MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009632	AGC	2	6	20167	20172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392494
502	NC_009632	CAT	2	6	20205	20210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392494
503	NC_009632	TGT	2	6	20212	20217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392494
504	NC_009632	TGG	2	6	20299	20304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392494
505	NC_009632	TGC	2	6	20323	20328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392494
506	NC_009632	ACA	2	6	20374	20379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392494
507	NC_009632	TAAAGG	2	12	20442	20453	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392495
508	NC_009632	A	6	6	20455	20460	100 %	0 %	0 %	0 %	150392495
509	NC_009632	AAG	2	6	20471	20476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392495
510	NC_009632	CTT	2	6	20499	20504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392495
511	NC_009632	A	6	6	20566	20571	100 %	0 %	0 %	0 %	150392495
512	NC_009632	CAA	2	6	20590	20595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392495
513	NC_009632	TTGAAG	2	12	20639	20650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392495
514	NC_009632	GGT	2	6	20671	20676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392495
515	NC_009632	AGTA	2	8	20691	20698	50 %	25 %	25 %	0 %	150392495
516	NC_009632	ATTC	2	8	20776	20783	25 %	50 %	0 %	25 %	150392495
517	NC_009632	AAG	2	6	20819	20824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392495
518	NC_009632	AC	3	6	20844	20849	50 %	0 %	0 %	50 %	150392495
519	NC_009632	GTCT	2	8	20947	20954	0 %	50 %	25 %	25 %	150392496
520	NC_009632	ATT	2	6	20963	20968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392496
521	NC_009632	TAC	2	6	20989	20994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392496
522	NC_009632	ATG	2	6	21056	21061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
523	NC_009632	ATA	2	6	21075	21080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392496
524	NC_009632	TGT	2	6	21091	21096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392496
525	NC_009632	TGAA	2	8	21132	21139	50 %	25 %	25 %	0 %	150392496
526	NC_009632	ACG	2	6	21185	21190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392496
527	NC_009632	TAT	2	6	21203	21208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392496
528	NC_009632	GCAT	2	8	21226	21233	25 %	25 %	25 %	25 %	150392496
529	NC_009632	GATT	2	8	21243	21250	25 %	50 %	25 %	0 %	150392496
530	NC_009632	ATG	2	6	21273	21278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
531	NC_009632	ATG	2	6	21285	21290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
532	NC_009632	ATC	2	6	21343	21348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392496
533	NC_009632	CAG	2	6	21483	21488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392496
534	NC_009632	GGTA	2	8	21733	21740	25 %	25 %	50 %	0 %	150392496
535	NC_009632	TGA	2	6	21766	21771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
536	NC_009632	GTC	2	6	21810	21815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392496
537	NC_009632	TGATTG	2	12	21843	21854	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392496
538	NC_009632	ACT	2	6	21855	21860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392496
539	NC_009632	ACA	2	6	21904	21909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392496
540	NC_009632	TC	3	6	21924	21929	0 %	50 %	0 %	50 %	150392496
541	NC_009632	GTG	2	6	21993	21998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392496
542	NC_009632	AAC	2	6	22002	22007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392496
543	NC_009632	ATG	2	6	22025	22030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
544	NC_009632	TGA	2	6	22093	22098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
545	NC_009632	GGC	2	6	22112	22117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150392496
546	NC_009632	GAT	2	6	22124	22129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
547	NC_009632	GAT	2	6	22133	22138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
548	NC_009632	GGT	2	6	22139	22144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392496
549	NC_009632	ATG	2	6	22161	22166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
550	NC_009632	TGAAAT	2	12	22174	22185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392496
551	NC_009632	AGTTA	2	10	22222	22231	40 %	40 %	20 %	0 %	150392496
552	NC_009632	ATA	2	6	22248	22253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392496
553	NC_009632	ATG	2	6	22286	22291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392496
554	NC_009632	A	6	6	22293	22298	100 %	0 %	0 %	0 %	150392496
555	NC_009632	AAT	2	6	22311	22316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009632	GAT	2	6	22323	22328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009632	AT	3	6	22366	22371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009632	TCA	2	6	22575	22580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392497
559	NC_009632	GTA	2	6	22584	22589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392497
560	NC_009632	AAGGAA	2	12	22612	22623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392497
561	NC_009632	CG	3	6	22661	22666	0 %	0 %	50 %	50 %	150392497
562	NC_009632	GGT	2	6	22674	22679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392497
563	NC_009632	AAT	2	6	22680	22685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392497
564	NC_009632	GTT	2	6	22788	22793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392497
565	NC_009632	GAA	2	6	22917	22922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392497
566	NC_009632	A	6	6	22956	22961	100 %	0 %	0 %	0 %	150392497
