MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009632	GCA	2	6	187130	187135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392639
4502	NC_009632	T	6	6	187204	187209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_009632	TTG	2	6	187222	187227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_009632	T	6	6	187233	187238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_009632	ATA	2	6	187242	187247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_009632	TAA	4	12	187317	187328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_009632	TAA	2	6	187350	187355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_009632	CTT	2	6	187388	187393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_009632	AAG	2	6	187400	187405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_009632	AAC	2	6	187434	187439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392640
4511	NC_009632	AGA	2	6	187620	187625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392640
4512	NC_009632	ATT	2	6	187693	187698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392640
4513	NC_009632	ATG	3	9	187716	187724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392640
4514	NC_009632	AAT	2	6	187821	187826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_009632	GGT	2	6	187834	187839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_009632	T	8	8	187856	187863	0 %	100 %	0 %	0 %	150392641
4517	NC_009632	GA	3	6	187928	187933	50 %	0 %	50 %	0 %	150392641
4518	NC_009632	ATT	2	6	187953	187958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392641
4519	NC_009632	A	6	6	188002	188007	100 %	0 %	0 %	0 %	150392641
4520	NC_009632	ATT	2	6	188110	188115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392641
4521	NC_009632	AT	3	6	188136	188141	50 %	50 %	0 %	0 %	150392641
4522	NC_009632	CAG	2	6	188189	188194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392641
4523	NC_009632	GCA	2	6	188224	188229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392641
4524	NC_009632	TTA	2	6	188305	188310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392641
4525	NC_009632	CTT	2	6	188314	188319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392641
4526	NC_009632	GAA	2	6	188329	188334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392641
4527	NC_009632	ACA	2	6	188400	188405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392641
4528	NC_009632	TTG	2	6	188447	188452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392641
4529	NC_009632	ACA	2	6	188484	188489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392641
4530	NC_009632	CAAT	2	8	188498	188505	50 %	25 %	0 %	25 %	150392641
4531	NC_009632	CAA	2	6	188506	188511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392641
4532	NC_009632	TGA	2	6	188541	188546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392641
4533	NC_009632	TCA	2	6	188554	188559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392641
4534	NC_009632	A	6	6	188638	188643	100 %	0 %	0 %	0 %	150392641
4535	NC_009632	ACCTGC	2	12	188757	188768	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150392641
4536	NC_009632	ATC	2	6	188771	188776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392641
4537	NC_009632	TTC	2	6	188881	188886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392641
4538	NC_009632	AAGATA	2	12	188903	188914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150392641
4539	NC_009632	TTG	2	6	188918	188923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392641
4540	NC_009632	TA	3	6	189003	189008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_009632	ACT	2	6	189025	189030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_009632	TGT	2	6	189033	189038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_009632	AGT	2	6	189048	189053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_009632	T	7	7	189053	189059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_009632	ATT	2	6	189138	189143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_009632	TCAT	2	8	189152	189159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_009632	AAT	2	6	189164	189169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_009632	AT	3	6	189168	189173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_009632	T	7	7	189190	189196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_009632	TTTG	2	8	189235	189242	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_009632	TAA	2	6	189290	189295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_009632	TA	3	6	189303	189308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_009632	GT	3	6	189316	189321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_009632	AT	3	6	189322	189327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_009632	TTA	2	6	189344	189349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_009632	GATT	2	8	189381	189388	25 %	50 %	25 %	0 %	150392642
4557	NC_009632	T	6	6	189394	189399	0 %	100 %	0 %	0 %	150392642
4558	NC_009632	ATT	2	6	189407	189412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392642
4559	NC_009632	TCAA	2	8	189463	189470	50 %	25 %	0 %	25 %	150392642
4560	NC_009632	TA	3	6	189478	189483	50 %	50 %	0 %	0 %	150392642
4561	NC_009632	TTG	2	6	189486	189491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392642
4562	NC_009632	TTAT	2	8	189570	189577	25 %	75 %	0 %	0 %	150392642
4563	NC_009632	CGA	2	6	189582	189587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392642
4564	NC_009632	ATT	2	6	189641	189646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392642
4565	NC_009632	ATTA	2	8	189712	189719	50 %	50 %	0 %	0 %	150392642
4566	NC_009632	TAC	2	6	189837	189842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392642
