MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009482	GC	3	6	169435	169440	0 %	0 %	50 %	50 %	148241270
4002	NC_009482	CAG	2	6	169504	169509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241270
4003	NC_009482	TGC	2	6	169530	169535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241270
4004	NC_009482	GTT	2	6	169540	169545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241270
4005	NC_009482	TGCTGT	2	12	169593	169604	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148241270
4006	NC_009482	TGG	2	6	169616	169621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241270
4007	NC_009482	TG	3	6	169694	169699	0 %	50 %	50 %	0 %	148241270
4008	NC_009482	GCT	2	6	169717	169722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241270
4009	NC_009482	GCTGTT	2	12	169750	169761	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148241270
4010	NC_009482	G	6	6	169813	169818	0 %	0 %	100 %	0 %	148241270
4011	NC_009482	GCT	2	6	169840	169845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241270
4012	NC_009482	GCTG	2	8	169894	169901	0 %	25 %	50 %	25 %	148241270
4013	NC_009482	TGC	2	6	169951	169956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241270
4014	NC_009482	GCC	2	6	169964	169969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241270
4015	NC_009482	GTT	2	6	169970	169975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241270
4016	NC_009482	GCC	2	6	169979	169984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241270
4017	NC_009482	TTG	2	6	169985	169990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241270
4018	NC_009482	CAG	2	6	169997	170002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241270
4019	NC_009482	TGC	2	6	170040	170045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241270
4020	NC_009482	GGC	2	6	170068	170073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241270
4021	NC_009482	CCGG	2	8	170133	170140	0 %	0 %	50 %	50 %	148241270
4022	NC_009482	AAC	2	6	170183	170188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241270
4023	NC_009482	GGT	2	6	170249	170254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241270
4024	NC_009482	GCT	2	6	170413	170418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241270
4025	NC_009482	TGC	3	9	170625	170633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4026	NC_009482	GCT	2	6	170636	170641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4027	NC_009482	TGC	2	6	170644	170649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4028	NC_009482	GCT	2	6	170650	170655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4029	NC_009482	ATGG	2	8	170737	170744	25 %	25 %	50 %	0 %	148241271
4030	NC_009482	CCT	2	6	170909	170914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241271
4031	NC_009482	GTT	2	6	170919	170924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241271
4032	NC_009482	T	7	7	170988	170994	0 %	100 %	0 %	0 %	148241271
4033	NC_009482	AC	3	6	171012	171017	50 %	0 %	0 %	50 %	148241271
4034	NC_009482	TGG	2	6	171108	171113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241271
4035	NC_009482	TGA	2	6	171121	171126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241271
4036	NC_009482	T	6	6	171133	171138	0 %	100 %	0 %	0 %	148241271
4037	NC_009482	CAGC	2	8	171196	171203	25 %	0 %	25 %	50 %	148241271
4038	NC_009482	TCCA	2	8	171233	171240	25 %	25 %	0 %	50 %	148241271
4039	NC_009482	GCC	2	6	171252	171257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241271
4040	NC_009482	TTG	2	6	171261	171266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241271
4041	NC_009482	TTG	2	6	171374	171379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241271
4042	NC_009482	GCT	2	6	171392	171397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4043	NC_009482	GTG	2	6	171437	171442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241271
4044	NC_009482	TG	3	6	171441	171446	0 %	50 %	50 %	0 %	148241271
4045	NC_009482	GCC	2	6	171483	171488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241271
4046	NC_009482	CAGGTT	2	12	171659	171670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148241271
4047	NC_009482	TGG	2	6	171705	171710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241271
4048	NC_009482	GCA	2	6	171773	171778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4049	NC_009482	GTT	2	6	171799	171804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241271
4050	NC_009482	CCA	2	6	171831	171836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241271
4051	NC_009482	GTTG	2	8	171868	171875	0 %	50 %	50 %	0 %	148241271
4052	NC_009482	CTT	2	6	171906	171911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241271
4053	NC_009482	TCG	2	6	171944	171949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4054	NC_009482	GGT	2	6	171955	171960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241271
4055	NC_009482	TCACCC	2	12	171999	172010	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	148241271
4056	NC_009482	GCT	2	6	172070	172075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4057	NC_009482	GGT	2	6	172088	172093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241271
4058	NC_009482	CAG	2	6	172145	172150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4059	NC_009482	GAG	2	6	172250	172255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241271
4060	NC_009482	CTG	2	6	172256	172261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4061	NC_009482	TTG	2	6	172300	172305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241271
4062	NC_009482	CTT	2	6	172343	172348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241271
4063	NC_009482	GCA	2	6	172360	172365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4064	NC_009482	CAG	2	6	172376	172381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241271
4065	NC_009482	GCA	2	6	172429	172434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241271
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4068	NC_009482	CTG	2	6	172543	172548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241272
4069	NC_009482	TGG	3	9	172574	172582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241272
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4071	NC_009482	GGC	2	6	172675	172680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241272
4072	NC_009482	TTGG	2	8	172785	172792	0 %	50 %	50 %	0 %	148241272
4073	NC_009482	CTTT	2	8	172827	172834	0 %	75 %	0 %	25 %	148241272
4074	NC_009482	CTG	2	6	172840	172845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241272
4075	NC_009482	CAG	2	6	172931	172936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241272
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4077	NC_009482	GAA	2	6	173008	173013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241272
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4079	NC_009482	TGG	2	6	173150	173155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241272
4080	NC_009482	GCC	2	6	173184	173189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241272
4081	NC_009482	TTG	2	6	173194	173199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241272
4082	NC_009482	GCTG	2	8	173207	173214	0 %	25 %	50 %	25 %	148241272
4083	NC_009482	T	6	6	173272	173277	0 %	100 %	0 %	0 %	148241272
