MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009481	TCT	2	6	107115	107120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238442
2502	NC_009481	GGC	2	6	107141	107146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238442
2503	NC_009481	CCA	2	6	107169	107174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238442
2504	NC_009481	GTG	2	6	107184	107189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238442
2505	NC_009481	CGA	2	6	107227	107232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238442
2506	NC_009481	CAC	2	6	107326	107331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238442
2507	NC_009481	GAA	2	6	107453	107458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238442
2508	NC_009481	CCA	2	6	107471	107476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238442
2509	NC_009481	TCG	2	6	107481	107486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238442
2510	NC_009481	TGATT	2	10	107539	107548	20 %	60 %	20 %	0 %	148238442
2511	NC_009481	TGGAT	2	10	107565	107574	20 %	40 %	40 %	0 %	148238442
2512	NC_009481	GTG	2	6	107604	107609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238442
2513	NC_009481	GAT	2	6	107618	107623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238442
2514	NC_009481	GGT	2	6	107633	107638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238442
2515	NC_009481	GAT	3	9	107642	107650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238442
2516	NC_009481	GAC	2	6	107699	107704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238442
2517	NC_009481	CGTG	2	8	107707	107714	0 %	25 %	50 %	25 %	148238442
2518	NC_009481	TGA	2	6	107725	107730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238442
2519	NC_009481	GTG	2	6	107732	107737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238442
2520	NC_009481	TGA	2	6	107806	107811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238442
2521	NC_009481	TGG	2	6	107821	107826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238442
2522	NC_009481	GAG	2	6	107856	107861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238442
2523	NC_009481	TTTGG	2	10	107893	107902	0 %	60 %	40 %	0 %	148238442
2524	NC_009481	CGAA	2	8	107940	107947	50 %	0 %	25 %	25 %	148238442
2525	NC_009481	CTG	2	6	107967	107972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238442
2526	NC_009481	ACC	2	6	108005	108010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238442
2527	NC_009481	TCG	2	6	108015	108020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238442
2528	NC_009481	CGCT	2	8	108077	108084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_009481	GGT	2	6	108158	108163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238443
2530	NC_009481	GGT	2	6	108176	108181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238443
2531	NC_009481	GCGA	2	8	108248	108255	25 %	0 %	50 %	25 %	148238443
2532	NC_009481	CGT	2	6	108313	108318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238443
2533	NC_009481	GCC	2	6	108356	108361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238443
2534	NC_009481	ACA	2	6	108364	108369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238443
2535	NC_009481	TGC	2	6	108387	108392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238443
2536	NC_009481	TCA	2	6	108541	108546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238443
2537	NC_009481	ACC	2	6	108602	108607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238443
2538	NC_009481	CAC	2	6	108674	108679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238443
2539	NC_009481	AGT	2	6	108694	108699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238443
2540	NC_009481	GCA	2	6	108711	108716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238443
2541	NC_009481	GGT	2	6	108757	108762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238443
2542	NC_009481	CT	3	6	108795	108800	0 %	50 %	0 %	50 %	148238443
2543	NC_009481	CGA	2	6	108838	108843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238443
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2548	NC_009481	AG	3	6	108976	108981	50 %	0 %	50 %	0 %	148238443
2549	NC_009481	C	6	6	108984	108989	0 %	0 %	0 %	100 %	148238443
2550	NC_009481	TCA	2	6	108999	109004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238443
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2553	NC_009481	ATG	2	6	109335	109340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238444
2554	NC_009481	TTGTT	2	10	109361	109370	0 %	80 %	20 %	0 %	148238444
2555	NC_009481	GGA	2	6	109386	109391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238444
2556	NC_009481	CTTA	2	8	109497	109504	25 %	50 %	0 %	25 %	148238444
2557	NC_009481	GTT	2	6	109534	109539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238444
2558	NC_009481	GT	3	6	109540	109545	0 %	50 %	50 %	0 %	148238444
2559	NC_009481	TCCG	2	8	109555	109562	0 %	25 %	25 %	50 %	148238444
2560	NC_009481	TTTG	2	8	109605	109612	0 %	75 %	25 %	0 %	148238444
2561	NC_009481	GAT	2	6	109674	109679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238444
2562	NC_009481	GCAAT	2	10	109684	109693	40 %	20 %	20 %	20 %	148238444
2563	NC_009481	GAT	2	6	109719	109724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238444
2564	NC_009481	AT	3	6	109759	109764	50 %	50 %	0 %	0 %	148238444
2565	NC_009481	AT	3	6	109815	109820	50 %	50 %	0 %	0 %	148238444
2566	NC_009481	ATGA	2	8	109827	109834	50 %	25 %	25 %	0 %	148238444
2567	NC_009481	CGAAT	2	10	109852	109861	40 %	20 %	20 %	20 %	148238444
2568	NC_009481	AG	4	8	110040	110047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_009481	T	7	7	110062	110068	0 %	100 %	0 %	0 %	148238445
2570	NC_009481	TGG	2	6	110107	110112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238445
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2572	NC_009481	GTT	2	6	110233	110238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238445
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2579	NC_009481	TTC	2	6	110537	110542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238445
