MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 chromosome

Total Repeats: 158435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009511	CCA	2	6	15081	15086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148552943
502	NC_009511	GTC	2	6	15095	15100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552943
503	NC_009511	ATCCTG	2	12	15110	15121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148552943
504	NC_009511	ATC	2	6	15134	15139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148552943
505	NC_009511	CGG	2	6	15207	15212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552944
506	NC_009511	GCG	2	6	15251	15256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552944
507	NC_009511	TCA	2	6	15266	15271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148552944
508	NC_009511	GGA	2	6	15360	15365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148552944
509	NC_009511	GC	3	6	15382	15387	0 %	0 %	50 %	50 %	148552944
510	NC_009511	CG	4	8	15399	15406	0 %	0 %	50 %	50 %	148552944
511	NC_009511	TGT	2	6	15419	15424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148552944
512	NC_009511	CGC	2	6	15525	15530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552944
513	NC_009511	CGAG	2	8	15581	15588	25 %	0 %	50 %	25 %	148552944
514	NC_009511	GGC	2	6	15595	15600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552944
515	NC_009511	CG	3	6	15625	15630	0 %	0 %	50 %	50 %	148552944
516	NC_009511	ATC	2	6	15649	15654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148552944
517	NC_009511	TTC	2	6	15655	15660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148552944
518	NC_009511	ACC	2	6	15670	15675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148552944
519	NC_009511	TCG	2	6	15716	15721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552944
520	NC_009511	GC	3	6	15778	15783	0 %	0 %	50 %	50 %	148552944
521	NC_009511	GTTC	2	8	15882	15889	0 %	50 %	25 %	25 %	148552944
522	NC_009511	AAT	2	6	15914	15919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148552944
523	NC_009511	TTCT	2	8	15952	15959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_009511	GATC	2	8	15965	15972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_009511	GGC	2	6	15991	15996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_009511	CGAT	2	8	16017	16024	25 %	25 %	25 %	25 %	148552945
527	NC_009511	CGA	2	6	16070	16075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552945
528	NC_009511	GGC	2	6	16083	16088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552945
529	NC_009511	GCC	2	6	16138	16143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552945
530	NC_009511	CGT	3	9	16145	16153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552945
531	NC_009511	CG	4	8	16233	16240	0 %	0 %	50 %	50 %	148552945
532	NC_009511	CGA	2	6	16247	16252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552945
533	NC_009511	ACG	2	6	16273	16278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552945
534	NC_009511	AGC	2	6	16303	16308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552945
535	NC_009511	CGC	2	6	16359	16364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552945
536	NC_009511	CAA	2	6	16379	16384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148552945
537	NC_009511	TGG	2	6	16426	16431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148552945
538	NC_009511	CGA	2	6	16433	16438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552945
539	NC_009511	GAG	2	6	16461	16466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148552945
540	NC_009511	CGA	3	9	16490	16498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552945
541	NC_009511	CTGGC	2	10	16530	16539	0 %	20 %	40 %	40 %	148552945
542	NC_009511	GCCG	2	8	16562	16569	0 %	0 %	50 %	50 %	148552945
543	NC_009511	TCT	3	9	16578	16586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009511	CCCG	2	8	16658	16665	0 %	0 %	25 %	75 %	148552946
545	NC_009511	CCG	2	6	16679	16684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552946
546	NC_009511	TCG	2	6	16798	16803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552946
547	NC_009511	AGC	2	6	16804	16809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552946
548	NC_009511	GC	3	6	16814	16819	0 %	0 %	50 %	50 %	148552946
549	NC_009511	GC	3	6	16887	16892	0 %	0 %	50 %	50 %	148552946
550	NC_009511	CGG	2	6	16967	16972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552946
551	NC_009511	GAT	2	6	17004	17009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148552946
552	NC_009511	CGT	2	6	17036	17041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552946
553	NC_009511	CCG	2	6	17066	17071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552946
554	NC_009511	CAG	2	6	17148	17153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552946
555	NC_009511	AATCG	2	10	17190	17199	40 %	20 %	20 %	20 %	148552946
556	NC_009511	TGCCGT	2	12	17256	17267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_009511	GGC	2	6	17390	17395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_009511	CGC	2	6	17469	17474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552947
559	NC_009511	CGC	2	6	17509	17514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552947
560	NC_009511	GCC	2	6	17519	17524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552947
561	NC_009511	CATC	2	8	17550	17557	25 %	25 %	0 %	50 %	148552947
