MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009632	A	6	6	63246	63251	100 %	0 %	0 %	0 %	150392531
1502	NC_009632	GTT	2	6	63267	63272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392531
1503	NC_009632	ATA	2	6	63287	63292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392531
1504	NC_009632	TTA	2	6	63373	63378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392531
1505	NC_009632	ATT	2	6	63393	63398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392531
1506	NC_009632	T	7	7	63397	63403	0 %	100 %	0 %	0 %	150392531
1507	NC_009632	TTC	2	6	63465	63470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392531
1508	NC_009632	ACT	2	6	63480	63485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392531
1509	NC_009632	TAT	2	6	63575	63580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392531
1510	NC_009632	ATC	2	6	63603	63608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392531
1511	NC_009632	CTT	2	6	63614	63619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392531
1512	NC_009632	ATTT	2	8	63624	63631	25 %	75 %	0 %	0 %	150392531
1513	NC_009632	CTA	2	6	63653	63658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392531
1514	NC_009632	ATC	2	6	63672	63677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392531
1515	NC_009632	TA	3	6	63680	63685	50 %	50 %	0 %	0 %	150392531
1516	NC_009632	TAT	2	6	63692	63697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392531
1517	NC_009632	TAA	2	6	63722	63727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_009632	TA	3	6	63731	63736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_009632	GAA	2	6	63762	63767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_009632	GCT	2	6	63808	63813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_009632	CTAGT	2	10	63826	63835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1522	NC_009632	TA	3	6	63844	63849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009632	ATTTTT	2	12	63862	63873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_009632	A	6	6	63884	63889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009632	ATC	2	6	63898	63903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_009632	TAA	2	6	63934	63939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_009632	TTG	2	6	64000	64005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392532
1528	NC_009632	ATT	3	9	64012	64020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392532
1529	NC_009632	ATT	2	6	64081	64086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392532
1530	NC_009632	TTC	2	6	64186	64191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392532
1531	NC_009632	ATA	2	6	64201	64206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392532
1532	NC_009632	AT	3	6	64245	64250	50 %	50 %	0 %	0 %	150392532
1533	NC_009632	GATTT	2	10	64267	64276	20 %	60 %	20 %	0 %	150392532
1534	NC_009632	ATC	2	6	64309	64314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392532
1535	NC_009632	ACA	2	6	64368	64373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392532
1536	NC_009632	GTT	2	6	64406	64411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_009632	TAA	2	6	64450	64455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392533
1538	NC_009632	GTC	2	6	64490	64495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392533
1539	NC_009632	ATG	2	6	64522	64527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392533
1540	NC_009632	CAT	2	6	64534	64539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392533
1541	NC_009632	CT	3	6	64548	64553	0 %	50 %	0 %	50 %	150392533
1542	NC_009632	GTTTT	2	10	64676	64685	0 %	80 %	20 %	0 %	150392533
1543	NC_009632	TTGA	2	8	64736	64743	25 %	50 %	25 %	0 %	150392533
1544	NC_009632	ACT	2	6	64778	64783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392533
1545	NC_009632	T	6	6	64816	64821	0 %	100 %	0 %	0 %	150392534
1546	NC_009632	CCA	2	6	64965	64970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392534
1547	NC_009632	TTG	2	6	65021	65026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392534
1548	NC_009632	CTG	2	6	65033	65038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392534
1549	NC_009632	TTTCA	2	10	65040	65049	20 %	60 %	0 %	20 %	150392534
1550	NC_009632	A	6	6	65096	65101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_009632	TA	3	6	65148	65153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_009632	CTA	2	6	65176	65181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_009632	T	6	6	65192	65197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009632	AAT	3	9	65211	65219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_009632	AAG	2	6	65234	65239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009632	TTA	2	6	65300	65305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392535
1557	NC_009632	AT	3	6	65358	65363	50 %	50 %	0 %	0 %	150392535
1558	NC_009632	GTA	2	6	65378	65383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392535
1559	NC_009632	TAG	2	6	65446	65451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_009632	AT	3	6	65465	65470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_009632	AATT	2	8	65471	65478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_009632	AAT	2	6	65493	65498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009632	AAG	2	6	65500	65505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009632	TA	3	6	65506	65511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_009632	TCAA	2	8	65541	65548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_009632	TTAA	2	8	65549	65556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_009632	AT	3	6	65610	65615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_009632	CCA	2	6	65641	65646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_009632	ACA	2	6	65665	65670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_009632	AAC	2	6	65752	65757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_009632	TGT	2	6	65781	65786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009632	ATA	2	6	65846	65851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_009632	TGA	3	9	65862	65870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009632	ATAA	2	8	65917	65924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_009632	GAT	2	6	65950	65955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_009632	CTA	2	6	66041	66046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_009632	ATG	2	6	66124	66129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009632	ACC	2	6	66170	66175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_009632	ATA	2	6	66202	66207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_009632	AAT	2	6	66234	66239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_009632	AGA	2	6	66261	66266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_009632	TCA	2	6	66271	66276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_009632	TGC	2	6	66303	66308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_009632	ATAAGA	2	12	66318	66329	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009632	T	6	6	66342	66347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009632	T	7	7	66350	66356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_009632	AATA	2	8	66367	66374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_009632	TAA	2	6	66377	66382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_009632	GAT	2	6	66396	66401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_009632	GTT	2	6	66439	66444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_009632	CTG	2	6	66446	66451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_009632	GAC	2	6	66465	66470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_009632	TTG	2	6	66485	66490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009632	TAC	2	6	66497	66502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_009632	ATA	2	6	66561	66566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009632	AAG	2	6	66584	66589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_009632	TAATA	2	10	66621	66630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_009632	ATA	2	6	66654	66659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_009632	TAA	2	6	66672	66677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009632	ATT	2	6	66687	66692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_009632	TAA	2	6	66718	66723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_009632	A	6	6	66722	66727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_009632	GGA	2	6	66740	66745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_009632	TATAA	2	10	66750	66759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009632	AT	3	6	66860	66865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_009632	AG	3	6	66887	66892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009632	ATT	2	6	66894	66899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009632	GTC	2	6	66936	66941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_009632	ATCA	2	8	67004	67011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_009632	AAT	2	6	67066	67071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_009632	GAA	2	6	67116	67121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_009632	GAAT	2	8	67152	67159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_009632	AAG	2	6	67174	67179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_009632	TCA	2	6	67180	67185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_009632	AAAT	2	8	67194	67201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_009632	AT	3	6	67200	67205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_009632	GAC	2	6	67218	67223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_009632	CTG	2	6	67227	67232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_009632	GTTA	2	8	67243	67250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_009632	TG	3	6	67289	67294	0 %	50 %	50 %	0 %	150392536
1621	NC_009632	TAA	2	6	67414	67419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392536
1622	NC_009632	ATG	2	6	67447	67452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392536
1623	NC_009632	ATA	2	6	67455	67460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392536
1624	NC_009632	ATTC	2	8	67476	67483	25 %	50 %	0 %	25 %	150392536
1625	NC_009632	AAT	2	6	67717	67722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392536
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1627	NC_009632	GA	3	6	67756	67761	50 %	0 %	50 %	0 %	150392536
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1629	NC_009632	ATA	2	6	67799	67804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392536
1630	NC_009632	GTT	2	6	67809	67814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392536
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1632	NC_009632	TAA	2	6	67868	67873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392536
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1634	NC_009632	AAT	2	6	67931	67936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392536
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