567	NC_009632	ATT	2	6	23045	23050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392497
568	NC_009632	CAT	2	6	23110	23115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392497
569	NC_009632	TGA	2	6	23117	23122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392497
570	NC_009632	GAA	2	6	23130	23135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392497
571	NC_009632	TGC	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392497
572	NC_009632	ATT	2	6	23411	23416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392497
573	NC_009632	CAT	2	6	23430	23435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392497
574	NC_009632	ACA	3	9	23463	23471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392497
575	NC_009632	CGT	2	6	23481	23486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392497
576	NC_009632	GGTT	2	8	23490	23497	0 %	50 %	50 %	0 %	150392497
577	NC_009632	TCG	2	6	23522	23527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392497
578	NC_009632	AGA	2	6	23702	23707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392497
579	NC_009632	AGA	2	6	23729	23734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392497
580	NC_009632	ATGTA	2	10	23780	23789	40 %	40 %	20 %	0 %	150392497
581	NC_009632	TCT	2	6	23800	23805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392497
582	NC_009632	AACA	2	8	23824	23831	75 %	0 %	0 %	25 %	150392497
583	NC_009632	TA	3	6	23861	23866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009632	AGG	2	6	23915	23920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009632	TTTG	2	8	23928	23935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009632	TCGAT	2	10	23944	23953	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
587	NC_009632	GAT	2	6	24014	24019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009632	AAG	2	6	24033	24038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009632	TAA	2	6	24052	24057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009632	ATT	2	6	24145	24150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009632	ATA	2	6	24151	24156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009632	TTC	2	6	24196	24201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_009632	A	6	6	24202	24207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009632	A	6	6	24225	24230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009632	ATCT	2	8	24263	24270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_009632	CGG	2	6	24321	24326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_009632	T	6	6	24359	24364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009632	GCCT	2	8	24391	24398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_009632	T	7	7	24467	24473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009632	ATATT	2	10	24481	24490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009632	AT	3	6	24499	24504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009632	TTA	2	6	24616	24621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009632	TTC	2	6	24653	24658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_009632	CCA	2	6	24670	24675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_009632	TCC	2	6	24677	24682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_009632	AAT	2	6	24714	24719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009632	ATTT	2	8	24723	24730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009632	TAT	2	6	24775	24780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009632	TCA	2	6	24794	24799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_009632	CCG	2	6	24825	24830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_009632	TAA	2	6	24839	24844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009632	A	6	6	24843	24848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009632	AT	3	6	24854	24859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009632	TA	3	6	24905	24910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009632	T	6	6	24979	24984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009632	A	6	6	25009	25014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009632	ATA	2	6	25022	25027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009632	GTT	2	6	25070	25075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392498
619	NC_009632	TGA	3	9	25081	25089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392498
620	NC_009632	A	7	7	25123	25129	100 %	0 %	0 %	0 %	150392498
621	NC_009632	ATG	2	6	25164	25169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392498
622	NC_009632	GAA	3	9	25187	25195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392498
623	NC_009632	A	6	6	25265	25270	100 %	0 %	0 %	0 %	150392498
624	NC_009632	AAT	3	9	25282	25290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392498
625	NC_009632	CGT	2	6	25409	25414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392498
626	NC_009632	A	6	6	25505	25510	100 %	0 %	0 %	0 %	150392498
627	NC_009632	TGAATT	2	12	25540	25551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392498
628	NC_009632	ATT	2	6	25557	25562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392498
629	NC_009632	TTA	2	6	25601	25606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392498
630	NC_009632	GTAC	2	8	25640	25647	25 %	25 %	25 %	25 %	150392498
631	NC_009632	TCG	2	6	25663	25668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392498
632	NC_009632	GAT	2	6	25688	25693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392498
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758	NC_009632	CAAC	2	8	31329	31336	50 %	0 %	0 %	50 %	150392503
759	NC_009632	ATCAGC	2	12	31339	31350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150392503
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