MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009482	GC	3	6	62304	62309	0 %	0 %	50 %	50 %	148241165
1502	NC_009482	CGC	2	6	62311	62316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241165
1503	NC_009482	CCA	2	6	62329	62334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241165
1504	NC_009482	GTG	2	6	62375	62380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241165
1505	NC_009482	GCT	2	6	62447	62452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1506	NC_009482	TCTTGC	2	12	62457	62468	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148241166
1507	NC_009482	GGC	2	6	62476	62481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241166
1508	NC_009482	CTTGGC	2	12	62485	62496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1509	NC_009482	CAG	2	6	62505	62510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1510	NC_009482	GGCTTT	2	12	62524	62535	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148241166
1511	NC_009482	GCT	2	6	62536	62541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1512	NC_009482	CCA	2	6	62586	62591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241166
1513	NC_009482	CAG	2	6	62623	62628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1514	NC_009482	GCA	2	6	62637	62642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1515	NC_009482	GATC	2	8	62676	62683	25 %	25 %	25 %	25 %	148241166
1516	NC_009482	TTG	2	6	62684	62689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241166
1517	NC_009482	CTG	2	6	62881	62886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1518	NC_009482	GCA	2	6	62910	62915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1519	NC_009482	TCT	2	6	62927	62932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241166
1520	NC_009482	CCA	2	6	62970	62975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241166
1521	NC_009482	CAG	2	6	62983	62988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1522	NC_009482	GTT	2	6	63001	63006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241166
1523	NC_009482	GCT	2	6	63015	63020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1524	NC_009482	CTTG	2	8	63027	63034	0 %	50 %	25 %	25 %	148241166
1525	NC_009482	CTG	2	6	63088	63093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1526	NC_009482	GTC	2	6	63193	63198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1527	NC_009482	T	6	6	63220	63225	0 %	100 %	0 %	0 %	148241166
1528	NC_009482	CAC	2	6	63244	63249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241166
1529	NC_009482	CGA	2	6	63255	63260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1530	NC_009482	CGC	2	6	63348	63353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241166
1531	NC_009482	ACG	2	6	63362	63367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1532	NC_009482	GGC	2	6	63423	63428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241166
1533	NC_009482	GAC	2	6	63547	63552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1534	NC_009482	CAG	2	6	63580	63585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1535	NC_009482	CTC	2	6	63586	63591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241166
1536	NC_009482	AG	3	6	63605	63610	50 %	0 %	50 %	0 %	148241166
1537	NC_009482	GCA	2	6	63654	63659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1538	NC_009482	TTG	2	6	63712	63717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241166
1539	NC_009482	CAGG	2	8	63756	63763	25 %	0 %	50 %	25 %	148241166
1540	NC_009482	CGG	2	6	63819	63824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241166
1541	NC_009482	GGT	2	6	63886	63891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241166
1542	NC_009482	GCA	2	6	63905	63910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_009482	CGCT	2	8	64005	64012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_009482	TGT	2	6	64026	64031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_009482	CAG	2	6	64062	64067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241167
1546	NC_009482	C	6	6	64073	64078	0 %	0 %	0 %	100 %	148241167
1547	NC_009482	CTG	2	6	64121	64126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241167
1548	NC_009482	GAG	2	6	64136	64141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241167
1549	NC_009482	GCG	2	6	64257	64262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241167
1550	NC_009482	CCG	2	6	64281	64286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241167
1551	NC_009482	CGG	2	6	64374	64379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241167
1552	NC_009482	TGG	2	6	64386	64391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241167
1553	NC_009482	CCA	2	6	64423	64428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241167
1554	NC_009482	CAC	2	6	64453	64458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241167
1555	NC_009482	CTG	2	6	64463	64468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241167
1556	NC_009482	CCCTGG	2	12	64470	64481	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148241167
1557	NC_009482	GCC	2	6	64490	64495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241167
1558	NC_009482	GCG	2	6	64507	64512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241167
1559	NC_009482	TGG	2	6	64515	64520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241167
1560	NC_009482	CAGC	2	8	64536	64543	25 %	0 %	25 %	50 %	148241167
1561	NC_009482	GC	4	8	64553	64560	0 %	0 %	50 %	50 %	148241167
1562	NC_009482	TGG	2	6	64600	64605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241167
1563	NC_009482	GC	3	6	64610	64615	0 %	0 %	50 %	50 %	148241167
1564	NC_009482	TGC	2	6	64623	64628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241167
1565	NC_009482	GCGTTC	2	12	64764	64775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241167
1566	NC_009482	TGC	2	6	64779	64784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241167
1567	NC_009482	GTTGA	2	10	64871	64880	20 %	40 %	40 %	0 %	148241167
1568	NC_009482	CCGA	2	8	64913	64920	25 %	0 %	25 %	50 %	148241167
