MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009641	TTG	2	6	100360	100365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_009641	AATGTA	2	12	100389	100400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_009641	GACAA	2	10	100421	100430	60 %	0 %	20 %	20 %	151220290
2504	NC_009641	A	6	6	100433	100438	100 %	0 %	0 %	0 %	151220290
2505	NC_009641	AATG	2	8	100525	100532	50 %	25 %	25 %	0 %	151220290
2506	NC_009641	ATC	2	6	100563	100568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220290
2507	NC_009641	AGT	2	6	100582	100587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220290
2508	NC_009641	ATG	2	6	100686	100691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220290
2509	NC_009641	TGG	2	6	100849	100854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220290
2510	NC_009641	CAA	2	6	100892	100897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220290
2511	NC_009641	AC	4	8	100914	100921	50 %	0 %	0 %	50 %	151220290
2512	NC_009641	CA	3	6	100935	100940	50 %	0 %	0 %	50 %	151220290
2513	NC_009641	CAA	2	6	100943	100948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220290
2514	NC_009641	ATC	2	6	100960	100965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220290
2515	NC_009641	ATG	2	6	100976	100981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220290
2516	NC_009641	TCA	2	6	101003	101008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220290
2517	NC_009641	ATC	2	6	101010	101015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220290
2518	NC_009641	A	6	6	101033	101038	100 %	0 %	0 %	0 %	151220290
2519	NC_009641	GCT	2	6	101048	101053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220290
2520	NC_009641	ACT	2	6	101098	101103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220290
2521	NC_009641	GAC	2	6	101133	101138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220290
2522	NC_009641	CAA	2	6	101142	101147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220290
2523	NC_009641	ATAA	2	8	101148	101155	75 %	25 %	0 %	0 %	151220290
2524	NC_009641	ATA	2	6	101158	101163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_009641	TAA	2	6	101168	101173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_009641	GAGC	2	8	101196	101203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_009641	AGT	2	6	101249	101254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_009641	TGAA	2	8	101259	101266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_009641	TCA	2	6	101315	101320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_009641	A	6	6	101320	101325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_009641	TAA	2	6	101338	101343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_009641	TAA	2	6	101348	101353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220291
2533	NC_009641	TTA	2	6	101411	101416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220291
2534	NC_009641	AAT	2	6	101455	101460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220291
2535	NC_009641	CAA	2	6	101465	101470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220291
2536	NC_009641	TGAT	2	8	101542	101549	25 %	50 %	25 %	0 %	151220291
2537	NC_009641	GTC	2	6	101590	101595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220291
2538	NC_009641	GCTT	2	8	101666	101673	0 %	50 %	25 %	25 %	151220291
2539	NC_009641	T	7	7	101687	101693	0 %	100 %	0 %	0 %	151220291
2540	NC_009641	ATA	2	6	101695	101700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220291
2541	NC_009641	CAAA	2	8	101736	101743	75 %	0 %	0 %	25 %	151220291
2542	NC_009641	TAAT	2	8	101777	101784	50 %	50 %	0 %	0 %	151220291
2543	NC_009641	TGA	2	6	101785	101790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220291
2544	NC_009641	TTTG	2	8	101864	101871	0 %	75 %	25 %	0 %	151220291
2545	NC_009641	TCCCT	2	10	101887	101896	0 %	40 %	0 %	60 %	151220291
2546	NC_009641	CT	3	6	101903	101908	0 %	50 %	0 %	50 %	151220291
2547	NC_009641	GC	3	6	101971	101976	0 %	0 %	50 %	50 %	151220291
2548	NC_009641	TA	3	6	102039	102044	50 %	50 %	0 %	0 %	151220291
2549	NC_009641	TAT	2	6	102048	102053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220291
2550	NC_009641	TCA	2	6	102121	102126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_009641	AAT	2	6	102130	102135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_009641	ATAG	2	8	102171	102178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_009641	TAG	2	6	102206	102211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_009641	CTGTAA	2	12	102212	102223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2555	NC_009641	A	6	6	102268	102273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_009641	TAT	3	9	102274	102282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_009641	GGA	2	6	102325	102330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_009641	CA	3	6	102351	102356	50 %	0 %	0 %	50 %	151220292
2559	NC_009641	AATG	2	8	102364	102371	50 %	25 %	25 %	0 %	151220292
2560	NC_009641	GAT	2	6	102446	102451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220292
2561	NC_009641	A	6	6	102509	102514	100 %	0 %	0 %	0 %	151220292
2562	NC_009641	GGTATG	2	12	102533	102544	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	151220292
2563	NC_009641	AATT	2	8	102570	102577	50 %	50 %	0 %	0 %	151220292
2564	NC_009641	A	6	6	102593	102598	100 %	0 %	0 %	0 %	151220292
2565	NC_009641	ATG	2	6	102648	102653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220292
