MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 2522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009641	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	151220213
2	NC_009641	AATTT	2	10	2500	2509	40 %	60 %	0 %	0 %	151220214
3	NC_009641	CAATT	2	10	2566	2575	40 %	40 %	0 %	20 %	151220214
4	NC_009641	AAATT	2	10	2944	2953	60 %	40 %	0 %	0 %	151220214
5	NC_009641	CAAAT	2	10	5231	5240	60 %	20 %	0 %	20 %	151220216
6	NC_009641	TGAAT	2	10	6741	6750	40 %	40 %	20 %	0 %	151220216
7	NC_009641	TGAAC	2	10	6982	6991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009641	TTCAA	2	10	7728	7737	40 %	40 %	0 %	20 %	151220217
9	NC_009641	GGTGT	2	10	10130	10139	0 %	40 %	60 %	0 %	151220218
10	NC_009641	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	151220218
11	NC_009641	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	151220219
12	NC_009641	AGGAA	2	10	14349	14358	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009641	GTAGG	2	10	14409	14418	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009641	TTATT	2	10	15449	15458	20 %	80 %	0 %	0 %	151220222
15	NC_009641	GCAAG	2	10	16623	16632	40 %	0 %	40 %	20 %	151220223
16	NC_009641	TTTGA	2	10	16782	16791	20 %	60 %	20 %	0 %	151220223
17	NC_009641	AGTTA	2	10	22095	22104	40 %	40 %	20 %	0 %	151220227
18	NC_009641	ATGTA	2	10	23653	23662	40 %	40 %	20 %	0 %	151220228
19	NC_009641	TCGAT	2	10	23817	23826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009641	ATATT	2	10	24355	24364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009641	ACCAA	2	10	26264	26273	60 %	0 %	0 %	40 %	151220230
22	NC_009641	ATCAA	2	10	26976	26985	60 %	20 %	0 %	20 %	151220230
23	NC_009641	GAAAC	2	10	27597	27606	60 %	0 %	20 %	20 %	151220231
24	NC_009641	GAAGT	2	10	27747	27756	40 %	20 %	40 %	0 %	151220231
25	NC_009641	ATTAT	2	10	29390	29399	40 %	60 %	0 %	0 %	151220232
26	NC_009641	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	151220234
27	NC_009641	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	151220235
28	NC_009641	TAGTA	2	10	36245	36254	40 %	40 %	20 %	0 %	151220236
29	NC_009641	TTTTA	2	10	36461	36470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009641	TACTA	2	10	37423	37432	40 %	40 %	0 %	20 %	151220238
31	NC_009641	ATCAA	2	10	40176	40185	60 %	20 %	0 %	20 %	151220240
32	NC_009641	TAATA	2	10	42008	42017	60 %	40 %	0 %	0 %	151220241
33	NC_009641	GTGTT	2	10	42091	42100	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009641	ATTTT	2	10	44617	44626	20 %	80 %	0 %	0 %	151220244
35	NC_009641	TATGG	2	10	46629	46638	20 %	40 %	40 %	0 %	151220247
36	NC_009641	TAACT	2	10	46934	46943	40 %	40 %	0 %	20 %	151220247
37	NC_009641	ATTGC	2	10	48206	48215	20 %	40 %	20 %	20 %	151220248
38	NC_009641	AGAAA	2	10	49126	49135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009641	TAAAG	2	10	49167	49176	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009641	ATTCA	2	10	49439	49448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009641	TATAT	2	10	49700	49709	40 %	60 %	0 %	0 %	151220250
42	NC_009641	CTAAA	2	10	51340	51349	60 %	20 %	0 %	20 %	151220251
43	NC_009641	CAAAA	2	10	51371	51380	80 %	0 %	0 %	20 %	151220251
44	NC_009641	TTACC	2	10	54487	54496	20 %	40 %	0 %	40 %	151220253
