MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_009481	TGG	2	6	2364576	2364581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240867
50002	NC_009481	GCC	2	6	2364661	2364666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240867
50003	NC_009481	GCA	2	6	2364748	2364753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240867
50004	NC_009481	GAG	2	6	2364861	2364866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240867
50005	NC_009481	CAC	2	6	2364955	2364960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240868
50006	NC_009481	GTG	2	6	2365046	2365051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240868
50007	NC_009481	GCAA	2	8	2365142	2365149	50 %	0 %	25 %	25 %	148240868
50008	NC_009481	CCA	2	6	2365223	2365228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240868
50009	NC_009481	GCC	2	6	2365426	2365431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240868
50010	NC_009481	CTT	2	6	2365467	2365472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240868
50011	NC_009481	CCG	2	6	2365518	2365523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50012	NC_009481	CCG	3	9	2365589	2365597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240869
50013	NC_009481	ACG	2	6	2365668	2365673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240869
50014	NC_009481	AAG	2	6	2365840	2365845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240869
50015	NC_009481	CCG	2	6	2365888	2365893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240869
50016	NC_009481	ACGC	2	8	2365906	2365913	25 %	0 %	25 %	50 %	148240869
50017	NC_009481	GC	3	6	2365925	2365930	0 %	0 %	50 %	50 %	148240869
50018	NC_009481	CAGG	2	8	2366232	2366239	25 %	0 %	50 %	25 %	148240869
50019	NC_009481	ATG	2	6	2366262	2366267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240869
50020	NC_009481	AAC	2	6	2366301	2366306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240869
50021	NC_009481	GCC	2	6	2366382	2366387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240869
50022	NC_009481	AGCC	2	8	2366393	2366400	25 %	0 %	25 %	50 %	148240869
50023	NC_009481	GCT	2	6	2366450	2366455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240869
50024	NC_009481	CGG	2	6	2366456	2366461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240869
50025	NC_009481	GCT	2	6	2366493	2366498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240869
50026	NC_009481	GGCC	2	8	2366504	2366511	0 %	0 %	50 %	50 %	148240869
50027	NC_009481	AAAAG	2	10	2366517	2366526	80 %	0 %	20 %	0 %	148240869
50028	NC_009481	GGT	2	6	2366549	2366554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240869
50029	NC_009481	GTGC	2	8	2366555	2366562	0 %	25 %	50 %	25 %	148240869
50030	NC_009481	CAA	3	9	2366600	2366608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240869
50031	NC_009481	CGC	2	6	2366695	2366700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50032	NC_009481	C	6	6	2366716	2366721	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50033	NC_009481	G	6	6	2366730	2366735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50034	NC_009481	T	7	7	2366736	2366742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50035	NC_009481	AC	3	6	2366751	2366756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50036	NC_009481	AACCA	2	10	2366764	2366773	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
50037	NC_009481	G	6	6	2366831	2366836	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.