MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009632	CATGT	2	10	227344	227353	20 %	40 %	20 %	20 %	150392670
5502	NC_009632	TGA	2	6	227355	227360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
5503	NC_009632	ATAA	2	8	227361	227368	75 %	25 %	0 %	0 %	150392670
5504	NC_009632	TAA	2	6	227398	227403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
5505	NC_009632	GAT	2	6	227407	227412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
5506	NC_009632	TTGAA	2	10	227419	227428	40 %	40 %	20 %	0 %	150392670
5507	NC_009632	TCG	2	6	227450	227455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392670
5508	NC_009632	CCA	2	6	227516	227521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392670
5509	NC_009632	AAC	2	6	227576	227581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392670
5510	NC_009632	TAA	2	6	227595	227600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
5511	NC_009632	TCA	2	6	227603	227608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392670
5512	NC_009632	ATGA	2	8	227626	227633	50 %	25 %	25 %	0 %	150392670
5513	NC_009632	TCA	2	6	227735	227740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392670
5514	NC_009632	TAAA	2	8	227745	227752	75 %	25 %	0 %	0 %	150392670
5515	NC_009632	CGA	2	6	227805	227810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392670
5516	NC_009632	CCCTGA	2	12	227833	227844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150392670
5517	NC_009632	TAA	2	6	227959	227964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
5518	NC_009632	TGA	2	6	227999	228004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
5519	NC_009632	TGT	2	6	228044	228049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392670
5520	NC_009632	TCG	2	6	228116	228121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392670
5521	NC_009632	GTGA	2	8	228148	228155	25 %	25 %	50 %	0 %	150392670
5522	NC_009632	ATA	2	6	228161	228166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
5523	NC_009632	GTT	2	6	228239	228244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392670
5524	NC_009632	ACC	2	6	228313	228318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392670
5525	NC_009632	TTTG	2	8	228450	228457	0 %	75 %	25 %	0 %	150392670
5526	NC_009632	AG	3	6	228484	228489	50 %	0 %	50 %	0 %	150392670
5527	NC_009632	TGT	2	6	228530	228535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392670
5528	NC_009632	ATT	2	6	228553	228558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392670
5529	NC_009632	AAT	2	6	228577	228582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
5530	NC_009632	TG	3	6	228595	228600	0 %	50 %	50 %	0 %	150392670
5531	NC_009632	GTA	2	6	228615	228620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
5532	NC_009632	TCCTGA	2	12	228652	228663	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150392670
5533	NC_009632	CAA	2	6	228669	228674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392670
5534	NC_009632	T	7	7	228688	228694	0 %	100 %	0 %	0 %	150392670
5535	NC_009632	T	6	6	228713	228718	0 %	100 %	0 %	0 %	150392670
5536	NC_009632	TCA	2	6	228737	228742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392670
5537	NC_009632	AATTG	2	10	228744	228753	40 %	40 %	20 %	0 %	150392670
5538	NC_009632	TAA	2	6	228775	228780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
5539	NC_009632	ATG	2	6	228788	228793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
5540	NC_009632	ATT	2	6	228863	228868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_009632	TAT	2	6	228945	228950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
5542	NC_009632	TTTTC	2	10	228993	229002	0 %	80 %	0 %	20 %	150392671
5543	NC_009632	A	6	6	229012	229017	100 %	0 %	0 %	0 %	150392671
5544	NC_009632	TAA	2	6	229027	229032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392671
5545	NC_009632	GCA	2	6	229087	229092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392671
5546	NC_009632	CA	3	6	229102	229107	50 %	0 %	0 %	50 %	150392671
5547	NC_009632	AAG	2	6	229116	229121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392671
5548	NC_009632	TAT	2	6	229206	229211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
5549	NC_009632	TCA	2	6	229221	229226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392671
5550	NC_009632	TATT	2	8	229270	229277	25 %	75 %	0 %	0 %	150392671
5551	NC_009632	TTAG	2	8	229286	229293	25 %	50 %	25 %	0 %	150392671
5552	NC_009632	AT	3	6	229294	229299	50 %	50 %	0 %	0 %	150392671
5553	NC_009632	TCA	2	6	229329	229334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392671
5554	NC_009632	GT	3	6	229350	229355	0 %	50 %	50 %	0 %	150392671
5555	NC_009632	CAA	2	6	229413	229418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392671
5556	NC_009632	TCAAT	2	10	229432	229441	40 %	40 %	0 %	20 %	150392671