562	NC_009511	CG	3	6	17564	17569	0 %	0 %	50 %	50 %	148552947
563	NC_009511	CGAC	2	8	17606	17613	25 %	0 %	25 %	50 %	148552947
564	NC_009511	CAT	2	6	17640	17645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148552947
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572	NC_009511	GCC	2	6	17846	17851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552947
573	NC_009511	CGA	2	6	17871	17876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552947
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576	NC_009511	GAG	2	6	18061	18066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148552947
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580	NC_009511	CCG	2	6	18138	18143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552947
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585	NC_009511	CCG	3	9	18275	18283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552947
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596	NC_009511	GTCG	2	8	18724	18731	0 %	25 %	50 %	25 %	148552948
597	NC_009511	GCG	2	6	18750	18755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552948
598	NC_009511	CG	3	6	18812	18817	0 %	0 %	50 %	50 %	148552948
599	NC_009511	GAA	2	6	18883	18888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148552948
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610	NC_009511	GAC	3	9	19175	19183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552948
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612	NC_009511	CGCGG	2	10	19220	19229	0 %	0 %	60 %	40 %	148552948
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620	NC_009511	ACA	2	6	19519	19524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148552949
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628	NC_009511	CGC	2	6	19865	19870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552949
629	NC_009511	CGT	2	6	19961	19966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552949
630	NC_009511	GGC	2	6	19973	19978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552949
631	NC_009511	GCC	2	6	19983	19988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552949
632	NC_009511	CCGA	2	8	20001	20008	25 %	0 %	25 %	50 %	148552949
633	NC_009511	AGC	2	6	20044	20049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552949
634	NC_009511	GCC	2	6	20067	20072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552949
635	NC_009511	GGC	2	6	20115	20120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552949
636	NC_009511	AAG	2	6	20142	20147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148552949
637	NC_009511	GTC	2	6	20178	20183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_009511	GCC	2	6	20236	20241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_009511	GCC	3	9	20330	20338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552950
640	NC_009511	GCC	2	6	20370	20375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552950
641	NC_009511	AGC	2	6	20407	20412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552950
642	NC_009511	CGA	2	6	20456	20461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552950
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644	NC_009511	GC	3	6	20566	20571	0 %	0 %	50 %	50 %	148552950
645	NC_009511	CG	3	6	20637	20642	0 %	0 %	50 %	50 %	148552951
646	NC_009511	GCT	2	6	20676	20681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552951
647	NC_009511	CGA	2	6	20691	20696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552951
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649	NC_009511	CGG	3	9	20739	20747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552951
650	NC_009511	GC	3	6	20810	20815	0 %	0 %	50 %	50 %	148552951
651	NC_009511	GC	3	6	20817	20822	0 %	0 %	50 %	50 %	148552951
652	NC_009511	ACG	2	6	20864	20869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552951
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655	NC_009511	GCC	2	6	20906	20911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552951
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663	NC_009511	TCGA	2	8	21181	21188	25 %	25 %	25 %	25 %	148552951
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665	NC_009511	GC	3	6	21237	21242	0 %	0 %	50 %	50 %	148552951
666	NC_009511	CGA	2	6	21279	21284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552951
667	NC_009511	GGC	2	6	21324	21329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552951
668	NC_009511	CGC	2	6	21342	21347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552951
669	NC_009511	TCG	2	6	21362	21367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552951
670	NC_009511	CG	4	8	21385	21392	0 %	0 %	50 %	50 %	148552951
671	NC_009511	GCT	2	6	21405	21410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552951
672	NC_009511	GCA	2	6	21414	21419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552951
673	NC_009511	CGAT	2	8	21422	21429	25 %	25 %	25 %	25 %	148552951
674	NC_009511	CGGC	2	8	21506	21513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
675	NC_009511	CGATC	2	10	21558	21567	20 %	20 %	20 %	40 %	148552952
676	NC_009511	CAT	2	6	21585	21590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148552952
677	NC_009511	CGGCG	2	10	21592	21601	0 %	0 %	60 %	40 %	148552952
678	NC_009511	CAC	2	6	21633	21638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148552952
679	NC_009511	GAG	2	6	21670	21675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148552952
