MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_009482	CTT	2	6	258572	258577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241359
6003	NC_009482	CAC	2	6	258600	258605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241359
6004	NC_009482	AGC	2	6	258611	258616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6005	NC_009482	CAG	3	9	258618	258626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6006	NC_009482	GCG	2	6	258648	258653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241359
6007	NC_009482	GCG	2	6	258657	258662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241359
6008	NC_009482	CTG	2	6	258669	258674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6009	NC_009482	CCCAG	2	10	258686	258695	20 %	0 %	20 %	60 %	148241359
6010	NC_009482	CAG	3	9	258717	258725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6011	NC_009482	GTA	2	6	258735	258740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241359
6012	NC_009482	GCA	2	6	258806	258811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6013	NC_009482	GCT	2	6	258830	258835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6014	NC_009482	CAG	2	6	258855	258860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6015	NC_009482	AGC	2	6	258901	258906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
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6017	NC_009482	GCA	2	6	259079	259084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6018	NC_009482	AGCCA	2	10	259102	259111	40 %	0 %	20 %	40 %	148241359
6019	NC_009482	AGC	2	6	259117	259122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6020	NC_009482	GCA	2	6	259145	259150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6021	NC_009482	CAG	3	9	259260	259268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6022	NC_009482	CT	3	6	259270	259275	0 %	50 %	0 %	50 %	148241359
6023	NC_009482	GCA	2	6	259310	259315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6024	NC_009482	CAG	2	6	259323	259328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
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6027	NC_009482	GCT	2	6	259509	259514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6028	NC_009482	CGCCC	2	10	259515	259524	0 %	0 %	20 %	80 %	148241359
6029	NC_009482	GCC	2	6	259598	259603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241359
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6031	NC_009482	CAG	3	9	259662	259670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241359
6032	NC_009482	CGC	2	6	259746	259751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241360
6033	NC_009482	TGC	2	6	259756	259761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241360
6034	NC_009482	CAG	2	6	259818	259823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241360
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6036	NC_009482	GGCC	2	8	259863	259870	0 %	0 %	50 %	50 %	148241360
6037	NC_009482	CGC	2	6	259875	259880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241360
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6043	NC_009482	CAG	2	6	259977	259982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241360
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6049	NC_009482	CGG	2	6	260221	260226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241360
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6057	NC_009482	CGCAG	2	10	260587	260596	20 %	0 %	40 %	40 %	148241360
6058	NC_009482	GCC	2	6	260628	260633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241360
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6060	NC_009482	GAG	2	6	260682	260687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241361
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6069	NC_009482	GCC	2	6	260863	260868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241361
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6085	NC_009482	CG	3	6	261588	261593	0 %	0 %	50 %	50 %	148241361
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6092	NC_009482	AGCC	2	8	261797	261804	25 %	0 %	25 %	50 %	148241361
6093	NC_009482	GGC	2	6	261825	261830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241361
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6099	NC_009482	GCCG	2	8	262114	262121	0 %	0 %	50 %	50 %	148241362
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6105	NC_009482	GCAGA	2	10	262315	262324	40 %	0 %	40 %	20 %	148241362
6106	NC_009482	TGCG	2	8	262364	262371	0 %	25 %	50 %	25 %	148241362
6107	NC_009482	GCA	2	6	262377	262382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241362
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6120	NC_009482	GGC	2	6	262836	262841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241362
6121	NC_009482	CAG	3	9	262843	262851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241362
6122	NC_009482	CCA	2	6	262855	262860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241362
6123	NC_009482	CAG	2	6	262861	262866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241362
6124	NC_009482	GCA	2	6	262926	262931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241362
6125	NC_009482	GCG	2	6	262949	262954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241362
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6129	NC_009482	GCA	2	6	263091	263096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241362
6130	NC_009482	TTG	2	6	263132	263137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241362
6131	NC_009482	GCA	2	6	263205	263210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241362
6132	NC_009482	CAG	3	9	263290	263298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241362
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6137	NC_009482	GAAT	2	8	263411	263418	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_009482	TC	3	6	263441	263446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6139	NC_009482	TG	4	8	263447	263454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_009482	TTGC	2	8	263482	263489	0 %	50 %	25 %	25 %	148241363
6141	NC_009482	CAA	3	9	263569	263577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241363
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6143	NC_009482	GCT	2	6	263767	263772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241363
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6146	NC_009482	CTG	2	6	263894	263899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241363
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6232	NC_009482	GCT	2	6	267797	267802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6233	NC_009482	CAA	2	6	267811	267816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241364
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6236	NC_009482	TCG	2	6	268023	268028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241364
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6239	NC_009482	TTCC	2	8	268099	268106	0 %	50 %	0 %	50 %	148241364
6240	NC_009482	TTC	2	6	268151	268156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241364
6241	NC_009482	CTG	2	6	268164	268169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6242	NC_009482	GT	3	6	268170	268175	0 %	50 %	50 %	0 %	148241364
6243	NC_009482	ACCGGT	2	12	268187	268198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6244	NC_009482	AAG	2	6	268229	268234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241364
6245	NC_009482	AAG	2	6	268394	268399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241364
6246	NC_009482	CAA	2	6	268435	268440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241364
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6253	NC_009482	GGT	2	6	268721	268726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241364
6254	NC_009482	GCA	2	6	268770	268775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241364
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6263	NC_009482	AGG	2	6	269024	269029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6264	NC_009482	T	8	8	269033	269040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6265	NC_009482	CTTATT	2	12	269059	269070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148241365
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6267	NC_009482	TTG	2	6	269140	269145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241365
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6270	NC_009482	TGC	2	6	269350	269355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6271	NC_009482	AGC	2	6	269356	269361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241365
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6344	NC_009482	CCAGG	2	10	272254	272263	20 %	0 %	40 %	40 %	148241367
6345	NC_009482	CGC	3	9	272279	272287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241367
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6354	NC_009482	GCG	2	6	272653	272658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241367
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6360	NC_009482	TTGA	2	8	272965	272972	25 %	50 %	25 %	0 %	148241369
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6363	NC_009482	GCT	2	6	273028	273033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241369
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