MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009632	ATT	2	6	165215	165220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392617
4003	NC_009632	A	6	6	165249	165254	100 %	0 %	0 %	0 %	150392617
4004	NC_009632	TTA	2	6	165255	165260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392617
4005	NC_009632	ATTA	2	8	165311	165318	50 %	50 %	0 %	0 %	150392618
4006	NC_009632	T	6	6	165391	165396	0 %	100 %	0 %	0 %	150392618
4007	NC_009632	A	6	6	165408	165413	100 %	0 %	0 %	0 %	150392618
4008	NC_009632	A	7	7	165428	165434	100 %	0 %	0 %	0 %	150392618
4009	NC_009632	TAA	2	6	165437	165442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392618
4010	NC_009632	GCA	2	6	165528	165533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392618
4011	NC_009632	ATT	2	6	165591	165596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392618
4012	NC_009632	TCA	2	6	165626	165631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392618
4013	NC_009632	A	6	6	165639	165644	100 %	0 %	0 %	0 %	150392618
4014	NC_009632	ATG	2	6	165708	165713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392618
4015	NC_009632	AGA	2	6	165896	165901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392618
4016	NC_009632	GTT	2	6	165915	165920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392618
4017	NC_009632	TAT	2	6	165950	165955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392618
4018	NC_009632	ATT	2	6	166001	166006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392618
4019	NC_009632	GA	3	6	166057	166062	50 %	0 %	50 %	0 %	150392618
4020	NC_009632	A	6	6	166062	166067	100 %	0 %	0 %	0 %	150392618
4021	NC_009632	TTG	2	6	166077	166082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392618
4022	NC_009632	GA	3	6	166085	166090	50 %	0 %	50 %	0 %	150392618
4023	NC_009632	ATT	2	6	166120	166125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392618
4024	NC_009632	ATA	2	6	166219	166224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392618
4025	NC_009632	GA	3	6	166320	166325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_009632	A	6	6	166370	166375	100 %	0 %	0 %	0 %	150392619
4027	NC_009632	ATC	2	6	166405	166410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392619
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4029	NC_009632	TTG	2	6	166461	166466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392619
4030	NC_009632	AT	3	6	166564	166569	50 %	50 %	0 %	0 %	150392619
4031	NC_009632	ATT	2	6	166598	166603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392619
4032	NC_009632	AG	3	6	166674	166679	50 %	0 %	50 %	0 %	150392619
4033	NC_009632	GTG	2	6	166739	166744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392619
4034	NC_009632	GAT	2	6	166851	166856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392619
4035	NC_009632	TCG	2	6	166858	166863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392619
4036	NC_009632	TAT	2	6	166963	166968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392619
4037	NC_009632	TCGA	2	8	166990	166997	25 %	25 %	25 %	25 %	150392619
4038	NC_009632	CTTA	2	8	167084	167091	25 %	50 %	0 %	25 %	150392619
4039	NC_009632	GAT	2	6	167100	167105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392619
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4045	NC_009632	ATC	2	6	167501	167506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392620
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4047	NC_009632	TGA	2	6	167594	167599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392620
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4052	NC_009632	GTT	2	6	167743	167748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392620
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4055	NC_009632	TTG	2	6	167851	167856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392620
4056	NC_009632	TATT	2	8	167904	167911	25 %	75 %	0 %	0 %	150392620
4057	NC_009632	TAAA	2	8	168010	168017	75 %	25 %	0 %	0 %	150392620
4058	NC_009632	CAA	2	6	168033	168038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392620
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4060	NC_009632	AATG	2	8	168101	168108	50 %	25 %	25 %	0 %	150392620
4061	NC_009632	AAG	2	6	168164	168169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392620
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4064	NC_009632	ATTTGA	2	12	168194	168205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392620
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4067	NC_009632	GTC	2	6	168308	168313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392620
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4069	NC_009632	AATCC	2	10	168416	168425	40 %	20 %	0 %	40 %	150392620
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4071	NC_009632	GAT	2	6	168464	168469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392620
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4075	NC_009632	TAA	2	6	168763	168768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392621
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4077	NC_009632	T	6	6	168839	168844	0 %	100 %	0 %	0 %	150392621
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4080	NC_009632	TAA	3	9	168868	168876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392621
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4082	NC_009632	ACA	2	6	168929	168934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392621
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4099	NC_009632	TAT	2	6	169495	169500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392622
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4103	NC_009632	TAA	2	6	169580	169585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392622
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4106	NC_009632	TTA	2	6	169720	169725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392622