4567	NC_009632	AGC	2	6	189853	189858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392642
4568	NC_009632	TTTAT	2	10	189881	189890	20 %	80 %	0 %	0 %	150392642
4569	NC_009632	AT	3	6	189889	189894	50 %	50 %	0 %	0 %	150392642
4570	NC_009632	TGA	2	6	189931	189936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392642
4571	NC_009632	AT	3	6	189978	189983	50 %	50 %	0 %	0 %	150392642
4572	NC_009632	ATC	2	6	190046	190051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392642
4573	NC_009632	ATG	2	6	190052	190057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392642
4574	NC_009632	AT	3	6	190078	190083	50 %	50 %	0 %	0 %	150392642
4575	NC_009632	GTC	3	9	190181	190189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392642
4576	NC_009632	A	6	6	190238	190243	100 %	0 %	0 %	0 %	150392642
4577	NC_009632	TTG	2	6	190272	190277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392642
4578	NC_009632	TTA	2	6	190313	190318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392642
4579	NC_009632	GTT	2	6	190319	190324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392642
4580	NC_009632	ATT	2	6	190352	190357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392642
4581	NC_009632	AAC	2	6	190377	190382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392642
4582	NC_009632	ATT	2	6	190391	190396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392642
4583	NC_009632	CTAG	2	8	190460	190467	25 %	25 %	25 %	25 %	150392642
4584	NC_009632	TA	3	6	190517	190522	50 %	50 %	0 %	0 %	150392642
4585	NC_009632	TTG	2	6	190554	190559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392642
4586	NC_009632	ATTT	2	8	190601	190608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_009632	ATTT	2	8	190613	190620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_009632	TTA	2	6	190680	190685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_009632	GTT	2	6	190727	190732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_009632	AAC	2	6	190767	190772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_009632	AAC	2	6	190798	190803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_009632	ATGT	2	8	190844	190851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_009632	GAT	2	6	190883	190888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_009632	AT	3	6	190911	190916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_009632	TTAA	2	8	190965	190972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_009632	TCG	2	6	190977	190982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_009632	TATCA	2	10	190985	190994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4598	NC_009632	AGTA	2	8	191007	191014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_009632	TAT	2	6	191020	191025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_009632	AAG	2	6	191033	191038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_009632	TA	3	6	191088	191093	50 %	50 %	0 %	0 %	150392643
4602	NC_009632	ATA	2	6	191099	191104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392643
4603	NC_009632	AC	3	6	191116	191121	50 %	0 %	0 %	50 %	150392643
4604	NC_009632	CTA	2	6	191162	191167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392643
4605	NC_009632	ATG	2	6	191170	191175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392643
4606	NC_009632	CAA	2	6	191197	191202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392643
4607	NC_009632	T	7	7	191220	191226	0 %	100 %	0 %	0 %	150392643
4608	NC_009632	TAC	2	6	191232	191237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392643
4609	NC_009632	TCT	2	6	191302	191307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392643
4610	NC_009632	T	7	7	191331	191337	0 %	100 %	0 %	0 %	150392643
4611	NC_009632	TGC	2	6	191409	191414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392643
4612	NC_009632	AT	3	6	191415	191420	50 %	50 %	0 %	0 %	150392643
4613	NC_009632	GAT	2	6	191449	191454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392643
4614	NC_009632	TGA	2	6	191475	191480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392643
4615	NC_009632	ATGCA	2	10	191484	191493	40 %	20 %	20 %	20 %	150392643
4616	NC_009632	TTA	2	6	191510	191515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392643
4617	NC_009632	ATG	2	6	191549	191554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392643
4618	NC_009632	TGAT	2	8	191690	191697	25 %	50 %	25 %	0 %	150392643
4619	NC_009632	GT	3	6	191735	191740	0 %	50 %	50 %	0 %	150392643
4620	NC_009632	CAA	2	6	191764	191769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392643
4621	NC_009632	ATG	2	6	191771	191776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392643
4622	NC_009632	CGTTAA	2	12	191837	191848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150392643
4623	NC_009632	ATGT	2	8	191864	191871	25 %	50 %	25 %	0 %	150392643
4624	NC_009632	ACA	2	6	191881	191886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392643
4625	NC_009632	TAA	2	6	191892	191897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392643
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4627	NC_009632	ATC	2	6	191972	191977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392643
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4996	NC_009632	CAT	2	6	207500	207505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392652
4997	NC_009632	CTG	2	6	207530	207535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392652
4998	NC_009632	TGT	2	6	207581	207586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392652
4999	NC_009632	CGT	2	6	207623	207628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392652
5000	NC_009632	ATA	2	6	207639	207644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392652

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