MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 44417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009641	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009641	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009641	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009641	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009641	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009641	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
7	NC_009641	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220213
8	NC_009641	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220213
9	NC_009641	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220213
10	NC_009641	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
11	NC_009641	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220213
12	NC_009641	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220213
13	NC_009641	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220213
14	NC_009641	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
15	NC_009641	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220213
16	NC_009641	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220213
17	NC_009641	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
18	NC_009641	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
19	NC_009641	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220213
20	NC_009641	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
21	NC_009641	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220213
22	NC_009641	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
23	NC_009641	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220213
24	NC_009641	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220213
25	NC_009641	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
26	NC_009641	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
27	NC_009641	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220213
28	NC_009641	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220213
29	NC_009641	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220213
30	NC_009641	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
31	NC_009641	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220213
32	NC_009641	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
33	NC_009641	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220213
34	NC_009641	CTA	3	9	2095	2103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009641	ATT	2	6	2188	2193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
36	NC_009641	TTA	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
37	NC_009641	AAC	2	6	2237	2242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220214
38	NC_009641	AGT	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220214
39	NC_009641	TTG	2	6	2410	2415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220214
40	NC_009641	TTA	2	6	2538	2543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
41	NC_009641	AGA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220214
42	NC_009641	TCA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220214
43	NC_009641	GAA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220214
44	NC_009641	TCT	2	6	2833	2838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220214
45	NC_009641	ATT	2	6	2891	2896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
46	NC_009641	ACA	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220214
47	NC_009641	TTA	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
48	NC_009641	GGT	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220214
49	NC_009641	TTA	2	6	3028	3033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220214
50	NC_009641	TGA	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220214
51	NC_009641	GTT	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220214
52	NC_009641	TCT	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220214
53	NC_009641	AGA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220214
54	NC_009641	GGT	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220214
55	NC_009641	ATG	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220214
56	NC_009641	TTC	2	6	3210	3215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220214
57	NC_009641	GAC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220214
58	NC_009641	AAT	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009641	GCA	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009641	TAA	2	6	3454	3459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009641	ATT	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009641	AAG	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009641	GTA	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009641	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009641	TGG	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009641	ATG	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220215
67	NC_009641	GTC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220215
68	NC_009641	AGA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220215
69	NC_009641	CTC	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	151220215
70	NC_009641	GAC	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220215
71	NC_009641	CTG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220215
72	NC_009641	AAT	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220215
73	NC_009641	CAG	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220215
74	NC_009641	AAG	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220215
75	NC_009641	ATT	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220215
76	NC_009641	GAA	2	6	4642	4647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220215
77	NC_009641	ATA	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220215
78	NC_009641	GAT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220215
79	NC_009641	TTA	3	9	4855	4863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220215
80	NC_009641	GAT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220215
81	NC_009641	TTA	2	6	4906	4911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220215
82	NC_009641	ACA	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220216
83	NC_009641	ATA	2	6	5198	5203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220216
84	NC_009641	GTT	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220216
85	NC_009641	TGG	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220216
86	NC_009641	TGG	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220216
87	NC_009641	TCA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220216
88	NC_009641	TCA	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220216
89	NC_009641	AAG	2	6	5528	5533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
90	NC_009641	CAG	2	6	5626	5631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220216
91	NC_009641	TGA	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220216
92	NC_009641	AGA	2	6	5709	5714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
93	NC_009641	ATG	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220216
94	NC_009641	TCA	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220216
95	NC_009641	GAT	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220216
96	NC_009641	GGT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220216
97	NC_009641	AGA	2	6	5985	5990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
98	NC_009641	ATT	2	6	6126	6131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220216
99	NC_009641	TAT	2	6	6198	6203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220216
100	NC_009641	GGC	2	6	6204	6209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	151220216
101	NC_009641	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220216
102	NC_009641	CGT	2	6	6250	6255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220216
103	NC_009641	GAA	2	6	6319	6324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
104	NC_009641	TTA	2	6	6598	6603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220216
105	NC_009641	TTC	2	6	6607	6612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220216
106	NC_009641	TAT	2	6	6700	6705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220216
107	NC_009641	ACA	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220216
108	NC_009641	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220216
109	NC_009641	AGG	2	6	6998	7003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	151220217
110	NC_009641	TCG	2	6	7149	7154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220217
111	NC_009641	TTG	2	6	7319	7324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220217
112	NC_009641	GCA	3	9	7363	7371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220217
113	NC_009641	TAA	2	6	7428	7433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220217
114	NC_009641	ATG	2	6	7460	7465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220217
115	NC_009641	TTA	2	6	7510	7515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220217
116	NC_009641	CCA	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220217
117	NC_009641	GGA	2	6	7641	7646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	151220217
118	NC_009641	CTG	2	6	7670	7675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220217
119	NC_009641	GAA	2	6	7759	7764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220217
120	NC_009641	TTG	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220217
121	NC_009641	TGA	2	6	7890	7895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220217
122	NC_009641	CAT	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220217
123	NC_009641	TTA	2	6	8045	8050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220217
124	NC_009641	AAG	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220217
125	NC_009641	ATT	2	6	8072	8077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220217
126	NC_009641	GTT	2	6	8095	8100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220217
127	NC_009641	AGA	2	6	8101	8106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220217
128	NC_009641	ATT	2	6	8191	8196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220217
129	NC_009641	CAA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220217
130	NC_009641	TTA	2	6	8353	8358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220217
131	NC_009641	TGA	2	6	8391	8396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220217
132	NC_009641	TTA	2	6	8404	8409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220217
133	NC_009641	TGA	2	6	8454	8459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220217
134	NC_009641	TCG	2	6	8460	8465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220217
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263	NC_009641	ATT	2	6	15703	15708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220222
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