MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED03

Total Repeats: 3423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009622	GTG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009622	CTG	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009622	TCG	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378264
4	NC_009622	CAA	2	6	376	381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378264
5	NC_009622	AGC	2	6	464	469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378264
6	NC_009622	TTC	2	6	470	475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378264
7	NC_009622	GGA	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378264
8	NC_009622	GGT	2	6	785	790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378264
9	NC_009622	CGC	2	6	836	841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378264
10	NC_009622	GGC	2	6	878	883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378264
11	NC_009622	GCA	2	6	908	913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378264
12	NC_009622	GAC	2	6	1159	1164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009622	GCA	2	6	1497	1502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378265
14	NC_009622	GAC	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009622	AAG	2	6	1713	1718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378266
16	NC_009622	GCT	2	6	1733	1738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378266
17	NC_009622	CGG	2	6	1776	1781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378266
18	NC_009622	AAC	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378266
19	NC_009622	GGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378266
20	NC_009622	CAA	2	6	1987	1992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378266
21	NC_009622	CGT	2	6	2068	2073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378266
22	NC_009622	GCT	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378266
23	NC_009622	CGA	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378266
24	NC_009622	AAC	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378266
25	NC_009622	ATA	2	6	2529	2534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150378266
26	NC_009622	CGT	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378266
27	NC_009622	GAC	2	6	2832	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378267
28	NC_009622	CAC	2	6	2923	2928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378267
29	NC_009622	ATG	2	6	2945	2950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378267
30	NC_009622	CGA	2	6	3137	3142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378267
31	NC_009622	CCT	2	6	3153	3158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378267
32	NC_009622	GAA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378267
33	NC_009622	AAC	2	6	3320	3325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378267
34	NC_009622	TGG	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378267
35	NC_009622	CAA	2	6	3585	3590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378267
36	NC_009622	CTT	2	6	3826	3831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009622	CGA	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009622	AAG	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378268
39	NC_009622	AAG	2	6	4146	4151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378268
40	NC_009622	CCG	2	6	4303	4308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009622	CGC	2	6	4337	4342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009622	GGA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009622	TCG	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378269
44	NC_009622	TCA	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378269
45	NC_009622	TGC	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378269
46	NC_009622	TGG	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378269
47	NC_009622	CGA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378269
48	NC_009622	AGC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378269
49	NC_009622	GAA	2	6	4837	4842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378269
50	NC_009622	CGA	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378269
51	NC_009622	GGC	2	6	5020	5025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378269
52	NC_009622	CGC	2	6	5131	5136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378269
53	NC_009622	CGT	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378269
54	NC_009622	CGG	2	6	5244	5249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378269
55	NC_009622	GCG	2	6	5305	5310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009622	ACG	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009622	GCC	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009622	GTC	2	6	5415	5420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009622	TCT	2	6	5463	5468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009622	TGT	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009622	GGC	2	6	5561	5566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009622	TTC	2	6	5629	5634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009622	GGC	2	6	5873	5878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009622	TTG	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009622	GTC	2	6	5920	5925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009622	ATG	2	6	6172	6177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378270
67	NC_009622	GAA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378270
68	NC_009622	GAC	2	6	6221	6226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378270
69	NC_009622	AAG	2	6	6346	6351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378270
70	NC_009622	AGG	2	6	6356	6361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378270
71	NC_009622	GCC	2	6	6372	6377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378270
72	NC_009622	TTC	2	6	6395	6400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378270
73	NC_009622	AGC	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378270
74	NC_009622	CAG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378270
75	NC_009622	CGA	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378270
76	NC_009622	CGT	2	6	6767	6772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378271
77	NC_009622	TTC	2	6	6791	6796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378271
78	NC_009622	CCG	2	6	6856	6861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378271
79	NC_009622	GGT	2	6	6871	6876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378271
80	NC_009622	GAC	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378271
81	NC_009622	GGC	2	6	7074	7079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378272
82	NC_009622	TGC	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378272
83	NC_009622	CGC	2	6	7095	7100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378272
84	NC_009622	GTC	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378272
85	NC_009622	GGA	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378272
86	NC_009622	GCC	2	6	7299	7304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378272
87	NC_009622	ACG	2	6	7315	7320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
88	NC_009622	TGC	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378272
89	NC_009622	GCA	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
90	NC_009622	GTG	2	6	7700	7705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378272
91	NC_009622	CGA	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
92	NC_009622	GAC	2	6	7809	7814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
93	NC_009622	CCA	2	6	7847	7852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378272
94	NC_009622	GCG	2	6	7880	7885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378272
95	NC_009622	TGA	2	6	7979	7984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378272
96	NC_009622	TCG	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378272
97	NC_009622	GGC	2	6	8089	8094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378272
98	NC_009622	TTC	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378272
99	NC_009622	AAC	2	6	8126	8131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378272
100	NC_009622	AAG	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378272
101	NC_009622	CGA	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
102	NC_009622	ACA	3	9	8372	8380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378272
103	NC_009622	GCG	2	6	8501	8506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378272
104	NC_009622	CGA	2	6	8574	8579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
