MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 5086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009632	AC	3	6	358	363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009632	TG	3	6	431	436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009632	GT	3	6	568	573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009632	AG	3	6	977	982	50 %	0 %	50 %	0 %	150392481
5	NC_009632	TA	3	6	1562	1567	50 %	50 %	0 %	0 %	150392481
6	NC_009632	AG	3	6	1838	1843	50 %	0 %	50 %	0 %	150392481
7	NC_009632	TA	3	6	2031	2036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009632	TA	3	6	2072	2077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009632	AC	3	6	2131	2136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009632	TA	3	6	2240	2245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009632	TA	4	8	2248	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009632	AT	3	6	3275	3280	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
13	NC_009632	AT	3	6	3766	3771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009632	AC	3	6	3777	3782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009632	AT	3	6	4353	4358	50 %	50 %	0 %	0 %	150392484
16	NC_009632	AG	4	8	5277	5284	50 %	0 %	50 %	0 %	150392485
17	NC_009632	TA	3	6	5598	5603	50 %	50 %	0 %	0 %	150392485
18	NC_009632	AG	3	6	5755	5760	50 %	0 %	50 %	0 %	150392485
19	NC_009632	AG	3	6	7591	7596	50 %	0 %	50 %	0 %	150392486
20	NC_009632	AG	4	8	8436	8443	50 %	0 %	50 %	0 %	150392486
21	NC_009632	AT	3	6	10752	10757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009632	AT	3	6	11020	11025	50 %	50 %	0 %	0 %	150392488
23	NC_009632	CT	3	6	11437	11442	0 %	50 %	0 %	50 %	150392488
24	NC_009632	TA	3	6	11645	11650	50 %	50 %	0 %	0 %	150392488
25	NC_009632	GT	3	6	12333	12338	0 %	50 %	50 %	0 %	150392488
26	NC_009632	AT	3	6	12636	12641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009632	AG	3	6	12655	12660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009632	AT	4	8	12689	12696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009632	TA	3	6	13593	13598	50 %	50 %	0 %	0 %	150392489
30	NC_009632	TA	3	6	14230	14235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009632	TA	3	6	14819	14824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009632	TA	3	6	14997	15002	50 %	50 %	0 %	0 %	150392490
33	NC_009632	AT	3	6	15315	15320	50 %	50 %	0 %	0 %	150392490
34	NC_009632	AT	3	6	16444	16449	50 %	50 %	0 %	0 %	150392492
35	NC_009632	TA	3	6	17212	17217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009632	CA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009632	GT	3	6	18199	18204	0 %	50 %	50 %	0 %	150392493
38	NC_009632	AT	3	6	19092	19097	50 %	50 %	0 %	0 %	150392494
39	NC_009632	GT	3	6	19518	19523	0 %	50 %	50 %	0 %	150392494
40	NC_009632	AG	3	6	19634	19639	50 %	0 %	50 %	0 %	150392494
41	NC_009632	AT	4	8	19817	19824	50 %	50 %	0 %	0 %	150392494
42	NC_009632	AC	3	6	20844	20849	50 %	0 %	0 %	50 %	150392495
43	NC_009632	TC	3	6	21924	21929	0 %	50 %	0 %	50 %	150392496
44	NC_009632	AT	3	6	22366	22371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009632	CG	3	6	22661	22666	0 %	0 %	50 %	50 %	150392497
46	NC_009632	TA	3	6	23861	23866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009632	AT	3	6	24499	24504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009632	AT	3	6	24854	24859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009632	TA	3	6	24905	24910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009632	AT	3	6	25708	25713	50 %	50 %	0 %	0 %	150392498
51	NC_009632	TA	3	6	26217	26222	50 %	50 %	0 %	0 %	150392499
52	NC_009632	AT	3	6	27659	27664	50 %	50 %	0 %	0 %	150392500
53	NC_009632	CA	3	6	29020	29025	50 %	0 %	0 %	50 %	150392501
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55	NC_009632	AG	3	6	30075	30080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009632	AT	3	6	30889	30894	50 %	50 %	0 %	0 %	150392502
57	NC_009632	CG	3	6	31892	31897	0 %	0 %	50 %	50 %	150392503
58	NC_009632	GC	3	6	33327	33332	0 %	0 %	50 %	50 %	150392503
59	NC_009632	AT	3	6	33450	33455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009632	TA	3	6	34708	34713	50 %	50 %	0 %	0 %	150392505
61	NC_009632	AT	3	6	34830	34835	50 %	50 %	0 %	0 %	150392505
