MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009632	CAA	2	6	143393	143398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392599
3502	NC_009632	AC	4	8	143415	143422	50 %	0 %	0 %	50 %	150392599
3503	NC_009632	ACA	2	6	143443	143448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392599
3504	NC_009632	ATC	2	6	143461	143466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392599
3505	NC_009632	ATG	2	6	143477	143482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392599
3506	NC_009632	TCA	2	6	143504	143509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392599
3507	NC_009632	ATC	2	6	143511	143516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392599
3508	NC_009632	A	6	6	143534	143539	100 %	0 %	0 %	0 %	150392599
3509	NC_009632	GCT	2	6	143549	143554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392599
3510	NC_009632	ACT	2	6	143599	143604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392599
3511	NC_009632	GAC	2	6	143634	143639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392599
3512	NC_009632	CAA	2	6	143643	143648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392599
3513	NC_009632	ATAA	2	8	143649	143656	75 %	25 %	0 %	0 %	150392599
3514	NC_009632	ATA	2	6	143659	143664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_009632	TAA	2	6	143669	143674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009632	GAGC	2	8	143697	143704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_009632	AGT	2	6	143750	143755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009632	TGAA	2	8	143760	143767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_009632	TCA	2	6	143816	143821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_009632	A	6	6	143821	143826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009632	TAA	2	6	143839	143844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_009632	TAA	2	6	143848	143853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392600
3523	NC_009632	TTA	2	6	143911	143916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392600
3524	NC_009632	AAT	2	6	143955	143960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392600
3525	NC_009632	CAA	2	6	143965	143970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392600
3526	NC_009632	TGAT	2	8	144042	144049	25 %	50 %	25 %	0 %	150392600
3527	NC_009632	GTC	2	6	144090	144095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392600
3528	NC_009632	GCTT	2	8	144166	144173	0 %	50 %	25 %	25 %	150392600
3529	NC_009632	T	7	7	144187	144193	0 %	100 %	0 %	0 %	150392600
3530	NC_009632	ATA	2	6	144195	144200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392600
3531	NC_009632	CAAA	2	8	144236	144243	75 %	0 %	0 %	25 %	150392600
3532	NC_009632	TAAT	2	8	144277	144284	50 %	50 %	0 %	0 %	150392600
3533	NC_009632	TGA	2	6	144285	144290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392600
3534	NC_009632	TTTG	2	8	144364	144371	0 %	75 %	25 %	0 %	150392600
3535	NC_009632	TCCCT	2	10	144387	144396	0 %	40 %	0 %	60 %	150392600
3536	NC_009632	CT	3	6	144403	144408	0 %	50 %	0 %	50 %	150392600
3537	NC_009632	GC	3	6	144471	144476	0 %	0 %	50 %	50 %	150392600
3538	NC_009632	TA	3	6	144539	144544	50 %	50 %	0 %	0 %	150392600
3539	NC_009632	TAT	2	6	144548	144553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392600
3540	NC_009632	TCA	2	6	144621	144626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_009632	AAT	2	6	144630	144635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009632	ATAG	2	8	144671	144678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_009632	TAG	2	6	144706	144711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009632	CTGTAA	2	12	144712	144723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3545	NC_009632	A	6	6	144768	144773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_009632	TAT	3	9	144774	144782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_009632	GGA	2	6	144825	144830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_009632	CA	3	6	144851	144856	50 %	0 %	0 %	50 %	150392601
3549	NC_009632	AATG	2	8	144864	144871	50 %	25 %	25 %	0 %	150392601
3550	NC_009632	GAT	2	6	144946	144951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392601
3551	NC_009632	A	6	6	145009	145014	100 %	0 %	0 %	0 %	150392601
3552	NC_009632	GGTATG	2	12	145033	145044	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	150392601
3553	NC_009632	AATT	2	8	145070	145077	50 %	50 %	0 %	0 %	150392601
3554	NC_009632	A	6	6	145093	145098	100 %	0 %	0 %	0 %	150392601
3555	NC_009632	ATG	2	6	145148	145153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392601
3556	NC_009632	ATT	2	6	145156	145161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392601
3557	NC_009632	CAA	2	6	145195	145200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392601
3558	NC_009632	CTT	2	6	145232	145237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392601
3559	NC_009632	ATT	2	6	145242	145247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392601
3560	NC_009632	TCA	2	6	145287	145292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392601
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3562	NC_009632	GT	3	6	145439	145444	0 %	50 %	50 %	0 %	150392601
