MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009481	TGG	2	6	43315	43320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238375
1002	NC_009481	GCT	2	6	43343	43348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238375
1003	NC_009481	TGG	2	6	43396	43401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238375
1004	NC_009481	ACGC	2	8	43424	43431	25 %	0 %	25 %	50 %	148238375
1005	NC_009481	GCA	3	9	43441	43449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238376
1006	NC_009481	TTGG	2	8	43462	43469	0 %	50 %	50 %	0 %	148238376
1007	NC_009481	CGT	2	6	43507	43512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238376
1008	NC_009481	CCA	2	6	43561	43566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238376
1009	NC_009481	GGC	2	6	43619	43624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238376
1010	NC_009481	CCT	2	6	43678	43683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238376
1011	NC_009481	GAG	2	6	43689	43694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238376
1012	NC_009481	CCG	2	6	43740	43745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238376
1013	NC_009481	CTG	2	6	43826	43831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238377
1014	NC_009481	TTG	2	6	43833	43838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238377
1015	NC_009481	TGG	2	6	43842	43847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238377
1016	NC_009481	CCG	2	6	43868	43873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238377
1017	NC_009481	CCA	2	6	43923	43928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238377
1018	NC_009481	ATC	2	6	43940	43945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238377
1019	NC_009481	GCG	2	6	43949	43954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238377
1020	NC_009481	AGG	2	6	44007	44012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238377
1021	NC_009481	GTT	2	6	44032	44037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238377
1022	NC_009481	TGC	2	6	44043	44048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238377
1023	NC_009481	GC	3	6	44067	44072	0 %	0 %	50 %	50 %	148238377
1024	NC_009481	CGG	2	6	44079	44084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238377
1025	NC_009481	GCA	3	9	44139	44147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238377
1026	NC_009481	G	6	6	44259	44264	0 %	0 %	100 %	0 %	148238378
1027	NC_009481	CAC	2	6	44275	44280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238378
1028	NC_009481	GCA	2	6	44286	44291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238378
1029	NC_009481	GAG	2	6	44293	44298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238378
1030	NC_009481	CCG	2	6	44334	44339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238378
1031	NC_009481	AGC	2	6	44429	44434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238378
1032	NC_009481	GAGG	2	8	44524	44531	25 %	0 %	75 %	0 %	148238378
1033	NC_009481	TGCCGA	2	12	44559	44570	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238378
1034	NC_009481	CAC	2	6	44632	44637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238378
1035	NC_009481	GCG	2	6	44664	44669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238378
1036	NC_009481	CAG	2	6	44695	44700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238378
1037	NC_009481	TGCC	2	8	44712	44719	0 %	25 %	25 %	50 %	148238378
1038	NC_009481	CAG	2	6	44731	44736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238378
1039	NC_009481	CAA	2	6	44757	44762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238378
1040	NC_009481	GTT	2	6	44777	44782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009481	TGC	2	6	44844	44849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_009481	TGT	2	6	44853	44858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009481	AGC	2	6	45011	45016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238379
1044	NC_009481	TGC	2	6	45080	45085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238379
1045	NC_009481	GCT	2	6	45099	45104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238379
1046	NC_009481	AAAG	2	8	45181	45188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009481	CT	3	6	45208	45213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_009481	TCC	2	6	45261	45266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_009481	T	6	6	45300	45305	0 %	100 %	0 %	0 %	148238380
1050	NC_009481	GGT	2	6	45309	45314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238380
1051	NC_009481	TGA	2	6	45365	45370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238380
1052	NC_009481	CTT	2	6	45384	45389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238380
1053	NC_009481	G	6	6	45410	45415	0 %	0 %	100 %	0 %	148238380
1054	NC_009481	GAA	2	6	45423	45428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238380
1055	NC_009481	TCA	2	6	45554	45559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_009481	ACA	3	9	45566	45574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009481	AGCA	2	8	45624	45631	50 %	0 %	25 %	25 %	148238381
1058	NC_009481	GCGCC	2	10	45700	45709	0 %	0 %	40 %	60 %	148238381
1059	NC_009481	ATG	2	6	45886	45891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009481	CTT	2	6	45930	45935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_009481	GCA	2	6	46007	46012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238382
1062	NC_009481	GGC	2	6	46023	46028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238382
1063	NC_009481	GCCA	2	8	46110	46117	25 %	0 %	25 %	50 %	148238382
1064	NC_009481	CCG	2	6	46214	46219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238382
1065	NC_009481	GCGT	2	8	46272	46279	0 %	25 %	50 %	25 %	148238382
1066	NC_009481	CAT	2	6	46314	46319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238382
1067	NC_009481	CCG	2	6	46355	46360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238382
1068	NC_009481	GCT	2	6	46384	46389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238382
1069	NC_009481	CAT	2	6	46494	46499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238382
1070	NC_009481	CCA	2	6	46523	46528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238382
1071	NC_009481	TGG	2	6	46559	46564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238382
1072	NC_009481	GCT	2	6	46623	46628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238382
