MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 4771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009508	ATCG	2	8	164100	164107	25 %	25 %	25 %	25 %	148550998
3502	NC_009508	CGA	2	6	164223	164228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550998
3503	NC_009508	GTC	2	6	164256	164261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550998
3504	NC_009508	GATC	2	8	164390	164397	25 %	25 %	25 %	25 %	148550998
3505	NC_009508	GCG	2	6	164475	164480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550998
3506	NC_009508	CAG	2	6	164590	164595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3507	NC_009508	ACT	2	6	164677	164682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550999
3508	NC_009508	GC	3	6	164701	164706	0 %	0 %	50 %	50 %	148550999
3509	NC_009508	CAG	2	6	164711	164716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3510	NC_009508	CGC	3	9	164755	164763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550999
3511	NC_009508	CCG	2	6	164764	164769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550999
3512	NC_009508	GTC	2	6	164777	164782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3513	NC_009508	GCT	2	6	164806	164811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3514	NC_009508	ACG	2	6	164895	164900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3515	NC_009508	CGT	2	6	164914	164919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3516	NC_009508	TC	3	6	164920	164925	0 %	50 %	0 %	50 %	148550999
3517	NC_009508	CTT	2	6	164941	164946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550999
3518	NC_009508	ACC	2	6	164952	164957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550999
3519	NC_009508	ATCG	2	8	164962	164969	25 %	25 %	25 %	25 %	148550999
3520	NC_009508	TCG	2	6	165012	165017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3521	NC_009508	CCGA	2	8	165038	165045	25 %	0 %	25 %	50 %	148550999
3522	NC_009508	ATC	2	6	165051	165056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550999
3523	NC_009508	CGA	2	6	165201	165206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3524	NC_009508	CGA	2	6	165208	165213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550999
3525	NC_009508	ATCTTG	2	12	165216	165227	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148550999
3526	NC_009508	GC	3	6	165286	165291	0 %	0 %	50 %	50 %	148550999
3527	NC_009508	CG	3	6	165335	165340	0 %	0 %	50 %	50 %	148550999
3528	NC_009508	GCG	3	9	165457	165465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551000
3529	NC_009508	TGC	2	6	165474	165479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551000
3530	NC_009508	GAA	2	6	165540	165545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148551000
3531	NC_009508	GAC	2	6	165573	165578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551000
3532	NC_009508	GCC	2	6	165657	165662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551000
3533	NC_009508	GCA	2	6	165710	165715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551000
3534	NC_009508	CAC	2	6	165719	165724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148551000
3535	NC_009508	CGG	2	6	165746	165751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551000
3536	NC_009508	CAG	2	6	165765	165770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551000
3537	NC_009508	TCT	2	6	165818	165823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148551000
3538	NC_009508	GCC	2	6	165846	165851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551000
3539	NC_009508	CGGT	2	8	165925	165932	0 %	25 %	50 %	25 %	148551000
3540	NC_009508	TCG	2	6	165970	165975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551000
3541	NC_009508	GGA	2	6	166012	166017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148551000
3542	NC_009508	CGC	2	6	166049	166054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551000
3543	NC_009508	GCA	2	6	166055	166060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551000
3544	NC_009508	CCG	2	6	166101	166106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551000
3545	NC_009508	GCG	2	6	166138	166143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551000
3546	NC_009508	CG	3	6	166193	166198	0 %	0 %	50 %	50 %	148551000
3547	NC_009508	TGC	2	6	166201	166206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551000
3548	NC_009508	GC	3	6	166205	166210	0 %	0 %	50 %	50 %	148551000
3549	NC_009508	CAGT	2	8	166320	166327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_009508	TGAT	2	8	166361	166368	25 %	50 %	25 %	0 %	148551001
3551	NC_009508	GCG	2	6	166377	166382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551001
3552	NC_009508	GC	3	6	166386	166391	0 %	0 %	50 %	50 %	148551001
3553	NC_009508	GGT	2	6	166401	166406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148551001
3554	NC_009508	GC	3	6	166411	166416	0 %	0 %	50 %	50 %	148551001
3555	NC_009508	GCCGC	2	10	166424	166433	0 %	0 %	40 %	60 %	148551001
3556	NC_009508	CAG	2	6	166464	166469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551001
3557	NC_009508	GGA	2	6	166485	166490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148551001
3558	NC_009508	GTA	2	6	166531	166536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551001
3559	NC_009508	CTG	2	6	166544	166549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551001
3560	NC_009508	CTG	2	6	166579	166584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551001
3561	NC_009508	GCCAG	2	10	166595	166604	20 %	0 %	40 %	40 %	148551001
3562	NC_009508	CG	3	6	166644	166649	0 %	0 %	50 %	50 %	148551001
3563	NC_009508	CTG	2	6	166726	166731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551001