45	NC_009641	GATAT	2	10	56062	56071	40 %	40 %	20 %	0 %	151220254
46	NC_009641	TACTA	2	10	56598	56607	40 %	40 %	0 %	20 %	151220255
47	NC_009641	TTTAC	2	10	57007	57016	20 %	60 %	0 %	20 %	151220255
48	NC_009641	ATTGC	2	10	59490	59499	20 %	40 %	20 %	20 %	151220258
49	NC_009641	CATGG	2	10	60894	60903	20 %	20 %	40 %	20 %	151220258
50	NC_009641	TGAAA	2	10	61562	61571	60 %	20 %	20 %	0 %	151220259
51	NC_009641	TCAAT	2	10	61934	61943	40 %	40 %	0 %	20 %	151220259
52	NC_009641	GTATT	2	10	62423	62432	20 %	60 %	20 %	0 %	151220260
53	NC_009641	AGATA	2	10	68294	68303	60 %	20 %	20 %	0 %	151220263
54	NC_009641	TAAAA	2	10	68854	68863	80 %	20 %	0 %	0 %	151220263
55	NC_009641	AAAGA	2	10	70487	70496	80 %	0 %	20 %	0 %	151220264
56	NC_009641	GTAAT	2	10	70706	70715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009641	CAATT	2	10	71138	71147	40 %	40 %	0 %	20 %	151220265
58	NC_009641	ATGTT	2	10	71972	71981	20 %	60 %	20 %	0 %	151220266
59	NC_009641	TTGCG	2	10	72543	72552	0 %	40 %	40 %	20 %	151220266
60	NC_009641	AGTTA	2	10	74079	74088	40 %	40 %	20 %	0 %	151220267
61	NC_009641	AGATG	2	10	77452	77461	40 %	20 %	40 %	0 %	151220269
62	NC_009641	GGTGA	2	10	78048	78057	20 %	20 %	60 %	0 %	151220270
63	NC_009641	GAAAA	2	10	81485	81494	80 %	0 %	20 %	0 %	151220273
64	NC_009641	TTATT	2	10	81652	81661	20 %	80 %	0 %	0 %	151220273
65	NC_009641	AATCA	2	10	84674	84683	60 %	20 %	0 %	20 %	151220275
66	NC_009641	GCACG	2	10	85078	85087	20 %	0 %	40 %	40 %	151220276
67	NC_009641	ATTTT	2	10	85372	85381	20 %	80 %	0 %	0 %	151220276
68	NC_009641	ATCAA	2	10	85399	85408	60 %	20 %	0 %	20 %	151220276
69	NC_009641	ATCAC	2	10	86632	86641	40 %	20 %	0 %	40 %	151220277
70	NC_009641	AACGA	2	10	87309	87318	60 %	0 %	20 %	20 %	151220277
71	NC_009641	ACACA	2	10	89365	89374	60 %	0 %	0 %	40 %	151220279
72	NC_009641	GACAA	2	10	90516	90525	60 %	0 %	20 %	20 %	151220280
73	NC_009641	ATTAC	2	10	93157	93166	40 %	40 %	0 %	20 %	151220283
74	NC_009641	ATTTT	2	10	93461	93470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009641	TATCT	2	10	93817	93826	20 %	60 %	0 %	20 %	151220284
76	NC_009641	ATACG	2	10	96250	96259	40 %	20 %	20 %	20 %	151220286
77	NC_009641	TTATA	2	10	96908	96917	40 %	60 %	0 %	0 %	151220287
78	NC_009641	TTTTA	2	10	97706	97715	20 %	80 %	0 %	0 %	151220287
79	NC_009641	GTATT	2	10	98219	98228	20 %	60 %	20 %	0 %	151220288
80	NC_009641	AATAA	2	10	98812	98821	80 %	20 %	0 %	0 %	151220288
81	NC_009641	TACGC	2	10	99079	99088	20 %	20 %	20 %	40 %	151220288
82	NC_009641	GACAA	2	10	100421	100430	60 %	0 %	20 %	20 %	151220290
83	NC_009641	TCCCT	2	10	101887	101896	0 %	40 %	0 %	60 %	151220291
84	NC_009641	GCTTT	2	10	104121	104130	0 %	60 %	20 %	20 %	151220293
85	NC_009641	TAATT	2	10	104206	104215	40 %	60 %	0 %	0 %	151220293
86	NC_009641	ATACT	2	10	105387	105396	40 %	40 %	0 %	20 %	151220295
87	NC_009641	TAATA	2	10	106553	106562	60 %	40 %	0 %	0 %	151220296
88	NC_009641	ATTTT	2	10	107544	107553	20 %	80 %	0 %	0 %	151220297
89	NC_009641	TTGTA	2	10	109768	109777	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009641	TGCAA	2	10	110773	110782	40 %	20 %	20 %	20 %	151220299
91	NC_009641	ATATG	2	10	112791	112800	40 %	40 %	20 %	0 %	151220300
92	NC_009641	AATAT	2	10	113659	113668	60 %	40 %	0 %	0 %	151220301
