_009661	TTA	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998486
76	NC_009661	TCAT	2	8	2933	2940	25 %	50 %	0 %	25 %	152998486
77	NC_009661	GTAA	2	8	2959	2966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009661	ATTT	2	8	2993	3000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009661	CTTC	2	8	3142	3149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009661	T	7	7	3159	3165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009661	GCT	2	6	3227	3232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998487
82	NC_009661	AGT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998487
83	NC_009661	TCT	2	6	3397	3402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998487
84	NC_009661	ATC	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998487
85	NC_009661	ATCA	2	8	3439	3446	50 %	25 %	0 %	25 %	152998487
86	NC_009661	TCAG	2	8	3452	3459	25 %	25 %	25 %	25 %	152998487
87	NC_009661	TTC	2	6	3481	3486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998487
88	NC_009661	ACA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998487
89	NC_009661	ACTT	2	8	3555	3562	25 %	50 %	0 %	25 %	152998487
90	NC_009661	GC	3	6	3791	3796	0 %	0 %	50 %	50 %	152998487
91	NC_009661	AT	3	6	3881	3886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009661	TTG	2	6	3994	3999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009661	GATTGA	2	12	4067	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998488
94	NC_009661	GTT	2	6	4119	4124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998488
95	NC_009661	TTTA	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	152998488
96	NC_009661	TGA	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998488
97	NC_009661	GAA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998488
98	NC_009661	AGA	2	6	4310	4315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998488
99	NC_009661	ATT	2	6	4384	4389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009661	GAAG	2	8	4406	4413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009661	GTTTGA	2	12	4419	4430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009661	TCC	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009661	TGG	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009661	A	6	6	4561	4566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009661	ATG	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009661	GCGG	2	8	4613	4620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009661	CAT	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009661	TAT	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009661	TTA	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009661	CTG	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009661	TGC	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009661	GCA	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009661	GGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009661	ACCGT	2	10	4908	4917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009661	TCC	2	6	4927	4932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009661	TGT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998489
117	NC_009661	TTC	2	6	5133	5138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998489
118	NC_009661	CTA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998489
119	NC_009661	TAG	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998489
120	NC_009661	TCACTA	2	12	5179	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998489
121	NC_009661	AATA	2	8	5205	5212	75 %	25 %	0 %	0 %	152998489
122	NC_009661	ATTG	2	8	5220	5227	25 %	50 %	25 %	0 %	152998489
123	NC_009661	CTT	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998489
124	NC_009661	T	6	6	5361	5366	0 %	100 %	0 %	0 %	152998489
125	NC_009661	GTT	2	6	5436	5441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998489
126	NC_009661	TAA	2	6	5492	5497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998490
127	NC_009661	TGT	2	6	5576	5581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998490
128	NC_009661	AATTG	2	10	5610	5619	40 %	40 %	20 %	0 %	152998490
129	NC_009661	TTTTAG	2	12	5635	5646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152998490
130	NC_009661	CT	3	6	5651	5656	0 %	50 %	0 %	50 %	152998490
131	NC_009661	CAC	2	6	5696	5701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998490
132	NC_009661	GCTT	2	8	5712	5719	0 %	50 %	25 %	25 %	152998490
133	NC_009661	TTG	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998490
134	NC_009661	CAC	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998490
135	NC_009661	GT	3	6	5797	5802	0 %	50 %	50 %	0 %	152998490
136	NC_009661	CAA	2	6	5824	5829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998490
137	NC_009661	TACC	2	8	6001	6008	25 %	25 %	0 %	50 %	152998490
138	NC_009661	ATT	2	6	6062	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009661	GTTG	2	8	6138	6145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009661	GTA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009661	TAA	2	6	6249	6254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009661	ATGC	2	8	6286	6293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009661	AAAGA	2	10	6367	6376	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009661	ATT	2	6	6537	6542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009661	GCC	2	6	6705	6710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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275	NC_009661	TGA	2	6	14951	14956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_009661	CAT	2	6	15044	15049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_009661	AT	3	6	15081	15086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_009661	AT	3	6	15133	15138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_009661	CCA	2	6	15208	15213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998500
280	NC_009661	GGTCT	2	10	15226	15235	0 %	40 %	40 %	20 %	152998500
281	NC_009661	CAA	2	6	15361	15366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998500
282	NC_009661	AT	3	6	15459	15464	50 %	50 %	0 %	0 %	152998500
