MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009632	CTT	2	6	121961	121966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392580
3002	NC_009632	TTTC	2	8	121967	121974	0 %	75 %	0 %	25 %	150392580
3003	NC_009632	TTTGAA	2	12	122007	122018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392580
3004	NC_009632	T	6	6	122179	122184	0 %	100 %	0 %	0 %	150392580
3005	NC_009632	AAC	2	6	122283	122288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392580
3006	NC_009632	GTT	2	6	122341	122346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392580
3007	NC_009632	GAT	2	6	122365	122370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392580
3008	NC_009632	AAC	2	6	122424	122429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392580
3009	NC_009632	CCT	2	6	122465	122470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_009632	T	6	6	122521	122526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_009632	ATT	2	6	122568	122573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_009632	A	6	6	122590	122595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_009632	AC	3	6	122641	122646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_009632	GAG	2	6	122669	122674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_009632	A	6	6	122691	122696	100 %	0 %	0 %	0 %	150392581
3016	NC_009632	TCA	2	6	122755	122760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392581
3017	NC_009632	GCA	2	6	122814	122819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392581
3018	NC_009632	CAT	2	6	122842	122847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392581
3019	NC_009632	GT	3	6	122965	122970	0 %	50 %	50 %	0 %	150392581
3020	NC_009632	CAA	2	6	122991	122996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392581
3021	NC_009632	ATT	2	6	123005	123010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392581
3022	NC_009632	GAA	2	6	123041	123046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392581
3023	NC_009632	TTG	2	6	123189	123194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392581
3024	NC_009632	ATT	2	6	123216	123221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392581
3025	NC_009632	AAG	2	6	123276	123281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392581
3026	NC_009632	TTG	2	6	123300	123305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392581
3027	NC_009632	GTCA	2	8	123322	123329	25 %	25 %	25 %	25 %	150392581
3028	NC_009632	GAT	2	6	123431	123436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392581
3029	NC_009632	TGAT	2	8	123465	123472	25 %	50 %	25 %	0 %	150392581
3030	NC_009632	ATT	2	6	123509	123514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392581
3031	NC_009632	GAA	2	6	123545	123550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392581
3032	NC_009632	CAA	2	6	123555	123560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392581
3033	NC_009632	A	6	6	123627	123632	100 %	0 %	0 %	0 %	150392581
3034	NC_009632	GAAT	2	8	123659	123666	50 %	25 %	25 %	0 %	150392581
3035	NC_009632	AG	3	6	123667	123672	50 %	0 %	50 %	0 %	150392582
3036	NC_009632	TGT	2	6	123674	123679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392582
3037	NC_009632	ATT	2	6	123841	123846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392582
3038	NC_009632	GGT	2	6	123865	123870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392582
3039	NC_009632	GTA	2	6	123902	123907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392582
3040	NC_009632	GTG	2	6	123947	123952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392582
3041	NC_009632	ATT	2	6	123955	123960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392582
3042	NC_009632	TAG	2	6	124014	124019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392582
3043	NC_009632	GCA	2	6	124030	124035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392582
3044	NC_009632	A	6	6	124066	124071	100 %	0 %	0 %	0 %	150392582
3045	NC_009632	GTTT	2	8	124164	124171	0 %	75 %	25 %	0 %	150392582
3046	NC_009632	TTG	2	6	124202	124207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392582
3047	NC_009632	CAA	2	6	124216	124221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392582
3048	NC_009632	AATT	2	8	124233	124240	50 %	50 %	0 %	0 %	150392582
3049	NC_009632	AAG	2	6	124262	124267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392582
3050	NC_009632	AGT	2	6	124284	124289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392582
3051	NC_009632	TTA	2	6	124352	124357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392582
3052	NC_009632	AAG	2	6	124385	124390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392582
3053	NC_009632	TTA	2	6	124394	124399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392582
3054	NC_009632	GTA	2	6	124414	124419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392582
3055	NC_009632	GAAAA	2	10	124444	124453	80 %	0 %	20 %	0 %	150392582
3056	NC_009632	AAG	2	6	124490	124495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392582
3057	NC_009632	GAT	2	6	124552	124557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392582
3058	NC_009632	TTATT	2	10	124611	124620	20 %	80 %	0 %	0 %	150392582
3059	NC_009632	CAA	3	9	124633	124641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392582
3060	NC_009632	ACA	2	6	124651	124656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392582