5557	NC_009632	CAT	2	6	229448	229453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392671
5558	NC_009632	TTATT	2	10	229465	229474	20 %	80 %	0 %	0 %	150392671
5559	NC_009632	AAT	2	6	229579	229584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392671
5560	NC_009632	ATTA	2	8	229612	229619	50 %	50 %	0 %	0 %	150392671
5561	NC_009632	TAT	2	6	229636	229641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
5562	NC_009632	TAT	2	6	229731	229736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
5563	NC_009632	CCA	2	6	229772	229777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392671
5564	NC_009632	TGC	2	6	229840	229845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392671
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5568	NC_009632	ATT	2	6	229970	229975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
5569	NC_009632	TCT	2	6	229996	230001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392671
5570	NC_009632	CAG	2	6	230025	230030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392671
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5572	NC_009632	CAG	2	6	230103	230108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392671
5573	NC_009632	TGGG	2	8	230112	230119	0 %	25 %	75 %	0 %	150392671
5574	NC_009632	TA	4	8	230124	230131	50 %	50 %	0 %	0 %	150392671
5575	NC_009632	ATT	2	6	230159	230164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
5576	NC_009632	AT	3	6	230166	230171	50 %	50 %	0 %	0 %	150392671
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5580	NC_009632	AACA	2	8	230417	230424	75 %	0 %	0 %	25 %	150392672
5581	NC_009632	CAT	2	6	230431	230436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
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5585	NC_009632	ATT	2	6	230502	230507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392672
5586	NC_009632	ACT	2	6	230587	230592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
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5589	NC_009632	TCAATT	2	12	230803	230814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392672
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5592	NC_009632	TAA	2	6	230891	230896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392672
5593	NC_009632	CAT	2	6	230927	230932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
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5595	NC_009632	CAT	2	6	230957	230962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
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5601	NC_009632	GTA	2	6	231266	231271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392672
5602	NC_009632	ACT	2	6	231272	231277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
5603	NC_009632	TAT	2	6	231318	231323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392672
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5605	NC_009632	GAA	2	6	231412	231417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392673
5606	NC_009632	GCGA	2	8	231522	231529	25 %	0 %	50 %	25 %	150392673
5607	NC_009632	CAA	2	6	231531	231536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392673
5608	NC_009632	CAAG	2	8	231551	231558	50 %	0 %	25 %	25 %	150392673
5609	NC_009632	TGA	2	6	231688	231693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392673
5610	NC_009632	CTATG	2	10	231721	231730	20 %	40 %	20 %	20 %	150392673
5611	NC_009632	ATT	2	6	231736	231741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392673
5612	NC_009632	GTT	2	6	231790	231795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392673
5613	NC_009632	AAAC	2	8	231830	231837	75 %	0 %	0 %	25 %	150392673
5614	NC_009632	A	6	6	231901	231906	100 %	0 %	0 %	0 %	150392673
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5617	NC_009632	TAG	2	6	232000	232005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392673
5618	NC_009632	TGA	2	6	232029	232034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392673
5619	NC_009632	CAA	2	6	232037	232042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392673
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5621	NC_009632	TTA	4	12	232124	232135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392673
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5995	NC_009632	CAA	2	6	249148	249153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392687
5996	NC_009632	ATA	2	6	249164	249169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392687
5997	NC_009632	ATC	2	6	249170	249175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392687
5998	NC_009632	CAT	2	6	249205	249210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392687
5999	NC_009632	TTG	2	6	249242	249247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392687
6000	NC_009632	TAA	2	6	249251	249256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392687

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