MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 68839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009641	ATCAA	2	10	40176	40185	60 %	20 %	0 %	20 %	151220240
1002	NC_009641	CAC	2	6	40190	40195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220240
1003	NC_009641	CAT	2	6	40198	40203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220240
1004	NC_009641	ATCA	2	8	40247	40254	50 %	25 %	0 %	25 %	151220240
1005	NC_009641	ATG	2	6	40256	40261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220240
1006	NC_009641	ATA	2	6	40277	40282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220240
1007	NC_009641	AG	3	6	40283	40288	50 %	0 %	50 %	0 %	151220240
1008	NC_009641	CA	3	6	40330	40335	50 %	0 %	0 %	50 %	151220240
1009	NC_009641	CAAT	2	8	40343	40350	50 %	25 %	0 %	25 %	151220240
1010	NC_009641	ACA	2	6	40358	40363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220240
1011	NC_009641	TTA	2	6	40370	40375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220240
1012	NC_009641	TTGG	2	8	40382	40389	0 %	50 %	50 %	0 %	151220240
1013	NC_009641	AC	3	6	40452	40457	50 %	0 %	0 %	50 %	151220240
1014	NC_009641	AATT	2	8	40463	40470	50 %	50 %	0 %	0 %	151220240
1015	NC_009641	AGA	2	6	40554	40559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220240
1016	NC_009641	ACGT	2	8	40571	40578	25 %	25 %	25 %	25 %	151220240
1017	NC_009641	ATG	2	6	40580	40585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220240
1018	NC_009641	AAT	2	6	40594	40599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220240
1019	NC_009641	ATT	2	6	40638	40643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220240
1020	NC_009641	TAA	2	6	40662	40667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220240
1021	NC_009641	AT	3	6	40678	40683	50 %	50 %	0 %	0 %	151220240
1022	NC_009641	GTCA	2	8	40691	40698	25 %	25 %	25 %	25 %	151220240
1023	NC_009641	AAT	2	6	40799	40804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220240
1024	NC_009641	A	6	6	40817	40822	100 %	0 %	0 %	0 %	151220241
1025	NC_009641	TTA	2	6	40844	40849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220241
1026	NC_009641	TGG	2	6	40851	40856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220241
1027	NC_009641	CAG	2	6	40862	40867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220241
1028	NC_009641	A	6	6	40896	40901	100 %	0 %	0 %	0 %	151220241
1029	NC_009641	CAG	2	6	40937	40942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220241
1030	NC_009641	CAT	2	6	40945	40950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220241
1031	NC_009641	GTTG	2	8	40971	40978	0 %	50 %	50 %	0 %	151220241
1032	NC_009641	ATA	2	6	41084	41089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220241
1033	NC_009641	ATA	2	6	41105	41110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220241
1034	NC_009641	TAT	2	6	41119	41124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220241
1035	NC_009641	T	6	6	41127	41132	0 %	100 %	0 %	0 %	151220241
1036	NC_009641	AGT	2	6	41133	41138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220241
1037	NC_009641	ATT	2	6	41351	41356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220241
1038	NC_009641	AT	3	6	41392	41397	50 %	50 %	0 %	0 %	151220241
1039	NC_009641	ATA	2	6	41435	41440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220241
1040	NC_009641	TTG	2	6	41456	41461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220241
1041	NC_009641	AAGA	2	8	41462	41469	75 %	0 %	25 %	0 %	151220241
1042	NC_009641	AATTAT	2	12	41482	41493	50 %	50 %	0 %	0 %	151220241
1043	NC_009641	TTG	2	6	41498	41503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220241
1044	NC_009641	A	6	6	41518	41523	100 %	0 %	0 %	0 %	151220241
1045	NC_009641	ACC	2	6	41592	41597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220241
1046	NC_009641	GTA	2	6	41614	41619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220241
1047	NC_009641	AAAG	2	8	41620	41627	75 %	0 %	25 %	0 %	151220241
1048	NC_009641	AAGC	2	8	41758	41765	50 %	0 %	25 %	25 %	151220241
1049	NC_009641	TCG	2	6	41771	41776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220241
1050	NC_009641	TAA	2	6	41778	41783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220241
1051	NC_009641	TGA	2	6	41795	41800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220241
1052	NC_009641	CAT	2	6	41818	41823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220241
1053	NC_009641	ATG	2	6	41825	41830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220241
1054	NC_009641	ATA	2	6	41861	41866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220241
1055	NC_009641	TAA	2	6	41892	41897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220241
1056	NC_009641	GTAT	2	8	41945	41952	25 %	50 %	25 %	0 %	151220241
1057	NC_009641	AT	3	6	41951	41956	50 %	50 %	0 %	0 %	151220241
1058	NC_009641	AAGA	2	8	41959	41966	75 %	0 %	25 %	0 %	151220241
1059	NC_009641	TTA	2	6	41968	41973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220241
1060	NC_009641	TAATA	2	10	42008	42017	60 %	40 %	0 %	0 %	151220241
