MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 2577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009632	CAAAT	2	10	1569	1578	60 %	20 %	0 %	20 %	150392481
2	NC_009632	AATTT	2	10	2617	2626	40 %	60 %	0 %	0 %	150392482
3	NC_009632	CAATT	2	10	2683	2692	40 %	40 %	0 %	20 %	150392482
4	NC_009632	AAATT	2	10	3061	3070	60 %	40 %	0 %	0 %	150392482
5	NC_009632	TGAAT	2	10	6858	6867	40 %	40 %	20 %	0 %	150392485
6	NC_009632	TGAAC	2	10	7099	7108	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009632	TTCAA	2	10	7845	7854	40 %	40 %	0 %	20 %	150392486
8	NC_009632	ATCGC	2	10	10316	10325	20 %	20 %	20 %	40 %	150392487
9	NC_009632	CGTTG	2	10	11859	11868	0 %	40 %	40 %	20 %	150392488
10	NC_009632	GTAGG	2	10	14532	14541	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009632	TTATT	2	10	15574	15583	20 %	80 %	0 %	0 %	150392491
12	NC_009632	GCAAG	2	10	16748	16757	40 %	0 %	40 %	20 %	150392492
13	NC_009632	TTTGA	2	10	16907	16916	20 %	60 %	20 %	0 %	150392492
14	NC_009632	TCAAT	2	10	19044	19053	40 %	40 %	0 %	20 %	150392494
15	NC_009632	AGTTA	2	10	22222	22231	40 %	40 %	20 %	0 %	150392496
16	NC_009632	ATGTA	2	10	23780	23789	40 %	40 %	20 %	0 %	150392497
17	NC_009632	TCGAT	2	10	23944	23953	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009632	ATATT	2	10	24481	24490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009632	ACCAA	2	10	26390	26399	60 %	0 %	0 %	40 %	150392499
20	NC_009632	ATCAA	2	10	27102	27111	60 %	20 %	0 %	20 %	150392499
21	NC_009632	GAAAC	2	10	27723	27732	60 %	0 %	20 %	20 %	150392500
22	NC_009632	GAAGT	2	10	27873	27882	40 %	20 %	40 %	0 %	150392500
23	NC_009632	ATTAT	2	10	29516	29525	40 %	60 %	0 %	0 %	150392501
24	NC_009632	AACGA	2	10	29589	29598	60 %	0 %	20 %	20 %	150392501
25	NC_009632	AAACG	2	10	31435	31444	60 %	0 %	20 %	20 %	150392503
26	NC_009632	AAGGT	2	10	32607	32616	40 %	20 %	40 %	0 %	150392503
27	NC_009632	TATGA	2	10	32804	32813	40 %	40 %	20 %	0 %	150392503
28	NC_009632	CATTA	2	10	34034	34043	40 %	40 %	0 %	20 %	150392504
29	NC_009632	TTTCA	2	10	34437	34446	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009632	AAATG	2	10	35678	35687	60 %	20 %	20 %	0 %	150392505
31	NC_009632	ATTTT	2	10	35759	35768	20 %	80 %	0 %	0 %	150392505
32	NC_009632	TAAAA	2	10	35890	35899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009632	AGATA	2	10	36048	36057	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009632	ATGAG	2	10	37345	37354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009632	TGAAT	2	10	37692	37701	40 %	40 %	20 %	0 %	150392507
36	NC_009632	TTGGT	2	10	37734	37743	0 %	60 %	40 %	0 %	150392507
37	NC_009632	AATAT	2	10	37802	37811	60 %	40 %	0 %	0 %	150392507
38	NC_009632	TTCGT	2	10	38013	38022	0 %	60 %	20 %	20 %	150392507
39	NC_009632	CAAAA	2	10	38373	38382	80 %	0 %	0 %	20 %	150392508
40	NC_009632	AAATT	2	10	40472	40481	60 %	40 %	0 %	0 %	150392509
41	NC_009632	TTTAA	2	10	43431	43440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009632	AAAAT	2	10	43523	43532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009632	TTATT	2	10	43751	43760	20 %	80 %	0 %	0 %	150392512
44	NC_009632	GAATT	2	10	44726	44735	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009632	TGGTG	2	10	45378	45387	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009632	CTTTT	2	10	46642	46651	0 %	80 %	0 %	20 %	150392513
47	NC_009632	ATAGC	2	10	48145	48154	40 %	20 %	20 %	20 %	150392515
48	NC_009632	ATATA	2	10	48278	48287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009632	ATTAC	2	10	50831	50840	40 %	40 %	0 %	20 %	150392518
50	NC_009632	GATTC	2	10	51710	51719	20 %	40 %	20 %	20 %	150392519
51	NC_009632	CATCC	2	10	53939	53948	20 %	20 %	0 %	60 %	150392521
52	NC_009632	TGCGT	2	10	53962	53971	0 %	40 %	40 %	20 %	150392521
53	NC_009632	ATAAA	2	10	57084	57093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009632	TTTGA	2	10	58664	58673	20 %	60 %	20 %	0 %	150392527