283	NC_009661	AAC	2	6	15582	15587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998500
284	NC_009661	ACGTC	2	10	15623	15632	20 %	20 %	20 %	40 %	152998500
285	NC_009661	CCACA	2	10	15634	15643	40 %	0 %	0 %	60 %	152998500
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288	NC_009661	CTTCA	2	10	15870	15879	20 %	40 %	0 %	40 %	152998500
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293	NC_009661	CTT	2	6	16094	16099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998500
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296	NC_009661	TAA	2	6	16345	16350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_009661	CAA	2	6	16445	16450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998501
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301	NC_009661	ACGA	2	8	16878	16885	50 %	0 %	25 %	25 %	152998501
302	NC_009661	CCTT	2	8	16906	16913	0 %	50 %	0 %	50 %	152998501
303	NC_009661	TTC	2	6	16921	16926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998501
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308	NC_009661	TTTC	2	8	17170	17177	0 %	75 %	0 %	25 %	152998501
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311	NC_009661	TTC	2	6	17403	17408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998501
312	NC_009661	GAT	2	6	17548	17553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
313	NC_009661	AGA	2	6	17737	17742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
314	NC_009661	GTT	2	6	17899	17904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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338	NC_009661	A	6	6	18971	18976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NC_009661	TAA	2	6	18993	18998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998503
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374	NC_009661	TAC	2	6	20821	20826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998503
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376	NC_009661	TTAG	2	8	20988	20995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
377	NC_009661	ATT	2	6	21062	21067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
378	NC_009661	CAT	2	6	21175	21180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
379	NC_009661	GAA	2	6	21313	21318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
380	NC_009661	GAG	2	6	21335	21340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
381	NC_009661	A	6	6	21355	21360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_009661	CT	3	6	21369	21374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
383	NC_009661	AAAAG	2	10	21490	21499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_009661	ATA	2	6	21666	21671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
386	NC_009661	AGA	2	6	21696	21701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
387	NC_009661	CTG	2	6	21708	21713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_009661	GAC	2	6	21826	21831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998504
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393	NC_009661	AGA	2	6	21902	21907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998504
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395	NC_009661	A	6	6	22002	22007	100 %	0 %	0 %	0 %	152998504
396	NC_009661	TAT	2	6	22074	22079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998504
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400	NC_009661	CAA	2	6	22160	22165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998504
401	NC_009661	CAAC	2	8	22172	22179	50 %	0 %	0 %	50 %	152998504
402	NC_009661	GTT	2	6	22197	22202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998504
403	NC_009661	TGC	3	9	22223	22231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998504
404	NC_009661	AAT	2	6	22311	22316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998504
405	NC_009661	CTTGG	2	10	22378	22387	0 %	40 %	40 %	20 %	152998504
406	NC_009661	A	6	6	22431	22436	100 %	0 %	0 %	0 %	152998504
407	NC_009661	GAT	2	6	22442	22447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998504
408	NC_009661	GGC	2	6	22490	22495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998504
409	NC_009661	TGT	2	6	22579	22584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
410	NC_009661	ATAAA	2	10	22590	22599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_009661	CT	3	6	22632	22637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
412	NC_009661	ATCAT	2	10	22653	22662	40 %	40 %	0 %	20 %	152998505
413	NC_009661	TAT	2	6	22677	22682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998505
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420	NC_009661	A	6	6	23607	23612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_009661	C	6	6	23622	23627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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433	NC_009661	AT	3	6	24408	24413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_009661	ACC	2	6	24869	24874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
439	NC_009661	ATT	2	6	25139	25144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_009661	CAG	2	6	25196	25201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_009661	TTA	2	6	25218	25223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_009661	ATA	2	6	25253	25258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_009661	GGT	2	6	25447	25452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_009661	ATA	2	6	25876	25881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998508
451	NC_009661	TTG	2	6	25948	25953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998508
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481	NC_009661	GCA	2	6	27463	27468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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484	NC_009661	ATT	2	6	27514	27519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_009661	CTG	2	6	27591	27596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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