MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_009481	GGT	2	6	1717663	1717668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240211
36002	NC_009481	CAG	2	6	1717720	1717725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240211
36003	NC_009481	GAG	2	6	1717937	1717942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240212
36004	NC_009481	CAG	2	6	1717961	1717966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240212
36005	NC_009481	CGT	2	6	1717984	1717989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240212
36006	NC_009481	TCGA	2	8	1718190	1718197	25 %	25 %	25 %	25 %	148240212
36007	NC_009481	ACC	2	6	1718199	1718204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240212
36008	NC_009481	C	7	7	1718240	1718246	0 %	0 %	0 %	100 %	148240212
36009	NC_009481	GGGC	2	8	1718266	1718273	0 %	0 %	75 %	25 %	148240212
36010	NC_009481	CACC	2	8	1718362	1718369	25 %	0 %	0 %	75 %	148240212
36011	NC_009481	CA	3	6	1718388	1718393	50 %	0 %	0 %	50 %	148240212
36012	NC_009481	GCG	2	6	1718425	1718430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240212
36013	NC_009481	GGCCCC	2	12	1718458	1718469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240212
36014	NC_009481	GCG	2	6	1718555	1718560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36015	NC_009481	CCGT	2	8	1718564	1718571	0 %	25 %	25 %	50 %	148240213
36016	NC_009481	CAG	3	9	1718608	1718616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240213
36017	NC_009481	TGC	3	9	1718628	1718636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240213
36018	NC_009481	GATC	2	8	1718671	1718678	25 %	25 %	25 %	25 %	148240213
36019	NC_009481	CAT	2	6	1718695	1718700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240213
36020	NC_009481	GGCC	2	8	1718701	1718708	0 %	0 %	50 %	50 %	148240213
36021	NC_009481	GAACG	2	10	1718710	1718719	40 %	0 %	40 %	20 %	148240213
36022	NC_009481	ATC	2	6	1718795	1718800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240213
36023	NC_009481	TGC	2	6	1718832	1718837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240213
36024	NC_009481	GCA	3	9	1718973	1718981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240213
36025	NC_009481	GGA	2	6	1718992	1718997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240213
36026	NC_009481	GGT	2	6	1718998	1719003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240213
36027	NC_009481	CCG	2	6	1719061	1719066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240213
36028	NC_009481	ACG	2	6	1719135	1719140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240213
36029	NC_009481	CACC	2	8	1719141	1719148	25 %	0 %	0 %	75 %	148240213
36030	NC_009481	GCG	2	6	1719192	1719197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240214
36031	NC_009481	CTGT	2	8	1719274	1719281	0 %	50 %	25 %	25 %	148240214
36032	NC_009481	AGC	2	6	1719371	1719376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240214
36033	NC_009481	AGG	2	6	1719383	1719388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240214
36034	NC_009481	TCA	2	6	1719416	1719421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240214
36035	NC_009481	CGCTTC	2	12	1719676	1719687	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148240214
36036	NC_009481	CAG	2	6	1719751	1719756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240214
36037	NC_009481	AG	4	8	1719909	1719916	50 %	0 %	50 %	0 %	148240214
36038	NC_009481	GCC	2	6	1719934	1719939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240214
36039	NC_009481	GAGC	2	8	1719966	1719973	25 %	0 %	50 %	25 %	148240214
36040	NC_009481	GC	3	6	1719991	1719996	0 %	0 %	50 %	50 %	148240214
36041	NC_009481	GC	3	6	1720037	1720042	0 %	0 %	50 %	50 %	148240214
36042	NC_009481	TGCC	3	12	1720050	1720061	0 %	25 %	25 %	50 %	148240214
36043	NC_009481	CG	3	6	1720067	1720072	0 %	0 %	50 %	50 %	148240214
36044	NC_009481	TGC	2	6	1720091	1720096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240214
36045	NC_009481	TGG	2	6	1720177	1720182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240214
36046	NC_009481	GCG	2	6	1720214	1720219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240214
36047	NC_009481	GCT	2	6	1720332	1720337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240215
36048	NC_009481	GCA	2	6	1720344	1720349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240215
36049	NC_009481	CAG	2	6	1720353	1720358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240215
36050	NC_009481	GGTG	2	8	1720360	1720367	0 %	25 %	75 %	0 %	148240215
36051	NC_009481	GC	3	6	1720382	1720387	0 %	0 %	50 %	50 %	148240215
36052	NC_009481	CCT	2	6	1720395	1720400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240215
36053	NC_009481	GAG	2	6	1720401	1720406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240215
36054	NC_009481	ACC	2	6	1720441	1720446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240215
36055	NC_009481	CG	3	6	1720464	1720469	0 %	0 %	50 %	50 %	148240215
36056	NC_009481	AGG	2	6	1720513	1720518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240215
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36059	NC_009481	GCA	2	6	1720614	1720619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240215
36060	NC_009481	TGCA	2	8	1720652	1720659	25 %	25 %	25 %	25 %	148240215
36061	NC_009481	GCA	2	6	1720671	1720676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240215