4084	NC_009482	TGC	2	6	173300	173305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241272
4085	NC_009482	T	6	6	173369	173374	0 %	100 %	0 %	0 %	148241272
4086	NC_009482	TGA	2	6	173529	173534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241272
4087	NC_009482	CCCCG	2	10	173584	173593	0 %	0 %	20 %	80 %	148241272
4088	NC_009482	CGAGCT	2	12	173601	173612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241272
4089	NC_009482	TCCG	2	8	173657	173664	0 %	25 %	25 %	50 %	148241272
4090	NC_009482	CTG	2	6	173770	173775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241272
4091	NC_009482	TTG	2	6	173779	173784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241272
4092	NC_009482	CTG	2	6	173788	173793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241272
4093	NC_009482	TGC	2	6	173810	173815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241272
4094	NC_009482	GC	3	6	173814	173819	0 %	0 %	50 %	50 %	148241272
4095	NC_009482	GCA	2	6	173835	173840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241272
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4099	NC_009482	GCTT	2	8	174098	174105	0 %	50 %	25 %	25 %	148241273
4100	NC_009482	GTT	3	9	174218	174226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241273
4101	NC_009482	TCAA	2	8	174276	174283	50 %	25 %	0 %	25 %	148241273
4102	NC_009482	CG	3	6	174359	174364	0 %	0 %	50 %	50 %	148241273
4103	NC_009482	GCC	2	6	174375	174380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241273
4104	NC_009482	CGG	2	6	174384	174389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241273
4105	NC_009482	T	7	7	174419	174425	0 %	100 %	0 %	0 %	148241273
4106	NC_009482	CAG	2	6	174429	174434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241273
4107	NC_009482	CTG	2	6	174504	174509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241273
4108	NC_009482	CTG	2	6	174546	174551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241273
4109	NC_009482	TTG	2	6	174657	174662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241273
4110	NC_009482	CAAT	2	8	174692	174699	50 %	25 %	0 %	25 %	148241273
4111	NC_009482	TGG	2	6	174772	174777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241273
4112	NC_009482	TGAA	2	8	174778	174785	50 %	25 %	25 %	0 %	148241273
4113	NC_009482	TTTGG	2	10	174795	174804	0 %	60 %	40 %	0 %	148241273
4114	NC_009482	ATC	2	6	174820	174825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241273
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4116	NC_009482	CGG	2	6	174877	174882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241273
4117	NC_009482	GTG	2	6	174892	174897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241273
4118	NC_009482	CTG	2	6	174921	174926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241273
4119	NC_009482	CAC	2	6	175037	175042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241273
4120	NC_009482	TGC	2	6	175173	175178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241274
4121	NC_009482	GCA	2	6	175396	175401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241274
4122	NC_009482	GT	3	6	175402	175407	0 %	50 %	50 %	0 %	148241274
4123	NC_009482	CAGTTC	2	12	175424	175435	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148241274
4124	NC_009482	GCT	2	6	175472	175477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241274
4125	NC_009482	GC	3	6	175535	175540	0 %	0 %	50 %	50 %	148241274
4126	NC_009482	GCC	2	6	175583	175588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241274
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4128	NC_009482	GCT	2	6	175644	175649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241274
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4137	NC_009482	GCT	2	6	175992	175997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241274
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4141	NC_009482	CAG	2	6	176325	176330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241274
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4144	NC_009482	CGG	2	6	176451	176456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241274
4145	NC_009482	GTTG	2	8	176464	176471	0 %	50 %	50 %	0 %	148241274
4146	NC_009482	TCGC	2	8	176508	176515	0 %	25 %	25 %	50 %	148241274
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4150	NC_009482	CAG	2	6	176813	176818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4152	NC_009482	GAT	2	6	176882	176887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_009482	TGC	2	6	177029	177034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241275
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4155	NC_009482	GTT	2	6	177093	177098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241275
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4237	NC_009482	ATGA	2	8	180918	180925	50 %	25 %	25 %	0 %	148241278
4238	NC_009482	ATT	2	6	180936	180941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241278
4239	NC_009482	AGG	2	6	181021	181026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_009482	CGG	2	6	181113	181118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_009482	G	7	7	181140	181146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_009482	ATC	2	6	181153	181158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_009482	ATG	2	6	181223	181228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_009482	T	6	6	181290	181295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_009482	CGT	2	6	181329	181334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4246	NC_009482	TGA	2	6	181355	181360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4248	NC_009482	TGT	2	6	181416	181421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_009482	AAT	2	6	181441	181446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_009482	TC	3	6	181469	181474	0 %	50 %	0 %	50 %	148241279
4251	NC_009482	CTG	2	6	181523	181528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241279
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4273	NC_009482	CAAG	2	8	182620	182627	50 %	0 %	25 %	25 %	148241279
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4360	NC_009482	AT	3	6	186739	186744	50 %	50 %	0 %	0 %	148241283
4361	NC_009482	CCG	2	6	186776	186781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241283
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4365	NC_009482	T	7	7	186859	186865	0 %	100 %	0 %	0 %	148241283
4366	NC_009482	GCA	2	6	186874	186879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241283
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4372	NC_009482	GTA	2	6	187093	187098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241283
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4393	NC_009482	ATGG	2	8	188230	188237	25 %	25 %	50 %	0 %	148241285
4394	NC_009482	TTC	2	6	188250	188255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241285
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4496	NC_009482	TGA	2	6	194033	194038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241291
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4499	NC_009482	TCC	2	6	194201	194206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241291
4500	NC_009482	CCT	2	6	194276	194281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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