3061	NC_009632	CAG	2	6	124705	124710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392583
3062	NC_009632	ATA	2	6	124728	124733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392583
3063	NC_009632	ATT	3	9	124754	124762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392583
3064	NC_009632	ACA	2	6	124844	124849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392583
3065	NC_009632	GAA	2	6	125022	125027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392583
3066	NC_009632	GACT	2	8	125029	125036	25 %	25 %	25 %	25 %	150392583
3067	NC_009632	CTG	2	6	125038	125043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392583
3068	NC_009632	CA	3	6	125045	125050	50 %	0 %	0 %	50 %	150392583
3069	NC_009632	A	6	6	125155	125160	100 %	0 %	0 %	0 %	150392583
3070	NC_009632	ATCA	2	8	125206	125213	50 %	25 %	0 %	25 %	150392583
3071	NC_009632	GCA	2	6	125229	125234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392583
3072	NC_009632	GACA	2	8	125318	125325	50 %	0 %	25 %	25 %	150392583
3073	NC_009632	GTTG	2	8	125435	125442	0 %	50 %	50 %	0 %	150392583
3074	NC_009632	GTC	2	6	125474	125479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392583
3075	NC_009632	ATT	2	6	125612	125617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392583
3076	NC_009632	TGA	2	6	125669	125674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392583
3077	NC_009632	TGG	2	6	125682	125687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392583
3078	NC_009632	AT	3	6	125690	125695	50 %	50 %	0 %	0 %	150392583
3079	NC_009632	GCA	2	6	125805	125810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392583
3080	NC_009632	ATA	2	6	125857	125862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392583
3081	NC_009632	ATG	2	6	125872	125877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392583
3082	NC_009632	AT	3	6	125971	125976	50 %	50 %	0 %	0 %	150392583
3083	NC_009632	TGT	2	6	125977	125982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392583
3084	NC_009632	GTC	2	6	126087	126092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392583
3085	NC_009632	AGA	2	6	126095	126100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392583
3086	NC_009632	TAAT	2	8	126115	126122	50 %	50 %	0 %	0 %	150392583
3087	NC_009632	ATT	2	6	126186	126191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392583
3088	NC_009632	ATTT	2	8	126205	126212	25 %	75 %	0 %	0 %	150392583
3089	NC_009632	GTT	2	6	126239	126244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392583
3090	NC_009632	A	6	6	126257	126262	100 %	0 %	0 %	0 %	150392583
3091	NC_009632	AGCT	2	8	126298	126305	25 %	25 %	25 %	25 %	150392583
3092	NC_009632	CAAA	2	8	126344	126351	75 %	0 %	0 %	25 %	150392583
3093	NC_009632	TTA	2	6	126354	126359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392583
3094	NC_009632	GTG	2	6	126382	126387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392583
3095	NC_009632	GTA	2	6	126391	126396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392583
3096	NC_009632	TCAG	2	8	126485	126492	25 %	25 %	25 %	25 %	150392584
3097	NC_009632	ATT	2	6	126528	126533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392584
3098	NC_009632	TGC	2	6	126603	126608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392584
3099	NC_009632	ACG	2	6	126619	126624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392584
3100	NC_009632	ATGG	2	8	126675	126682	25 %	25 %	50 %	0 %	150392584
3101	NC_009632	TGG	2	6	126783	126788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392584
3102	NC_009632	TGT	2	6	126789	126794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392584
3103	NC_009632	TCAG	2	8	126871	126878	25 %	25 %	25 %	25 %	150392584
3104	NC_009632	TGA	2	6	126947	126952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392584
3105	NC_009632	TTA	2	6	126962	126967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392584
3106	NC_009632	ATTG	2	8	126999	127006	25 %	50 %	25 %	0 %	150392584
3107	NC_009632	TAA	2	6	127044	127049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392584
3108	NC_009632	TAT	2	6	127076	127081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392584
3109	NC_009632	CA	3	6	127083	127088	50 %	0 %	0 %	50 %	150392584
3110	NC_009632	TAT	2	6	127104	127109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392584
3111	NC_009632	TATG	2	8	127134	127141	25 %	50 %	25 %	0 %	150392584
3112	NC_009632	CAC	2	6	127160	127165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392584
3113	NC_009632	TCA	2	6	127171	127176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392584
3114	NC_009632	GC	3	6	127253	127258	0 %	0 %	50 %	50 %	150392584
3115	NC_009632	TA	4	8	127301	127308	50 %	50 %	0 %	0 %	150392584
3116	NC_009632	CGA	2	6	127355	127360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392584
3117	NC_009632	TGTT	2	8	127430	127437	0 %	75 %	25 %	0 %	150392584
3118	NC_009632	TCA	2	6	127452	127457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392584
3119	NC_009632	ACG	2	6	127483	127488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392584
3120	NC_009632	GTT	2	6	127501	127506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392584
3121	NC_009632	ATT	2	6	127513	127518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392584