93	NC_009641	ATTTT	2	10	115048	115057	20 %	80 %	0 %	0 %	151220304
94	NC_009641	GATTT	2	10	115102	115111	20 %	60 %	20 %	0 %	151220304
95	NC_009641	GGGGC	2	10	115371	115380	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009641	TGGTA	2	10	117999	118008	20 %	40 %	40 %	0 %	151220306
97	NC_009641	CGAAC	2	10	118089	118098	40 %	0 %	20 %	40 %	151220306
98	NC_009641	TTCAA	2	10	120116	120125	40 %	40 %	0 %	20 %	151220307
99	NC_009641	ACATC	2	10	120959	120968	40 %	20 %	0 %	40 %	151220309
100	NC_009641	TAATT	2	10	123182	123191	40 %	60 %	0 %	0 %	151220310
101	NC_009641	AGAGA	2	10	126208	126217	60 %	0 %	40 %	0 %	151220313
102	NC_009641	AATCC	2	10	126564	126573	40 %	20 %	0 %	40 %	151220313
103	NC_009641	CTAAT	2	10	130459	130468	40 %	40 %	0 %	20 %	151220317
104	NC_009641	TGAAT	2	10	135320	135329	40 %	40 %	20 %	0 %	151220322
105	NC_009641	TGATT	2	10	136451	136460	20 %	60 %	20 %	0 %	151220324
106	NC_009641	CAAAA	2	10	136704	136713	80 %	0 %	0 %	20 %	151220324
107	NC_009641	CAAAA	2	10	138815	138824	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009641	AAAGC	2	10	139165	139174	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009641	TTCAT	2	10	139557	139566	20 %	60 %	0 %	20 %	151220326
110	NC_009641	TTTAC	2	10	139940	139949	20 %	60 %	0 %	20 %	151220326
111	NC_009641	CGTTT	2	10	140384	140393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009641	TTATT	2	10	140921	140930	20 %	80 %	0 %	0 %	151220327
113	NC_009641	GGATT	2	10	141909	141918	20 %	40 %	40 %	0 %	151220328
114	NC_009641	TAACT	2	10	144949	144958	40 %	40 %	0 %	20 %	151220331
115	NC_009641	TTTAT	2	10	147856	147865	20 %	80 %	0 %	0 %	151220334
116	NC_009641	TATCA	2	10	148960	148969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009641	ATGCA	2	10	149459	149468	40 %	20 %	20 %	20 %	151220335
118	NC_009641	TATGA	2	10	156705	156714	40 %	40 %	20 %	0 %	151220336
119	NC_009641	GTGAA	2	10	156739	156748	40 %	20 %	40 %	0 %	151220336
120	NC_009641	ATCAT	2	10	157092	157101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009641	TTAAT	2	10	157182	157191	40 %	60 %	0 %	0 %	151220337
122	NC_009641	ATATA	2	10	160012	160021	60 %	40 %	0 %	0 %	151220340
123	NC_009641	AAGAT	2	10	163741	163750	60 %	20 %	20 %	0 %	151220342
124	NC_009641	CGTTT	2	10	164186	164195	0 %	60 %	20 %	20 %	151220343
125	NC_009641	AAATG	2	10	166667	166676	60 %	20 %	20 %	0 %	151220345
126	NC_009641	GTAAA	2	10	166831	166840	60 %	20 %	20 %	0 %	151220345
127	NC_009641	TTTAA	2	10	166851	166860	40 %	60 %	0 %	0 %	151220345
128	NC_009641	TTTGC	2	10	167367	167376	0 %	60 %	20 %	20 %	151220345
129	NC_009641	TTGTT	2	10	168373	168382	0 %	80 %	20 %	0 %	151220345
130	NC_009641	CAACT	2	10	169223	169232	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_009641	CAAAA	2	10	171586	171595	80 %	0 %	0 %	20 %	151220348
132	NC_009641	AGTTT	2	10	172122	172131	20 %	60 %	20 %	0 %	151220348
133	NC_009641	CAACA	2	10	172352	172361	60 %	0 %	0 %	40 %	151220348
134	NC_009641	AAAAT	2	10	172980	172989	80 %	20 %	0 %	0 %	151220349
135	NC_009641	AAATG	2	10	173389	173398	60 %	20 %	20 %	0 %	151220349
136	NC_009641	GCTTT	2	10	173735	173744	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009641	TGAAG	2	10	173937	173946	40 %	20 %	40 %	0 %	151220350
