MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009632	TCT	2	6	207718	207723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392652
5002	NC_009632	ATG	2	6	207766	207771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392652
5003	NC_009632	GCT	2	6	207776	207781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392652
5004	NC_009632	TAA	2	6	207804	207809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392652
5005	NC_009632	TA	3	6	207813	207818	50 %	50 %	0 %	0 %	150392652
5006	NC_009632	GTAAAT	2	12	207899	207910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392652
5007	NC_009632	ATTA	2	8	207939	207946	50 %	50 %	0 %	0 %	150392652
5008	NC_009632	GTT	2	6	207961	207966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392652
5009	NC_009632	GTC	2	6	208026	208031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392652
5010	NC_009632	AGTG	2	8	208048	208055	25 %	25 %	50 %	0 %	150392652
5011	NC_009632	GTA	2	6	208180	208185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392652
5012	NC_009632	ATA	2	6	208285	208290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392652
5013	NC_009632	TAAG	2	8	208368	208375	50 %	25 %	25 %	0 %	150392652
5014	NC_009632	GTT	2	6	208385	208390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392652
5015	NC_009632	A	7	7	208395	208401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_009632	TGT	2	6	208472	208477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_009632	G	6	6	208530	208535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_009632	TGA	2	6	208543	208548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009632	ATG	2	6	208587	208592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_009632	A	6	6	208614	208619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_009632	ATT	2	6	208666	208671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392653
5022	NC_009632	AAT	2	6	208680	208685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
5023	NC_009632	AAATG	2	10	208694	208703	60 %	20 %	20 %	0 %	150392653
5024	NC_009632	ATA	2	6	208758	208763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
5025	NC_009632	TAA	2	6	208817	208822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
5026	NC_009632	CTT	2	6	208837	208842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392653
5027	NC_009632	GTAAA	2	10	208858	208867	60 %	20 %	20 %	0 %	150392653
5028	NC_009632	TTTAA	2	10	208878	208887	40 %	60 %	0 %	0 %	150392653
5029	NC_009632	TTG	2	6	208954	208959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392653
5030	NC_009632	CAT	2	6	209036	209041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392653
5031	NC_009632	T	6	6	209041	209046	0 %	100 %	0 %	0 %	150392653
5032	NC_009632	TTG	2	6	209128	209133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392653
5033	NC_009632	TCT	2	6	209142	209147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392653
5034	NC_009632	CAA	3	9	209149	209157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392653
5035	NC_009632	TAG	3	9	209182	209190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
5036	NC_009632	CTA	2	6	209197	209202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392653
5037	NC_009632	TTGC	2	8	209263	209270	0 %	50 %	25 %	25 %	150392653
5038	NC_009632	ATT	2	6	209273	209278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392653
5039	NC_009632	TTTGC	2	10	209394	209403	0 %	60 %	20 %	20 %	150392653
5040	NC_009632	ATTTTA	2	12	209494	209505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392653
5041	NC_009632	AGT	2	6	209527	209532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
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5043	NC_009632	TTA	2	6	209583	209588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392653
5044	NC_009632	GTA	2	6	209590	209595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
5045	NC_009632	ACC	2	6	209621	209626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392653
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5047	NC_009632	ATG	2	6	209767	209772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
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5050	NC_009632	TG	3	6	209828	209833	0 %	50 %	50 %	0 %	150392653
5051	NC_009632	GCT	2	6	209847	209852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392653
5052	NC_009632	CAT	2	6	209867	209872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392653
5053	NC_009632	AAT	2	6	209960	209965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
5054	NC_009632	TAA	2	6	210044	210049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
5055	NC_009632	TGA	2	6	210055	210060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
5056	NC_009632	TAA	2	6	210098	210103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
5057	NC_009632	ATG	2	6	210175	210180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
5058	NC_009632	CAT	2	6	210188	210193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392653
5059	NC_009632	GAA	2	6	210218	210223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392653
5060	NC_009632	ATA	3	9	210288	210296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
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5062	NC_009632	AC	3	6	210304	210309	50 %	0 %	0 %	50 %	150392653
5063	NC_009632	TTGTT	2	10	210400	210409	0 %	80 %	20 %	0 %	150392653
5064	NC_009632	CGA	2	6	210424	210429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392653
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5069	NC_009632	AGT	2	6	210580	210585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
5070	NC_009632	TAA	2	6	210623	210628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
5071	NC_009632	GCT	2	6	210636	210641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392653
5072	NC_009632	TTC	2	6	210702	210707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392653