1061	NC_009641	GTGTT	2	10	42091	42100	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009641	GTT	2	6	42146	42151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009641	CAG	2	6	42209	42214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009641	ATC	2	6	42236	42241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_009641	CTG	2	6	42245	42250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_009641	T	6	6	42251	42256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009641	ATT	2	6	42281	42286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009641	TAAT	2	8	42293	42300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009641	TGAC	2	8	42328	42335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_009641	TGT	2	6	42467	42472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009641	T	8	8	42478	42485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009641	T	7	7	42494	42500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009641	CAT	2	6	42576	42581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_009641	ATA	2	6	42610	42615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009641	ATC	2	6	42656	42661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_009641	TTA	2	6	42670	42675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009641	AGT	2	6	42731	42736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220242
1078	NC_009641	ATTG	2	8	42752	42759	25 %	50 %	25 %	0 %	151220242
1079	NC_009641	TG	3	6	42758	42763	0 %	50 %	50 %	0 %	151220242
1080	NC_009641	TCA	2	6	42765	42770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220242
1081	NC_009641	CTTG	2	8	42913	42920	0 %	50 %	25 %	25 %	151220242
1082	NC_009641	TG	3	6	42919	42924	0 %	50 %	50 %	0 %	151220242
1083	NC_009641	TAG	2	6	43223	43228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220242
1084	NC_009641	AAT	2	6	43279	43284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220242
1085	NC_009641	GCA	2	6	43289	43294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220242
1086	NC_009641	ACCCTT	2	12	43321	43332	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	151220242
1087	NC_009641	AT	3	6	43440	43445	50 %	50 %	0 %	0 %	151220242
1088	NC_009641	TATG	2	8	43497	43504	25 %	50 %	25 %	0 %	151220242
1089	NC_009641	GCT	2	6	43565	43570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220242
1090	NC_009641	A	6	6	43627	43632	100 %	0 %	0 %	0 %	151220242
1091	NC_009641	ATA	2	6	43667	43672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220242
1092	NC_009641	T	6	6	43705	43710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009641	ATG	2	6	43715	43720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009641	AGT	2	6	43793	43798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009641	TGT	2	6	43809	43814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009641	ATT	2	6	43863	43868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009641	ACT	2	6	43877	43882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_009641	T	6	6	43931	43936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009641	TGG	2	6	44013	44018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009641	ATTT	2	8	44020	44027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009641	T	6	6	44025	44030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009641	ATT	2	6	44106	44111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009641	AAGA	2	8	44238	44245	75 %	0 %	25 %	0 %	151220243
1104	NC_009641	ATTT	2	8	44254	44261	25 %	75 %	0 %	0 %	151220243
1105	NC_009641	AAGA	2	8	44294	44301	75 %	0 %	25 %	0 %	151220243
1106	NC_009641	AT	3	6	44312	44317	50 %	50 %	0 %	0 %	151220243
1107	NC_009641	TATT	2	8	44318	44325	25 %	75 %	0 %	0 %	151220243
1108	NC_009641	ATG	2	6	44326	44331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220243
1109	NC_009641	GGT	2	6	44343	44348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220243
1110	NC_009641	ATA	2	6	44356	44361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220243
1111	NC_009641	ATT	2	6	44363	44368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220243
1112	NC_009641	CAG	2	6	44391	44396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220243
1113	NC_009641	ATA	2	6	44407	44412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220243
1114	NC_009641	CAA	2	6	44473	44478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220243
1115	NC_009641	ATTT	2	8	44488	44495	25 %	75 %	0 %	0 %	151220243
1116	NC_009641	A	6	6	44504	44509	100 %	0 %	0 %	0 %	151220243
1117	NC_009641	AGT	2	6	44526	44531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009641	AG	3	6	44545	44550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009641	AGA	2	6	44584	44589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009641	CTT	2	6	44602	44607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220244
1121	NC_009641	ATTTT	2	10	44617	44626	20 %	80 %	0 %	0 %	151220244
1122	NC_009641	AGC	2	6	44643	44648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220244
1123	NC_009641	CGAC	2	8	44790	44797	25 %	0 %	25 %	50 %	151220244
1124	NC_009641	TGAT	2	8	44845	44852	25 %	50 %	25 %	0 %	151220244
1125	NC_009641	AAAT	2	8	44911	44918	75 %	25 %	0 %	0 %	151220244
1126	NC_009641	TTC	2	6	44979	44984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220244
1127	NC_009641	TCC	2	6	45017	45022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	151220244
1128	NC_009641	ATC	2	6	45159	45164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220244
1129	NC_009641	TGT	2	6	45166	45171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220244
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1131	NC_009641	TTC	2	6	45224	45229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220244
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