105	NC_009622	GAC	2	6	8638	8643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378273
106	NC_009622	GGC	2	6	8776	8781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378273
107	NC_009622	ACC	2	6	8850	8855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378273
108	NC_009622	CTC	2	6	8909	8914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378273
109	NC_009622	ACC	3	9	8949	8957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378273
110	NC_009622	CGA	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378273
111	NC_009622	GAA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378273
112	NC_009622	AGG	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378273
113	NC_009622	TCG	2	6	9214	9219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378273
114	NC_009622	TCC	2	6	9336	9341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378273
115	NC_009622	CTC	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378273
116	NC_009622	ATC	2	6	9447	9452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378273
117	NC_009622	CCG	2	6	9642	9647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378273
118	NC_009622	ACC	2	6	9678	9683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378273
119	NC_009622	TCG	2	6	9740	9745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378273
120	NC_009622	GCG	2	6	9781	9786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378273
121	NC_009622	CGC	2	6	9986	9991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378273
122	NC_009622	TTC	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378273
123	NC_009622	GCC	2	6	10091	10096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378273
124	NC_009622	GAC	2	6	10259	10264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378273
125	NC_009622	GAA	2	6	10286	10291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378273
126	NC_009622	CCG	2	6	10292	10297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378273
127	NC_009622	CAG	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378273
128	NC_009622	AAG	2	6	10577	10582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378274
129	NC_009622	CAG	2	6	10597	10602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378274
130	NC_009622	GCA	2	6	10758	10763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378274
131	NC_009622	ATC	2	6	10810	10815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378274
132	NC_009622	TGC	2	6	10816	10821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378274
133	NC_009622	TCC	2	6	10835	10840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378274
134	NC_009622	CCG	2	6	11042	11047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378274
135	NC_009622	CCT	2	6	11163	11168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378274
136	NC_009622	CGA	2	6	11238	11243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378274
137	NC_009622	CAC	2	6	11269	11274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378274
138	NC_009622	GAA	2	6	11356	11361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378274
139	NC_009622	CGA	2	6	11403	11408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378274
140	NC_009622	ACA	2	6	11463	11468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378274
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142	NC_009622	GCC	2	6	11488	11493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378274
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144	NC_009622	AGG	2	6	11647	11652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378275
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146	NC_009622	AGG	2	6	11905	11910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009622	CGG	2	6	11921	11926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009622	CGG	2	6	11984	11989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009622	GCC	2	6	12188	12193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378276
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153	NC_009622	CAC	2	6	12327	12332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378276
154	NC_009622	TTG	2	6	12431	12436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150378276
155	NC_009622	GCA	2	6	12462	12467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378276
156	NC_009622	GTC	2	6	12508	12513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378276
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159	NC_009622	ACT	2	6	12671	12676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_009622	CGA	2	6	12878	12883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_009622	GGC	2	6	13121	13126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_009622	GCC	2	6	13133	13138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_009622	CGC	2	6	13191	13196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378277
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166	NC_009622	ATC	2	6	13616	13621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378277
167	NC_009622	CAA	2	6	13627	13632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378277
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172	NC_009622	ACC	2	6	13773	13778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_009622	CGG	2	6	13895	13900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_009622	AGC	2	6	13943	13948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_009622	AGT	2	6	14048	14053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_009622	TCC	2	6	14941	14946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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233	NC_009622	TGC	2	6	17406	17411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378282
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250	NC_009622	ACC	2	6	18517	18522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378282
251	NC_009622	CCT	2	6	18677	18682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378282
252	NC_009622	CAA	2	6	18695	18700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378282
253	NC_009622	GGC	2	6	18789	18794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378282
254	NC_009622	GGC	2	6	18873	18878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378282
255	NC_009622	GAC	2	6	18884	18889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378282
256	NC_009622	TCT	2	6	18904	18909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378282
257	NC_009622	CAT	2	6	18989	18994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378282
258	NC_009622	CGA	2	6	19003	19008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378282
259	NC_009622	CGG	2	6	19058	19063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378282
260	NC_009622	CCG	2	6	19111	19116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378282
261	NC_009622	CCA	2	6	19156	19161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378282
262	NC_009622	GCC	2	6	19207	19212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378283
263	NC_009622	AAC	2	6	19276	19281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378283
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271	NC_009622	CGA	2	6	19587	19592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378283
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279	NC_009622	GCC	2	6	19972	19977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378283
280	NC_009622	CCG	2	6	19981	19986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378283
281	NC_009622	CTG	2	6	20007	20012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378284
282	NC_009622	GCG	2	6	20019	20024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378284
283	NC_009622	GAG	2	6	20055	20060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378284
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290	NC_009622	GAG	2	6	20379	20384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378284
291	NC_009622	CGC	2	6	20399	20404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378284
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354	NC_009622	TGG	2	6	23541	23546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378287
355	NC_009622	TCA	2	6	23620	23625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378287
356	NC_009622	CCG	2	6	23725	23730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378287
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379	NC_009622	GGC	2	6	24852	24857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378289
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499	NC_009622	GCG	2	6	32216	32221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_009622	AAG	2	6	32296	32301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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