MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009482	TGC	2	6	83159	83164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241184
2002	NC_009482	TGG	2	6	83201	83206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241184
2003	NC_009482	TCA	2	6	83207	83212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241184
2004	NC_009482	GCA	2	6	83249	83254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241184
2005	NC_009482	CCA	2	6	83261	83266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241184
2006	NC_009482	GCC	2	6	83270	83275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241184
2007	NC_009482	TCT	2	6	83296	83301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241184
2008	NC_009482	CAC	2	6	83307	83312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241184
2009	NC_009482	CACAG	2	10	83317	83326	40 %	0 %	20 %	40 %	148241184
2010	NC_009482	GCT	2	6	83343	83348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241184
2011	NC_009482	CCA	2	6	83363	83368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241184
2012	NC_009482	CCG	2	6	83396	83401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241184
2013	NC_009482	GCCA	2	8	83406	83413	25 %	0 %	25 %	50 %	148241184
2014	NC_009482	CCG	2	6	83418	83423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241184
2015	NC_009482	TTGA	2	8	83463	83470	25 %	50 %	25 %	0 %	148241184
2016	NC_009482	CAG	2	6	83526	83531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241184
2017	NC_009482	GCAT	2	8	83554	83561	25 %	25 %	25 %	25 %	148241184
2018	NC_009482	TCC	2	6	83590	83595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241184
2019	NC_009482	GCT	3	9	83647	83655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2020	NC_009482	GAG	2	6	83720	83725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241185
2021	NC_009482	C	6	6	83733	83738	0 %	0 %	0 %	100 %	148241185
2022	NC_009482	CAG	2	6	83780	83785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2023	NC_009482	ACG	2	6	83931	83936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2024	NC_009482	TGG	2	6	83976	83981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
2025	NC_009482	CGT	2	6	83991	83996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2026	NC_009482	ATGG	2	8	84070	84077	25 %	25 %	50 %	0 %	148241185
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2029	NC_009482	CGG	2	6	84135	84140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241185
2030	NC_009482	GCC	2	6	84144	84149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2031	NC_009482	CCA	2	6	84177	84182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241185
2032	NC_009482	ACA	2	6	84213	84218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241185
2033	NC_009482	GGT	2	6	84238	84243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
2034	NC_009482	CGA	2	6	84271	84276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2035	NC_009482	TGG	2	6	84291	84296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
2036	NC_009482	CGC	2	6	84309	84314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2037	NC_009482	GCGTTG	2	12	84368	84379	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148241185
2038	NC_009482	TGC	2	6	84391	84396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2039	NC_009482	TGA	2	6	84442	84447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241185
2040	NC_009482	CAGCG	2	10	84452	84461	20 %	0 %	40 %	40 %	148241185
2041	NC_009482	CGA	2	6	84472	84477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2042	NC_009482	GGA	2	6	84511	84516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241185
2043	NC_009482	TCA	2	6	84582	84587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241185
2044	NC_009482	GGT	2	6	84619	84624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
2045	NC_009482	TCG	2	6	84627	84632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2046	NC_009482	AG	3	6	84703	84708	50 %	0 %	50 %	0 %	148241185
2047	NC_009482	CCAG	2	8	84718	84725	25 %	0 %	25 %	50 %	148241185
2048	NC_009482	AAACCC	2	12	84726	84737	50 %	0 %	0 %	50 %	148241185
2049	NC_009482	CTT	2	6	84760	84765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241185
2050	NC_009482	TGT	2	6	84768	84773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241185
2051	NC_009482	CTGG	2	8	84782	84789	0 %	25 %	50 %	25 %	148241185
2052	NC_009482	GAG	2	6	84812	84817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241185
2053	NC_009482	CGT	2	6	84853	84858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2054	NC_009482	CCA	2	6	84861	84866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241185
2055	NC_009482	CCG	2	6	84880	84885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2056	NC_009482	TGG	2	6	84891	84896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
2057	NC_009482	AAACGG	2	12	84909	84920	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148241185
2058	NC_009482	GC	3	6	84928	84933	0 %	0 %	50 %	50 %	148241185
2059	NC_009482	CCG	2	6	84948	84953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2060	NC_009482	TGG	2	6	84981	84986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
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2062	NC_009482	GCT	2	6	85024	85029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2063	NC_009482	GGCC	2	8	85108	85115	0 %	0 %	50 %	50 %	148241185
2064	NC_009482	CCA	2	6	85137	85142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241185
2065	NC_009482	CAT	2	6	85165	85170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241185
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2072	NC_009482	CT	3	6	85370	85375	0 %	50 %	0 %	50 %	148241185
2073	NC_009482	ACG	2	6	85554	85559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
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2089	NC_009482	GC	3	6	85912	85917	0 %	0 %	50 %	50 %	148241185
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2117	NC_009482	AGCAG	2	10	87106	87115	40 %	0 %	40 %	20 %	148241186
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2120	NC_009482	GCA	2	6	87184	87189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241186
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2125	NC_009482	TCA	2	6	87426	87431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241187
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2142	NC_009482	CCGG	2	8	87909	87916	0 %	0 %	50 %	50 %	148241187
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2250	NC_009482	TGG	2	6	93267	93272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241193
2251	NC_009482	TGG	2	6	93315	93320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241193
2252	NC_009482	GCT	2	6	93322	93327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241193