4107	NC_009632	TAT	2	6	169832	169837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392622
4108	NC_009632	TCA	2	6	169842	169847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392622
4109	NC_009632	TTCA	2	8	169868	169875	25 %	50 %	0 %	25 %	150392622
4110	NC_009632	GAA	2	6	169899	169904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392622
4111	NC_009632	TAA	2	6	170054	170059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392622
4112	NC_009632	TAG	2	6	170290	170295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392622
4113	NC_009632	TA	3	6	170299	170304	50 %	50 %	0 %	0 %	150392622
4114	NC_009632	AG	3	6	170313	170318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_009632	T	6	6	170332	170337	0 %	100 %	0 %	0 %	150392623
4116	NC_009632	AAG	2	6	170393	170398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392623
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4118	NC_009632	ATTA	2	8	170451	170458	50 %	50 %	0 %	0 %	150392623
4119	NC_009632	ATT	2	6	170517	170522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392623
4120	NC_009632	TAT	2	6	170554	170559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392623
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4122	NC_009632	AT	3	6	170655	170660	50 %	50 %	0 %	0 %	150392623
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4124	NC_009632	ATTT	2	8	170718	170725	25 %	75 %	0 %	0 %	150392623
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4243	NC_009632	AG	3	6	176729	176734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_009632	A	7	7	176747	176753	100 %	0 %	0 %	0 %	150392629
4245	NC_009632	GT	3	6	176880	176885	0 %	50 %	50 %	0 %	150392629
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4364	NC_009632	CAT	2	6	181812	181817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392633
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4370	NC_009632	A	6	6	182044	182049	100 %	0 %	0 %	0 %	150392633
4371	NC_009632	TGA	2	6	182058	182063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392633
4372	NC_009632	ATC	2	6	182085	182090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392633
4373	NC_009632	TTG	2	6	182092	182097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392633
4374	NC_009632	ATAA	2	8	182187	182194	75 %	25 %	0 %	0 %	150392633
4375	NC_009632	AGT	2	6	182253	182258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_009632	T	6	6	182289	182294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4377	NC_009632	AAAT	2	8	182373	182380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4378	NC_009632	TCCCAC	2	12	182402	182413	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4379	NC_009632	GTTT	2	8	182414	182421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4380	NC_009632	CAT	2	6	182434	182439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392634
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4383	NC_009632	ATG	2	6	182547	182552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392634
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4385	NC_009632	TTTA	2	8	182653	182660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_009632	AT	3	6	182696	182701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_009632	A	7	7	182727	182733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_009632	T	6	6	182775	182780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_009632	AGG	2	6	182794	182799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4390	NC_009632	TTA	2	6	182802	182807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_009632	ATT	2	6	182813	182818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392635
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4403	NC_009632	TGA	2	6	183334	183339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4404	NC_009632	AT	3	6	183341	183346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_009632	TA	3	6	183348	183353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4406	NC_009632	AGT	2	6	183410	183415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4408	NC_009632	TAG	2	6	183479	183484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4431	NC_009632	TCA	2	6	184438	184443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392637
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4471	NC_009632	GA	3	6	186147	186152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4472	NC_009632	TGA	3	9	186153	186161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392639
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4482	NC_009632	AC	3	6	186508	186513	50 %	0 %	0 %	50 %	150392639
4483	NC_009632	GTAA	2	8	186557	186564	50 %	25 %	25 %	0 %	150392639
4484	NC_009632	AAG	2	6	186570	186575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392639
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4489	NC_009632	ATC	2	6	186749	186754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392639
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4492	NC_009632	A	6	6	186920	186925	100 %	0 %	0 %	0 %	150392639
4493	NC_009632	AG	3	6	186941	186946	50 %	0 %	50 %	0 %	150392639
4494	NC_009632	TAACT	2	10	186973	186982	40 %	40 %	0 %	20 %	150392639
4495	NC_009632	GAA	2	6	187009	187014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392639
4496	NC_009632	TATT	2	8	187025	187032	25 %	75 %	0 %	0 %	150392639
4497	NC_009632	GTC	2	6	187055	187060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392639
4498	NC_009632	TGG	2	6	187063	187068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392639
4499	NC_009632	AC	3	6	187080	187085	50 %	0 %	0 %	50 %	150392639
4500	NC_009632	TTC	3	9	187121	187129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392639

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