2580	NC_009481	TGGA	2	8	110543	110550	25 %	25 %	50 %	0 %	148238445
2581	NC_009481	CGT	2	6	110566	110571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238445
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2583	NC_009481	T	7	7	110644	110650	0 %	100 %	0 %	0 %	148238445
2584	NC_009481	CGA	2	6	110676	110681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238445
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2587	NC_009481	GGTT	2	8	110809	110816	0 %	50 %	50 %	0 %	148238445
2588	NC_009481	TGGC	2	8	110852	110859	0 %	25 %	50 %	25 %	148238445
2589	NC_009481	TTGT	2	8	111014	111021	0 %	75 %	25 %	0 %	148238445
2590	NC_009481	TGT	2	6	111133	111138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238445
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2592	NC_009481	TTGC	2	8	111295	111302	0 %	50 %	25 %	25 %	148238445
2593	NC_009481	TGCTC	2	10	111304	111313	0 %	40 %	20 %	40 %	148238445
2594	NC_009481	CCATC	2	10	111390	111399	20 %	20 %	0 %	60 %	148238446
2595	NC_009481	GTT	2	6	111422	111427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238446
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2597	NC_009481	GCC	2	6	111490	111495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238446
2598	NC_009481	AAC	2	6	111622	111627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_009481	AGC	2	6	111688	111693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_009481	A	8	8	111747	111754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_009481	GTG	3	9	111871	111879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238447
2602	NC_009481	TCC	2	6	111912	111917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238447
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2604	NC_009481	GAG	2	6	112014	112019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238447
2605	NC_009481	CCA	2	6	112039	112044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238447
2606	NC_009481	ATC	2	6	112077	112082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238447
2607	NC_009481	GAT	2	6	112128	112133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238447
2608	NC_009481	GCG	2	6	112213	112218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238447
2609	NC_009481	AGT	2	6	112248	112253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238447
2610	NC_009481	TGA	2	6	112301	112306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238447
2611	NC_009481	GTG	2	6	112321	112326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238447
2612	NC_009481	GCT	2	6	112347	112352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2613	NC_009481	GCC	2	6	112410	112415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238447
2614	NC_009481	CGT	2	6	112424	112429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
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2617	NC_009481	ATC	2	6	112479	112484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238447
2618	NC_009481	AG	3	6	112524	112529	50 %	0 %	50 %	0 %	148238447
2619	NC_009481	GAG	2	6	112566	112571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238447
2620	NC_009481	TCG	2	6	112609	112614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2621	NC_009481	GT	3	6	112691	112696	0 %	50 %	50 %	0 %	148238447
2622	NC_009481	GTT	2	6	112819	112824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238447
2623	NC_009481	CAT	2	6	112826	112831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238447
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2626	NC_009481	TTG	2	6	113032	113037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238447
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2732	NC_009481	GGCTG	2	10	118363	118372	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2737	NC_009481	CAGC	2	8	118592	118599	25 %	0 %	25 %	50 %	148238449
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2739	NC_009481	TCG	2	6	118675	118680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2740	NC_009481	GCAG	2	8	118828	118835	25 %	0 %	50 %	25 %	148238449
2741	NC_009481	GGTGG	2	10	118848	118857	0 %	20 %	80 %	0 %	148238449
2742	NC_009481	TGG	2	6	118883	118888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238449
2743	NC_009481	TGG	2	6	118979	118984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238449
2744	NC_009481	CAG	2	6	119001	119006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2745	NC_009481	GCT	2	6	119052	119057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2746	NC_009481	AAGA	2	8	119061	119068	75 %	0 %	25 %	0 %	148238449
2747	NC_009481	CACCG	2	10	119081	119090	20 %	0 %	20 %	60 %	148238449
2748	NC_009481	GCT	2	6	119095	119100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2749	NC_009481	GCA	2	6	119132	119137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238449
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2753	NC_009481	TCCA	2	8	119221	119228	25 %	25 %	0 %	50 %	148238449
2754	NC_009481	ATC	2	6	119244	119249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238449
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2757	NC_009481	GC	3	6	119317	119322	0 %	0 %	50 %	50 %	148238449
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2764	NC_009481	GCTCG	2	10	119558	119567	0 %	20 %	40 %	40 %	148238450
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2773	NC_009481	GTC	2	6	119869	119874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238450
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2775	NC_009481	GCA	2	6	120330	120335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238450
2776	NC_009481	GATC	2	8	120375	120382	25 %	25 %	25 %	25 %	148238450
2777	NC_009481	CTG	2	6	120398	120403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238450
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2779	NC_009481	TCT	2	6	120534	120539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2780	NC_009481	GC	3	6	120607	120612	0 %	0 %	50 %	50 %	148238451
2781	NC_009481	GCT	2	6	120630	120635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
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