36062	NC_009481	GCC	2	6	1720739	1720744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240215
36063	NC_009481	CGA	2	6	1720754	1720759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240215
36064	NC_009481	CAG	2	6	1720798	1720803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240215
36065	NC_009481	GCA	2	6	1720818	1720823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240215
36066	NC_009481	CGT	2	6	1720866	1720871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240215
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36072	NC_009481	GAAG	2	8	1721174	1721181	50 %	0 %	50 %	0 %	148240215
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36083	NC_009481	C	6	6	1721443	1721448	0 %	0 %	0 %	100 %	148240216
36084	NC_009481	CACC	2	8	1721451	1721458	25 %	0 %	0 %	75 %	148240216
36085	NC_009481	CCTT	2	8	1721459	1721466	0 %	50 %	0 %	50 %	148240216
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36097	NC_009481	CGAAG	2	10	1722126	1722135	40 %	0 %	40 %	20 %	148240216
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36100	NC_009481	CAG	2	6	1722289	1722294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240216
36101	NC_009481	GTG	2	6	1722314	1722319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240216
36102	NC_009481	GCT	2	6	1722326	1722331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240216
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36104	NC_009481	AGCGG	2	10	1722367	1722376	20 %	0 %	60 %	20 %	148240216
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36112	NC_009481	CACC	2	8	1722751	1722758	25 %	0 %	0 %	75 %	148240217
36113	NC_009481	A	6	6	1722786	1722791	100 %	0 %	0 %	0 %	148240217
36114	NC_009481	CAC	2	6	1722806	1722811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240217
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36116	NC_009481	TGC	2	6	1722846	1722851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240217
36117	NC_009481	CCAGC	2	10	1722857	1722866	20 %	0 %	20 %	60 %	148240217
36118	NC_009481	CAA	2	6	1722992	1722997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240217
36119	NC_009481	CAGGGG	2	12	1723001	1723012	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148240217
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36121	NC_009481	CCAC	2	8	1723035	1723042	25 %	0 %	0 %	75 %	148240217
36122	NC_009481	GTA	2	6	1723049	1723054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240217
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36128	NC_009481	GAG	2	6	1723338	1723343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240218
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36130	NC_009481	TCT	2	6	1723529	1723534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240218
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36152	NC_009481	GCA	2	6	1724207	1724212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240219
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36203	NC_009481	GC	4	8	1726492	1726499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36204	NC_009481	ACC	2	6	1726528	1726533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240220
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36231	NC_009481	TGA	2	6	1727486	1727491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240220
36232	NC_009481	CGC	2	6	1727523	1727528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240220
36233	NC_009481	CGG	2	6	1727543	1727548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240220
36234	NC_009481	CAT	2	6	1727583	1727588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240220
36235	NC_009481	GATCG	2	10	1727614	1727623	20 %	20 %	40 %	20 %	148240220
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36237	NC_009481	ATCT	2	8	1727731	1727738	25 %	50 %	0 %	25 %	148240220
36238	NC_009481	CTT	2	6	1727739	1727744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240220
36239	NC_009481	GGCTG	2	10	1727749	1727758	0 %	20 %	60 %	20 %	148240220
36240	NC_009481	ACC	2	6	1727759	1727764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240220
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36243	NC_009481	GAT	2	6	1727835	1727840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240220
36244	NC_009481	GGT	2	6	1727841	1727846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240220
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36247	NC_009481	CTCC	2	8	1727914	1727921	0 %	25 %	0 %	75 %	148240220
36248	NC_009481	TGT	3	9	1727946	1727954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240220
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36260	NC_009481	GAT	2	6	1728418	1728423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240221
36261	NC_009481	CAG	3	9	1728533	1728541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240221
36262	NC_009481	ATC	2	6	1728563	1728568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240221
36263	NC_009481	CAC	2	6	1728622	1728627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240221
36264	NC_009481	GAC	2	6	1728629	1728634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240221
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36270	NC_009481	TTGGA	2	10	1729008	1729017	20 %	40 %	40 %	0 %	148240222
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36275	NC_009481	CGC	2	6	1729209	1729214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240222