2566	NC_009641	ATT	2	6	102656	102661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220292
2567	NC_009641	CAA	2	6	102695	102700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220292
2568	NC_009641	CTT	2	6	102732	102737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220292
2569	NC_009641	ATT	2	6	102742	102747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220292
2570	NC_009641	TCA	2	6	102787	102792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220292
2571	NC_009641	ACA	2	6	102836	102841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220292
2572	NC_009641	GT	3	6	102939	102944	0 %	50 %	50 %	0 %	151220292
2573	NC_009641	CAA	2	6	102978	102983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220292
2574	NC_009641	GAT	2	6	103045	103050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220292
2575	NC_009641	AAAG	2	8	103075	103082	75 %	0 %	25 %	0 %	151220293
2576	NC_009641	TAT	2	6	103095	103100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2577	NC_009641	TGA	2	6	103162	103167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220293
2578	NC_009641	GTA	2	6	103238	103243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220293
2579	NC_009641	TATT	2	8	103281	103288	25 %	75 %	0 %	0 %	151220293
2580	NC_009641	ATT	2	6	103319	103324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2581	NC_009641	TAT	2	6	103369	103374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2582	NC_009641	GCT	2	6	103391	103396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220293
2583	NC_009641	AT	3	6	103415	103420	50 %	50 %	0 %	0 %	151220293
2584	NC_009641	AGA	2	6	103449	103454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220293
2585	NC_009641	ATTT	2	8	103519	103526	25 %	75 %	0 %	0 %	151220293
2586	NC_009641	GTA	2	6	103571	103576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220293
2587	NC_009641	ATT	2	6	103600	103605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2588	NC_009641	ATA	2	6	103617	103622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220293
2589	NC_009641	TTG	2	6	103644	103649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220293
2590	NC_009641	ACA	2	6	103676	103681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220293
2591	NC_009641	TTA	2	6	103692	103697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2592	NC_009641	TA	3	6	103713	103718	50 %	50 %	0 %	0 %	151220293
2593	NC_009641	TA	3	6	103755	103760	50 %	50 %	0 %	0 %	151220293
2594	NC_009641	TAAA	2	8	103785	103792	75 %	25 %	0 %	0 %	151220293
2595	NC_009641	TTTA	2	8	103825	103832	25 %	75 %	0 %	0 %	151220293
2596	NC_009641	ATC	2	6	103902	103907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220293
2597	NC_009641	ACA	2	6	103919	103924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220293
2598	NC_009641	TTA	2	6	103931	103936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2599	NC_009641	TA	3	6	103946	103951	50 %	50 %	0 %	0 %	151220293
2600	NC_009641	TTG	2	6	103962	103967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220293
2601	NC_009641	ATT	2	6	104027	104032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2602	NC_009641	GCTTT	2	10	104121	104130	0 %	60 %	20 %	20 %	151220293
2603	NC_009641	TAATT	2	10	104206	104215	40 %	60 %	0 %	0 %	151220293
2604	NC_009641	TGC	2	6	104248	104253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220293
2605	NC_009641	ATG	2	6	104292	104297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220293
2606	NC_009641	TAT	2	6	104317	104322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2607	NC_009641	ATT	2	6	104327	104332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220293
2608	NC_009641	AAAT	2	8	104399	104406	75 %	25 %	0 %	0 %	151220293
2609	NC_009641	AT	3	6	104424	104429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_009641	TAAA	2	8	104448	104455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_009641	TA	3	6	104461	104466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_009641	GAG	2	6	104471	104476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_009641	AGTA	2	8	104478	104485	50 %	25 %	25 %	0 %	151220294
2614	NC_009641	AT	3	6	104499	104504	50 %	50 %	0 %	0 %	151220294
2615	NC_009641	ATC	2	6	104554	104559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220294
2616	NC_009641	TG	3	6	104593	104598	0 %	50 %	50 %	0 %	151220294
2617	NC_009641	GCA	2	6	104620	104625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220294
2618	NC_009641	AGA	2	6	104715	104720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220294
2619	NC_009641	TCA	2	6	104756	104761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220294
2620	NC_009641	TGA	2	6	104790	104795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220294
2621	NC_009641	ACA	2	6	104799	104804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220294
2622	NC_009641	CA	3	6	104839	104844	50 %	0 %	0 %	50 %	151220294
2623	NC_009641	ATT	2	6	104854	104859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220294
2624	NC_009641	TTG	2	6	104869	104874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220294
2625	NC_009641	AGA	2	6	104973	104978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220294
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2875	NC_009641	ATTT	2	8	116378	116385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2876	NC_009641	ATA	2	6	116407	116412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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