680	NC_009511	CCG	2	6	21701	21706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552952
681	NC_009511	GTC	2	6	21724	21729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552952
682	NC_009511	GCT	2	6	21741	21746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552952
683	NC_009511	GCG	2	6	21772	21777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552952
684	NC_009511	ATC	2	6	21778	21783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148552952
685	NC_009511	GC	3	6	21795	21800	0 %	0 %	50 %	50 %	148552952
686	NC_009511	GAATAT	2	12	21814	21825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148552952
687	NC_009511	CAG	2	6	21844	21849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552952
688	NC_009511	CAA	2	6	21852	21857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148552952
689	NC_009511	TCGCG	2	10	21905	21914	0 %	20 %	40 %	40 %	148552952
690	NC_009511	CGAT	2	8	21947	21954	25 %	25 %	25 %	25 %	148552952
691	NC_009511	GTG	2	6	21973	21978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148552952
692	NC_009511	GTC	2	6	21985	21990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552952
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694	NC_009511	AAG	2	6	22012	22017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148552952
695	NC_009511	CGG	2	6	22037	22042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
696	NC_009511	GTT	2	6	22130	22135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148552953
697	NC_009511	GCCGGC	2	12	22180	22191	0 %	0 %	50 %	50 %	148552953
698	NC_009511	CGG	2	6	22255	22260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552953
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702	NC_009511	GC	5	10	22487	22496	0 %	0 %	50 %	50 %	148552953
703	NC_009511	TTC	2	6	22523	22528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148552953
704	NC_009511	TCT	2	6	22584	22589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148552953
705	NC_009511	GCC	2	6	22627	22632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552953
706	NC_009511	TCGA	2	8	22661	22668	25 %	25 %	25 %	25 %	148552953
707	NC_009511	CGA	2	6	22672	22677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552953
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709	NC_009511	GCC	2	6	22724	22729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552953
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712	NC_009511	GAAG	2	8	22780	22787	50 %	0 %	50 %	0 %	148552953
713	NC_009511	GAAG	2	8	22789	22796	50 %	0 %	50 %	0 %	148552953
714	NC_009511	GGC	2	6	22807	22812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552953
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721	NC_009511	CCGA	2	8	22964	22971	25 %	0 %	25 %	50 %	148552953
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723	NC_009511	GAG	2	6	22997	23002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148552953
724	NC_009511	GCC	2	6	23006	23011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552953
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727	NC_009511	CCCG	2	8	23062	23069	0 %	0 %	25 %	75 %	148552954
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729	NC_009511	GC	3	6	23106	23111	0 %	0 %	50 %	50 %	148552954
730	NC_009511	TGC	2	6	23115	23120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148552954
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735	NC_009511	GATC	2	8	23400	23407	25 %	25 %	25 %	25 %	148552954
736	NC_009511	CGA	2	6	23425	23430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552954
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739	NC_009511	CGAC	2	8	23499	23506	25 %	0 %	25 %	50 %	148552954
740	NC_009511	CGCGAC	2	12	23510	23521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148552954
741	NC_009511	CG	4	8	23539	23546	0 %	0 %	50 %	50 %	148552954
742	NC_009511	CGC	2	6	23560	23565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552954
743	NC_009511	CCG	2	6	23571	23576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552954
744	NC_009511	CGC	2	6	23589	23594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552954
745	NC_009511	GGC	3	9	23611	23619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552954
746	NC_009511	CGA	2	6	23683	23688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552954
747	NC_009511	CGA	2	6	23692	23697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552954
748	NC_009511	ATGC	2	8	23705	23712	25 %	25 %	25 %	25 %	148552954
749	NC_009511	CGC	2	6	23731	23736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552954
750	NC_009511	CCG	2	6	23739	23744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552954
751	NC_009511	ACC	2	6	23745	23750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148552954
752	NC_009511	CG	3	6	23762	23767	0 %	0 %	50 %	50 %	148552954
753	NC_009511	CGG	2	6	23770	23775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148552954
754	NC_009511	GCCTGC	2	12	23802	23813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148552954
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756	NC_009511	CG	3	6	23897	23902	0 %	0 %	50 %	50 %	148552954
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999	NC_009511	GCC	3	9	32577	32585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148552963
1000	NC_009511	GCA	2	6	32630	32635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148552963

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