36276	NC_009481	GAT	2	6	1729322	1729327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240222
36277	NC_009481	CTG	2	6	1729353	1729358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240222
36278	NC_009481	CGA	2	6	1729439	1729444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240222
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36282	NC_009481	GAGATC	2	12	1729662	1729673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148240223
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36292	NC_009481	AGCA	2	8	1730142	1730149	50 %	0 %	25 %	25 %	148240223
36293	NC_009481	GGC	2	6	1730173	1730178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240223
36294	NC_009481	CAC	2	6	1730241	1730246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240223
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36296	NC_009481	CTG	2	6	1730331	1730336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240223
36297	NC_009481	ATCG	2	8	1730349	1730356	25 %	25 %	25 %	25 %	148240223
36298	NC_009481	G	6	6	1730399	1730404	0 %	0 %	100 %	0 %	148240223
36299	NC_009481	GCA	2	6	1730512	1730517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240223
36300	NC_009481	CAG	3	9	1730628	1730636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240224
36301	NC_009481	TCCA	2	8	1730640	1730647	25 %	25 %	0 %	50 %	148240224
36302	NC_009481	TCG	2	6	1730671	1730676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240224
36303	NC_009481	CAC	2	6	1730730	1730735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240224
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36305	NC_009481	GGC	2	6	1730807	1730812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240224
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36307	NC_009481	CA	3	6	1730869	1730874	50 %	0 %	0 %	50 %	148240224
36308	NC_009481	CAG	2	6	1730964	1730969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240224
36309	NC_009481	CCA	3	9	1731035	1731043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240224
36310	NC_009481	C	8	8	1731105	1731112	0 %	0 %	0 %	100 %	148240224
36311	NC_009481	GCG	2	6	1731113	1731118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240224
36312	NC_009481	CCGT	2	8	1731129	1731136	0 %	25 %	25 %	50 %	148240224
36313	NC_009481	ACC	2	6	1731186	1731191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240224
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36325	NC_009481	AGA	2	6	1731858	1731863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240225
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36327	NC_009481	GGTTG	2	10	1731983	1731992	0 %	40 %	60 %	0 %	148240225
36328	NC_009481	GATGG	2	10	1732129	1732138	20 %	20 %	60 %	0 %	148240225
36329	NC_009481	CCT	2	6	1732207	1732212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240225
36330	NC_009481	GCC	2	6	1732281	1732286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240225
36331	NC_009481	GCAG	2	8	1732318	1732325	25 %	0 %	50 %	25 %	148240225
36332	NC_009481	GATC	2	8	1732414	1732421	25 %	25 %	25 %	25 %	148240225
36333	NC_009481	GCT	2	6	1732426	1732431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240225
36334	NC_009481	GCG	2	6	1732466	1732471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240225
36335	NC_009481	GCC	2	6	1732702	1732707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240226
36336	NC_009481	CCA	2	6	1732763	1732768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240226
36337	NC_009481	CAG	3	9	1732829	1732837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240226
36338	NC_009481	ACA	3	9	1732848	1732856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36339	NC_009481	GCT	2	6	1732883	1732888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36340	NC_009481	CGC	2	6	1732915	1732920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240227
36341	NC_009481	GCCC	2	8	1733003	1733010	0 %	0 %	25 %	75 %	148240227
36342	NC_009481	ACG	2	6	1733027	1733032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240227
36343	NC_009481	TCA	2	6	1733038	1733043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240227
36344	NC_009481	GCG	2	6	1733068	1733073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240227
36345	NC_009481	GCC	3	9	1733107	1733115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240227
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36347	NC_009481	TGC	3	9	1733212	1733220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240227
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36465	NC_009481	GCT	2	6	1738702	1738707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240231
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36484	NC_009481	CTT	2	6	1739756	1739761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240233
36485	NC_009481	TC	3	6	1739885	1739890	0 %	50 %	0 %	50 %	148240233
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36490	NC_009481	CTC	2	6	1740140	1740145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36495	NC_009481	GCT	2	6	1740376	1740381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240235
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36497	NC_009481	TGC	2	6	1740430	1740435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240235
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