62	NC_009632	TA	4	8	36117	36124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009632	AT	3	6	36149	36154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009632	TA	3	6	36633	36638	50 %	50 %	0 %	0 %	150392506
65	NC_009632	AT	3	6	37140	37145	50 %	50 %	0 %	0 %	150392506
66	NC_009632	GA	3	6	38327	38332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009632	AT	3	6	38334	38339	50 %	50 %	0 %	0 %	150392508
68	NC_009632	AT	3	6	38439	38444	50 %	50 %	0 %	0 %	150392508
69	NC_009632	AT	3	6	40609	40614	50 %	50 %	0 %	0 %	150392509
70	NC_009632	AT	3	6	40756	40761	50 %	50 %	0 %	0 %	150392509
71	NC_009632	TA	3	6	40831	40836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009632	TA	3	6	40996	41001	50 %	50 %	0 %	0 %	150392510
73	NC_009632	AT	3	6	41514	41519	50 %	50 %	0 %	0 %	150392510
74	NC_009632	TA	4	8	41615	41622	50 %	50 %	0 %	0 %	150392510
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76	NC_009632	AT	3	6	43027	43032	50 %	50 %	0 %	0 %	150392511
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78	NC_009632	GT	3	6	45765	45770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009632	TA	3	6	45882	45887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009632	TA	3	6	47017	47022	50 %	50 %	0 %	0 %	150392513
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84	NC_009632	AT	3	6	48206	48211	50 %	50 %	0 %	0 %	150392515
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88	NC_009632	TA	3	6	52762	52767	50 %	50 %	0 %	0 %	150392520
89	NC_009632	CT	3	6	53028	53033	0 %	50 %	0 %	50 %	150392520
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91	NC_009632	AT	3	6	54129	54134	50 %	50 %	0 %	0 %	150392521
92	NC_009632	CT	3	6	54704	54709	0 %	50 %	0 %	50 %	150392521
93	NC_009632	AT	3	6	55341	55346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95	NC_009632	AT	4	8	55855	55862	50 %	50 %	0 %	0 %	150392523
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98	NC_009632	TA	3	6	56680	56685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009632	GA	3	6	56722	56727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009632	TA	3	6	56853	56858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_009632	AT	4	8	58204	58211	50 %	50 %	0 %	0 %	150392527
104	NC_009632	TA	3	6	58623	58628	50 %	50 %	0 %	0 %	150392527
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108	NC_009632	TA	3	6	60166	60171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009632	AT	3	6	60187	60192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_009632	AT	3	6	62884	62889	50 %	50 %	0 %	0 %	150392531
113	NC_009632	TA	3	6	63680	63685	50 %	50 %	0 %	0 %	150392531
114	NC_009632	TA	3	6	63731	63736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009632	TA	3	6	63844	63849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009632	AT	3	6	64245	64250	50 %	50 %	0 %	0 %	150392532
117	NC_009632	CT	3	6	64548	64553	0 %	50 %	0 %	50 %	150392533
118	NC_009632	TA	3	6	65148	65153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009632	AT	3	6	65358	65363	50 %	50 %	0 %	0 %	150392535
120	NC_009632	AT	3	6	65465	65470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009632	TA	3	6	65506	65511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009632	AT	3	6	65610	65615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_009632	AG	3	6	66887	66892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009632	AT	3	6	67200	67205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_009632	TA	3	6	70355	70360	50 %	50 %	0 %	0 %	150392537
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131	NC_009632	AT	3	6	72331	72336	50 %	50 %	0 %	0 %	150392538
132	NC_009632	TG	3	6	73321	73326	0 %	50 %	50 %	0 %	150392539
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135	NC_009632	TA	3	6	73710	73715	50 %	50 %	0 %	0 %	150392539
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139	NC_009632	AG	3	6	79312	79317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_009632	GA	3	6	79520	79525	50 %	0 %	50 %	0 %	150392546
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144	NC_009632	AT	3	6	80668	80673	50 %	50 %	0 %	0 %	150392546
145	NC_009632	AT	3	6	80957	80962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009632	AT	3	6	80966	80971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009632	TA	3	6	81579	81584	50 %	50 %	0 %	0 %	150392548
148	NC_009632	TA	3	6	81736	81741	50 %	50 %	0 %	0 %	150392548
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