138	NC_009641	AAAAT	2	10	174008	174017	80 %	20 %	0 %	0 %	151220350
139	NC_009641	TGATT	2	10	174081	174090	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009641	TTGAA	2	10	174663	174672	40 %	40 %	20 %	0 %	151220351
141	NC_009641	ATTAT	2	10	176619	176628	40 %	60 %	0 %	0 %	151220351
142	NC_009641	TAGAT	2	10	177601	177610	40 %	40 %	20 %	0 %	151220352
143	NC_009641	CTAAG	2	10	180101	180110	40 %	20 %	20 %	20 %	151220354
144	NC_009641	TAACA	2	10	180307	180316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_009641	CATGT	2	10	180526	180535	20 %	40 %	20 %	20 %	151220355
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149	NC_009641	TCAAT	2	10	182614	182623	40 %	40 %	0 %	20 %	151220356
150	NC_009641	TTATT	2	10	182647	182656	20 %	80 %	0 %	0 %	151220356
151	NC_009641	CTATG	2	10	184903	184912	20 %	40 %	20 %	20 %	151220358
152	NC_009641	GATTG	2	10	186966	186975	20 %	40 %	40 %	0 %	151220359
153	NC_009641	TAATG	2	10	188605	188614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009641	TTATT	2	10	188720	188729	20 %	80 %	0 %	0 %	151220360
155	NC_009641	GTAAA	2	10	191778	191787	60 %	20 %	20 %	0 %	151220363
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158	NC_009641	ATTCA	2	10	195073	195082	40 %	40 %	0 %	20 %	151220365
159	NC_009641	ATGTG	2	10	196312	196321	20 %	40 %	40 %	0 %	151220367
160	NC_009641	TAAAT	2	10	196655	196664	60 %	40 %	0 %	0 %	151220367
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162	NC_009641	TGGAT	2	10	198305	198314	20 %	40 %	40 %	0 %	151220368
163	NC_009641	AATAT	2	10	199487	199496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009641	TCGCA	2	10	202229	202238	20 %	20 %	20 %	40 %	151220371
165	NC_009641	TATTG	2	10	202691	202700	20 %	60 %	20 %	0 %	151220371
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168	NC_009641	TATTT	2	10	205478	205487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009641	TAACT	2	10	207918	207927	40 %	40 %	0 %	20 %	151220374
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172	NC_009641	AATTG	2	10	211205	211214	40 %	40 %	20 %	0 %	151220377
173	NC_009641	CAAGC	2	10	213376	213385	40 %	0 %	20 %	40 %	151220378
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175	NC_009641	AACAT	2	10	213769	213778	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_009641	ATCAA	2	10	214469	214478	60 %	20 %	0 %	20 %	151220379
177	NC_009641	TTGCT	2	10	215350	215359	0 %	60 %	20 %	20 %	151220379
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179	NC_009641	GATAA	2	10	217722	217731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_009641	TAATT	2	10	218889	218898	40 %	60 %	0 %	0 %	151220381
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188	NC_009641	TGAAT	2	10	222480	222489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009641	ATTAA	2	10	222621	222630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009641	ATGAT	2	10	224857	224866	40 %	40 %	20 %	0 %	151220385
191	NC_009641	TTCAT	2	10	225682	225691	20 %	60 %	0 %	20 %	151220385
192	NC_009641	AAAGT	2	10	226365	226374	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_009641	AATTA	2	10	226478	226487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_009641	TAAAA	2	10	228078	228087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_009641	AAGCG	2	10	228793	228802	40 %	0 %	40 %	20 %	151220388
