MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009481	ACCGC	2	10	198456	198465	20 %	0 %	20 %	60 %	148238518
4502	NC_009481	GCA	2	6	198535	198540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4503	NC_009481	TCC	2	6	198677	198682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238518
4504	NC_009481	G	6	6	198739	198744	0 %	0 %	100 %	0 %	148238518
4505	NC_009481	GCA	2	6	198761	198766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4506	NC_009481	CTCA	2	8	198779	198786	25 %	25 %	0 %	50 %	148238518
4507	NC_009481	GCC	2	6	198809	198814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238518
4508	NC_009481	G	6	6	198895	198900	0 %	0 %	100 %	0 %	148238518
4509	NC_009481	CCA	2	6	198943	198948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238518
4510	NC_009481	GCC	2	6	198950	198955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238518
4511	NC_009481	GCCA	2	8	198963	198970	25 %	0 %	25 %	50 %	148238518
4512	NC_009481	CG	3	6	199019	199024	0 %	0 %	50 %	50 %	148238518
4513	NC_009481	GGC	2	6	199045	199050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238518
4514	NC_009481	CATCAG	2	12	199070	199081	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148238518
4515	NC_009481	TGC	3	9	199089	199097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4516	NC_009481	TGC	2	6	199101	199106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4517	NC_009481	CGC	2	6	199141	199146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238518
4518	NC_009481	CAG	2	6	199154	199159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4519	NC_009481	CGG	2	6	199211	199216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238518
4520	NC_009481	CAG	2	6	199223	199228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4521	NC_009481	CGGC	2	8	199303	199310	0 %	0 %	50 %	50 %	148238518
4522	NC_009481	GGT	2	6	199358	199363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238518
4523	NC_009481	GGGC	2	8	199382	199389	0 %	0 %	75 %	25 %	148238518
4524	NC_009481	CGG	2	6	199517	199522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_009481	CTG	2	6	199610	199615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4526	NC_009481	ATC	2	6	199659	199664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238519
4527	NC_009481	GCC	2	6	199700	199705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4528	NC_009481	TGC	2	6	199788	199793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4529	NC_009481	CGG	2	6	199813	199818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238519
4530	NC_009481	GAG	2	6	199826	199831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
4531	NC_009481	CTGG	2	8	199843	199850	0 %	25 %	50 %	25 %	148238519
4532	NC_009481	AGG	2	6	199863	199868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
4533	NC_009481	CTG	2	6	199877	199882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4534	NC_009481	TGC	4	12	199938	199949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4535	NC_009481	CTG	2	6	199955	199960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4536	NC_009481	TGC	2	6	199974	199979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4537	NC_009481	CAG	2	6	199985	199990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4538	NC_009481	TGC	2	6	200070	200075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4539	NC_009481	AGC	2	6	200088	200093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4540	NC_009481	CGG	2	6	200109	200114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238519
4541	NC_009481	C	6	6	200121	200126	0 %	0 %	0 %	100 %	148238519
4542	NC_009481	GGC	2	6	200136	200141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238519
4543	NC_009481	TGGA	2	8	200159	200166	25 %	25 %	50 %	0 %	148238519
4544	NC_009481	TCC	2	6	200212	200217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238519
4545	NC_009481	GCT	2	6	200224	200229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4546	NC_009481	GAC	2	6	200243	200248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4547	NC_009481	TGC	2	6	200253	200258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4548	NC_009481	CGG	2	6	200259	200264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238519
4549	NC_009481	ATCTGG	2	12	200265	200276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148238519
4550	NC_009481	CTG	2	6	200306	200311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4551	NC_009481	GGT	3	9	200434	200442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238519
4552	NC_009481	GGC	2	6	200455	200460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238519
4553	NC_009481	GCC	2	6	200479	200484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4554	NC_009481	GCCCC	2	10	200515	200524	0 %	0 %	20 %	80 %	148238519
4555	NC_009481	CAG	2	6	200540	200545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4556	NC_009481	GCC	2	6	200546	200551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4557	NC_009481	GGT	2	6	200569	200574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238519
4558	NC_009481	TGG	2	6	200598	200603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238519
4559	NC_009481	C	6	6	200642	200647	0 %	0 %	0 %	100 %	148238519
4560	NC_009481	CAGC	2	8	200694	200701	25 %	0 %	25 %	50 %	148238519
4561	NC_009481	C	6	6	200705	200710	0 %	0 %	0 %	100 %	148238519