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5074	NC_009632	A	6	6	210755	210760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_009632	CTTA	2	8	210820	210827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5076	NC_009632	TAAT	2	8	210846	210853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_009632	AAG	2	6	210858	210863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_009632	AGT	2	6	210874	210879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_009632	TTTG	2	8	210936	210943	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_009632	ATT	2	6	210986	210991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_009632	ATT	3	9	211025	211033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_009632	ATA	2	6	211039	211044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_009632	GTT	2	6	211074	211079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_009632	TAA	2	6	211081	211086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_009632	CAG	2	6	211089	211094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5087	NC_009632	TAT	2	6	211102	211107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_009632	AAAG	2	8	211117	211124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_009632	TAA	2	6	211142	211147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_009632	ATT	2	6	211173	211178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_009632	CAACT	2	10	211249	211258	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5092	NC_009632	TAA	2	6	211268	211273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_009632	AGG	2	6	211285	211290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_009632	AGA	3	9	211401	211409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392654
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5096	NC_009632	ACT	2	6	211440	211445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392654
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5098	NC_009632	ATG	2	6	211535	211540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392654
5099	NC_009632	TAT	2	6	211632	211637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392654
5100	NC_009632	CAA	2	6	211666	211671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392654
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5102	NC_009632	AT	3	6	211795	211800	50 %	50 %	0 %	0 %	150392654
5103	NC_009632	CAA	2	6	211850	211855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392654
5104	NC_009632	ATT	2	6	211896	211901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392654
5105	NC_009632	ATTG	2	8	211941	211948	25 %	50 %	25 %	0 %	150392654
5106	NC_009632	AGGC	2	8	211954	211961	25 %	0 %	50 %	25 %	150392654
5107	NC_009632	AAC	2	6	211964	211969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392654
5108	NC_009632	GAA	2	6	212011	212016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392654
5109	NC_009632	TTCG	2	8	212090	212097	0 %	50 %	25 %	25 %	150392654
5110	NC_009632	ACG	2	6	212143	212148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392654
5111	NC_009632	ACG	2	6	212151	212156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392654
5112	NC_009632	TGT	2	6	212253	212258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392654
5113	NC_009632	ATT	2	6	212266	212271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392654
5114	NC_009632	AGA	2	6	212274	212279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392654
5115	NC_009632	A	6	6	212327	212332	100 %	0 %	0 %	0 %	150392654
5116	NC_009632	AAG	2	6	212344	212349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392654
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5119	NC_009632	AGA	2	6	212441	212446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392655
5120	NC_009632	TAA	2	6	212497	212502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392655
5121	NC_009632	A	8	8	212501	212508	100 %	0 %	0 %	0 %	150392655
5122	NC_009632	GT	3	6	212594	212599	0 %	50 %	50 %	0 %	150392655
5123	NC_009632	TAT	2	6	212636	212641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392655
5124	NC_009632	TGG	2	6	212645	212650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392655
5125	NC_009632	ACA	2	6	212651	212656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392655
5126	NC_009632	A	6	6	212694	212699	100 %	0 %	0 %	0 %	150392655
5127	NC_009632	GAA	2	6	212706	212711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392655
5128	NC_009632	ACA	2	6	212823	212828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392655
5129	NC_009632	TGGT	2	8	212983	212990	0 %	50 %	50 %	0 %	150392655
5130	NC_009632	TGAT	2	8	213016	213023	25 %	50 %	25 %	0 %	150392655
5131	NC_009632	TAT	2	6	213065	213070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392655
5132	NC_009632	ATG	2	6	213094	213099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392655
5133	NC_009632	ATG	2	6	213130	213135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392655
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5154	NC_009632	ATT	2	6	213980	213985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392656
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5191	NC_009632	TGTGA	2	10	215645	215654	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5229	NC_009632	TGA	2	6	217386	217391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392659
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5235	NC_009632	GAA	2	6	217672	217677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392659
5236	NC_009632	ATC	2	6	217720	217725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392659
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5239	NC_009632	AAC	2	6	217841	217846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392659
5240	NC_009632	GAT	2	6	217888	217893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392659
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5242	NC_009632	A	6	6	218016	218021	100 %	0 %	0 %	0 %	150392659
5243	NC_009632	GTT	2	6	218065	218070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392659
5244	NC_009632	A	6	6	218227	218232	100 %	0 %	0 %	0 %	150392659
5245	NC_009632	CAAA	2	8	218263	218270	75 %	0 %	0 %	25 %	150392659
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5247	NC_009632	CA	3	6	218363	218368	50 %	0 %	0 %	50 %	150392659
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5359	NC_009632	A	6	6	223039	223044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_009632	A	7	7	223067	223073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_009632	TAT	2	6	223074	223079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5362	NC_009632	ATA	2	6	223080	223085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_009632	GAG	3	9	223091	223099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_009632	A	7	7	223126	223132	100 %	0 %	0 %	0 %	150392664
5365	NC_009632	TTA	2	6	223172	223177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392664
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5367	NC_009632	AGT	2	6	223195	223200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392664
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5370	NC_009632	AG	3	6	223354	223359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_009632	CTTT	2	8	223361	223368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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