3563	NC_009632	CAA	2	6	145478	145483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392601
3564	NC_009632	GAT	2	6	145545	145550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392601
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3567	NC_009632	TGA	2	6	145662	145667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392602
3568	NC_009632	GTA	2	6	145738	145743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392602
3569	NC_009632	TATT	2	8	145781	145788	25 %	75 %	0 %	0 %	150392602
3570	NC_009632	ATT	2	6	145819	145824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392602
3571	NC_009632	TAT	2	6	145869	145874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392602
3572	NC_009632	GCT	2	6	145891	145896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392602
3573	NC_009632	AT	3	6	145915	145920	50 %	50 %	0 %	0 %	150392602
3574	NC_009632	AGA	2	6	145949	145954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392602
3575	NC_009632	ATTT	2	8	146019	146026	25 %	75 %	0 %	0 %	150392602
3576	NC_009632	GTA	2	6	146071	146076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392602
3577	NC_009632	ATT	2	6	146100	146105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392602
3578	NC_009632	ATA	2	6	146117	146122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392602
3579	NC_009632	TTG	2	6	146144	146149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392602
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3582	NC_009632	TA	3	6	146213	146218	50 %	50 %	0 %	0 %	150392602
3583	NC_009632	TA	3	6	146255	146260	50 %	50 %	0 %	0 %	150392602
3584	NC_009632	TAAA	2	8	146285	146292	75 %	25 %	0 %	0 %	150392602
3585	NC_009632	TTTA	2	8	146325	146332	25 %	75 %	0 %	0 %	150392602
3586	NC_009632	ATC	2	6	146402	146407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392602
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3588	NC_009632	TTA	2	6	146431	146436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392602
3589	NC_009632	TA	3	6	146446	146451	50 %	50 %	0 %	0 %	150392602
3590	NC_009632	TTG	2	6	146462	146467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392602
3591	NC_009632	ATT	2	6	146527	146532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392602
3592	NC_009632	GCTTT	2	10	146621	146630	0 %	60 %	20 %	20 %	150392602
3593	NC_009632	TAATT	2	10	146706	146715	40 %	60 %	0 %	0 %	150392602
3594	NC_009632	TGC	2	6	146748	146753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392602
3595	NC_009632	ATG	2	6	146792	146797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392602
3596	NC_009632	TAT	2	6	146817	146822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392602
3597	NC_009632	ATT	2	6	146827	146832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392602
3598	NC_009632	AAAT	2	8	146899	146906	75 %	25 %	0 %	0 %	150392602
3599	NC_009632	AT	3	6	146924	146929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_009632	TAAA	2	8	146948	146955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_009632	TA	3	6	146961	146966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_009632	GAG	2	6	146971	146976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_009632	AGTA	2	8	146978	146985	50 %	25 %	25 %	0 %	150392603
3604	NC_009632	AT	3	6	146999	147004	50 %	50 %	0 %	0 %	150392603
3605	NC_009632	ATC	2	6	147054	147059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392603
3606	NC_009632	TG	3	6	147093	147098	0 %	50 %	50 %	0 %	150392603
3607	NC_009632	GCA	2	6	147120	147125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392603
3608	NC_009632	AGA	2	6	147215	147220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392603
3609	NC_009632	TCA	2	6	147256	147261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392603
3610	NC_009632	TGA	2	6	147290	147295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392603
3611	NC_009632	ACA	2	6	147299	147304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392603
3612	NC_009632	CA	3	6	147339	147344	50 %	0 %	0 %	50 %	150392603
3613	NC_009632	ATT	2	6	147354	147359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392603
3614	NC_009632	TTG	2	6	147369	147374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392603
3615	NC_009632	AGA	2	6	147473	147478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392603
3616	NC_009632	CGTA	2	8	147536	147543	25 %	25 %	25 %	25 %	150392603
3617	NC_009632	AGA	2	6	147548	147553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392603
3618	NC_009632	CAGATT	2	12	147631	147642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150392603
3619	NC_009632	AT	4	8	147647	147654	50 %	50 %	0 %	0 %	150392603
3620	NC_009632	AGT	2	6	147857	147862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392604
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3622	NC_009632	ATACT	2	10	147887	147896	40 %	40 %	0 %	20 %	150392604
3623	NC_009632	CAA	2	6	148014	148019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392604
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3625	NC_009632	GTT	2	6	148044	148049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392604
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