4562	NC_009481	GCC	2	6	200742	200747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4563	NC_009481	TGG	2	6	200787	200792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238519
4564	NC_009481	CTG	2	6	200801	200806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4565	NC_009481	GGA	2	6	200851	200856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
4566	NC_009481	CGG	2	6	200867	200872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238519
4567	NC_009481	GGA	2	6	200890	200895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
4568	NC_009481	TGGC	2	8	200897	200904	0 %	25 %	50 %	25 %	148238519
4569	NC_009481	AGC	2	6	200913	200918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4570	NC_009481	GCC	2	6	200920	200925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4571	NC_009481	TGC	2	6	200928	200933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4572	NC_009481	GC	3	6	200932	200937	0 %	0 %	50 %	50 %	148238519
4573	NC_009481	AGC	2	6	200973	200978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4574	NC_009481	GCA	2	6	200992	200997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4575	NC_009481	GTG	2	6	201014	201019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238519
4576	NC_009481	GCC	2	6	201079	201084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4577	NC_009481	GGA	2	6	201130	201135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
4578	NC_009481	GCGG	2	8	201200	201207	0 %	0 %	75 %	25 %	148238519
4579	NC_009481	GCCG	2	8	201236	201243	0 %	0 %	50 %	50 %	148238519
4580	NC_009481	GGC	2	6	201313	201318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238519
4581	NC_009481	GTG	2	6	201338	201343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238519
4582	NC_009481	CTGC	2	8	201455	201462	0 %	25 %	25 %	50 %	148238519
4583	NC_009481	GATCCC	2	12	201467	201478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148238519
4584	NC_009481	GCC	2	6	201529	201534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4585	NC_009481	GCCG	2	8	201544	201551	0 %	0 %	50 %	50 %	148238519
4586	NC_009481	GGA	2	6	201556	201561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
4587	NC_009481	GGA	2	6	201574	201579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
4588	NC_009481	GCC	2	6	201610	201615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4589	NC_009481	TGC	2	6	201668	201673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238520
4590	NC_009481	TTTC	2	8	201679	201686	0 %	75 %	0 %	25 %	148238520
4591	NC_009481	CGG	2	6	201706	201711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238520
4592	NC_009481	TGCAGG	2	12	201774	201785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148238520
4593	NC_009481	CAG	2	6	201857	201862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238520
4594	NC_009481	G	6	6	201913	201918	0 %	0 %	100 %	0 %	148238520
4595	NC_009481	TGCAGC	2	12	201933	201944	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238520
4596	NC_009481	CCA	2	6	202018	202023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238520
4597	NC_009481	CAG	2	6	202088	202093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238520
4598	NC_009481	GCG	2	6	202104	202109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238520
4599	NC_009481	CG	3	6	202108	202113	0 %	0 %	50 %	50 %	148238520
4600	NC_009481	CTT	2	6	202127	202132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238520
4601	NC_009481	CCT	3	9	202134	202142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238520
4602	NC_009481	CAT	2	6	202211	202216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238521
4603	NC_009481	TCC	2	6	202227	202232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238521
4604	NC_009481	CGC	2	6	202235	202240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238521
4605	NC_009481	GTG	2	6	202290	202295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238521
4606	NC_009481	GAT	2	6	202317	202322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238521
4607	NC_009481	CCGG	2	8	202330	202337	0 %	0 %	50 %	50 %	148238521
4608	NC_009481	AGG	2	6	202348	202353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238521
4609	NC_009481	GGC	2	6	202430	202435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238521
4610	NC_009481	TGC	2	6	202465	202470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238521
4611	NC_009481	GCCC	2	8	202477	202484	0 %	0 %	25 %	75 %	148238521
4612	NC_009481	ACC	2	6	202497	202502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238521
4613	NC_009481	TGT	2	6	202618	202623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238521
4614	NC_009481	GCT	2	6	202664	202669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238521
4615	NC_009481	CCG	2	6	202688	202693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238521
4616	NC_009481	GCA	2	6	202717	202722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238521
4617	NC_009481	GC	3	6	202725	202730	0 %	0 %	50 %	50 %	148238521
4618	NC_009481	GCC	2	6	202748	202753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238521
4619	NC_009481	TGG	2	6	202762	202767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238521
4620	NC_009481	ACC	2	6	202773	202778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238521