3564	NC_009508	CTCG	2	8	166746	166753	0 %	25 %	25 %	50 %	148551001
3565	NC_009508	TGA	2	6	166796	166801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551001
3566	NC_009508	TGA	2	6	166857	166862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551001
3567	NC_009508	CAT	2	6	166872	166877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551001
3568	NC_009508	GCC	2	6	166953	166958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551001
3569	NC_009508	CGC	2	6	166970	166975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551001
3570	NC_009508	CCG	2	6	166998	167003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551001
3571	NC_009508	TCGT	2	8	167062	167069	0 %	50 %	25 %	25 %	148551001
3572	NC_009508	GTT	2	6	167106	167111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148551001
3573	NC_009508	CGG	2	6	167173	167178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551001
3574	NC_009508	TCG	2	6	167190	167195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551001
3575	NC_009508	TGC	2	6	167207	167212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551001
3576	NC_009508	GC	3	6	167221	167226	0 %	0 %	50 %	50 %	148551001
3577	NC_009508	CAG	2	6	167269	167274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551001
3578	NC_009508	CGGC	2	8	167328	167335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_009508	ACT	2	6	167415	167420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551002
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3582	NC_009508	ACGA	2	8	167480	167487	50 %	0 %	25 %	25 %	148551002
3583	NC_009508	GCATCA	2	12	167490	167501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148551002
3584	NC_009508	GAAT	2	8	167504	167511	50 %	25 %	25 %	0 %	148551002
3585	NC_009508	GAA	2	6	167513	167518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148551002
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3587	NC_009508	GGC	2	6	167547	167552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551002
3588	NC_009508	CTT	2	6	167597	167602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148551002
3589	NC_009508	TCC	2	6	167670	167675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148551002
3590	NC_009508	CGA	3	9	167688	167696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551002
3591	NC_009508	TCA	2	6	167757	167762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551002
3592	NC_009508	TCG	2	6	167805	167810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551002
3593	NC_009508	TCC	2	6	167838	167843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148551002
3594	NC_009508	TCA	2	6	167851	167856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551002
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3597	NC_009508	GCGTG	2	10	167965	167974	0 %	20 %	60 %	20 %	148551002
3598	NC_009508	CGC	2	6	167984	167989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551002
3599	NC_009508	GCAG	2	8	167994	168001	25 %	0 %	50 %	25 %	148551002
3600	NC_009508	GGC	2	6	168052	168057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551002
3601	NC_009508	CGG	2	6	168069	168074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148551002
3602	NC_009508	ATC	2	6	168084	168089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148551002
3603	NC_009508	ATT	2	6	168138	168143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148551003
3604	NC_009508	GCA	2	6	168145	168150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551003
3605	NC_009508	C	7	7	168169	168175	0 %	0 %	0 %	100 %	148551003
3606	NC_009508	GTC	2	6	168233	168238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551003
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3608	NC_009508	GGA	2	6	168305	168310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148551003
3609	NC_009508	GC	3	6	168429	168434	0 %	0 %	50 %	50 %	148551003
3610	NC_009508	AGCC	2	8	168435	168442	25 %	0 %	25 %	50 %	148551003
3611	NC_009508	GAA	2	6	168473	168478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148551003
3612	NC_009508	CGCC	2	8	168496	168503	0 %	0 %	25 %	75 %	148551003
3613	NC_009508	GTC	2	6	168539	168544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551003
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3616	NC_009508	GC	3	6	168653	168658	0 %	0 %	50 %	50 %	148551003
3617	NC_009508	CCG	2	6	168664	168669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148551003
3618	NC_009508	ACCA	2	8	168683	168690	50 %	0 %	0 %	50 %	148551003
3619	NC_009508	GCGT	2	8	168691	168698	0 %	25 %	50 %	25 %	148551003
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3863	NC_009508	GCGG	2	8	179855	179862	0 %	0 %	75 %	25 %	148551015
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3865	NC_009508	GAT	2	6	179950	179955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551015
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3872	NC_009508	TCTG	2	8	180172	180179	0 %	50 %	25 %	25 %	148551016
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3985	NC_009508	TTC	2	6	185272	185277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148551020
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3988	NC_009508	CGA	2	6	185375	185380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148551020
3989	NC_009508	TGG	2	6	185406	185411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148551020
3990	NC_009508	TGA	2	6	185414	185419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551020
3991	NC_009508	TGA	2	6	185499	185504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148551020
3992	NC_009508	GTC	2	6	185587	185592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148551020
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