55	NC_009632	GTTTT	2	10	58747	58756	0 %	80 %	20 %	0 %	150392527
56	NC_009632	TTGCT	2	10	59705	59714	0 %	60 %	20 %	20 %	150392528
57	NC_009632	CTAGT	2	10	63826	63835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009632	GATTT	2	10	64267	64276	20 %	60 %	20 %	0 %	150392532
59	NC_009632	GTTTT	2	10	64676	64685	0 %	80 %	20 %	0 %	150392533
60	NC_009632	TTTCA	2	10	65040	65049	20 %	60 %	0 %	20 %	150392534
61	NC_009632	TAATA	2	10	66621	66630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009632	TATAA	2	10	66750	66759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009632	ATTTT	2	10	68191	68200	20 %	80 %	0 %	0 %	150392537
64	NC_009632	ATTTT	2	10	70794	70803	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009632	AAACT	2	10	71670	71679	60 %	20 %	0 %	20 %	150392538
66	NC_009632	TTGGT	2	10	73155	73164	0 %	60 %	40 %	0 %	150392539
67	NC_009632	GTGAG	2	10	75160	75169	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009632	AGGGT	2	10	77786	77795	20 %	20 %	60 %	0 %	150392543
69	NC_009632	TCAAT	2	10	78102	78111	40 %	40 %	0 %	20 %	150392543
70	NC_009632	AAAAT	2	10	80037	80046	80 %	20 %	0 %	0 %	150392546
71	NC_009632	TTTAG	2	10	80240	80249	20 %	60 %	20 %	0 %	150392546
72	NC_009632	AAATG	2	10	80362	80371	60 %	20 %	20 %	0 %	150392546
73	NC_009632	TAGTA	2	10	82955	82964	40 %	40 %	20 %	0 %	150392548
74	NC_009632	TTTTA	2	10	83171	83180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009632	TACTA	2	10	84316	84325	40 %	40 %	0 %	20 %	150392549
76	NC_009632	ATCAA	2	10	87066	87075	60 %	20 %	0 %	20 %	150392552
77	NC_009632	TAATA	2	10	88898	88907	60 %	40 %	0 %	0 %	150392553
78	NC_009632	GTGTT	2	10	88981	88990	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009632	ATTCA	2	10	91573	91582	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009632	TATAT	2	10	91834	91843	40 %	60 %	0 %	0 %	150392558
81	NC_009632	CTAAA	2	10	93474	93483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009632	CAAAA	2	10	93505	93514	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009632	GATAT	2	10	98192	98201	40 %	40 %	20 %	0 %	150392561
84	NC_009632	ATATA	2	10	99015	99024	60 %	40 %	0 %	0 %	150392562
85	NC_009632	GATAT	2	10	99849	99858	40 %	40 %	20 %	0 %	150392563
86	NC_009632	AATAA	2	10	100479	100488	80 %	20 %	0 %	0 %	150392564
87	NC_009632	ATTGC	2	10	102459	102468	20 %	40 %	20 %	20 %	150392566
88	NC_009632	TCATT	2	10	102647	102656	20 %	60 %	0 %	20 %	150392566
89	NC_009632	CATGG	2	10	103863	103872	20 %	20 %	40 %	20 %	150392566
90	NC_009632	TGAAA	2	10	104531	104540	60 %	20 %	20 %	0 %	150392567
91	NC_009632	TCAAT	2	10	104903	104912	40 %	40 %	0 %	20 %	150392567
92	NC_009632	GTATT	2	10	105392	105401	20 %	60 %	20 %	0 %	150392568
93	NC_009632	ATTAA	2	10	108134	108143	60 %	40 %	0 %	0 %	150392570
94	NC_009632	AGATA	2	10	111253	111262	60 %	20 %	20 %	0 %	150392572
95	NC_009632	TAAAA	2	10	111813	111822	80 %	20 %	0 %	0 %	150392572
96	NC_009632	ATACA	2	10	112243	112252	60 %	20 %	0 %	20 %	150392573
97	NC_009632	AAAGA	2	10	113446	113455	80 %	0 %	20 %	0 %	150392573
98	NC_009632	GTAAT	2	10	113665	113674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009632	ATGTT	2	10	114931	114940	20 %	60 %	20 %	0 %	150392575
100	NC_009632	TTGCG	2	10	115502	115511	0 %	40 %	40 %	20 %	150392575
101	NC_009632	AGTTA	2	10	117038	117047	40 %	40 %	20 %	0 %	150392576
102	NC_009632	AGATG	2	10	120411	120420	40 %	20 %	40 %	0 %	150392578
103	NC_009632	GGTGA	2	10	121007	121016	20 %	20 %	60 %	0 %	150392579
104	NC_009632	GAAAA	2	10	124444	124453	80 %	0 %	20 %	0 %	150392582
105	NC_009632	TTATT	2	10	124611	124620	20 %	80 %	0 %	0 %	150392582
106	NC_009632	AATCA	2	10	127633	127642	60 %	20 %	0 %	20 %	150392584
107	NC_009632	ATTTT	2	10	128331	128340	20 %	80 %	0 %	0 %	150392585
108	NC_009632	ATCAA	2	10	128358	128367	60 %	20 %	0 %	20 %	150392585
109	NC_009632	ATCAC	2	10	129591	129600	40 %	20 %	0 %	40 %	150392586