4621	NC_009481	GGA	2	6	202850	202855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238521
4622	NC_009481	GCC	2	6	202878	202883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238521
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4626	NC_009481	CTG	2	6	202968	202973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238521
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4634	NC_009481	CTG	2	6	203208	203213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238521
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4644	NC_009481	CT	3	6	203472	203477	0 %	50 %	0 %	50 %	148238522
4645	NC_009481	TGC	2	6	203509	203514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238522
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4702	NC_009481	CTGG	2	8	205872	205879	0 %	25 %	50 %	25 %	148238525
4703	NC_009481	GCA	2	6	205886	205891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238525
4704	NC_009481	CCTGG	2	10	205926	205935	0 %	20 %	40 %	40 %	148238525
4705	NC_009481	CGATGG	2	12	205965	205976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148238525
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4711	NC_009481	TTG	2	6	206286	206291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4712	NC_009481	TC	3	6	206308	206313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4713	NC_009481	GC	3	6	206328	206333	0 %	0 %	50 %	50 %	148238526
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4720	NC_009481	TCGA	2	8	206767	206774	25 %	25 %	25 %	25 %	148238526
4721	NC_009481	CAT	2	6	206802	206807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238526
4722	NC_009481	CAG	2	6	206821	206826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238526
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4728	NC_009481	CCG	2	6	207111	207116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238526
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4732	NC_009481	GGA	2	6	207204	207209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238526
4733	NC_009481	GCG	2	6	207295	207300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238526
4734	NC_009481	GGCAC	2	10	207311	207320	20 %	0 %	40 %	40 %	148238526
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4736	NC_009481	CGA	2	6	207459	207464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238526
4737	NC_009481	GC	3	6	207531	207536	0 %	0 %	50 %	50 %	148238526
4738	NC_009481	ACG	2	6	207548	207553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238526
4739	NC_009481	GCCG	2	8	207561	207568	0 %	0 %	50 %	50 %	148238526
4740	NC_009481	GCT	2	6	207688	207693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238526
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4742	NC_009481	ACC	2	6	207814	207819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238527
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4755	NC_009481	GC	3	6	208324	208329	0 %	0 %	50 %	50 %	148238527
4756	NC_009481	TGT	2	6	208376	208381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238527
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4759	NC_009481	CTG	2	6	208419	208424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238527
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4864	NC_009481	GTC	2	6	213628	213633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238531
4865	NC_009481	GCA	2	6	213663	213668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238531
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4982	NC_009481	CGGTG	2	10	218813	218822	0 %	20 %	60 %	20 %	148238536
4983	NC_009481	CGG	2	6	218857	218862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238536
4984	NC_009481	CG	3	6	218885	218890	0 %	0 %	50 %	50 %	148238536
4985	NC_009481	CGG	2	6	218920	218925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238536
4986	NC_009481	CCAGCA	2	12	218926	218937	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148238536
4987	NC_009481	CAG	2	6	219017	219022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238536
4988	NC_009481	GGT	2	6	219076	219081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238536
4989	NC_009481	CGT	2	6	219082	219087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238536
4990	NC_009481	GCG	3	9	219100	219108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238536
4991	NC_009481	GCT	2	6	219133	219138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238536
4992	NC_009481	CTG	2	6	219143	219148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238536
4993	NC_009481	CGC	2	6	219163	219168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238536
4994	NC_009481	GCC	2	6	219170	219175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238536
4995	NC_009481	GTGCCG	2	12	219228	219239	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148238536
4996	NC_009481	GGT	2	6	219266	219271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238536
4997	NC_009481	TGT	2	6	219334	219339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_009481	GGACT	2	10	219344	219353	20 %	20 %	40 %	20 %	148238537
4999	NC_009481	ATC	2	6	219441	219446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238537
5000	NC_009481	CCAGCA	2	12	219469	219480	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148238537

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