2253	NC_009482	GGC	2	6	93400	93405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241193
2254	NC_009482	AGC	2	6	93406	93411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241193
2255	NC_009482	CGT	3	9	93572	93580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241194
2256	NC_009482	CTG	2	6	93609	93614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241194
2257	NC_009482	GCT	2	6	93644	93649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241194
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2259	NC_009482	TGG	2	6	93697	93702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241194
2260	NC_009482	GTG	2	6	93708	93713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241194
2261	NC_009482	TGGGAT	2	12	93772	93783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148241194
2262	NC_009482	CGGC	2	8	93806	93813	0 %	0 %	50 %	50 %	148241194
2263	NC_009482	GGC	2	6	93820	93825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241194
2264	NC_009482	CGC	2	6	93873	93878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241195
2265	NC_009482	CCA	2	6	93912	93917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241195
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2268	NC_009482	CAG	2	6	94201	94206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241195
2269	NC_009482	CTG	2	6	94304	94309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2270	NC_009482	TGC	2	6	94347	94352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2271	NC_009482	ACG	2	6	94429	94434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241196
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2273	NC_009482	TGC	2	6	94528	94533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241196
2274	NC_009482	GCA	2	6	94580	94585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241196
2275	NC_009482	GCT	2	6	94589	94594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241196
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2279	NC_009482	GCA	2	6	94703	94708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241196
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2281	NC_009482	TGA	2	6	94777	94782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241196
2282	NC_009482	CAC	2	6	94811	94816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241196
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2289	NC_009482	AGG	2	6	95128	95133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241196
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2312	NC_009482	GAT	2	6	95705	95710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241196
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2314	NC_009482	CTT	2	6	95780	95785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2315	NC_009482	ACC	2	6	95827	95832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241197
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2323	NC_009482	CCTGAG	2	12	96430	96441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241197
2324	NC_009482	CGA	2	6	96504	96509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241197
2325	NC_009482	GCT	2	6	96525	96530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241197
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2336	NC_009482	AGCC	2	8	97263	97270	25 %	0 %	25 %	50 %	148241198
2337	NC_009482	CAG	2	6	97283	97288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241198
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2339	NC_009482	GCA	2	6	97360	97365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241198
2340	NC_009482	GGC	2	6	97370	97375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241198
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2342	NC_009482	CACC	2	8	97496	97503	25 %	0 %	0 %	75 %	148241198
2343	NC_009482	TGA	2	6	97531	97536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241198
2344	NC_009482	ACC	2	6	97539	97544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241198
2345	NC_009482	TCA	2	6	97588	97593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241198
2346	NC_009482	GCTGAA	2	12	97595	97606	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148241198
2347	NC_009482	CCA	2	6	97615	97620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241198
2348	NC_009482	T	7	7	97636	97642	0 %	100 %	0 %	0 %	148241198
2349	NC_009482	AGTG	2	8	97687	97694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2350	NC_009482	GAA	2	6	97697	97702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2351	NC_009482	ATA	2	6	97802	97807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2352	NC_009482	TTC	2	6	97836	97841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241199
2353	NC_009482	CA	3	6	97867	97872	50 %	0 %	0 %	50 %	148241199
2354	NC_009482	A	7	7	98015	98021	100 %	0 %	0 %	0 %	148241199
2355	NC_009482	AGTC	2	8	98054	98061	25 %	25 %	25 %	25 %	148241199
2356	NC_009482	TCA	2	6	98063	98068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241199
2357	NC_009482	ATTG	2	8	98069	98076	25 %	50 %	25 %	0 %	148241199
2358	NC_009482	T	6	6	98078	98083	0 %	100 %	0 %	0 %	148241199
2359	NC_009482	GGA	2	6	98110	98115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241199
2360	NC_009482	ATC	2	6	98211	98216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241199
2361	NC_009482	CGC	2	6	98225	98230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241199
2362	NC_009482	T	7	7	98248	98254	0 %	100 %	0 %	0 %	148241199
2363	NC_009482	ATC	2	6	98262	98267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241199
2364	NC_009482	CTTG	2	8	98368	98375	0 %	50 %	25 %	25 %	148241199
2365	NC_009482	TGGA	2	8	98408	98415	25 %	25 %	50 %	0 %	148241199
2366	NC_009482	TTGT	2	8	98429	98436	0 %	75 %	25 %	0 %	148241199
2367	NC_009482	TAA	2	6	98485	98490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241199
2368	NC_009482	ACC	2	6	98558	98563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241199
2369	NC_009482	AGC	2	6	98571	98576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241199
2370	NC_009482	ATC	2	6	98610	98615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241199
2371	NC_009482	TA	3	6	98623	98628	50 %	50 %	0 %	0 %	148241199
2372	NC_009482	GGA	2	6	98672	98677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241199
2373	NC_009482	A	7	7	98686	98692	100 %	0 %	0 %	0 %	148241199
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2497	NC_009482	CGC	2	6	103843	103848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241205
2498	NC_009482	TGA	2	6	103903	103908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241205
2499	NC_009482	CACC	2	8	103921	103928	25 %	0 %	0 %	75 %	148241205
2500	NC_009482	GGC	2	6	103949	103954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241205

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