MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009481	GCCA	2	8	240639	240646	25 %	0 %	25 %	50 %	148238555
5502	NC_009481	CAG	2	6	240671	240676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238555
5503	NC_009481	GA	3	6	240740	240745	50 %	0 %	50 %	0 %	148238555
5504	NC_009481	GCT	2	6	240774	240779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_009481	TCA	2	6	240791	240796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_009481	CGG	2	6	240881	240886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238556
5507	NC_009481	AGC	2	6	240899	240904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238556
5508	NC_009481	GCC	2	6	240913	240918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238556
5509	NC_009481	GAT	2	6	240943	240948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238556
5510	NC_009481	CTGG	2	8	240963	240970	0 %	25 %	50 %	25 %	148238556
5511	NC_009481	AGG	2	6	240971	240976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238556
5512	NC_009481	TC	3	6	240987	240992	0 %	50 %	0 %	50 %	148238556
5513	NC_009481	CTGG	2	8	241004	241011	0 %	25 %	50 %	25 %	148238556
5514	NC_009481	CCT	2	6	241087	241092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238556
5515	NC_009481	CTC	2	6	241096	241101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238556
5516	NC_009481	CGG	2	6	241271	241276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238556
5517	NC_009481	TCA	2	6	241304	241309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_009481	GAA	2	6	241395	241400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238557
5519	NC_009481	GCT	2	6	241436	241441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238557
5520	NC_009481	GTG	2	6	241453	241458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238557
5521	NC_009481	TGG	2	6	241481	241486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238557
5522	NC_009481	CGC	2	6	241506	241511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238557
5523	NC_009481	CCG	2	6	241581	241586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238557
5524	NC_009481	TAC	2	6	241615	241620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238557
5525	NC_009481	CAG	2	6	241636	241641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238557
5526	NC_009481	GCT	2	6	241710	241715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238557
5527	NC_009481	CGG	2	6	241800	241805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238557
5528	NC_009481	ACG	2	6	241808	241813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238557
5529	NC_009481	TTCCT	2	10	241827	241836	0 %	60 %	0 %	40 %	148238557
5530	NC_009481	CGA	2	6	241845	241850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238557
5531	NC_009481	ACC	2	6	241864	241869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238557
5532	NC_009481	TGG	2	6	241922	241927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238557
5533	NC_009481	TGG	2	6	241988	241993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238557
5534	NC_009481	GCT	2	6	242062	242067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238557
5535	NC_009481	CGCT	2	8	242165	242172	0 %	25 %	25 %	50 %	148238558
5536	NC_009481	GGT	2	6	242198	242203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238558
5537	NC_009481	TGC	2	6	242248	242253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5538	NC_009481	CTG	2	6	242316	242321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5539	NC_009481	GTGCT	2	10	242338	242347	0 %	40 %	40 %	20 %	148238558
5540	NC_009481	GGC	2	6	242402	242407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238558
5541	NC_009481	GC	4	8	242508	242515	0 %	0 %	50 %	50 %	148238558
5542	NC_009481	GCG	2	6	242558	242563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238558
5543	NC_009481	AGC	2	6	242568	242573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5544	NC_009481	GAT	2	6	242649	242654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238558
5545	NC_009481	GTT	2	6	242663	242668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238558
5546	NC_009481	AAC	2	6	242670	242675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238558
5547	NC_009481	CCG	2	6	242698	242703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238558
5548	NC_009481	TG	3	6	242772	242777	0 %	50 %	50 %	0 %	148238558
5549	NC_009481	CAG	2	6	242783	242788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5550	NC_009481	GCA	2	6	242858	242863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5551	NC_009481	TGC	2	6	242882	242887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5552	NC_009481	ACCC	2	8	242912	242919	25 %	0 %	0 %	75 %	148238558
5553	NC_009481	TTG	2	6	242937	242942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238558
5554	NC_009481	GGC	2	6	242977	242982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238558
5555	NC_009481	C	7	7	243030	243036	0 %	0 %	0 %	100 %	148238558
5556	NC_009481	GCT	2	6	243054	243059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5557	NC_009481	CGTCGC	2	12	243063	243074	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148238558
5558	NC_009481	TGC	2	6	243080	243085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5559	NC_009481	GGT	2	6	243095	243100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238558
5560	NC_009481	CTGG	2	8	243112	243119	0 %	25 %	50 %	25 %	148238558
5561	NC_009481	TAA	2	6	243155	243160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_009481	GAAC	2	8	243237	243244	50 %	0 %	25 %	25 %	148238559
5563	NC_009481	CAC	2	6	243269	243274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238559
5564	NC_009481	GCA	2	6	243304	243309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5565	NC_009481	CTG	2	6	243337	243342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5566	NC_009481	TTG	2	6	243370	243375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238559
5567	NC_009481	TTG	2	6	243452	243457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238559
5568	NC_009481	TTGG	2	8	243477	243484	0 %	50 %	50 %	0 %	148238559
5569	NC_009481	GTT	2	6	243522	243527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238559
5570	NC_009481	TGC	2	6	243578	243583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5571	NC_009481	CAG	2	6	243693	243698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5572	NC_009481	TGC	2	6	243719	243724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5573	NC_009481	TCT	2	6	243764	243769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238559
5574	NC_009481	GA	3	6	243937	243942	50 %	0 %	50 %	0 %	148238559
5575	NC_009481	TTG	2	6	243991	243996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238559
5576	NC_009481	CAA	2	6	244179	244184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238559