196	NC_009641	AAATT	2	10	229394	229403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_009641	AAATT	2	10	229873	229882	60 %	40 %	0 %	0 %	151220389
198	NC_009641	AAACT	2	10	230116	230125	60 %	20 %	0 %	20 %	151220389
199	NC_009641	ATTGG	2	10	236707	236716	20 %	40 %	40 %	0 %	151220394
200	NC_009641	TATCT	2	10	237052	237061	20 %	60 %	0 %	20 %	151220394
201	NC_009641	GTATC	2	10	237513	237522	20 %	40 %	20 %	20 %	151220395
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215	NC_009641	ATAAA	2	10	251450	251459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_009641	TATCT	2	10	251857	251866	20 %	60 %	0 %	20 %	151220406
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218	NC_009641	TCATA	2	10	259859	259868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
219	NC_009641	TGGCA	2	10	261849	261858	20 %	20 %	40 %	20 %	151220416
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230	NC_009641	GCAAT	2	10	276631	276640	40 %	20 %	20 %	20 %	151220432
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247	NC_009641	TGAAT	2	10	293201	293210	40 %	40 %	20 %	0 %	151220447
248	NC_009641	TGAAT	2	10	295682	295691	40 %	40 %	20 %	0 %	151220450
249	NC_009641	TGAAT	2	10	298238	298247	40 %	40 %	20 %	0 %	151220455
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252	NC_009641	TGAAA	2	10	302662	302671	60 %	20 %	20 %	0 %	151220460
253	NC_009641	TTTTA	2	10	306255	306264	20 %	80 %	0 %	0 %	151220463
254	NC_009641	TCATA	2	10	306622	306631	40 %	40 %	0 %	20 %	151220463
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256	NC_009641	GACAT	2	10	308725	308734	40 %	20 %	20 %	20 %	151220465
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258	NC_009641	GTTAA	2	10	309941	309950	40 %	40 %	20 %	0 %	151220466
259	NC_009641	TAAAT	2	10	311517	311526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_009641	AAATG	2	10	311741	311750	60 %	20 %	20 %	0 %	151220468
261	NC_009641	CCATA	2	10	312262	312271	40 %	20 %	0 %	40 %	151220468
262	NC_009641	AAATT	2	10	315210	315219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009641	CATTG	2	10	316564	316573	20 %	40 %	20 %	20 %	151220472
264	NC_009641	ATTTT	2	10	317075	317084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009641	AGCCA	2	10	317395	317404	40 %	0 %	20 %	40 %	151220473
266	NC_009641	TAATG	2	10	318140	318149	40 %	40 %	20 %	0 %	151220473
267	NC_009641	TTAAA	2	10	322259	322268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_009641	AAATC	2	10	322292	322301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
269	NC_009641	TTTAC	2	10	322502	322511	20 %	60 %	0 %	20 %	151220476
270	NC_009641	AACAT	2	10	324274	324283	60 %	20 %	0 %	20 %	151220478
271	NC_009641	GAAAG	2	10	326297	326306	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_009641	AAATT	2	10	332370	332379	60 %	40 %	0 %	0 %	151220489
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397	NC_009641	CTTAA	2	10	483891	483900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
398	NC_009641	CAATA	2	10	484574	484583	60 %	20 %	0 %	20 %	151220645
399	NC_009641	TATAA	2	10	485455	485464	60 %	40 %	0 %	0 %	151220646
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