1569	NC_009482	TG	3	6	64998	65003	0 %	50 %	50 %	0 %	148241167
1570	NC_009482	TGT	2	6	65055	65060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241167
1571	NC_009482	AGC	2	6	65258	65263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241168
1572	NC_009482	GA	3	6	65297	65302	50 %	0 %	50 %	0 %	148241168
1573	NC_009482	GCA	2	6	65327	65332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241168
1574	NC_009482	TGG	2	6	65396	65401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241168
1575	NC_009482	CTA	2	6	65409	65414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241168
1576	NC_009482	CCGC	2	8	65418	65425	0 %	0 %	25 %	75 %	148241168
1577	NC_009482	ACA	2	6	65495	65500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241168
1578	NC_009482	GCC	2	6	65581	65586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241168
1579	NC_009482	TGCGT	2	10	65610	65619	0 %	40 %	40 %	20 %	148241168
1580	NC_009482	GCG	2	6	65651	65656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241168
1581	NC_009482	ATG	2	6	65657	65662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241168
1582	NC_009482	TGGC	2	8	65723	65730	0 %	25 %	50 %	25 %	148241168
1583	NC_009482	GAT	2	6	65745	65750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241168
1584	NC_009482	CTC	2	6	65803	65808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241168
1585	NC_009482	GCG	2	6	65857	65862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241168
1586	NC_009482	TCCG	2	8	65923	65930	0 %	25 %	25 %	50 %	148241168
1587	NC_009482	GCC	2	6	65953	65958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241168
1588	NC_009482	TC	3	6	66021	66026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_009482	T	6	6	66027	66032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_009482	GGC	2	6	66089	66094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241169
1591	NC_009482	GAC	2	6	66137	66142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1592	NC_009482	TGAT	2	8	66150	66157	25 %	50 %	25 %	0 %	148241169
1593	NC_009482	GTG	2	6	66200	66205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241169
1594	NC_009482	CAC	2	6	66299	66304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241169
1595	NC_009482	TGC	2	6	66402	66407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1596	NC_009482	CAC	2	6	66602	66607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241169
1597	NC_009482	CCA	2	6	66642	66647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241169
1598	NC_009482	GCCC	2	8	66669	66676	0 %	0 %	25 %	75 %	148241169
1599	NC_009482	CGC	2	6	66704	66709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241169
1600	NC_009482	GCCGAA	2	12	66713	66724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1601	NC_009482	ATC	2	6	66734	66739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241169
1602	NC_009482	ACC	2	6	66740	66745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241169
1603	NC_009482	GAA	2	6	66793	66798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241169
1604	NC_009482	TTG	2	6	66815	66820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241169
1605	NC_009482	GAT	2	6	66881	66886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241169
1606	NC_009482	CTG	3	9	66935	66943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1607	NC_009482	GCTG	2	8	66967	66974	0 %	25 %	50 %	25 %	148241169
1608	NC_009482	ATC	2	6	67034	67039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241169
1609	NC_009482	GGT	2	6	67075	67080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241169
1610	NC_009482	TGA	2	6	67098	67103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241169
1611	NC_009482	ACA	2	6	67287	67292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241169
1612	NC_009482	ATC	2	6	67298	67303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241169
1613	NC_009482	TGG	2	6	67317	67322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241169
1614	NC_009482	CCG	2	6	67329	67334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241169
1615	NC_009482	GCT	2	6	67375	67380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1616	NC_009482	CAG	2	6	67430	67435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1617	NC_009482	CTG	2	6	67460	67465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1618	NC_009482	GCT	2	6	67466	67471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1619	NC_009482	TGG	2	6	67491	67496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241169
1620	NC_009482	CCCCG	2	10	67497	67506	0 %	0 %	20 %	80 %	148241169
1621	NC_009482	CAC	2	6	67528	67533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241169
1622	NC_009482	AGC	2	6	67602	67607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241169
1623	NC_009482	TGGAT	2	10	67641	67650	20 %	40 %	40 %	0 %	148241169
1624	NC_009482	CCGG	2	8	67745	67752	0 %	0 %	50 %	50 %	148241169
1625	NC_009482	CGC	2	6	67755	67760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241169
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1744	NC_009482	TTGCT	2	10	72265	72274	0 %	60 %	20 %	20 %	148241173
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1991	NC_009482	GTGG	2	8	82683	82690	0 %	25 %	75 %	0 %	148241183
1992	NC_009482	GCA	2	6	82702	82707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241183
1993	NC_009482	GGT	2	6	82715	82720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241183
1994	NC_009482	CTG	2	6	82737	82742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241183
1995	NC_009482	CCG	2	6	82814	82819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241183
1996	NC_009482	CAG	2	6	82923	82928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241183
1997	NC_009482	GC	3	6	82949	82954	0 %	0 %	50 %	50 %	148241183
1998	NC_009482	CCG	2	6	83001	83006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1999	NC_009482	CATG	2	8	83017	83024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2000	NC_009482	ATC	2	6	83025	83030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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