110	NC_009632	AACGA	2	10	130268	130277	60 %	0 %	20 %	20 %	150392586
111	NC_009632	ACACA	2	10	132324	132333	60 %	0 %	0 %	40 %	150392588
112	NC_009632	GACAA	2	10	133475	133484	60 %	0 %	20 %	20 %	150392589
113	NC_009632	ATTAC	2	10	135659	135668	40 %	40 %	0 %	20 %	150392591
114	NC_009632	ATTTT	2	10	135963	135972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009632	TATCT	2	10	136319	136328	20 %	60 %	0 %	20 %	150392593
116	NC_009632	ATACG	2	10	138752	138761	40 %	20 %	20 %	20 %	150392595
117	NC_009632	TTATA	2	10	139410	139419	40 %	60 %	0 %	0 %	150392596
118	NC_009632	TTTTA	2	10	140208	140217	20 %	80 %	0 %	0 %	150392596
119	NC_009632	GTATT	2	10	140721	140730	20 %	60 %	20 %	0 %	150392597
120	NC_009632	AATAA	2	10	141314	141323	80 %	20 %	0 %	0 %	150392597
121	NC_009632	TACGC	2	10	141581	141590	20 %	20 %	20 %	40 %	150392597
122	NC_009632	TCCCT	2	10	144387	144396	0 %	40 %	0 %	60 %	150392600
123	NC_009632	GCTTT	2	10	146621	146630	0 %	60 %	20 %	20 %	150392602
124	NC_009632	TAATT	2	10	146706	146715	40 %	60 %	0 %	0 %	150392602
125	NC_009632	ATACT	2	10	147887	147896	40 %	40 %	0 %	20 %	150392604
126	NC_009632	TAATA	2	10	149051	149060	60 %	40 %	0 %	0 %	150392605
127	NC_009632	ATTTT	2	10	150042	150051	20 %	80 %	0 %	0 %	150392606
128	NC_009632	TTGTA	2	10	152247	152256	20 %	60 %	20 %	0 %	150392608
129	NC_009632	TGCAA	2	10	153252	153261	40 %	20 %	20 %	20 %	150392609
130	NC_009632	ATATG	2	10	155270	155279	40 %	40 %	20 %	0 %	150392610
131	NC_009632	TATGA	2	10	156950	156959	40 %	40 %	20 %	0 %	150392612
132	NC_009632	AATAT	2	10	157956	157965	60 %	40 %	0 %	0 %	150392612
133	NC_009632	TGGTA	2	10	159853	159862	20 %	40 %	40 %	0 %	150392613
134	NC_009632	CGAAC	2	10	159943	159952	40 %	0 %	20 %	40 %	150392613
135	NC_009632	TTCAA	2	10	161968	161977	40 %	40 %	0 %	20 %	150392614
136	NC_009632	ACATC	2	10	162811	162820	40 %	20 %	0 %	40 %	150392616
137	NC_009632	TAATT	2	10	165034	165043	40 %	60 %	0 %	0 %	150392617
138	NC_009632	AGAGA	2	10	168060	168069	60 %	0 %	40 %	0 %	150392620
139	NC_009632	AATCC	2	10	168416	168425	40 %	20 %	0 %	40 %	150392620
140	NC_009632	TGAAT	2	10	177172	177181	40 %	40 %	20 %	0 %	150392629
141	NC_009632	TGATT	2	10	178303	178312	20 %	60 %	20 %	0 %	150392631
142	NC_009632	CAAAA	2	10	178556	178565	80 %	0 %	0 %	20 %	150392631
143	NC_009632	CAAAA	2	10	180667	180676	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_009632	ATGCA	2	10	191484	191493	40 %	20 %	20 %	20 %	150392643
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155	NC_009632	ATCAT	2	10	199117	199126	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009632	TTAAT	2	10	199207	199216	40 %	60 %	0 %	0 %	150392645
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166	NC_009632	CAAAA	2	10	213612	213621	80 %	0 %	0 %	20 %	150392656
167	NC_009632	AGTTT	2	10	214148	214157	20 %	60 %	20 %	0 %	150392656
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171	NC_009632	TGTGA	2	10	215645	215654	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009632	GCTTT	2	10	215761	215770	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_009632	TGATT	2	10	216107	216116	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_009632	TTGAA	2	10	216689	216698	40 %	40 %	20 %	0 %	150392659
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186	NC_009632	CTAAG	2	10	226919	226928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_009632	ATAAA	2	10	298317	298326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_009632	TGGCA	2	10	308659	308668	20 %	20 %	40 %	20 %	150392735
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265	NC_009632	CGTAT	2	10	317169	317178	20 %	40 %	20 %	20 %	150392744
266	NC_009632	ACTTC	2	10	319161	319170	20 %	40 %	0 %	40 %	150392745
267	NC_009632	TTAAT	2	10	319670	319679	40 %	60 %	0 %	0 %	150392746
268	NC_009632	CTTTG	2	10	320068	320077	0 %	60 %	20 %	20 %	150392746
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