5577	NC_009481	CGG	2	6	244191	244196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238559
5578	NC_009481	GCCGC	2	10	244293	244302	0 %	0 %	40 %	60 %	148238559
5579	NC_009481	TG	3	6	244313	244318	0 %	50 %	50 %	0 %	148238559
5580	NC_009481	ACA	2	6	244361	244366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238559
5581	NC_009481	ACC	2	6	244429	244434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238559
5582	NC_009481	CTG	2	6	244447	244452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5583	NC_009481	TCT	3	9	244479	244487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238559
5584	NC_009481	AGG	2	6	244508	244513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238559
5585	NC_009481	CCTG	2	8	244519	244526	0 %	25 %	25 %	50 %	148238559
5586	NC_009481	CTC	2	6	244564	244569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238559
5587	NC_009481	TGA	2	6	244620	244625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238559
5588	NC_009481	TTG	2	6	244670	244675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238559
5589	NC_009481	G	7	7	244731	244737	0 %	0 %	100 %	0 %	148238559
5590	NC_009481	ACAG	2	8	244772	244779	50 %	0 %	25 %	25 %	148238559
5591	NC_009481	CCA	2	6	244805	244810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238559
5592	NC_009481	GTC	2	6	244865	244870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5593	NC_009481	GTG	2	6	244882	244887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238559
5594	NC_009481	TGT	2	6	245046	245051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238560
5595	NC_009481	ATC	2	6	245067	245072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238560
5596	NC_009481	CAA	2	6	245083	245088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238560
5597	NC_009481	GTGC	2	8	245153	245160	0 %	25 %	50 %	25 %	148238560
5598	NC_009481	C	6	6	245160	245165	0 %	0 %	0 %	100 %	148238560
5599	NC_009481	CCG	2	6	245185	245190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238560
5600	NC_009481	CGT	2	6	245198	245203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5601	NC_009481	CGC	2	6	245396	245401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238560
5602	NC_009481	TCTGCG	2	12	245404	245415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5603	NC_009481	CCACG	2	10	245422	245431	20 %	0 %	20 %	60 %	148238560
5604	NC_009481	CCAG	2	8	245461	245468	25 %	0 %	25 %	50 %	148238560
5605	NC_009481	CAC	2	6	245533	245538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238560
5606	NC_009481	GCCGAT	2	12	245603	245614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5607	NC_009481	CGGG	2	8	245620	245627	0 %	0 %	75 %	25 %	148238560
5608	NC_009481	CGC	2	6	245649	245654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238560
5609	NC_009481	CTG	2	6	245852	245857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5610	NC_009481	CCTC	2	8	245874	245881	0 %	25 %	0 %	75 %	148238560
5611	NC_009481	AC	3	6	245937	245942	50 %	0 %	0 %	50 %	148238560
5612	NC_009481	TTC	2	6	245963	245968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238560
5613	NC_009481	GCT	2	6	245978	245983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5614	NC_009481	GGT	2	6	245992	245997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238560
5615	NC_009481	GCT	2	6	246016	246021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5616	NC_009481	GCT	2	6	246040	246045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5617	NC_009481	TCC	2	6	246049	246054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238560
5618	NC_009481	TGC	2	6	246070	246075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5619	NC_009481	CAACA	2	10	246137	246146	60 %	0 %	0 %	40 %	148238560
5620	NC_009481	CGCA	2	8	246158	246165	25 %	0 %	25 %	50 %	148238560
5621	NC_009481	CTG	2	6	246197	246202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5622	NC_009481	AGC	2	6	246207	246212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238560
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5624	NC_009481	CTTGG	2	10	246267	246276	0 %	40 %	40 %	20 %	148238560
5625	NC_009481	CTG	2	6	246290	246295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
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5634	NC_009481	TGC	2	6	246719	246724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
5635	NC_009481	GCTCA	2	10	246767	246776	20 %	20 %	20 %	40 %	148238560
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5739	NC_009481	ACAGC	2	10	252268	252277	40 %	0 %	20 %	40 %	148238565
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5977	NC_009481	ATGGCC	2	12	262156	262167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238574
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5979	NC_009481	GAGG	2	8	262254	262261	25 %	0 %	75 %	0 %	148238574
5980	NC_009481	CCA	2	6	262274	262279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238574
5981	NC_009481	GCA	2	6	262316	262321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238574
5982	NC_009481	AGC	2	6	262327	262332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238574
5983	NC_009481	CGG	2	6	262334	262339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238574
5984	NC_009481	CAG	3	9	262356	262364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238574
5985	NC_009481	TCG	2	6	262372	262377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238574
5986	NC_009481	GCC	2	6	262378	262383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238574
5987	NC_009481	ACC	2	6	262384	262389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238574
5988	NC_009481	GGA	2	6	262446	262451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238574
5989	NC_009481	GGC	2	6	262458	262463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238574
5990	NC_009481	CAG	2	6	262539	262544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238574
5991	NC_009481	CTCC	2	8	262553	262560	0 %	25 %	0 %	75 %	148238574
5992	NC_009481	TGCCGC	2	12	262581	262592	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148238574
5993	NC_009481	GGC	2	6	262599	262604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238574
5994	NC_009481	CCT	2	6	262607	262612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238574
5995	NC_009481	GCAG	2	8	262616	262623	25 %	0 %	50 %	25 %	148238574
5996	NC_009481	TGC	2	6	262779	262784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238575
5997	NC_009481	CTC	2	6	262793	262798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238575
5998	NC_009481	GCAGC	2	10	262810	262819	20 %	0 %	40 %	40 %	148238575
5999	NC_009481	GAT	2	6	262834	262839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238575
6000	NC_009481	GCT	2	6	262870	262875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238575

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