3122	NC_009632	TAC	2	6	127551	127556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392584
3123	NC_009632	CTA	2	6	127562	127567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392584
3124	NC_009632	GTA	2	6	127585	127590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392584
3125	NC_009632	AGTA	2	8	127596	127603	50 %	25 %	25 %	0 %	150392584
3126	NC_009632	AATCA	2	10	127633	127642	60 %	20 %	0 %	20 %	150392584
3127	NC_009632	CA	3	6	127648	127653	50 %	0 %	0 %	50 %	150392584
3128	NC_009632	A	6	6	127679	127684	100 %	0 %	0 %	0 %	150392584
3129	NC_009632	ACA	2	6	127705	127710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392585
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3131	NC_009632	ACC	2	6	127777	127782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392585
3132	NC_009632	ATC	2	6	127788	127793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392585
3133	NC_009632	CAT	2	6	127862	127867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392585
3134	NC_009632	ATC	2	6	127872	127877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392585
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3136	NC_009632	AAC	2	6	127915	127920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392585
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3140	NC_009632	CAT	2	6	128199	128204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392585
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3142	NC_009632	AGA	2	6	128266	128271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392585
3143	NC_009632	AT	3	6	128310	128315	50 %	50 %	0 %	0 %	150392585
3144	NC_009632	ATTTT	2	10	128331	128340	20 %	80 %	0 %	0 %	150392585
3145	NC_009632	ATCAA	2	10	128358	128367	60 %	20 %	0 %	20 %	150392585
3146	NC_009632	TAA	2	6	128415	128420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392585
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3148	NC_009632	TACG	2	8	128538	128545	25 %	25 %	25 %	25 %	150392585
3149	NC_009632	GAA	2	6	128642	128647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392585
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3152	NC_009632	ATT	2	6	128890	128895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392585
3153	NC_009632	GTT	2	6	128908	128913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392585
3154	NC_009632	TCTA	2	8	129019	129026	25 %	50 %	0 %	25 %	150392585
3155	NC_009632	TGT	2	6	129061	129066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392585
3156	NC_009632	GCA	2	6	129068	129073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392585
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3161	NC_009632	TTG	2	6	129258	129263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392585
3162	NC_009632	AGA	2	6	129271	129276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392585
3163	NC_009632	TGA	2	6	129315	129320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392585
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3167	NC_009632	TTG	2	6	129478	129483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392586
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3225	NC_009632	ATTT	2	8	131844	131851	25 %	75 %	0 %	0 %	150392587
3226	NC_009632	TGA	2	6	131856	131861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392587
3227	NC_009632	AT	3	6	131872	131877	50 %	50 %	0 %	0 %	150392587
3228	NC_009632	GAT	2	6	131920	131925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392587
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3230	NC_009632	GAAC	2	8	132090	132097	50 %	0 %	25 %	25 %	150392588
3231	NC_009632	ATT	2	6	132192	132197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392588
3232	NC_009632	TGG	2	6	132200	132205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392588
3233	NC_009632	AGAC	2	8	132214	132221	50 %	0 %	25 %	25 %	150392588
3234	NC_009632	AGA	2	6	132308	132313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392588
3235	NC_009632	ACACA	2	10	132324	132333	60 %	0 %	0 %	40 %	150392588
3236	NC_009632	TGA	2	6	132428	132433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392588
3237	NC_009632	TTTCAT	2	12	132480	132491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150392588
3238	NC_009632	A	6	6	132549	132554	100 %	0 %	0 %	0 %	150392588
3239	NC_009632	TGG	3	9	132605	132613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392588
3240	NC_009632	AGG	2	6	132821	132826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150392588
3241	NC_009632	CAA	2	6	132831	132836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392588
3242	NC_009632	GCA	2	6	132857	132862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392588
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3494	NC_009632	AATGTA	2	12	142891	142902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_009632	A	6	6	142934	142939	100 %	0 %	0 %	0 %	150392599
3496	NC_009632	AATG	2	8	143026	143033	50 %	25 %	25 %	0 %	150392599
3497	NC_009632	ATC	2	6	143064	143069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392599
3498	NC_009632	AGT	2	6	143083	143088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392599
3499	NC_009632	ATG	2	6	143187	143192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392599
3500	NC_009632	TGG	2	6	143350	143355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392599

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