1073	NC_009481	CGC	2	6	46853	46858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238382
1074	NC_009481	TGA	2	6	46871	46876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238382
1075	NC_009481	GCC	2	6	46891	46896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238382
1076	NC_009481	GCT	2	6	46926	46931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238382
1077	NC_009481	CAGC	2	8	46941	46948	25 %	0 %	25 %	50 %	148238382
1078	NC_009481	CCA	2	6	46970	46975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238382
1079	NC_009481	ATC	2	6	47062	47067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238382
1080	NC_009481	TCC	2	6	47105	47110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_009481	A	6	6	47116	47121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009481	CTG	2	6	47126	47131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_009481	CGC	2	6	47145	47150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_009481	TGT	2	6	47154	47159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009481	TCCGGA	2	12	47164	47175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_009481	GCT	2	6	47278	47283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1090	NC_009481	GGC	2	6	47304	47309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238383
1091	NC_009481	TG	3	6	47314	47319	0 %	50 %	50 %	0 %	148238383
1092	NC_009481	GT	3	6	47350	47355	0 %	50 %	50 %	0 %	148238383
1093	NC_009481	CTG	2	6	47409	47414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1094	NC_009481	CGGGG	2	10	47451	47460	0 %	0 %	80 %	20 %	148238383
1095	NC_009481	CGGC	2	8	47550	47557	0 %	0 %	50 %	50 %	148238383
1096	NC_009481	GGT	2	6	47571	47576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238383
1097	NC_009481	CGC	2	6	47616	47621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238383
1098	NC_009481	TGGTG	2	10	47625	47634	0 %	40 %	60 %	0 %	148238383
1099	NC_009481	GGC	2	6	47750	47755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238383
1100	NC_009481	GCT	2	6	47853	47858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1101	NC_009481	TGGC	2	8	47927	47934	0 %	25 %	50 %	25 %	148238383
1102	NC_009481	TGG	2	6	47984	47989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238383
1103	NC_009481	GCT	2	6	48040	48045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1104	NC_009481	CTGG	2	8	48069	48076	0 %	25 %	50 %	25 %	148238383
1105	NC_009481	CGG	2	6	48125	48130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238383
1106	NC_009481	TGGGCG	2	12	48179	48190	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148238383
1107	NC_009481	CT	3	6	48194	48199	0 %	50 %	0 %	50 %	148238383
1108	NC_009481	GTCAGC	2	12	48354	48365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238384
1109	NC_009481	GGT	2	6	48445	48450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1110	NC_009481	CAC	2	6	48463	48468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238384
1111	NC_009481	GTG	2	6	48513	48518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1112	NC_009481	TG	3	6	48552	48557	0 %	50 %	50 %	0 %	148238384
1113	NC_009481	GCA	2	6	48622	48627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238384
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1115	NC_009481	GTG	2	6	48641	48646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1116	NC_009481	GGC	2	6	48817	48822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238384
1117	NC_009481	GGT	2	6	48871	48876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1118	NC_009481	GAT	2	6	48898	48903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238384
1119	NC_009481	CGG	2	6	48951	48956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238384
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1121	NC_009481	CTC	2	6	49039	49044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238384
1122	NC_009481	AAG	2	6	49064	49069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238384
1123	NC_009481	ATC	2	6	49250	49255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238384
1124	NC_009481	GT	3	6	49272	49277	0 %	50 %	50 %	0 %	148238384
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1126	NC_009481	CCA	2	6	49411	49416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238384
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1131	NC_009481	CTGC	2	8	49606	49613	0 %	25 %	25 %	50 %	148238384
1132	NC_009481	GGCA	2	8	49674	49681	25 %	0 %	50 %	25 %	148238384
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1138	NC_009481	TGG	2	6	49933	49938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1157	NC_009481	GA	3	6	50797	50802	50 %	0 %	50 %	0 %	148238386
1158	NC_009481	GATCA	2	10	50810	50819	40 %	20 %	20 %	20 %	148238386
1159	NC_009481	AGGTGG	2	12	50853	50864	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	148238386
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1237	NC_009481	CACC	2	8	54243	54250	25 %	0 %	0 %	75 %	148238389
1238	NC_009481	TGA	2	6	54251	54256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238389
1239	NC_009481	G	6	6	54302	54307	0 %	0 %	100 %	0 %	148238389
1240	NC_009481	CA	3	6	54325	54330	50 %	0 %	0 %	50 %	148238389
1241	NC_009481	TGAA	2	8	54350	54357	50 %	25 %	25 %	0 %	148238389
1242	NC_009481	GCC	2	6	54370	54375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238389
1243	NC_009481	CGT	2	6	54450	54455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238389
1244	NC_009481	CGGT	2	8	54485	54492	0 %	25 %	50 %	25 %	148238389
1245	NC_009481	TGG	2	6	54524	54529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238389
1246	NC_009481	TTG	2	6	54557	54562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238389
1247	NC_009481	TAG	2	6	54563	54568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238389
1248	NC_009481	GGA	2	6	54630	54635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238389
1249	NC_009481	TCC	2	6	54638	54643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238389
1250	NC_009481	AGCCGT	2	12	54717	54728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238389
1251	NC_009481	CAC	2	6	54751	54756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238389
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1482	NC_009481	CGG	2	6	65471	65476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238401
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